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文档简介
1、miRNA 的具体研究方法及研究思路lin-4,第一个已知的 miRNA,在 1993 年被发现。自此,miRNA 的研究就一发不可收拾。线虫、果蝇等模式生物的研究鉴定出miRNA 的许多重要功能,包括发育期间细胞增殖和死亡的协调,抗逆性,脂肪代谢等等。相对于这些低等的模式生物,哺乳动物的miRNA 功能研究可就复杂得多。在开始的几年,科学家们的首要目标是利用克隆、生物信息学和基因表达等方法编纂出完整的 miRNA 目录和它的表达方式。随着这个目标日益接近,研究重心又转移至 miRNA 功能的阐释。针对这一目标,涌现出多种技术,有报告基因分析、原位杂交、过表达和沉默、生物信息学预测算法等,它们
2、都有助于 miRNA 功能的推断。分析 miRNA 的表达miRNAmiRNAmiRNA 就是这么鉴定出的。然而,正向遗传学这么多年来也就鉴定出miRNAmiRNA列,它们就有潜力耐受,因此很难击中。另外,由于冗余,表型筛miRNA之后,定向克隆技术的出现,让多种细胞系和组织中的miRNAmiRNARNA18-25 ntRNA53接头,并进RT-PCRcDNARNA。目前测序技术的蓬勃发展也大大促进了这种方法。然而对于某些只在特定细胞类型中表miRNAmiRNAmiRNAmiRNAmiRNAmiRNAmiRNAmiRNAmiRNA有时,我们并不需要全盘了解所有 miRNA,而只是想了解发育或分
3、化的不同阶段、某种疾病状态下特异表达的 miRNA。这时,芯片就成为一种强大的工具,能监测组织特异的 miRNA 表达,帮您挑出关键的 miRNA。目前市场上多个 miRNA 芯片包括了最新的Sanger miRBase 数据库 14.0 版的内容,让您能紧跟形势。尽管最初 miRNA 芯片的交叉杂交和特异性为人诟病,但经过改进,很多已经能够分辨出单个碱基的差异。有了它,人们绘制出细胞分化期间的 miRNA 表达谱;有了它,人们了解到疾病状态下异常的miRNA 表达模式。ABI 公司还开发出一种类似芯片的 TaqMan miRNA Array,在一张微流体卡片上集合了数百个 TaqMan mi
4、RNA Assay,尽管通量不如芯片高,但发挥了 TaqMan 分析的优势高灵敏度、高特异性和宽动态范围。鉴定 miRNA 的功能miRNA 的功能研究与基因相似,过表达和沉默是两种有力的方法。miRNAmiRNAmiRNAmiRNAmiRNADicermiRNA内。不过,仅有 miRNA 过表达的结论往往不让人信服,我们还需要功能丧失(loss-of-function)实验来证实。对于小鼠中的 miRNA 研究,科学家们开发出一些遗传方法, 来产生功能丧失的突变。目前主要有三种:(1) Dicer 酶的突变,让所有成熟的 miRNA 都缺失;(2) 小鼠中 miRNA 基因的敲除;(3)miRNA 靶位点的突变。不过,miRNAmiRNAmiRNA2-O-甲基
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