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文档简介

1、化细胞死亡化细胞死亡(programmed cell death , PCD)是指多细胞有机体在正常生理或病理情况下 基因与基因组学基因(gene):是一段携带功能产物(多肽,蛋白 质,tRNA和rRNA和某些小分子RNA)信息的 DNA片段,是控制某种性状的遗传单位。2基因组(genome):是指一个细胞或生物体的一套完整的单倍体遗传物质。泛指一个有生命体、病 毒或细胞器的全部遗传物质;在真核生物,基因组 是指一套染色体(单倍体) DNA。3.蛋白质组:一个基因组、一种生物或一种细胞/组 织所表达的全套蛋白质.蛋白质组学就是从整体的 角度,分析细胞内动态变化的蛋白质组成成份、表 达水平与修饰

2、状态,了解蛋白质之间的相互作用与 联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律的一个 新的研究领域4基因家族(genefamily)概念:指核苷酸序列或编码 产物的结构具有一定同源性的一些基因。单核苷酸多态性(SNP):指发生在基因组序列中 单个碱基的改变引起的DNA序列的变化;编码基 因区内的称 cSNP.不包括插入和缺失引起的碱基的加减.C值悖理/C值佯谬:用C值代表基因组的大小,C 值的大小并不能完全说明生物进化程度和遗传 复杂性的高低,即C值和它进化复杂性之间并没有 严格的对应关系的现象,称之。N值佯谬:N表示基因总数,基因组中基因数目 与生物进化程度或复杂性的不对称性,称为N值佯 谬。密码

3、子偏爱:指在不同物种的基因中,经常为某 种氨基酸编码的只是其中的一个密码子。细胞周期调控分子伴侣:是细胞一类保守蛋白质,可识别肽链 的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质的正确 折叠。由热休克蛋白和伴侣素组成。热休克蛋白促进蛋白折叠基本作用:结合保护待折 叠多肽片段,再释放该片段进行折叠。形成 HSP70 和多肽片段依次结合、解离的循环。伴侣素的主要作用:为非自发性折叠蛋白质提供能 折叠形成天然空间构象的微环境。10顺式作用元件(cis-acting element):真核生物中 能够被基因调控蛋白特异性识别和结合,并对自身 基因转录起始有调节作用的DNA序列。个别蛋白 质因子可特异识别、结合

4、自身基因的调节序列,调 节自身基因的表达,称顺式作用。反式作用因子:由某一基因表达产生的蛋白质因 子,能够与另一基因的特异的顺式作用元件特异性 结合,对基因表达的转录起始过程有调控作用的蛋 白质。这种调控作用称为反式作用。锌指结构(zinc finger motif):常结合GC盒 含 1个a螺旋,2个反向平行的p折迭;与Zn2+结合.信号肽:各种新生分泌蛋白的 N 端有保守的氨 基酸序列,含有信号序列.称信号肽。14信号序列(signal sequence):所有靶向输送的蛋 白质结构中存在分栋信号,主要为 N 末端特异氨基 酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位细胞凋亡15. G1-C

5、DK-cyclinD+CDK4 、 CDK6 S-CDKcyclinE+CDK2 M-CDK-cyclinA 、 cyclinB+CDK116细胞凋亡(apoptosis)(有树叶凋零之意 咸程序,发生的一种由多基因控制的主动死亡过程。凋亡小体:指凋亡的最后阶段,由胞质分割形成 大小不等,含有细胞质膜细胞器及核碎片的膜包被 小体。DNA片段化(主):凋亡细胞DNA经琼脂糖凝 胶电泳呈特征性梯状条带图谱死亡受体(death receptors,DR):指细胞表面存在 的一类能结合凋亡剌激分子,并将信号传递至胞内 引起细胞凋亡的受体属肿瘤坏死因子受体(TNF) 超家族“死亡结构域”概念:是凋亡信号

6、受体共有的、 存在于胞内的转导细胞凋亡所必需的一段高度同 源的氨基酸序列。周期蛋白框:各类周期蛋白均含有一段约100个 氨基酸的保守序列,称为周期蛋白框,介导周期蛋 白与CDK结合。检验点:意指当 DNA 受到损伤时,复制不完全或 纺锤体形成不正常,周期将被阻断。四个主要的检 验点G1/S,S期,G2/M,中-后期检验点(纺锤体组装检验 点)酵母双杂交系统:是在真核模式生物酵母中进行 的,研究活细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间 微弱的、瞬间的作用也能通过报告基因的表达产物 敏感地检测得到。它是一种具有很高灵敏度的研究 蛋白质之间关系的技术。报道株:经改造的含报告基因的重组质粒的宿主 细胞。

