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文档简介
YY/T1731-2020人单核苷酸多态性(SNP)检测试剂盒标准张利刚2020-09-29YY/T1731-2020主要内容项目背景修订过程主要技术指标YY/T1731-2020项目背景近年来在临床治疗中,病人对相同的药物反应不完全相同,研究表明,这些差异是由于药物相关基因变异,即单核苷酸多态性(SNP)引起的。由于SNP改变了个体对药物的代谢及药物结合的受体蛋白的特性,因而决定某种药物是否对个体有效,是否会引起不良反应,这对于临床医生按个体化用药具有重要的意义。YY/T1731-2020药物对筛选的患者达最佳疗效-
必须依靠分子检测指导用药基因基因位点蛋白药物药物CYP2C9基因C-A氨基酸Ile被Leu取代是否适合药物华法林VKORC1基因ALDH2基因CYP2C19基因MTHFR基因G-AG-AG-A华法林药物量维生素K环氧化物还原酶氨基酸Glu被Lys硝酸甘油细胞色素P450酶类氯吡格雷、伏立康唑c.677C-Tc.1298A>C叶酸代谢过程中的关键酶/到目前为止,不完全统计,目前获证的产品有60多个,涉及十多个厂商。市面上检测的试剂盒主要是ALDH2、CYP2C19、CYP2C9
等相关基因,涉及的方法主要是荧光PCR法,还有基因芯片法,基因芯片法等。方法学产品数目CYP2C19基因、VKORC1基因、ALDH2基因荧光PCR探针法38CYP2C19基因、VKORC1基因、ALDH2基因/MTHFR基因荧光PCR熔融曲线法PCR-基因芯法98IL28B基因、CYP2C19基因、VKORC1基因、ALDH2基因CYP2C19基因、ALDH2基因、MTHFR基因PCR-电泳521PCR-金磁微粒层析法测序法(一代)MTHFRC677T
基因CYP2C19基因YY/T1731-2020修订过程•
项目来源:SAC/TC136,CFDA医疗器械标准管理中心的国械标管【2017】94号文,编号I2017004-T-BJ
;•
起草单位:北京市医疗器械检验所;
中国食品药品检定研究院;
中山大学达安基因股份有限公司;
山东省医疗器械产品质量检验中心YY/T1731-2020修订过程会议时间主要审查内容
形成文件标准启动会
2017年4月
/标准草案讨论稿第一次审查会
2017年6月标准草案第二次审查会
2017年9月
征求意见稿送审稿•
四家企业生产商参与标准验证•
标准号YY/T1731-2020•
2020年06月30日发布,2021年06月1日实施。YY/T1731-2020主要技术指标范围本标准适用于人基因单核苷酸多态性(SNP)检测试剂(盒)的质量控制。试剂盒方法学包含实时荧光PCR法、基因芯片法、PCR电泳法、PCR毛细电泳分析法、PCR高分辨熔解曲线法、流式荧光杂交法、飞行时间质谱法、焦磷酸测序法、Sanger测序法等。术语和定义单核苷酸多态性
SingleNucleotidePolymorphisms,SNP在正常个体基因组水平上单个碱基序列的差异,包括碱基的转换、颠换。YY/T1731-2020主要技术指标4.1
外观试剂盒各组分应齐全、完整,液体无渗漏,标志和标签应清晰。方法:在自然光下以正常视力或矫正视力目视检查,应符合4.1的要求。YY/T1731-2020主要技术指标4.2参考品符合性检测试剂盒范围内国家参考品和/或经标化的企业参考品,检测结果应与已知基因型别相符合。参考品的设置应遵循以下原则:•
试剂盒范围内可检测的所有的基因型;•
参考品中常见基因型别应采用临床样本或细胞系提取的基因组DNA;•
所使用的参考品组成中,所有基因型参考品的基质应与实际检测样本基质相同或相近。方法:使用国家参考品和/或企业参考品加入检测体系中检测一次,检测结果应符合4.2的要求。YY/T1731-2020主要技术指标4.3分析特异性检测特异性国家参考品和/或经标化的企业参考品,检测结果应为阴性。分析特异性参考品的设置应遵循以下原则:•
应包含一定数量的非人类基因组样本:常见的微生物样本;•
应包含一定数量与目标基因密切相关的、试剂盒设计范围外的基因型或基因突变样本。方法:使用特异性国家参考品和/或企业参考品加入检测体系中检测一次,检测结果应符合4.3的要求YY/T1731-2020主要技术指标4.4检测限检测试剂盒范围内国家参考品和/或经标化的企业参考品,检测结果应与已知基因型别相符合。检测限参考品的设置应遵循以下原则:•
检测限参考品应包括试剂盒检测范围内所有的基因型;•
制造商应规定最低检测量;•
检测限参考品中常见基因型别应采用临床样本或细胞系提取的基因组DNA;•
所使用的参考品组成中,所有基因型参考品的基质应与实际检测样本基质相同或相近。•
注:最低检测量指反应体系中加入的DNA总量。YY/T1731-2020主要技术指标4.4检测限方法:使用检测限国家参考品和/或企业参考品加入检测体系中至少检测三次,检测结果应符合4.4的要求。YY/T1731-2020主要技术指标4.5重复性(精密度)•
4.5.1采用荧光PCR法原理且通过Ct值进行判读的试剂盒,检测试剂盒范围内国家参考品和/或经标化的企业参考品,检测结果应一致且与已知基因型别相符合且Ct值的变异系数(CV,%)不大于5.0%。•
4.5.2采用基因芯片法、PCR电泳法、PCR毛细电泳分析法、PCR高分辨熔解曲线法、流式荧光杂交法、飞行时间质谱法等试剂盒以及采用荧光PCR法原理但不直接采用Ct值进行结果解释的试剂盒,检测试剂盒范围内国家参考品和/或经标化的企业参考品,检测结果应一致且与已
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