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文档简介
动物生物化学实验讲义东北农业大学实验项目1 γ–球蛋白的分离实验项目2 γ–球蛋白含量测定(光度分析法实验项目3 凝胶柱层析法(γ–球蛋白纯化)实验项目4 SDS–聚丙烯酰胺凝胶电泳实验项目5 动物组织中DNA的制备实验项目6 多聚酶链反应扩增反应实验项目7 琼脂糖凝胶电泳分离DNA实验项目8 转氨酶GPT活性的测实验项目9 氨基酸薄层层析实验项目10 琥珀酸脱氢酶及丙二酸的抑制作用实验一 γ–球蛋白的分离【原理】中性盐(如硫酸铵、硫酸钠、氯化钠、硫酸镁等)β球蛋白分离,最后用透析法脱盐,即可得到纯度较高的γ–球蛋白。【试剂和器材】一试剂pH7.0.01mol/L磷酸盐缓冲液生理盐水(简称PB:取0.2mol/LN2HP4溶液36.0ml,0.2mol/LNaH2PO4溶液14.0ml混合,加NaCl8.5克,用蒸馏水稀释至1000ml。0.2mol/LNa2HPO4溶液:取28.4gNa2HPO4或71.6gNa2HPO4·12H2O用蒸馏水溶解稀释至1000ml。0.2mol/LNaH2PO4溶液:取24gNaH2PO4用蒸馏水溶解稀释至1000ml。24pH7.2饱和硫酸铵溶液:取化学纯24
800g,加蒸馏水1000ml,不断搅拌下加热至50~60℃,并保持数分钟,趁热过滤,滤液在室温中过夜,有结晶析出,即达到100%饱和度,使用时用浓氨水将饱和硫酸铵溶液调pH到7.2。纳氏试剂:500ml15011050克及蒸馏水l00ml,用力振荡7~152000ml量2000ml刻度后,混匀即成。150ml150ml混匀即成,如显混浊,可静置数日后取上清液使用。此试剂之酸碱度极为重要。用lmol/L盐酸溶液20ml滴定时,需此试剂11~11.5ml纠正其酸碱度。4.双缩脲试剂:溶解1.50 克硫酸铜(CuSO4·5H2O)和6.0 克酒石酸钾钠(NaKC4H406·4H20)500ml10%300ml,用蒸馏1升,贮存在内壁涂以石蜡的瓶中,可长期储存。5.浓蔗糖液:蔗糖的饱和溶液。6.10%氢氧化钠:取10克氢氧化钠溶解于蒸馏水中,定容至100ml。二器材透析袋。磁力搅拌器。三材料兔血清【操作】一盐析12mlPBS稀释血清,摇匀后,逐步加入饱和硫酸铵溶液2m(相当于33饱和度硫酸铵,边加边摇。然后静止半小时,再离心3000r/min)20分钟,倾去上清液(要紧含白蛋白。用lmlPBS将离心管底部的沉淀搅拌溶解,再逐滴加饱和硫酸铵溶液0.5m1放置半小时,离心3000r/mi)20分钟,倾去上清液(要紧含α、β球蛋白,其沉淀即为初步纯化的γ–球蛋白。如要得到更纯的γ–球蛋白,可重复盐析过程1~2次。把提取的γ–1mlPBS二透析脱盐与浓缩将盐析得到的γ–100ml烧杯中,使透析袋下半部浸入水中。将烧杯放在磁力搅拌器上搅拌1(1~2次用纳氏试剂检查袋内外液体中的铵离子N4+,观看透析法的脱盐成效。脱盐后得到的γ–球蛋白溶液可连续浓缩,即用透析袋装好悬于盛有10ml1小时以上,观看袋内液体体积的变化。实验二γ–球蛋白含量测定(光度分析法)【原理】双缩脲法是蛋白质光度分析法的一种方法。因蛋白质含有两个以上的肽键,因此有双缩脲反应。在碱性溶液中蛋白质与Cu2+形540~560nm测定,即能够通过标准蛋白质的标准曲线求出未知样品的蛋白质浓度。【试剂和器材】一试剂1.标准酪蛋白溶液5mg/m:用0.05mol/LNaOH5g酪蛋白加NaOH1000ml。2.双缩脲试剂:溶解1.5g 硫酸铜(CuSO4· 5H2O)和6.0 g 酒石酸钾钠(NaKC4H4O6·4H2O)500ml10%NaOH300ml,用蒸馏1升,贮存在内壁涂有石蜡的瓶中,可长期储存。3.未知蛋白质溶液:γ–球蛋白溶液。二器材分光光度计。【操作】6支试管按下表操作。试 剂 1 2 3 4 5 6标准酪蛋白溶液(ml)00.40.81.21.62.0蒸馏水 (ml)21.61.20.80.40双缩脲试剂 (ml)444444室温下(15~25℃)30540nm酪蛋白含量为横坐标用坐标纸绘制标准曲线。