Genemapper微卫星分析中文操作指南

1、Genemapper微卫星剖析中文操作指南Genemapper微卫星剖析中文操作指南16/16Genemapper微卫星剖析中文操作指南GeneMapper软件微卫星剖析中文简单操作手册微卫星剖析流程：设定微卫星剖析方法：登录软件创办剖析所需kit、panel和marker等参数；创办新文件，导入数据；设置剖析参数；执行初始剖析；剖析并检查结果：编写剖析方法；剖析数据；查察结果；打印并导出数据（可选）：打印结果；导出结果。软件术语介绍：术语定义Analysis软件中剖析样品所使用的特定设置；用于计算片段大小和基因Parameters型，这些特定设置包括和analysismethod,sizes

2、tandardpanelbin在marker内设定等位基因的片段大小和颜色binset等位基因特定实验条件下一组binmarker微卫星标记，经过位点名称、片段大小、荧光标记和重复长度进行设定panelMarker组合kitpanel组合设定微卫星剖析方法：登录GeneMapper软件：选择开始-AllPrograms-AppliedBiosystems-GeneMapper-GeneMapper；或双击桌面快捷方式打开软件；登录GeneMapper软件：用户名默认为gm，在Passwprd中输入密码，点击OK进入GeneMapper软件创办剖析所需kit、panel和marker等参数:点击

3、软件上方工具栏Tools，选择PanelManager；在PanelManager对话框中，选中1PanelManager，点击2新建Kit；于NewKit对话框中依次输入Kit名称，Kit种类，并点击OK保存设置；在PanelManager对话框中，选中1STRKIT，点击2新建Panel；3中输入Panel名称；选中1STRpanel，点击2新建Marker，在3地址依次输入MarkerName(Marker名称)，DyeColor(荧光标记种类)，MinSize，MaxSize片(段最小值和最大值)，MarkerRepeat(重复次数)；重复步骤，完成所有Marker设置，点击OK保存；

4、创办新文件，导入数据：3.1点击1新建文件夹，在2ProjectType中文件夹种类选择Microsatellite，点击OK；导入数据：点击1AddSamplesToProject增加数据，在弹出的对话框中选择待剖析数据，经过3AddToList增加到右边的面板中，点击4Add完成数据增加；设置剖析参数：完成数据增加后，在1地址，AnalysisMethod中选择建剖析方法；在弹出的对话框中选择剖析种类确认；NewAnalysisMethod新2Microsatellite，点击OK设置剖析参数：在AnalysisMethodEditor中，点击1General，填写2Name（剖析方法名称

5、）；此后点击3Allele，在将4BinSet选择none；其他参数为软件默认，不需要更正；点击OK确认；选定好从前设定的剖析方法，在后续的栏目中设定Panel和SizeStandard（分子量内标）；完成剖析参数设定后，选中AnalysisMethod，Panel和SizeStandard栏目，点击1File，选择2FillDown；此时，AnalysisMethod，Panel和SizeStandard栏目会使用从前选定的剖析参数；也可以使用鼠标分别选择；保存剖析文件：点击File，选择SaveProject，输入文件夹名称：执行初始剖析：点击剖析按钮1，剖析数据：在1Genotypes中

6、查察初步剖析结果，或经过2DisplayPlots选项查察样品分型图：在样品分型图界面中，PlotSetting选择MicrosatelliteDefault；经过软件上方的快捷按钮编写数据显示方式：6创办BinSet：打开ToolsPanelManager，选中1STRKit，点击2新建BinSet，在弹出的NewBinSet对话框3中输入BinSet名称：增加参照数据：保证1BinSet已选择新建的BinSet，选中2STRPanel，此时会显示出从前新建的每个Marker，点击3AddReferenceData增加参照数据；在AddMicrosatelliteReferenceData对

7、话框中，选择1参照数据，经过2AddToList增加至右边的面板中，点击3Add，完成增加：生成BinSet：完成参照数据增加后，点击数，点击2OK，自动生成BinSet：1AutoBin，此后使用软件默认参编写BinSet：分别选中每个Marker1查察其对应的Bin，选中2Bin，右键进行Bin的编写也许删除，也可经过软件3处的快捷图标进行Bin的编写；完成后点击OK生成BinSet；剖析并检查结果：编写剖析方法：点击软件上方快捷图标1AnalysisMethodEditor，将Allele中的2BinSet更正为从前新建的BinSet，其他参数保持默认，点击OK；点击剖析按钮再次剖析数据，经过Genotypes查察分型结果，或选中数据经过DisplayPlots查察样品分型图；选中需要查察的数据，否则无法查察SamplesPlot：查察样品分型图：打印并导出数据（可选）：在View中选择不同样样的界面（Samples，Genoty