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文档简介
1、 # #美国应用生物系统公司ABIPrism7900HT型荧光定量PCR仪操作手册 # # 美国应用生物系统中国公司技术服务部2003年ABIPrism7900HT中文操作手册目录ABIPRISM7900HT型荧光定量PCR仪简明手册快速入门3ABIPRISM7900HT型荧光定量PCR仪简明手册绝对定量4TOC o 1-5 h z HYPERLINK l bookmark20开机4 HYPERLINK l bookmark22新建文件4探针设置4 HYPERLINK l bookmark132参数设置5 HYPERLINK l bookmark50填样品表6 HYPERLINK l book
2、mark62启动循环7 HYPERLINK l bookmark64数据分析7 HYPERLINK l bookmark66查看结果7ABIPRISM7900HT型荧光定量PCR仪简明手册相对定量9开机9 HYPERLINK l bookmark86新建文件9探针设置9参数设置10 HYPERLINK l bookmark100填样品表11启动循环12 HYPERLINK l bookmark32数据分析12设置STUDY12 HYPERLINK l bookmark116查看结果12ABIPRISM7900HT型荧光定量PCR仪简明手册终点读板.14开机14 HYPERLINK l book
3、mark122新建文件14 HYPERLINK l bookmark128设置DETECTOR和MARKER15参数设置16 HYPERLINK l bookmark134填样品表16终点读板16数据分析17 HYPERLINK l bookmark148查看结果17ABIPrism7900HT中文操作手册ABIPrism7900HT中文操作手册 ABIPrism7900HT型荧光定量PCR仪简明手册快速入门开机开电脑显示屏电源,启动电脑,进入WindowsNT操作系统,以用户名Administrator登陆,密码7900。待鼠标沙漏消失,电脑完全启动后,开7900HT电源,红橙绿灯依次闪动2
4、次,然后绿灯点亮。双击桌而图标,打开SDS应用软件。新建文件菜单File-*New,新建一个空白文件。Assay代表试验类型,实时定盘选AbsoluteQuantification;终点读板选AllelicDiscrimination:Container指反应板类型,根据需要选择96孔板、384孔板或微虽反应卡;Template项用丁调用事先设直好的模板文件:Barcode是反应板的条形码,可以用扫描仪扫入或者手工输入。设置完毕,点OK确认。填样品表设定Detector:菜单Tools-*DetectorManager,点New新建探针,设定名称、报告基团、淬火基团等相关参数:选定探针后点Co
5、pytoPlateDocument复制到板文件,指定各个孔所用探针、样品名和样品类型(未知样品、标准品和对照,标准品并输入拷贝数),扫描或输入条形码。循环参数切换到Instrument口,在Thermalprofile选单下设定、修改PCR循环的温度、时间、反应休枳等。其中AddADissociationStage指令仪器进彳了融解曲线试验,只适用TSYBRGreenI荧光染料法:保存文件设世完毕,保存文件;也可以保存为模板文件,方便以后调用。启动PCR在Instrument口点击Open/Close按钮,弹出样品架(在主机的右侧)。把样品板置入托盘,再单击Open/Close按钮,样品架动收
6、回并关闭上样门。按Start开始实验,开始时有样品架到位、扫描头到位、惣盖丑温等工作,筹待出现RemainTime若干时何后即开始U:式运行。数据分析实验结束,H动或F工设艸基线和阈俏,单击Analyze分析结果,切换到Result窗口査看扩增曲线、标准曲线、腹始数据、实验报告等试验结果。保存数据,也可以Export各种数据。ABIPrism7900HT型荧光定量PCR仪简明手册绝对定量ABIPrism07900HT型荧光定虽PCR仪支持使用标准曲线法对核酸进行实时绝对定虽。请严格按照顺序开机,以便仪器系统能够正确地初始化,在乞个部分之间建立通讯联络。实验开始前,主机和机械惰需预热W分钟以上。