γ–球蛋白溶液浓度的测定:取3支试管按下表操作。试 剂 空白管 测定1 测定2γ–球蛋白溶液(ml)-11蒸馏水 (ml)211双缩脲试剂 (ml)444摇匀,放置30分钟,540nm测定读取光密度。【实验结果】毫升蛋白质溶液的蛋白质含量。实验三凝胶柱层析法(γ–球蛋白纯化)【原理】gelchromatograph(gelfiltratiosievefiltratio、凝胶渗透层析gelosmoticchromatograph)等。它是20世纪60(凝胶分子筛的特点,将被分离物质各成分按分子大小分开,达到分离的方法。凝胶是由胶体粒子构成的立体网状结构并随着流淌相的移动沿凝胶网眼孔道移动阻力小、流速快,比小分子先流出层析柱;小分子最后流出用于凝胶层析的凝胶均为人工合成的产品,要紧有交联葡聚糖(Sephade琼脂糖(商品名为Sepharos、聚丙烯酰胺凝胶(商品名为Bi–ge)及具有一定网眼的细玻璃珠等和这些凝胶的衍生物。13–环氧丙烷(CH2交连而成。环氧丙烷引入丙三醇基将链状的多聚葡萄糖单位交联起来,凝\/O 胶网眼的大小由多聚葡萄糖的分子和环氧丙烷的比例(交联度)来操纵。葡聚糖具有较强的亲水性,在水和电解质溶液中膨胀成为柔软而富于弹性的凝胶,其G–10G–200G后面的数字是其吸水量(/克干胶)10所得的值。如G–252.5ml/g干胶。市售有G–10G–25G–50、G–75、G–100、G–150、G–200等型号。G–75以上的胶因吸水量大,膨胀后形状柔软易变,统称为软胶。G–75以下的称为硬胶。选择使用。一样说SephadexG–l0~15通常用于分离肽及“脱盐SephadexG–75~200用以分离各类蛋白质。0.08的NaCl等中性盐缓冲液作洗脱液。本实验采纳凝胶过滤法纯化γ–球蛋白,除去其中的硫酸铵,以达到纯化目的。【试剂和器材】一试剂实验二提取出的γ–球蛋白磷酸盐缓冲液pH6.0.0175mo:取0.2mol/LNaHPO4溶液NaH2PO456.6ml1000ml。Sephadex4.奈氏试剂5.20%磺酰水扬酸(pH0.2mol/L/LNaH2PO4溶液19.4ml混合,加NaCl8.5克,用蒸馏水稀释至1000ml。二器材1.lcm×20cm层析柱2.洗脱瓶。部分收集器恒流泵监测仪【操作】凝胶处理:溶胀(水化必须水化溶胀。商品琼脂糖凝胶呈悬浮胶体可直截了当用,玻璃球不用溶胀。凝胶溶胀有两种方法:一种是将所需葡聚糖凝胶浸入蒸馏水中于室温下溶胀;另一种是置于沸水浴中溶胀。各种葡聚糖在上述溶胀方法中所需的时刻见实验原理部分。够杀灭凝胶中污染的细菌并排出网眼。在装柱后产生堵塞现象,降低流速。洗后将凝胶浸泡在洗脱液中待用。一支层析柱中应该装入的干胶量能够用下法推算:称取1g所需型号的葡聚糖干胶,放在5ml量筒中,用室温溶胀的方法充分溶胀,观看溶胀后凝胶的体积。然后在层析柱中加水到1g分离成效。柱的内径不宜较细,直径1cm以下的柱易发生“管壁效应组分移动较快,管壁周围的则移动较慢,造成分离纷乱。因此柱的内径也不宜过粗。凝胶层析中,在把小分子物质(mw<1500(mw<20分离时,层析柱的体积一样约为样品的4~10至G–2525~100凝胶柱。当到达所需凝胶柱高度时(17c凝3~5cm,并覆盖一层溶液。毛病的部分再让凝胶重新沉降或连续加入搅匀的凝胶悬液。若在灌好胶后才发觉“纹路C000(Bluedextran–2000)通过凝胶柱,观看形成的色斑带是否整齐,若斑带歪斜,应该重新装柱,直至达到要求。会产生大量的气泡阻碍层析。在整个灌注凝胶的过程及使用中,凝胶柱面上一定要覆盖着一层溶液,以免进入空气。若进空气再加入溶液时,凝胶柱中易形成气泡。平稳装好的凝胶柱,使用前应该用相当于柱床体积两倍或更多的洗脱液(pH7.0,0.01mol磷酸盐缓冲液溶液)流过凝胶柱,以压实凝胶,称为平稳。上样将样品加入到凝胶柱中,预备层析的过程称上样。上样时,应该注意上样量10%~25%1%~5%2倍以上,不然洗脱峰会变宽和歪斜。