高通量测序仪器

1、Illumina Hiseq 2000平台简介Hiseq 2000是Illumina公司2010年推出的一款新的高通量测序仪，测序通量 可达600Gb/run，一次运行可独立测试16个样品（或混合样本）。凭借Illumina 久经考验且广泛采用的可逆终止法边合成边测序试剂，再加上创新的制造工艺， HiSeq 2000实现了行业最高的测序产量和最快的数据产生速率。技术特色HiSeq 2000的测序原理和Genome Analyzer相同，采用稳定的可逆终止法 边合成边测序技术。该技术使用4种含有末端阻断基团和不同荧光信号的碱基进 行模板互补链的合成，不仅确保了测序的高精确性和高顺序性，而且排除了

2、由重 复序列和同聚物导致的测序错误。在光学系统和制造工艺方面，HiSeq 2000在 Genome Analyzer的基础上进行了全面改进和提升。光学系统采用2个激光源对 Flowcell进行扫描，并使用4台照相机对4种碱基分别进行记录，大幅度减少了 不同碱基之间的信号干扰，提高了测序系统的准确度。同时，HiSeq 2000使用了 新颖的双表面成像技术，增加了 Flowcell的有效面积，从而提高测序产量和降低 成本。Illumina Hiseq 2500可从HiSeq 2000升级平台概况高通量运行模式*快速运行模式*读长双流动槽（仅适用于HiSeq2500）单流动槽（HiSeq 1500

3、或 2500）双流动槽运行时间双流动槽（仅 适用于HiSeq 2500）单流动槽（HiSeq 1500 或 2500）双流动槽运行时间1x3695-105 Gb47-52 Gb2天18-22 Gb9-11 Gb7小时2x50270-300 Gb135-150 Gb5.5天50-60 Gb25-30 Gb16小时2x100540-600 Gb270-300 Gb11天100-120 Gb50-60 Gb27小时2x150N/AN/AN/A150-180 Gb75-90 Gb40小时通过过滤的读取最多30亿个单 端读取或60亿 个末端配对读 取最多15亿个单 端读取或30亿 个末端配对读 取最多6

4、亿个单 端读取或12 亿个末端配对读取最多3亿个单 端读取或6亿 个末端配对读 取质量在2 x 50时， 85%的碱基高于 Q30在2 x 100时，80%的碱基高于 Q30在2 x 50时，85%的碱基高于 Q30在2 x 100时，80%的碱基高于 Q30在2 x 150时，75%的碱基高于 Q30应用：基因组de novo测序、 基因组重测序、 转录组测序、 小RNA测序、ChIP-Seq测 序、甲基化测序Illumina GA II xIllumina Genome Analyzer IIx （简称GAIIx）平台集合了无可匹敌的准确度、 读长、读数以及双端插入片段长度，更强大且使用更

5、简便。为用户提供了各种不 同应用的高速全基因组分析系统。特点：90G 一次反应通量目前，GAII x在单个流动槽内每运行一次对读测序，都能生成超过100亿碱基 的高质量的数据；一次反应总通量最少为950亿碱基（95G）（截至2012年1 月）。该技术的可扩展特性确保了更高的数据密度和输出量，让用户能以更低的 成本完成更为复杂的项目。有关系统规格的最新信息，请与Illumina联系。200ng上样量基因分析仪系统仅需低至100ng的样品量，即在样本量有限的情况下，实现多种 应用（如免疫沉淀反应、激光分切和小模型系统）。簇生成cBot在众多极高通量测序技术当中，illumina的基因分析仪系统可提

6、供最为简单而出 色的工作流程。样本库的制备在数小时内即可完成。搭配使用的DNA簇群生成工作站cBOT是一套独立的软件控制型系统，用于在Illumina基因分析仪系统流 动槽上自动生成DNA簇群。支持单端、对读测序基因分析仪系统同时支持单端和对读测序。2x150碱基片段的读取可以提高数据 拼接能力并且可以拓展更多的应用。利用短片段及长片段双端（paired-end）技 术可处理片段长度为200bp至5kb不等Roche 454平台概况第二代 DNA 高通量测序仪 Genome Sequencer FLX +（GS FLX +）试剂：GS FLX Titanium sequencing Kit X

7、L+产量：100万序列/ Run读长：最高可达1000bp测序通量每次实验可以产生400800Mb数据运行时间每次实验只需23h序列读长单条序列的平均读长在600bp以上序列质量单碱基准确率为99%序列产量平均每次实验可以产生100万条的序列应用：基因组de novo测序、转录组de novo测序、宏基因组测序、重测序ABI SOLID测序平台（目前型号多为5000,3,4）简介SOLiD 4测序系统是由ABI公司研发的新一代超高通量基因测序分析系统，可 运用到多个领域。该系统采用结合在磁珠上单分子DNA片段簇为测序模板，以 四色荧光标记寡核苷酸进行连续的连接反应为基础，对扩增的DNA片段进行

8、 大规模高通量测序。与聚合酶测序方法不同的是，SOLiD系统利用专利的逐步 连接（stepwiseligation）技术来产生高质量的数据，可应用于全基因组测序、染 色质免疫共沉淀（ChIP）、微生物测序、数字核型分析、临床 测序、基因型分析、 基因表达分析和小分子RNA的发现等等。技术特点无以伦比的通量：100Gb的数据/run；高准确率：准确率99.94%；全自动的操作平台，省时，高效，准确：每道每天可产生100 Mreads， 15 Gb/ 每天；系统的灵活性：两个独立控制的流动池，可以进行一张或二张玻片的同时分析。 开放式高密度磁珠沉置，每张玻片可分为1个，4个或8个测序区域，支持多重 技术 Barcodeo应用广泛灵活:超高通量的数据支持大规模测序和结构变异性分析。独