讲稿学术沙龙_第1页
讲稿学术沙龙_第2页
讲稿学术沙龙_第3页
已阅读5页，还剩5页未读， 继续免费阅读

付费下载

下载本文档

版权说明：本文档由用户提供并上传，收益归属内容提供方，若内容存在侵权，请进行举报或认领

文档简介

1、HIV整合酶抑制剂三维定量构效关系研究 罗宇明 2014年3月16日三维定量构效关系(3D-QSAR)简介由于实验费用高昂且需求时间较长，计算机辅助药物设计(CADD)已经被广泛应用于药物研发过程中。在这些辅助设计工具中，三位定量构效关系(3D-QSAR)以配基和受体的三维结构特征为基础, 根据分子的内能变化和分子间相互作用的能量变化来定量分析化合物三维结构与生物活性间的关系。一般来说，3D-QSAR根据定位规则将分子在空间进行叠合,计算每个化合物构象的一系列分子场描述符，通过偏最小二乘法将这些描述符与化合物活性关联，得到可预测未知化合物活性的模型，并反应出各个位置的基团对活性的影响。应用最广

2、泛的三维定量构效关系方法是比较分子场方法(CoMFA)和比较分子相似性方法(CoMSIA)。它们之间的区别在于CoMFA在建立模型时只考虑静电场(electrostatic)和立体场 (steric)，而CoMSIA考虑静电场(electrostatic)，立体场 (steric)，疏水场(hydrophobic)，氢键供体场(H-bond donor)与氢键受体场 (H-bond acceptor).数学模型的建立根据Di Santo报道的化合物，建立的CoMFA与CoMSIA模型： 为了确保生成模型的准确性与可预测性，需要至少保证交叉验证回归系数q2 0.5，线性偏差系数r2 0.9。生成的CoMFA模型q2=0.847，r2=0.976；CoMSIA模型q2=0.847，r2=0.980，表明生成的模型具有统计学

人人文库> 全部分类> 教育资料 > 课件下载

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明，都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等，如果需要附件，请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸，网页内容里面会有图纸预览，若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间，仅对用户上传内容的表现方式做保护处理，对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑，并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容，请与我们联系，我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论