7、电源打开以后,主机即开始加热热盖,直到105co如果热盖尚未达到105C就开始实验,仪器将Il动暂停,等待热盖温度达到后才开始PCR。打开电脑显示屏的电源:启动电脑:启动机械臂,电源开关在背而;启动7900HT主机,可以看到红橙绿灯依次闪动2次,然后绿灯点亮,说明仪器启动完毕。二、新建文件启动软件按照下述路径启动SDS软件:Start-Programs-AppliedBiosystems-*SDS2.1-SDS2.1也可以双击桌而上的快捷方式图标启动SDS软件。如果使用的是SDSEnterpriseDatabase,登录时输入用名和密码,点OK。新建文件选择菜单File-New。在Assay下
8、拉菜单中选AbsoluteQuantification(StandardCurve)(实时定呈模式,用丁核酸的绝对定星研究):在Container下拉菜单中根据需要选择所用的反应板类型:96孔板、384孔板或微量反应卡;在Template下拉菜单中选BlankTemplate如果只测一块板,在Barcode栏扫描或者输入反应板的条形码。点OK,软件打开一个空白的反应板文件。三、探针设置新建探针在SDS软件中,选择菜单Tools-DetectorManager,打开DetectorManager窗口。如果是第一次使用软件,或者探针(Detector)没有设直好,在DetectorManager对
9、话框中点New,新建探针。在AddDetector对话框的Name栏输入探针的名字,建议使用所研究的基因座的名称,如GAPDH、RNaseP等。不同探针给以不同的名字。(可选)在Description栏,输入简短的说明,32个字母以下。指定ReporterDye和QuencherDye。报告基团通常是FAM或者VIC:TaqMan探针的淬灭基团选TAMRA,MGB探针的淬灭基团选None。点Color,在弹出的调色板中任意选择一种颜色,点OK。(可选)在Notes栏输入200字以下说明。设代完成后,点击OK保存探针并返回DetectorManager页而。该探针即出现在探针列表中。重复设置更多
10、的探针。复制探针文件探针设捏好后,在DetectorManager页而.从探针列表中选择探针.或者按住Ctrl键点击.选择多个探针,这些探针即被选黑;再点击CopytoPlateDocument按钮,探针被复制到板文件的WellInspector中。点Done关闭DetectorManager樹口。应用探针在样品表中,选择含有第一种探针的所有样品孔。在WellInspector对话框中探针列表的Use项下的方框中,打钩选择要用的一个或多个探针,该探针即显示在样品表的相应孔中。重复1-2,设籃其余样品所用的探针。设置样品类型使用Ctrl和Shift键,在样品表中选择同一类型的所有样品孔。在Wel
11、lInspector对话框中探针列表的Task的下拉菜单中选择样品类型:空白对照选NTC:耒知样品选Unknown:C知拷贝数的标准品选Standard。对丁标准品,还要(Quantity栏中输入DNA模板的拷贝数,输入后按Enter。四、参数设置切换到SDS软件的Instrument页而。根据需要,选择或者不选9600Emulation如果选择9600Emulation.SDS软件将降低7900HT的升降温速率,使之与7700样。根据需要,修改PCR参数。在7900HT系统默认的参数中,50C2min是UNG酶起作用的步骤,UNG爾可以预防先前的PCR产物可能对木次定量PCR造成的污染;如果
12、所用试剂中没有UNG酶,请去掉此步;95C10min的作用是激活金牌Taq酚,同时火活UNG爾:如果用的不是金牌Taq爾,请去掉此步:后而40个循环的95C15sec和60C1min是定戢PCR的循环步骤。调整温度/时间:拖动臥标,选中需要修改的温度或时间,输入新的数值,回车:增加保温、循环或步骤:点击需要插入步骤处的左边,出现粗黑竖线后,点击AddHold、AddCycle或者AddStep按钮,分别插入保温、循环或步骤:删除步骤:选中想要删除的步骤,点击DeleteStep按钮。融解曲线试验:点AddADissociationStage按钮。注意:融解曲线试验只适用TSYBRGreenI荧