7、DNA体外重组嗓交PCR25克隆(clone):来自于同一始祖的一群相同分子、 细菌、细胞或动物(常被成为副本或拷贝)。克隆 化(cloning):获取大量单一拷贝的过程,也称无性繁 殖DNA 克隆:应用酶学的方法,在体外将各种来源 的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、 天然的或人工的DNA)与载体DNA接合成一具有 自我复制能力的DNA分子。继而通过转化或转染 宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞。再 进行扩增提取获得大量同一 DNA分子,又称基因 克隆或分子克隆。载体(vector):能携带外源基因进入受体细胞, 并在其中进行扩增或诱导外源基因表达的工具。质粒:细菌染色质以外的

8、双链环状DNA,能自我 复制和表达其携带的遗传信息。限制性核酸内切酶:由细菌自己产生的一种能识 别和切割DNA内部特定序列的一类核酸酶基因组文库(genomic library,G文库):用基因克 隆的方法保存宿主细胞中的DNA重组分子中的集 合, 所有重组子所含的插入片段的总和代表某种 生物基因组全部核苷酸序列。31cDNA文库(cDNA library,C文库):用基因克隆 的方法保存在宿主细胞中的DNA重组体的群体, 每一重组子只含一种 mRNA 信息,这些重组子的 总和包含某种生物的全部mRNA序列。定向克隆:将外源 DNA 片段定向插入到载体中 的方法T/A克隆定义:利用嗜热聚合酶如

9、Taq聚合酶的 模板非依赖性末端转移酶活性(在7075C活性 高),使PCR产物的3末端加一个A的粘性端,将 其直接克隆至3粘性末端含一个T的线性克隆载体 中.宿主细胞:被导入重组分子的细胞转化: 质粒 DNA 或以质粒为载体构建的重组 DNA 导入细菌的过程 转染:利用化学或物理等非病毒方法将重组 DNA 分子导入真核细胞的过程。感受态细胞:用理化方法人工诱导细胞,使之处 于易于吸收和容纳外源DNA分子的状态,转导:通过噬菌体的释放和感染将 DNA 从一个 细胞转移到另一个细胞的过程。核酸分子杂交:用一已知的DNA或RNA片段(探 针)来检测样品中未知的核苷酸序列,通过核苷酸 间碱基互补的原

10、理互相结合,再经显影或显色的方 法,将结合核苷酸序列的位置和大小显示出来。探针:用放射性核素或其他标记物标记的用来检 测某一特定核苷酸序列或基因序列的DNA片段或 RNA 片段。印迹技术(blotting):是指将存在于凝胶中的生 物大分子转移(印迹)于或直接放在固定化介质上 并加以检测分析的技术。41.Southern 印迹杂交:是将经凝胶分离的 DNA 转 移到合适的固相支持物,再通过特异性探针的杂交 来检测被转移的DNA片段的一种技术。Northern 印迹杂交:将 RNA 样品变性和通过琼 脂糖凝胶电泳进行分离,再转移到NC膜等固相载 体上,用标记的 DNA 或 RNA 特异探针对固定

11、在 膜上的 RNA 进行杂交。核酸原位杂交:以特异性探针与细菌、细胞或组 织切片中的核酸进行杂交并对其进行检测的方法 , 又称原位杂交组织化学或杂交组织化学。实时定量 PCR 技术:是指在 PCR 反应体系中加 入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR 进程,使每一个循环变得“可见”,最后通过外标准 对样品中的DNA (or cDNA)的起始浓度进行定量 的方法。表位标签:亦称附加表位由短肽序列组成的能显 示抗体存在的一个表位,广泛用于分子生物学中附 加到转基因蛋白中,翻译产物为融合蛋白,通过免 疫组化或Western印迹杂交跟踪其表达,不会增加 抗体对特异蛋白的反应。消减杂交法:将实验

12、组mRNA(或 cDNA)与对照 组cDNA(或mRNA)杂交,去除杂交体和未杂交 上的对照组成分(cDNA或mRNA),得到的为实 验组独有的mRNA或cDNA,这些基因即是差异表 达基因。47酶单位:在适当反应条件下,1h内在50卩1体系 中完全酶解1昭特定DNA底物所需酶量,定为1 个活性单位。星活性: 酶切反应条件不能满足最适条件 ,导 致某些酶产生第二活性.标准的酶切体系:1憾DNA,20卩1总反应体积, 1U酶,推荐的Buffer和温度,反应1h。基因诊断: 利用分子生物学的技术方法,直接 检测体内 DNA 或 RNA 的结构或水平变化,从而 对疾病做出诊断的方法。特点:特异性强;