离0.08,以免产生特异性吸附。球蛋白为样品,用皮头洗脱液,接上洗脱瓶预备洗脱。洗脱用规定的溶液(本实验用pH磷酸盐缓冲液)流过样品,使分子(洗脱瓶洗脱过程中保持恒定的流速是柱层析获得良好分离成效的重要条件(或接触空气的两个液面间的高差置等,因此静水压又称操作压。(因为当洗脱瓶液体流出时,瓶顶形成真空,空气只从玻璃管中进入,玻管下口即为接触空气点,因此在凝胶层析中,不仅要保持静水压的恒定,还要保持适当的静水压。这是因为G–75以上的软胶胶体柔软易变形本实验中使用的G–25属于硬胶,硬胶不易变形,受静水压的阻碍较小,实验过程中的流速可用恒压瓶下口橡皮管上的螺旋夹操纵在0.5ml/min左右,随着洗脱液的流出,样品逐步被分开。用试管收集洗脱液,按顺序每管收集2ml。1滴放在黑色比色板孔中(按编号顺序,再分别加入1滴201滴于白色比1绘图。可获具有一条洗脱峰的曲线,称为洗脱曲线,用以表示被分离物质流出的状态。因此使用一段时刻后应倒出来,清洗后重新装柱。凝胶临时不使用可浸泡在溶液中,存放在4℃冰箱中。若放在室温储存应加入0.02%叠氮钠或0.01%乙酸汞等防腐剂,以防发霉。用时以水洗去防腐剂即可使用。凝胶长30℃逐步烘干。实验四SDS–聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS–PAGE)【原理】带电的颗粒(蛋白质)在电场的作用下,移动的速度是:v= Vqd6πrη依照此公式,在同一电场强度(v/d)和电极缓冲液(η)条件下,带电的各种蛋白质成分,移动的速度决定于,各蛋白质的带电量)和自身分子的大小6。若使各蛋白质成分的带电量分子的大小π1967年Shapiro二烷基硫酸钠sodiumdodecylsulfatSD则要紧取决于它的自身分子量的大小。加入SDS之因此能获得如此的效应SDS使蛋白质变性成为松散的线状。同时大多数蛋白质的每个氨基酸能与固定量的SDS相结合溶液中的SDS3SDS按11.W/)的,形成SD–蛋白质复合物。其结果)由于SDS解离后带有专门强的负电荷,致使SDS–蛋白质复合物都带上了相同密度的负电荷,其电量大大超过了蛋白质分子原有(2)SDS与蛋白质结合后,改变了蛋白质原有构象,使所有蛋白质水溶液中的形状都近似椭圆柱形。不同SDS–蛋白质复合物的短轴直径都一样,约为18nm,而长轴则与蛋白质分子的大小成正比。如此SDS–蛋白质复合物在凝胶电泳中的迁移率,就不再受蛋白质原有电荷及其形状的阻碍了,而只取决于椭圆柱长度,即蛋白质分子的大小。需要注意的是:为使SDS与蛋白质能充分的按比例结合,必须将蛋白质间的二硫键完全打开。因此,在用SDS处理蛋白质样品时,必须同时用巯基乙醇处理。巯基乙醇是一种蛋白质与SDSSDS定量地与蛋白SDS,因此称为SDS–聚丙烯酰胺凝胶电泳。1969WeberOsborn40迁移率与其分子量的对数呈直线关系:lgMω=K1–bmMω表示分子量,m表示迁移率,b表示斜率,K1表示常数即用此法能够测得蛋白质的分子量12000~200000以内,重复性高。此方法时进行SDS–聚丙烯酰胺凝胶电泳。然后测出各个蛋白质成分的迁移率,再以标准蛋白质一般坐标纸作图,则纵坐标应取蛋白质分子量的对数值。被测蛋白质的分子量只要测得迁移率即可从标准曲线上求出。WeberSDS–15%10000~50000的凝胶适用于分子量在10000~70000范畴的蛋白质;5%的凝胶适用于分子量在25000~2000000范畴的蛋白质;3.33%的凝胶其胶孔径更大,适用于分子量更高的蛋白质的测定。使用时应依照待测蛋白质样品的分子量范畴选择合适的凝胶浓度,以求获得好的结果。实验中使用的标准蛋白质Mar的,应使其待测样品的分子量恰好在标准蛋白质的范畴之内。、结构蛋白(如胶原蛋白)SDS相结合,因而测定结果偏差较大。另外,由亚基(如血红蛋白)或由于两条以上肽链(如–胰凝乳蛋白酶)组成的蛋白质,在SDS些蛋白质的亚基或单条肽链的分子量,而不是整个蛋白质的分子量。