13、光染料法,不适用丁荧光探针法。AutoIncrement:每循环1次,温度和时间増加或减少一定幅度,一般不需设定。指定信号收集点:切换到DataCollection页而,点击每一个PCR循环步骤的平台线或升降温线,即出现信号收集标志;再点击一次,即消去信号收集标志。最好每一步都收集信号。有关信号收集可以使用默认设进,一般不需要改动。ABIPrism7900HT中文操作手册ABIPrism7900HT中文操作手册 # /BiosymsABIPrism7900HT中文操作手册 设世反应体枳:定戢PCR的标准反应休枳是:96孔板50pL,384孔板10jjL,微呈反应卡2pL:如果想修改的话,建议9
14、6孔板大T25pL,384孔板大T5jjL另外,同一块板上所有孔的反应体积必须一样大小。设理参比荧光:如果使用的是ABI公司的定ffiPCR试剂,TaqManUniversalPCRMasterMix或者SYBRGreenPCRMasterMix.参比荧光(PassiveReference)选ROX:如果所用试剂中没有参比荧光,请选None。五、填样品表(可选)保存为模板菜单FileSaveAs:对丁企业版软件,选择File-*SaveTemplatetoDatabase给文件另外取一个名称。在文件类型下拉菜单中,选SDSTemplates(.sdt)oOK。设置样品名在反应板上选中含有第一个
15、样品的所有反应孔。在SampleName栏输入样品名,回车。重复1和2,命名其余样品。增加或编辑条形码、备注在SDS软件中.选择ToolsDocumentInformation。在对话框中编辑条形码或者备注。完成后,点OK。保存到数据库在File下拉菜单选择SaveDocumenttoDatabasec在UniqueName栏输入文件名,Barcode栏扫描或者输入条形码。在Comment栏,输入简短的文件说明,点OK。在SaveDocument对话框,点OK。保存到文件系统在SDS软件的File下拉菜单中选择SaveAs。选好路径,在FileName栏输入文件名,也可以扫描或者输入条形码。点
16、Save。六、启动循环准备好反应板。切换到SDS软件的Instrument页而。在Real-Time或者Plate-Read子页面,点Open/Close,弹出样品架(在主机的右侧)。把样品板放在托盘上,再单击Open/Close按钮,样品架H动收回进入仪器里面,并关闭上样门。点击Start按钮开始实验。开始时有样品架到位、扫描头到位、热盖升温等工作,等待屏幕上显示PCR进程和剩余时间后即开始正式运行。程序结束后点FileSave保存实验结果。七、数据分析设代基线和阙值:在SDS软件中,选择AnalysisAnalysisSettings;在Detector下拉菜单中选择探针:在Analysi
17、sSettings对话框中选择|动或者手T确定6值,如果选择手工方式,先输入阈值,然后选择H动或FT设代基线。基线(Baseline)的起点和终点确定脈则为:起点要避开前而几个循坏dll-Stage2的95C高温所导致的荧光信号增高(特别是国产试剂,升高比较明显),设在信号开始达到本底的地方,一般在第3到第6个循环之间:肉为基线是指PCR开始时信号很低、处丁本底水平的那个阶段:终点要设定在荧光信号有明显增高处的询而,一般选在本组实验中最小的Ct值前再3个循环处:另外起点到终点之间的距离应该大丁8个循环。菜单Analysis-Analyze,SDS软件即开始分析数据,并在Results页面显示计
18、算结果。选择FileSaveResultstoDatabase.保存实验结果。八、查看结果扩增曲线切换到Result页面,在AmplificationPlot口査看扩增llll线。在默认的情况下,扩增Illi线的纵坐标代表经过ROX和空白校正后的相对荧光信号强度,横坐标代表PCR循环次数(从1到40);纵坐标以对数表示,横坐标以线性表示。如果要看完全线性的S形图谱,请双击纵坐标轴线,打开坐标设代谢口,将纵坐标改成线性形式。原始数据切换到Component口,査看原始数据。正常惜况下,报告基团FAM的信号强度基线时约为4000-5000点,扩增完成后达到约25000-30000点,中间呈S形増长
