分子诊断技术在感控中的应用

1、分子诊断技术在感控中的应用分子生物学诊断技术检测DNA、RNA或蛋白质等物质对疾病进行诊断或 辅助诊断分析基因或蛋白的存在、变异或表达为疾病提供更直接的证据常见分子诊断技术核酸检测核酸扩增技术测序技术核酸杂交技术基因芯片技术生物传感技术蛋白质检测光谱技术蛋白芯片技术标记免疫分析技术质谱技术医院感染暴发调查Sivertsen A, Billstrom H, Melefors O , Liljequist BO, Wisell KT, et al. (2014) A Multicentre Hospital Outbreak in Sweden Caused by Introduction of

2、a vanB2 Transposon into a Stably Maintained pRUM-Plasmid in an Enterococcus faecium ST192 Clone. PLoS ONE 9(8): e103274. doi:10.1371/journal.pone.0103274屎肠球菌ST192Baier et al. Molecular characteristics and successful management of a respiratory syncytial virus outbreak among pediatric patients with h

3、emato-oncological disease Antimicrobial Resistance and Infection Control (2018) 7:21RSV感染 暴发Sanger测序病原体诊断关于测序技术Sanger测序新一代测序（next genome sequencing, NGS）第三代测序genome-wide association study, GWASwhole-genome sequencing ,WGS耐药基因/耐药突变葡萄球菌：mecA、SCCmec肠球菌：VanA、 VanB、 VanC结核分枝杆菌：ropB肠杆菌科：NDM-1、KPC、 mcr-1HB

4、V、HCV、HIVCRE：CPE？NO-CP-CRE?孔蛋白缺失+ 产ESBL / AmpC水解厄他培南临床反应可能与MIC一 致较低的传播可能产碳青霉烯酶（如KPC，NDM）可能是交叉耐药较高的暴发可能紧急感染控制Zhan L, et al.(2017) Outbreak by Hypermucoviscous Klebsiella pneumoniae ST11 Isolates with Carbapenem Resistance in a Tertiary Hospital in China. Front. Cell. Infect. Microbiol. 7:182. doi: 10

5、.3389/fcimb.2017.00182多种技术联合应用PFGEPCR扩增测序血清分型MLST从经验治疗到直接干预快速：24小时内报告分子诊断实验结果质谱（MALDI-TOF）核酸扩增/检测（NAAT）：多重PCR、微阵列（mecA, vanA, KPC； MRSA/SA, carbapenemases,C difficile）PNA-FISH（Enterococcus, Candida, Staphylococcus, EC/PSA/KP，mecA）T2MR： 用核磁信号检测，目前仅用于念 珠菌二代测序：宏基因组学，但不快！ 全自动显微镜+ FISH：快速表型检测Adapted from

6、 Chan, et al. Nature Biotechnology 30:1068-71CLSI AST News Update.2018,3(1).技术的局限性表型诊断实验（MIC）与临床结果非常相关MIC升高，耐药基因表达任何微生物实验室都可 以使用这种方法基因型诊断实验（机制）更好地预测传播风险和 暴发可能表型方法差（例如MHTNAAT仅在参考/研究实 验室中可用纳入医院感染实时监测和暴发预警系统Du et al.: Real-time automatic hospital-wide surveillance of nosocomial infections and outbreaks in a large Chinese tertiary hospital. BMC Medical Informatics a