大数据时代医院图书馆馆员的新要求

1、大数据时代医院图书馆馆员的新要求CONTENTS142536大数据数据监护医疗应用馆员知识与技能数据科学家图书馆未来发展BIG DATAAPPLICATIONS IN MEDICAL CAREDATA SCIENTISTDATA CURATIONSKILLS AND KNOWLEDGEFUTURE DEVELOPMENT 1大数据BIG DATAXX省医院协会医院图书情报管理专业委员会2015年学术年会8月2022日XXXX 1大数据BIG DATA定义DEFINITIONS“大数据”概念最早是由咨询公司麦肯锡(McKensey)提出，在其报告Big data: The next fronti

2、er for innovation, competition, and productivity中给出的大数据定义是：大数据指的是大小超出常规的数据库工具获取、存储、管理和分析能力的数据集。Wikipedia ： Big data is a broad term for data sets so large or complex that traditional data processing applications are inadequate. 特征CHARACTERISTICSVolume 数据量庞大数据以几何级数增长，数据量很容易达到TB（Tera Bytes，兆位元组），甚至PB（

3、Peta Bytes，千兆位元组）或 EB（Exabytes，百万兆位元组）的等级。Variety 包罗万象大数据的来源种类十分多样化，数据的形态包含文字、音画、视讯、网页、串流等等，主要分类为结构化数据、半结构化数据和非结构化数据。Velocity 输入输出速度快资料的传输流动(data streaming)是连续且快速的，要迅速地分析、处理数据，作出回应、输出结果，保证处理的时效。许多资料要能即时得到结果才能发挥最大的价值。Veracity 真实性存疑当数据的来源变得更多元时，数据本身的可靠度和质量就会存疑，应当分析并过滤有偏差、伪造、异常的部分，防止这些dirty data损害到资料系统

4、的完整及正确性，进而影响决策。1大数据BIG DATA 1大数据BIG DATA大数据在越来越多的领域当中逐渐得到广泛的应用，比如：政府部门、国际开发、制造业、媒体、民间部门、科学领域等。数据处理思维方式正逐步从抽样分析向全体性、混沌性以及相关性演变，以适应数据量的爆发式增长。大数据情报分析：梳理所有可以获得的数据库， 对相关信息进行确认，并将其整合起来。医疗：大数据可以通过利用各种采集人们身体健康指数的设备采集数据，对数据进行分析，对医疗技术产生帮助。影响 INFLUENCES 2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CAREXX省医院协会医院图书情报管理专业委员会2015

5、年学术年会8月2022日XXXX 2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE大数据：生物医学变革新契机世界正在由资本经济时代向数据经济时代过渡，数据及其服务成为国家战略和经济的基础设施。欧美主导的国际生命科学计划产生的数据和知识，已成为重要的国家资源。例如国际人类基因组单体型图计划、DNA元件百科全书计划、人类表观基因组计划、国际癌基因组计划、千人基因组计划等，这些计划形成的数据资源潜在价值十分巨大。大数据不仅为生物医学研究带来了新的技术手段，还可能大幅度降低医疗费用。麦肯锡全球研究院报告显示，如果美国医疗保健行业对大数据进行有效利用，就能把成本降低8%左右，从而每年创

6、造出超过3000亿美元的产值。 基因测序和基因模型人类基因组有30亿个碱基对，一个完全测序的人类基因组包含100-1,000GB的数据量。一百万个人的数据合计能达到1EB或者说1,000,000TB的数据量。苹果公司的传奇总裁史蒂夫.乔布斯在与癌症斗争的过程中采用了不同的方式，成为世界上第一个对自身所有DNA和肿瘤DNA进行排序的人。他得到的不是一个只有一系列标记的样本，而是包括整个基因密码的数据文档。对于一个普通的癌症患者，医生只能期望她的DNA排列同试验中使用的样本足够相似。但是，乔布斯的医生们能够基于乔布斯的特定基因组成，按所需效果用药。如果癌症病变导致药物失效，医生可以及时更换另一种药