19、;VIC的信号强度基线时约为4000-5000点,扩增完成后达到约15000-20000点,中间也呈S形增长;淬灭基团TAMRA的信号强度基线时比FAM稍低一点,到报告基团开始指数增长时它反而会向下降低:ROX信号比FAM的基线水平稍低一点,而且是水平稳定的,不随PCR进程而改变,肉为ROX是以固定的浓度加入到PCR试剂中的,并不参与PCR反应。原始数据切换到Spectra子页面,可以査看另一种脈始数据。与Component的区别是:Component显示的是信号强度随时间也就是PCR循环次数的变化,是纵向的;Spectra显示的是每个PCR循环点上信号强度在不同波长上的分布,是横向的。标准曲
20、线切换到StandardCurve口,査看标准曲线。注意:只有在Setup时输入标准品的拷贝数后,软件才能H动生成标准曲线。实验报告切换到Report窗口,査看实验报告。确认无误后,保存结果。也可以从File菜单中选择Export.再选择数据类型,输出不同的数据,包括信号强度、療始数据和实验结果等。输出的数据可以用Excel打开,并可在Excel中垂新生成扩増曲线、标准曲线等图谱。ABIPrism7900HT中文操作手册ABIPrism7900HT中文操作手册 /BiosymsABIPrism7900HT中文操作手册 #ABIPrism7900HT型荧光定量PCR仪简明手册相对定量ABIPri
21、sm07900HT型荧光定虽PCR仪支持使用6值比较法对核酸进行实时相对定虽。请严格按照顺序开机,以便仪器系统能够正确地初始化,在乞个部分之间建立通讯联络。实验开始前,主机和机械惰需预热10分钟以上。电源打开以后,主机即开始加热热盖,直到105co如果热盖尚未达到105C就开始实验,仪器将H动暂停,等待热盖温度达到后才开始PCR。打开电脑显示屏的电源:启动电脑:启动机械臂,电源开关在背而;启动7900HT主机,可以看到红橙绿灯依次闪动2次,然后绿灯点亮,说明仪器启动完毕。二、新建文件启动SDS软件按照下述路径启动SDS软件:Start-Programs-AppliedBiosystems-*S
22、DS2.1-SDS2.1也可以双击桌而上的快捷方式图标启动SDS软件。如果使用的是SDSEnterpriseDatabase,登录时输入用名和密码,点OK。新建文件选择菜单File-New。在Assay下拉菜单中选RelativeQuantificationDDCT(实时定呈模式,用丁核酸的相对定戢研究):在Container下拉菜单中根据需要选择所用的反应板类型:96孔板、384孔板或微虽反应卡:在Template下拉菜单中选BlankTemplate。如果只测一块板,在Barcode栏扫描或者输入反应板的条形码。点OK,软件打开一个空白的反应板文件。三、探针设置新建探针在SDS软件中,选择
23、菜单Tools-DetectorManager,打开DetectorManager窗口。如果是第一次使用软件,或者探针(Detector)没有设直好,在DetectorManager对话框中点New,新建探针。在AddDetector对话框的Name栏输入探针的名字,建议使用所研究的基冈座的名称,如GAPDH、RNaseP等。不同探针给以不同的名字。(可选)在Description栏,输入简短的说明,32个字母以下。指定ReporterDye和QuencherDye。报告基团通常是FAM或者VIC:TaqMan探针的淬灭基团选TAMRA,MGB探针的淬灭基团选None。点Color,在弹出的调
24、色板中任意选择一种颜色,点OK。(可选)在Notes栏输入200字以下说明。设代完成后,点击OK保存探针并返回DetectorManager页而。该探针即出现在探针列表中。重复步骤设且更多的探针。复制探针文件探针设咒好后,在DetectorManager页而.从探针列表中选择探针.或者按住Ctrl键点击.选择多个探针,这些探针即被选黑;再点击CopytoPlateDocument按钮,探针被复制到板文件的WellInspector中。点Done关闭DetectorManager樹口。应用探针在样品表中,选择含有第一种探针的所有样品孔。在WellInspector对话框中探针列表的Use项下的方