上述这些“专门10000~70000范畴的标准蛋白质,使用10%其配制方法要紧参照U.K.Laemmli(1970)的方法,以板状、不连续电泳系统进行电泳。【试剂和器材】一试剂标准蛋白质目前国内外均有厂商生产低分子量及高分子量标准蛋白质成套试剂盒,用于SDS–PAGE盒以及自己配制的低分子量或高分子量标准蛋白质混合试剂。连续体系SDS–PAGE有关试剂:(10.2mol/LPH7.20.2mol/LN2HP4溶液720m0.2mol/LNaPO4溶液280ml混合。(2)样品溶解液:0.01mol/LPH7.21%SDS1%10%甘油或40%0.02%如下:SDS巯基乙醇甘油溴酚蓝0.2mol/L磷酸盐缓冲液加重蒸水至最后总体积100mg0.1ml 1ml2mg 0.5ml 10ml(330丙烯酰胺(称为凝胶贮液:丙烯酰胺(简称Ac30g,甲叉双丙烯酰胺(Bis)0.8g100ml2~3月。(4)0.2g0.2mol/LPH7.2。4前稍加温使SDS溶解。(5)1%TEMEN,–四甲基乙二胺:取TEMED1m,加重蒸水至4℃储存。(610过硫酸铵APAP10,加重蒸水至100m,每周新配,置棕色瓶3、0.1mol/LPH7.2磷酸盐缓冲液。4.1%琼脂:琼脂1g,用上述缓冲液溶解至100ml4℃储存。固定液:甲醇:冰乙酸:水为1:2:7染色液:考马斯亮蓝R–250 0.25g加上述固定液500ml,过滤后应用。脱色液:冰乙酸:甲醇:水为2:9:9二器材夹心式垂直板电泳槽。电泳仪。三材料1.纯化后的γ–球蛋白。【操作】(一)安装夹心式垂直板电泳槽(二)配胶及凝胶板的制备配胶:分离胶(浓度为15%)水 4.6ml凝胶贮液 10ml1.5mol/LTris-HClpH8.8 5.0ml10%SDS 0.2ml10%过硫酸铵 0.2mlTEMED 8uL总计 20ml凝胶板的制备:用细长头滴管将胶混合液加到两块玻璃板的缝隙内直至距离短玻璃板上缘0.5cm馏水,但不能超过短板,以防凝胶被稀释。大约30min20~30min后,倒(三)样品的处理与加样样品的处理0.5~1mg/ml上盖子(不要塞紧以免加热时迸出,在10℃沸水浴中保温3mi,取出冷却后加样。如处201003rnin,以除去亚稳态聚合。加样即2~10ug蛋白加样体积可达100uL。如样品槽中有气泡,可用注射器针头挑除。加样时,将微量注射器的(四)电泳分离胶聚合后是否进行预电泳则应依照需要而定,SDS连续系统预电泳采纳30mA,60~120min。0.1%SDSPH7.20.1mol/L磷酸盐缓冲液,连接电泳仪与电泳槽,上槽接20m待1~1.5cm5~6h。(五)凝胶板剥离与固定(六)染色与脱色将染色液倒入培养皿中,染色1h左右,用蒸馏水漂洗数次,再用脱色液脱色,直到蛋白质区带清晰,即可运算相对迁移率。(七)绘制标准曲线【注意事项】SDS纯度:在SDS–PAGE中,需高纯度的SDS,市售化学纯SDS次方可使用。SDS与蛋白的结合量:当SDS1mmol/L1.4gSDS结合才能生成SDS–蛋白复合物。巯基乙醇可使蛋白质间的二硫键还原,使SDS易与蛋白质的浓度至少比蛋白质的量高310最高不超过0.26,以保证在样品溶解液中有较多的SDS单体。在处理蛋白质样品时,每次3~5min,以免有亚稳聚合物存在。凝胶浓度:应依照未知样品的估量分子量,选择凝胶浓度。对样品的要求:应采纳低离子强度的样品。如样品中离子强度高,则应透析或经离子交换除盐。加样时,应保持凹形加样槽胶面平直。加样量以10~15uL为宜,如样品系较稀由于凝胶中含SDS,直截了当制备干板会产生龟裂现象。如需制干板,则用25%丙醇内含7SDS脱尽(约需2~3天,才可按PAGE干板。为方便起见,常采纳照像法,储存结果。实验五动物组织中DNA的制备【原理】DNA是所有生物体的差不多组成物质。真核生物DNA要紧存在于细胞核中。制备DNA时应将细胞核膜打破方能开释出来。DNARNA分别与蛋白质相结合,形成脱氧核糖核蛋白及核糖核蛋白。