7、。2014年”Google X”实验室推出的”Baseline Study”计划，不仅可以让医疗专家预测治疗重大疾病，最终目的是利用大数据分析找到健康完美的人类基因模型。2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE 美国FDA向社会开放健康和医疗大数据大数据被认为是能够改变未来健康和医疗产业版图的重要资源。美国食品药品监督管理局(FDA)开始逐步向社会开放医疗和健康方面的大数据。2014年6月2日，FDA的公共数据开放项目OpenFDA()正式上线。其先导项目开放了“300万份药物不良反应报告”的数据。这些数据是2004至2013年间提交给FDA的

8、药物不良反应和医疗过失记录。健康和医疗相关的大数据通常都汇集到政府监管部门(如FDA)或政府控制的机构和基础设施(如医保和数据库)中。这些数据的开放对于基于数据的健康和医疗产业的发展至关重要。2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE 2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE大数据：医疗保健和疾病预防更加个性化、精准化美国学者埃里克拖.托普在新著颠覆医疗：大数据时代的个人健康革命中称：医疗保健的数字化，已经势不可当。数字世界和医学的交汇是不可避免的，变革已经在这个交汇的舞台上初见端倪。大数据，不仅将临床治疗推向新时代，发挥着对医改的科技支撑作用

9、，而且将医疗保健和疾病预防变得更加个性化、精准化。这种变化是一种从未有过的爆炸性革命。 2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE电脑医生-“沃森”美国安德森癌症中心(M.D. Anderson Cancer Center)和IBM联合开发出一款癌症治疗软件，名叫“肿瘤专家顾问(Oncology Expert Advisor, OEA)。OEA的核心正是IBM沃森电脑(Dr. Watson)，它通过沃森的认知计算能力，从病人的病例和丰富的研究资料库中寻找资料，为临床医生提供有价值的见解，帮助医护人员针对每位患者的特质，找到精准、有效的治疗方案。 Lumiata-用大数据

10、建医疗图谱，提高诊疗的精准性Lumiata是首家提出“医疗图谱(medical graph)”的公司，他们把电子病历和病理生理学等数据整合起来，并通过图谱分析的方式去模拟人类的多维推理过程，进而预测出病人会需要什么、以及何时需要。利用这些数据，Lumiata还可以去分析和预测一个人群整体的健康状态。通过把数据转化成图谱，Lumiata可以更有效地对病人分类，并获得更准确的处方信息，这些处方信息主要是关于症状、药物、病情的风险因素、医生的诊断等。利用这个图谱，医生可以对病人做出更迅速、更有针对性地诊断。比如，Lumiata在一个有数百位病人的急救中心进行试点，结果显示，对病人分诊的时间缩短了30

11、%40%。2医疗应用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE 3数据科学家DATA SCIENTISTXX省医院协会医院图书情报管理专业委员会2015年学术年会8月2022日XXXX DATA SCIENCE数据科学数据科学家采用科学方法、运用数据挖掘工具寻找新的数据洞察的工程师。其核心能力一开始被定义为：SQL、统计、预测建模和编程、Python等，很快又加入Hadoop/MapReduce、机器学习、可视化，甚至还有传统的数学、物理、计算机科学等类似能力。利用计算机的运算能力对数据进行处理，从数据中提取信息，进而形成“知识”。数据采集数据可视化数据分析3数据科学家DATA

12、SCIENTIST 3数据科学家DATA SCIENTIST医院图书馆员：医学数据的科学家信息转化、文献整序、信息公开数据科学的核心技能是信息的管理和组织，这正是图书馆员所擅长的，在大数据问题的数据监护中也起到突出作用。信息转化许多图书馆员还是出色的沟通人员，并且通常经过教育和培训，熟知如何将用户的信息需求转化为调查策略和研究数据来源。文献整序数据科学的重要任务是把原始的、杂乱的数据转化为可行动的知识，提供给决策制定者使用；而图书馆文献整序的职能、文献交流的情报职能正是要把资料、期刊、书籍等文献转化为有序的知识传递给读者。信息公开图书馆员代表了信息的公开获取，为公众提供信息。大数据时代对公众也