25、框中,打钩选择要用的一个或多个探针,该探针即显示在样品表的相应孔中。重复1-2,设習其余样品所用的探针。设置样品类型使用Ctrl和Shift键,在样品表中选择同一类型的所有样品孔。在WellInspector对话框中探针列表的Task的下拉菜单中选择样品类型:未知样品选Target:内对照(即管家基因)选EndogenousControL四、参数设置切换到SDS软件的Instrument页而。根据需要,选择或者不选9600Emulation如果选择9600Emulation.SDS软件将降低7900HT的升降温速率,使之与7700样。根据需要,修改PCR参数。在7900HT系统默认的参数中,5
26、0C2min是UNG酶起作用的步骤,UNG爾可以预防先前的PCR产物可能对木次定量PCR造成的污染;如果所用试剂中没有UNG酶,请去掉此步;95C10min的作用是激活金牌Taq酚,同时火活UNG爾:如果用的不是金牌Taq爾,请去掉此步:后而40个循环的95C15sec和60C1min是定戢PCR的循环步骤。调整温度/时间:拖动就标,选中需要修改的温度或时间,输入新的数值,回车:增加保温、循环或步骤:点击需要插入步骤处的左边,出现粗黑竖线后,点击AddHold、AddCycle或者AddStep按钮,分别插入保温、循环或步骤:删除步骤:选中想要删除的步骤,点击DeleteStep按钮。融解曲线
27、试验:点AddADissociationStage按钮。注意:融解曲线试验只适用TSYBRGreenI荧光染料法,不适用丁荧光探针法。AutoIncrement:每循环1次,温度和时间増加或减少一定幅度,一般不需设定。指定信号收集点:切换到DataCollection页而,点击每一个PCR循环步骤的平台线或升降温线,即出现信号收集标志;再点击一次,即消去信号收集标志。最好每一步都收集信号。有关信号收集可以使用默认设直,一般不需要改动。设代反应体积:定虽PCR的标准反应休枳是:96孔板50|JL.384孔板10pL,微呈反应卡2pL;如果想修改的话,建议96孔板大T25pL,384孔板大丁5pL
28、。另外,同一块板上所有孔的反应体积必须一样大小。设理参比荧光:如果使用的是ABI公司的定MPCR试剂,TaqManUniversalPCRMasterMix或者SYBRGreenPCRMasterMix.参比荧光(PassiveReference)选ROX:如果所用试剂中没有参比荧光,请选None。五、填样品表(可选)保存为模板菜单FileSaveAs:对丁企业版软件,选择File-*SaveTemplatetoDatabase给文件另外取一个名称。在文件类型下拉菜单中,选SDSTemplates(.sdt)oOK。设置样品名在反应板上选中含有第一个样品的所有反应孔。在SampleName栏输
29、入样品名,回车。重复1和2,命名其余样品。编辑条形码、备注在SDS软件中.选择ToolsDocumentInformation。在对话框中编辑条形码或者备注。完成后,点0K。保存到数据库在File下拉菜单选择SaveDocumenttoDatabasec在UniqueName栏输入文件名,Barcode栏扫描或者输入条形码。在Comment栏,输入255字以下的文件说明,点0K。在SaveDocument对话框,点OK。保存到文件系统在SDS软件的File下拉菜单中选择SaveAs。选好路径,在FileName栏输入文件名,也可以扫描或者输入条形码。点Save。启动循环准备好反应板。切换到SD
30、S软件的Instrument页而。在Real-Time或者Plate-Read子页面,点Open/Close,弹出样品架(在主机的右侧)。把样品板放在托盘上,再单击Open/Close按钮,样品架|动收回进入仪器里面,并关闭上样门。点击Start按钮开始实验。开始时有样品架到位、扫描头到位、热盖升温等工作,等待屏幕上显示PCR进程和剩余时间后即开始正式运彳亍。程序结束后点File-Save保存实验结果。七、数据分析/SSBiosymsABIPrism7900HT中文操作手册/SSBiosymsABIPrism7900HT中文操作手册 /BiosymsABIPrism7900HT中文操作手册 #