在DNA已知这两种核蛋白在不同浓度的盐溶液中具有不同的溶解度,如在0.15mol/LNaC1的稀盐溶液中核糖核蛋白的溶解度最大(仅约为在纯水中的1;而lmol/LNaCl的浓盐溶液中,脱氧核糖核蛋白的溶解度增大,至少是在纯水中的2倍,核分离得到的脱氧核糖核蛋白,用十二烷基硫酸钠使蛋白质成分变性,让DNA95%的乙醇即可从除去蛋白质的溶液中把DNA当细胞破裂时,细胞内的脱氧核糖核酸酶(DNase)赶忙开始降解DNA,假如在破裂细胞后不及时采取抑制酶活的措施,最后将会得不到任何DNA。为此,如在本实验中加入EDTA等螯合剂以除DNase必需的M离子,使DNase4℃以下进行,以减少DNaseSDS使所有的蛋白质(包括DNase)变性。因此假如期望获得更大分子的DNA时,则在细胞破裂后,及时加入SDS使蛋白质(DNase)氨基酸,及时阻止DNase的降解作用。DNADNA链的双螺旋结构不宜小角度的折叠,使之DNA分子具有刚性,即分子是僵直的stif将使DNA断裂成碎片。为保证获得大分子DNA,操作时应幸免急裂振摇,或过大的离心力。转移吸取DNA时不可用过细的吸头,不可猛吸猛放,更不能用细的吸头反复吹吸。大分子DNA的水溶液呈黏稠状,能够用玻璃棒缠起来。液体DNA只要防止DNase染和高盐浓度条件下能在液体状态储存;抽干后的固体DNA,性质稳固,可长期储存。生物体内各部位的DNA是相同的,但取材时以含量丰富的部位为主,如动物的肝脏、DNA的含量及纯度可用紫外吸取法、定磷法及化学法等测定。【试剂和器材】一试剂NaCl–0.015mol/LpH7.08.77g钠Na3CH507·22,用约800ml蒸馏水溶解后,调剂pH至7.,最后定容至1000m。NaCl–0.1mol/L溶液:称取8.77g溶于约800ml蒸馏水中,以NaOH调pH至8.0,最后定容至1000ml。十二烷基硫酸钠溶液:称取5gSDS的乙醇中。:=24:1配制。2pH8.0TE0.01mol/LNaOH:120mol/LTris–HCl,lmol/LEDTANa。或取2NaOH0.4g加蒸馏水至1000ml。6.95%(V/V)乙醇1000ml。7.75%(V/V)乙醇1000ml。二器材组织捣碎机。玻璃匀浆器。三材料1.冰、粗盐。2.鸡肝脏【操作】(其他动物肝脏也能够24h糖原的干扰。用烧杯(500m1)1/320g食盐,制成冰盐水。1g浸入预先在冰盐0.15mol/LNaCl–0.015mol/L量溶液反复洗涤几次,直至组织块无血为止。将洗净的组织剪成碎块。先加入2m10.15mol/LNaCl–0.015mol/L柠檬酸钠溶液,放在组织捣碎机中迅速捣成匀浆,再放入玻璃匀浆器中匀浆2~30.15mol/LNaCl–0.015mol/L。匀浆液在常温6000r/min离心15mi4倍体积冷的0.15mol/LNaCl–0.015mol/L2~3尽量洗去可溶的部分(?。最后弃去上清,留沉淀。将沉淀物悬浮于5倍体积的mol/Lmol/L 溶液中搅匀,而后边搅拌边慢慢滴加5%SDS溶液,直至SDS的最终浓度达1%为止(应加多少毫?现在溶液变得十分黏稠若不黏稠应重做然后加入固体NaCl使最终浓度达lmol/。连续搅拌30~45min,以确保NaCl全部溶解,现在可见溶液由稠变稀薄。7.将上述混合溶液倒于一个EP管中,加入等体积的氯仿–异戊醇,振荡10min。在室温3000r/min离心10mi(,现在可见离心液分为3层:上层为水溶液,中层为变性蛋白块,下层为氯仿–异戊醇。小心吸取上层水相,记录体积,放入EP2–3净蛋白质。8.最后1次离心后,小心吸取上层溶液(不要吸取下层氯仿,放入干燥EP管中,加入2倍体积预冷的95%20min,10000r/min按200μg/ml的浓度溶于0.01NaOH溶液或pH8.0TE缓冲液中。实验六 多聚酶链反应【原理】通常的DNA胞后进行扩增,再用同位素探针进行选择。这种方法,需通过DNA内切、连接、转化和培养等有关过程,操作复杂,一样需数周时刻才能完成,而PCR基因扩增法只需几小时,就0.1DNA中仅含数个拷贝的摸板序列,因此,这种基因扩增法又称无细胞分子克隆法。