13、提出了查找、检验、分析、理解各种数据来源的要求，这就需要图书馆员的协助，为公众提供一个接触和学习知识的地方。 4数据监护DATA CURATIONXX省医院协会医院图书情报管理专业委员会2015年学术年会8月2022日XXXX 概念：为确保数据当前使用目的， 并能用于未来再发现及再利用， 从数据产生伊始即对其进行管理和完善的活动。对于动态数据集而言， 数据监护意味着需进行持续性补充和更新， 以使数据符合用户需求。数据监护中的“数据”专指科学数据。Data curation is the active and on-going management of data through its lif

14、ecycle of interest and usefulness to scholarship， science， and education; curation activities enable data discovery and retrieval， maintain quality， add value， and provide for re-use over time.数据保管/保存、数据典藏、数据维护、数据监护、数据策管、数据策展4数据监护DATA CURATION 4数据监护DATA CURATION国外现状案例国外图书馆已充分意识到数据监护和大数据带来的机遇和挑战，并设法将

15、图书馆服务边界拓展到科学研究和学术交流的新阶段数据阶段；数据监护服务逐渐成为国外图书馆界科研及实践的新热点，其中以美国高校图书馆表现最为活跃。开始设置专门的数据监护岗位，较典型的如：数据专家（Data Scientist）、数据研究专家（Data Research Scientist）、数据服务馆员（Data Services Librarian）、数据人文专家（Data Humanist）等，将图书馆的服务边界加以拓展。美国国家科学基金会NSF （National Science Foundation）在2007年启动“DataNet”计划，预算花1亿美元，明确以图书馆为主体，用五年时间资助

16、5项数据监护重点研究课题，以推动数据监护工作。目前已有两个获全额资助的研究项目，一个由新墨西哥大学图书馆主持，另一个由约翰霍普金斯大学图书馆主持。实际上参与这两个项目的高校图书馆多达10余所，各图书馆均有长期承担数据监护的意向。美国制定了明确的数据监护发展策略，即：数据监护要能实现经济上的可持续发展。NSF的“DataNet”计划就明确要求被资助者提出经济模式，在5年资助期满后具备自生存能力。它实际要求的是“图书馆 - 学科”共建模式，其成员不仅要有图书馆员及信息技术员，还必须有相关学科的学者参与，通过为科研人员提供服务，吸引其加入该活动并注资。 4数据监护DATA CURATION1423完

17、成“数据监护员”角色转变。接纳自己在数据处理上的一个新的角色，即把大数据集变得更加有用、可视化程度更高和更易获取。医院图书馆员应学习数据监护抢占数据监护服务阵地。医院每天产生大量的管理、科研和临床数据。图书馆应当立即对可获得的数据展开收集工作，探索数据监护的一系列活动。加强与其它科室的合作。向本院医护管理人员宣传数据监护的知识和作用，共同开发可用的数据，并能够对医院、各专科科室的大数据集的存储和获取给与指导性建议。加快元数据建设。元数据价值尚待挖掘，应帮助研究人员通过新型分析方法，从全新的视角来观察数据，发掘出原本信息以外的价值。 5馆员知识与技能SKILLS AND KNOWLEDGEXX省

18、医院协会医院图书情报管理专业委员会2015年学术年会8月2022日XXXX 5馆员知识与技能SKILLS AND KNOWLEDGE程序Programming数据库工程Database统计Statistics可视化Visualization熟悉数据转换技术及软件的工作方法(程序员)清楚描述性统计汇总和数字数据基本测试哪些情况是正确运用，哪些情况是不恰当运用(统计员)明白信息检索工具的理论基础(数据库工程师)认识有效数据呈现的特征(视图设计师) 5馆员知识与技能SKILLS AND KNOWLEDGE人才储备丰富人才储备，让医院图书馆在大数据时代发挥应有的功能。方法一方法二所有馆员都学习相应的基础知识，并针对各馆员的专长加以培训，使其更符合大数据的要求。培训对专业性较强的技能要求，可以考虑直接引进具备该项知识和技能的人员加入。引进提升馆员在理解读者的信息需求到完成数据监护中间，还有很多高深的知识和复杂的技术等待医院图书馆员去学习和掌握。 6图书馆未来发展FUTURE DEVELOPMENT 管理人员和馆员在大数据时代为图书馆思考:利用大数据工具，本馆可以