31、在SDS软件中,菜单Analysis-Analyze,SDS软件即开始分析数据,并在Results页面显示计算结果。八、设置Study(EnterpriseSoftwareonly)在SDS软件中,确保板文件是打开的。选择File-SaveResultstoDatabaseo点击Study按钮。在SelectStudy对话框,点New。在Name栏输入名字,可以长达128个字母:Creator栏显示操作者的账号名称,不可编辑:在Description栏输入说明,可以长达255个字。点0K。选中新Study,点OK。在下而3种情况下,实验数据被作为Sessiondata附加到Study中:每块板
32、在定蚩PCR完成后立即被附加到Study中:如果使用机械臂,AutomationController软件在操作过程中|动完成附加:SDSManager或RQManager软件在分析数据的过程中|动完成附加。九、查看结果扩增曲线切换到Result页面,在AmphficationPlot窗口査看扩增llll线。在默认的惜况下,扩增曲线的纵坐标代表经过ROX和空白校正后的相对荧光信号强度,横坐标代表PCR循环次数(从1到40);纵坐标以对数表示,横坐标以线性表示。如果要看完全线性的S形图谱,请双击纵坐标轴线,打开坐标设代窗口,将纵坐标改成线性形式。原始数据切换到Component口,査看原始数据。正
33、常惜况下,报告基团FAM的信号强度基线时约为4000-5000点,扩增完成后达到约25000-30000点,中间呈S形增长;VIC的信号强度基线时约为4000-5000点,扩增完成后达到约15000-20000点,中间也呈S形增长;淬灭基团TAMRA的信号强度基线时比FAM稍低一点,到报告基团开始指数增长时它反而会向下降低:ROX信号比FAM的基线水平稍低一点,而且是水平稳定的,不随PCR进程而改变,肉为ROX是以固定的浓度加入到PCR试剂中的,并不参与PCR反应。原始数据切换到Spectra子页面,可以査看另一种脈始数据。与Component的区别是:Component显示的是信号强度随时间
34、也就是PCR循环次数的变化,是纵向的;Spectra显示的是每个PCR循环点上信号强度在不同波长上的分布,是横向的。标准曲线切换到StandardCurve口,査看标准曲线。注意:只有在Setup时输入标准品的拷贝数后,软件才能M动生成标准曲线。实验报告切换到Report窗口,査看实验报告。确认无误后,保存结果。也可以从File菜单中选择Export.再选择数据类型,输出不同的数据,包括信号强度、療始数据和实验结果等。输出的数据可以用Excel打开,并可在Excel中垂新生成扩増曲线、标准曲线等图谱。ABIPrism7900HT型荧光定量PCR仪简明手册终点读板ABIPrism7900HT型荧
35、光定量PCR仪支持各种使用TaqMan探针的等位基肉鉴定实验.包括SNP筛査、基因突变检测、物种鉴定、+/-检测、等位基因鉴定等。所有等位基因鉴定实验都可以分为两个阶段:1、PCR扩增:2、PCR后的荧光信号读取(Post-read)和数据处理。第一步既可以在9700、9600等普通的PCR仪上进彳亍,也可以在7000、7900等定呈PCR仪上进行:第一步则必须在定虽PCR仪上进行。以下只叙述第二步Post-Read和数据处理的操作方法。如果第一步也在定量PCR仪上进行,请按实时定嵐的实验方法设代软件和运彳亍;待PCR完成、数据保存好后,再按以下步骤操作。、开机请严格按照顺序开机,以便仪器系统
36、能够正确地初始化,在乞个部分之间建立必要的通讯联络。实验开始前,主机和机械惰需预热10分钟以上。电源打开以后,主机即开始加热热盖,直到105Co如果热盖尚未达到105C就开始实验,仪器将暂停等待热盖温度达到后才开始运转。打开电脑显示屏的电源:启动电脑:启动机械臂,电源开关在背而;启动7900HT主机,可以看到红橙绿灯依次闪动2次,然后绿灯点亮,说明仪器启动完毕。二、新建文件启动SDS软件按照下述路径启动SDS软件:Start-Programs-AppliedBiosystems-*SDS2.1-SDS2.1。也可以双击桌而上的快捷方式图标启动SDS软件。如果使用的是SDSEnterpriseD
