基因组学概论 绪论

1、基因组学概论授课老师：吴晓梅杭州师范大学生命与环境科学学院wuxm/course/ 课程网站基因组学概论2教材杨金水著, 基因组学第4版，普通高等教育“十一五”国家级规划教材，高等教育出版社，2019年9月。基因组学概论3重要参考书 (1)(英国)T.A.布朗，译者：袁建刚等, 2009基因组3, 科学出版社。重要参考书 (2)基因组学概论4Genome: The Autobiography of a Species in 23 Chapt(英)马特里德利(Matt Ridley)，译者：李南哲, 2015年,机械工业出版社。基因组学概论5国内外期刊Nature, Science, Cell,

2、 PLoS BiologyNature Reviews .Annual Review in Trends in Current Opinion in Genome Research, Genome BiologyNucleic Acids Research基因组学概论6考试说明教师授课总学时：32 学时考核方式：考查课，开卷考试平时成绩40%，包括上交的章节作业 (60%)思考题汇报 (20%)课堂表现 (15%)考勤 (5%)考查考试60%课程网站：/course/基因组学概论70 绪论0.1 从遗传学到基因组学0.2 课程内容基因组学概论80.1 从遗传学到基因组学发现遗传规律 (Mend

3、el 1865)遗传学 Genetics (Bateson 1905)基因 Gene (Johannsen 1909)基因组 Genome (Winkler 1920)基因组学 Genomics (Roderick 1986)人类基因组计划 (1990-2003)基因组学概论9什么是基因组？一个物种中所有基因的整体组成。遗传信息和遗传物质。揭开生命的奥秘，需要从整体水平研究基因的存在、基因的结构与功能、基因之间的相互关系。基因组学概论10什么是基因组学？基因组学（Genomics）：以基因组分析为手段，对所有基因进行基因组作图、核苷酸序列分析、基因定位、时序表达模式和基因功能分析，以及不同物种

4、之间基因组的进化关系分析。分子遗传学的分支学科提供有关生物物种及其细胞功能的进化信息衍生出的学科：比较基因组学、进化基因组学、功能基因组学、结构基因组、宏基因组学基因组学概论111900 Mendel遗传学的重新发现；1909 基因 Gene (Johannsen)1910 Morgan发现连锁遗传学，确立基因与染色体之间的关系；1920 基因组 Genome (Winkler 1920)1944 Avery等证明遗传物质是DNA；1953 Watson和Crick发现DNA的双螺旋结构；1973 Cohen等第一次实现重组DNA，开始了遗传工程时代；1983 Mullis发明了PCR技术，实

5、现了DNA体外大量扩增；1986 基因组学 Genomics (Roderick 1986)1990 人类基因组计划起动；1995 第一个原核生物（细菌）基因组测序完成；1996 第一个真核生物（酵母）的基因组测序完成；2000 果蝇和拟南芥的基因组测序完成； 人类和水稻的第一张基因组草图完成；2001 人类基因组测序完成； 水稻（籼稻和粳稻）基因组草图完成。2005 开发第二代测序技术，2007年起广泛利用。2007 开发第三代测序技术，目前处于商业化阶段。 基因组学概论120.1 从遗传学到基因组学图片来自于 /nature/journal/v422/n6934/pdf/timeline_01626.pdf 基因组学概论130.2 课程内容基因组与基因组结构 (3课时)遗传图绘制 (4课时)物理图绘制 (2课时)基因组测序与序列拼接 (4课时)基因组序列注释 (5课时)高通量基因功能分析 (3课时)表观遗传学 (2课时)基因组进化的分子基础 (4课时)思考题讨论 (2课时)基因组进化的模式 (2课时)基因组学概论140.2 课程内容对于课程的每部分内容，我们都可以从这三个角度去考虑：Why 为什么需要