PCR基因扩增是一种特定区段DNAPCR扩增法的DNA复制,必须有DNADNADNA引物及四种dNTP。如图16-1DNA中A-B区间的DNAB扩增DNAA和B片段的DNA序列是已知的,这是PCR扩增的必要条件,但A-BA段和B段序列的长度15-20个碱基,据此可用DNA合成仪人工合成与、B对应互补的二个引物A’和BPCR扩增系统中的模板DNA(55-3℃,引物退火,与互补的模板DNA结合,形成局部的双链,这是DNA复制的固定起点,即延伸的固定起点。如图16-1和AB’相结合,退火的时刻为1~2PCR扩增过程中,链的延伸具有方向性,以引物为固定起点,延伸才能进行。目前使用的DNADNA时,在多聚酶的作用下,四种dNTP会迅速以旧链为模板合成新链,其合成方向,若以A’B53PCR扩增片段的长度范畴,从数2kbDNA通过高温变性、低温退火和中温延伸三个时期的循环过程。每循环一DNA的拷贝数加倍,第一次循环由一条模板双链DNA变成二条;第二次循环,4条;第三次循环,就变成8条……,以几何级数扩增下去,一样扩增循环是30-35次,最后形成特定的DNAPCRDNA特定区段,是由人工合成的二条引物决定的,这是PCR扩增的关键。【试剂和器材】一试剂TaqDNA多聚酶在PCR100μlDNA1–2.5单位.由于DNA的不同和三磷酸脱氧核苷酸dNTP用NaOH(pH7.10mmol/2℃dNTP20–200μmol/L之间,这四种的dNTPPCR反应中,使用低dNTPdNTP浓度是依照靶序列的长度和组100μ1dNTP20μmol/L,差不多能满足合2.6μgDNA10pmol400bp序列。使用低dNTP浓度,能够高灵敏扩增ras变的等位基因。引物0.1~0.5μmol/L之间。引物的浓度偏高,会引起错配和非特异性产引物及dNTP,结果是特异性产物的量降低。15–30个核苷酸,组成中含有45–55%的G+C,运算的Tm值与使用的引物对应一致。为此,可使用拇指规则运算AGC的温度校正系数。应用上:期Tm55–803’末端互补,以生成引物的二聚体;应幸免在G+C遵循的原则。镁离子选择合适的镁离子浓度是专门重要的。其浓度可阻碍到引物的退火,模板和PCR中间产PCR反应系统中,0.5–2.5mmol/LdNTP备液中有其他螯合物或DNA其他反应组成物在PCR中使用10–50mmol/LTris–HCl(pH8.3–8.8,20℃)缓冲液,双极化离子缓冲液。KClKCl50mmol/LNaCl50mmol/L,而KCl50mmol/L时,将会抑制TaqDNA多聚酶的活性。100μg/ml,有些操作中也可不加蛋白,亦能获得良好的结果。二器材PCR仪EP管【操作】一PCR的差不多操作PCR两个合成DNA的引物、微量的模板DNA及适量的水。然后将离心管放人PCR基因扩增仪内进行扩增。将上述溶液加热,使模板DNA互补退火,形成部分的双链;再将溶液反应温度升dNTPDNA的一3030DNA带。其规范操作由下列三部分组成:1.25μl反应体系的PCR在0.5ml的离心管内,加入如下试剂:DNA模板 引物 两种:上游引物 下游引物 dNTP 四种 Buffer 2.5μLTaqDNA多聚酶 0.2μL蒸馏水 18.3μL总体积 25μ12.PCR三个时期的温度操纵变性温度 95℃ 15秒引物退火 5℃ 30秒新链延伸 72℃ 1.53.循环25次~35次开始时,模板DNA变性时刻要适当延长,最后一次循环的延伸时刻要保持5分钟.反应终止要赶忙冷却到4℃或加入10mmol/LEDTA以终止反应。二PCR反应的差不多条件引物的退火引物退火温度和所需时刻的长短取决于反应体系中的差不多组成Tm5TaqDNA多聚酶的活性温度范畴专门宽,引物延伸将在低温下获得。在典型的引物浓度时(如0.μmol/,退火仅需要数秒即可完成。严格规定退火温度,专门是前几个循环中,会增加扩增的特异性。引物的延伸延伸时刻的长短取决于模板序列的长度、浓度及延伸温度的高低,引物延伸在72℃条件下进行,因为72℃时核苷酸补位的速度为35~100个核苷酸/秒,其速度取决于缓冲液的组成、pH值、盐的浓度和DNA模板的性质。