13、灵敏度 高;检测样品局限性小;应用范围广基因治疗:用正常或野生型基因校正或置换致病 基因的一种治疗方法称基因治疗基因疗法:治疗过程中应用的目的基因就像平常 临床上使用的药物一样,为了与传统意义上的基因 治疗相区别,通常称之为基因疗法。VNTR 多态性:不同个体间重复单元如 (CA)n/(TG)n的拷贝数(即出现的频率)不同,因而 产生多态性,称VNTR多态性。54DNA 指纹分析的分子基础:在人类和动物基 因组中分布着许多小卫星DNA,它们所含重复序 列的数目各不相同 (同卵双生子和近交系动物除 外),故呈现出高度的多态性,这种多态性是进行 DNA指纹分析的分子基础反义核酸(antisense

14、 nucleic acid):指与细胞内 DNA或RNA序列相互补形成杂交体而阻断或减弱 其转录和翻译过程的 DNA 片段或 RNA 片段。反 义RNA结合于细胞中特异mRNA的特定部位(如 UTR 位点),可抑制有害基因的表达。反义技术: 研究和设计有效抑制靶基因表达以 控制和治疗疾病的人工反义分子的专门技术反义 RNA 技术:反义 RNA 结合于细胞中特异 mRNA 的特定部位(如 UTR 位点),可抑制有害基 因的表达。基因干预: 是指采用特定的手段,抑制或阻断 某个基因的表达。逆转录病毒载体: 切除野生型逆转录病毒的结 构基因(保留包装信号序列屮),在逆转录病毒的结 构基因部位插入标记

15、基因(如neo)和目的基因。辅(助)病毒:即缺陷型逆转录病毒(含有完整的 病毒结构基因序列,但缺失屮及相关序列)。包装细胞系: 经辅病毒转染且整合了辅病毒缺 陷基因的哺乳动物细胞系。重组逆转录病毒: 经包装细胞系产生的含有病 毒结构蛋白,但其RNA(由目的基因及标记基因转 录合成)不含病毒蛋白的编码序列,仅有一次感染 能力的逆转录病毒颗粒。故又被称为假病毒颗粒。生物芯片: 在可识别的有序点阵集合上,试样 与每个点阵发生分子间反应或杂交后,通过扫描检 测同时获得各个点阵上的作用信息。包括信息芯片( DNA 芯片、蛋白质芯片、细胞芯片等)和功能 -H- LL芯片。肽核酸: 是一类以氨基酸替代糖 -

16、磷酸主链的 DNA类似物,骨架由重复的N-甘氨酸通过酰胺键 相连构成,碱基则通过甲叉碳酰基与骨架相连。65基因芯片技术:用已知序列的探针与样品cDNAs 杂交,杂交信号阳性的探针序列即为细胞中表达的 DNA 序列受体:是细胞膜上或细胞内能识别、结合 生物 活性分子并转导其信号的大分子配体:与受体特异结合的生物活性分子称为 配 体68.膜受体:存在于细胞质膜上的受体,绝大部分 是镶嵌糖蛋白。胞内受体: 位于细胞浆和细胞核中的受体,全 部为DNA结合蛋白。小分子G蛋白:分子量2万-3万的单链结构, 功能类似异三聚体G protein的a亚基,可结合GTP 或 GDP, 并 有 GTP 酶 活 性

17、; Ras-GTP 代 表 “开”,Ras-GDP代表“关”,控制信号转导。已知50 多种小分子G蛋白,最重要的是癌基因Ras和Rho 亚家族71.SH2 结构域:约为 100 个氨基酸的序列,可识 别蛋白质中的磷酸酪氨酸及其周围氨基酸残基所 组成的模体,并与磷酸酪氨酸的磷酸基团结合。72.SH3结构域:由50-100个氨基酸的序列,常存 在于含有 SH2 结构域的蛋白质中,也可以存在于 不含SH2结构域的蛋白质。含SH3结构域的蛋白 质可与富含脯氨酸的蛋白质结合。PH 结构域 pleckstrin domain:由 100-120 个氨 基酸组成的功能性结构域,识别具有磷酸化的丝氨 酸和苏氨

18、酸的短肽,并能与G蛋白的pY复合物结合, 还能与膜上的磷脂结合。PTEN蛋白:是抑癌基因PTEN的产物,分布于 胞浆中,分子量为50kDa左右,含有双重特异性磷 酸酶结构域,可使PIP3脱磷酸化为PIP2,也可催 化蛋白质中磷酸酪氨酸或丝/苏氨酸脱磷酸。第一信使(first messenger):把某种调节信息由 内分泌细胞带到靶细胞的使者第二信使(second messenger):将第一信使传递 到细胞的信息由细胞表面再传递给细胞内的特定 结构,产生生理效 应的细胞内信使;或担负细胞内信息传递,实现激 素作用的使者。PCR (聚合酶链式反应):一种体外酶促扩增特 异 DNA 片段的技术,是利用针对目的基因所设计 的一对特异寡核苷酸引物,以目的基因为模板进行 的 DNA 体外合成反应。78限制性片段长度多态性(RFLP):控制某些性 状的DNA碱基差异造成DNA位点的多态性,DNA 位点

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