37、atabase,登录时输入用名和密码,点OK。新建文件选择菜单File-New-在Assay下拉菜单中选AllelicDiscrimination;在Container下拉菜单中根据需要选择所用的反应板类型:96孔板、384孔板或384孔微虽反应卡:在Template下拉菜单中选BlankTemplateo如果只测一块板,在Barcode栏扫描或者输入反应板的条形码。点OK,软件打开一个空白的反应板文件。三、设置Detector和Marker新建Detector在SDS软件中,选择菜单Tools-DetectorManager,打开DetectorManager窗口。如果是第一次使用软件,或者
38、探针(Detector)没有设直好,在DetectorManager对话框中点New,新建探针。在AddDetector对话框的Name栏输入探针的名字,建议使用所研究基因位点的等位基因名称,如AlleleRAllele2等。(可选)在Description栏,输入简短的说明,32个字母以下。指定ReporterDye和QuencherDye。报告基团通常是FAM或者VIC:TaqMan探针的淬火基团选TAMRA,MGB探针的淬火基团选None。点Color,在弹出的调色板中任意选择一种颜色,点OK。(可选)在Notes栏输入200字以下说明。设代完成后,点击OK保存探针并返回Detector
39、Manager页而。该探针即出现在探针列表中。重复1-8,设置更多的探针。新建Marker在SDS软件中,选择菜单Tools-MarkerManager,打开MarkerManager口。如果Marker没有设代好,在MarkerManager对话框中点New,新建Marker。在MarkerEditor对话框的Name栏输入Marker的名字,建议使用所研究的基因位点的名称,如D3S1169等。设雄完成后点OK,该名称即出现在位点列表中。在左边的位点列表中选中该名称,然后在右边的探针列表中Use项下方框中打钩,选择该Marker所用的Detector。一般每个Marker选两个Detecto
40、r,FAM、VIC各一。如果需要,重复步骤3-4,设置更多的Marker。注意:实时定呈PCR只耍求设置Detector即可,而SNP实验必须进一步设ftMarker,二者有区别。应用Marker在SDS软件的MarkerManager页而,在左边的位点列表中选择所需Marker,点击CopytoPlateDocument按钮,该Marker的信息即分3行出现在WellInspector窗口中。根据需要继续选择其他所需Marker。点击Done关闭MarkerManager窗口。在样品表中,选择含有第一种Marker的所有样品孔。在MarkerInspector对话框中Marker列表的Use
41、项下的方框中,打钩选择要用的Marker,该Marker即显示在相应的样品孔中。根据需要,重复步骤3-4,设置其余Marker。设置样品类型使用Ctrl和Shift键,在样品表中选择同一类型的所有样品孔。在WellInspector对话框中Marker列表的Task下拉菜单中选择样品类型:空白对照选NTC:所有样品选Unknown。设捏参比荧光:如果使用的是ABI公司的定MPCR试剂,TaqManUniversalPCRMasterMix或者SYBRGreenPCRMasterMix.参比荧光(PassiveReference)选ROX:如果所用试剂中没有参比荧光,请选None。点击右上角的X按钮关闭WellInspector窗口。四、参数设置切换到SDS软件的Instrument页而。PCR热循环程序只有60C一个步骤,不需要修改。ABIPrism7900HT中文操作手册/SSBiosymsABIPrism7900HT中文操作手册 /BiosymsABIPrism7900HT中文操作手册 #设世反应休枳:终点读板的标准反应休枳是:96孔板25pL,384孔板5pL.微虽反应卡2pL
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