变性时刻和温度模板DNA和PCR产物的变性不充分是PCR双链失。因此,把握好变性时刻和温度是十分重要的。循环次数当其他参数选定之后,循环次数要紧取决于模板DNA【注意事项】PRCDNA了往常扩增的靶序列,将会与样品一样大量的扩增,使试验结果难以区别。设对比试验。即除不加入模板DNA件步同步进行。扩增之后,对比试验不显现扩增电泳带,说明PCR操作过程中没有受到污染。假如对比试验显现扩增电泳带,则说明PCR是必要的。PCR扩增仪应与PCR染时,则PCR作器具应尽可能放在专用柜内。PCR在无PCR幸免再次分装造成污染。PCRPCREPTip应用新品。移液时应慢吸慢吹出,不能过快。1.应细心操作。离心管开盖或上盖时都要专门小心,防备溶液雾化或外溅。加液的离(薄膜塑料实验七琼脂糖凝胶电泳分离DNA【原理】DNA分子由于两条链相互配对形成双螺旋结构,随着DNA的比率就会降低,如此,不同长度的DNA片段表现出不同的迁移率,因而可依据DNA分子的大小将它们分开。通过染色和与标准相对分子质量的DNA的对比来进行检测。琼脂糖凝胶电泳的辨论率较聚丙烯酰胺凝胶电泳差一些,但在分离范畴上优于聚丙烯酰胺凝胶电泳,并有便于制备和操作的优点。一样琼脂糖凝胶适用于分离大小在0.2~50kb范畴内的DNA片段。而聚丙烯酰胺凝胶电泳一样适用于分离小片段的DN(500b,在那个范畴内相差仅一个碱基的DNA分子都能获得较中意的分离成效,如在DNA序列测定经常用含变性剂的聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离。用琼脂糖凝胶分离DNADNADNA样本的分离、纯化、鉴定以及相对分子质量测定常用琼脂糖凝胶电泳。DNA分子在pHDNA分子或片段泳动速率的大小除与DNA(电荷效应DNA分子的大小和空间构象有关(分子筛效应DNADNA与同一相对分子质量的开环或线状DNA的电泳迁移率也明显不同。DNA0.5~1/1g,超薄平板型琼脂糖凝胶所需样品DNA量能够更低。凝胶浓度与被分离DNA样品的相对分子质量成反比关系,一样常用的凝胶浓度为1%~2%分子质量DNA的比较。DNA样品在凝胶中所处的大致位置,但每种DNA样品所处的确切位置需要用溴乙啶(ethidiumbromide,EB)对DNA分子进行染色才能确定。溴乙DNA双螺旋结构的两个碱基之间,与DNA分子形成一种荧光络合物,在紫外光EB的溶DNA浸泡时刻过长容易引起扩散,故可依照被分离DNA分子的大小DNA10ng甚至更少的DNA【试剂和器材】一试剂TBE×l0(0.89mol/Lmol/L硼酸–0.025mol/LEDTA缓冲溶液:取108gTri55g硼酸和9.3gEDT(EDTAN2·20)溶于水,定容至1。10倍。100ml甘油中。3.50%甘油4.0.5mg/L溴乙啶染色液:取5mg溴乙啶,用少量去离子水溶解,定溶至10ml。取1ml稀释至1000ml。5.琼脂糖样品DNA:2.5mgDNA100mlTBE缓冲溶液中。标准相对分子质量DNA二器材电泳槽及胶床电泳仪乳胶管微量进样器【操作】(一)制胶1,加pH=8.3的TBE100ml,于沸水浴中至熔化,制成1%的琼脂糖胶液。此胶液可赶忙使用,或置于冰箱中储存,临用前在沸水浴中熔化即可。采纳垂直柱型电泳时,取制胶用的玻璃管(10cm×0.6cm)用一小段乳胶管套住,并塞以玻璃珠封住管底,向管底滴加250%的甘油。侧放,让凝胶从玻管中滑出,放平,用刀片将凝胶一端切平,留下约9cm长的凝胶柱,并。将凝胶管接到电泳槽上,上、下槽加入TBE电泳缓冲溶液。(二)加样取样品DNA40μL,加10μL溴酚蓝-甘油指示剂,混匀,用微量注射器上样。(三)电泳电泳时操纵电流强度在2~5mA/管范畴内,当溴酚蓝指示剂距管底1cm左右时断电,终止电泳。(四)染色然后慢慢松开上管口,将凝胶放入试管中。0.5mg/L20~30DNA的位置会出现出橙黄色的荧光,可在紫外灯下进行拍照记录。也能够将溴乙啶放入胶中(终质量浓度为0.5mg/,电泳后可在紫外灯下直截了当观看结果。不能直截了当倒入下水道,应进行处理。【实验结果】天然双链DNATriEDTTATri–硼酸TAE缓冲容量较TBETPE低,长时DNATAE体系中辨论率更好一些。电泳中,溴酚蓝和500bp大小的DNA一起移动,这可给泳动最快的DNA一个指征。但在不同浓度的凝胶中,溴酚蓝相对应的DNA片段的大小是不同的。DNA加样量太大;②电压太高;③加样孔破裂;④凝胶中有气泡。【注意事项】AmberliteXAD–16或活性炭可用于净化被EB(溴乙啶)污染的物体表面。截了当倒入下水道,应进行如下处理:方法(1)每100ml溶液中加非离子型多聚吸附剂AmberliteXAD-16.29;12小时,不时摇动;1号滤纸过滤,弃滤液;用塑料袋封装滤纸和Amberlite()每100ml溶液中加入100mg粉状活性炭;1小时,不时摇动;1号滤纸过滤,弃滤液;用塑料袋封装滤纸和活性炭,作为有害废物丢弃。溴乙啶在260实验八转氨酶GPT活性的测定【原理】α–氨基酸的α–氨基与α–酮酸的α–在动物机体中活力最强、分布最广的转氨酶有两种:一种为谷氨酸草酰乙酸转氨酶(glutamic-Oxaloacetate transaminase 简称GOT,另一种为谷氨酸丙酮酸转氨酶glutamic-pyruvic transaminase简称GP反应如下:GPT丙氨酸+α–酮戊二酸 谷氨酸+丙酮酸37℃性。丙酮酸可与2,4显色的深浅在一定范畴内可反映所生成的丙酮酸量多少丙酮酸+2,4–二硝基苯肼 丙酮酸二硝基苯腙(棕红色)本实验用金氏法测定转氨酶的活性单位为:每毫升血清与基质在37601μmol1个单位。【试剂和器材】一试剂1.1/15mol/LpH7.4磷酸盐缓冲溶液:甲液:1/15mol/L磷酸氢二钠溶液:称取磷酸氢二钠(Na2HPO4)9.47g(·12H2O23.87g)溶解于蒸馏水中,定容至1000。mol/L磷酸二氢钾溶液:称取磷酸二氢钾1000。取甲液825ml乙液175ml混合,测其pH为7.4即1/15mol/LpH7.4磷酸盐缓冲液。2.GPT基质液:精确称取a–酮戊二酸29.2mg及DL–丙氨酸1.78g,溶于1/15mol/LpH7.4的磷酸盐缓冲液50ml中溶解,加1mol/LNaOH溶液0.5ml,校正pH至7.4。再以pH7.4的磷酸缓冲液定容至100ml,充分混合,冰冻贮存。3.2,4–二硝基苯肼溶液:精确称取2,4–二硝基苯肼20mg,先溶解于10ml浓盐酸中(可加热助溶,再以蒸馏水稀释至100m(有沉渣可过滤(液配制时开释大量的热和难闻气味配制时应戴上口罩)41ml=μmol丙酮酸即2mmol/22mg于100ml容量瓶中,用1/15mol/LpH7.4磷酸盐缓冲溶液稀释至刻度。此溶液应新奇配制,不能存放。5.0.4mol/L16g氢氧化钠溶解于蒸馏水中,定容至16.1mol/L氢氧化钠溶液:称取4g氢氧化钠溶解于蒸馏水中,定容至100ml。7.。二器材水浴锅。分光光度计。【操作】6支试管按下表操作。试管号试管号123456试剂丙酮酸标准液(ml)00.050.10.150.20.25GPT基质液(ml)0.50.450.40.350.30.25PH7.4磷酸缓冲液(ml)0.10.10.10.10.10.1水浴37℃,10分钟2,4二硝基苯肼溶液0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5保温37℃,20分钟0.4N氢氧化钠溶液(ml)5.05.05.05.05.05.0相当活性(单位数)空白100200300400500混匀后,用分光光度计在520nmGPT2支洁净的试管按下表操作。试剂空白测定血清(ml)0.10.1GPT基质液 (ml) -- 0.5混匀,37分钟GPT基质液(ml)0.5--2,4二硝基苯肼溶液(ml)0.50.5混匀,37分钟mol/L氢氧化钠(ml) 5.0 5.05520nm读取测定管吸
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