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文档简介

8/8多肽的基本常识

保存:ﻫ大多肽在—20℃很稳定,特别是冷冻干燥并保存在干燥器中,在将它们暴露于空气之前,冷冻干燥多肽可以放于室温。这将使湿度影响减少,当无法冷冻干燥时,最好的方法是以小的工作样量存放。ﻫ对于含Cys,Met,TrP的多肽,脱氧缓冲剂对其溶解必不可少,因为这种多肽可易空气氧化,在封瓶前,慢慢流过多肽的氮气或氩气也会降低氧化作用。含Gln或Asn溶解性:

大多肽的首选溶剂是超纯抽气水。稀乙酸或氨水分别对于碱性或酸性多肽的溶解很重要.这些方法不溶的多肽,需要DMF、脲、guanidiniamchloride或acetonitnle来溶解,这些溶剂可能某些实验有副作用。所以我们建议设计多肽时要加注意。

残基Ala,Cys,Ile,Leu,Met,Phe和Val将会增加多肽的溶解难度。

您需要特殊的多肽或任何技术帮助,请随时与我们联系。我们包你完全满意,对于我们不能适当合成的顺序,我们不收费。多肽的保存和操做ﻫﻫ包装1mg或更少的多肽按净重包装,声明的小瓶重不含相关抗离子和水。例如,氨基酸分析决定的肽含量是80%,在1mg样品中,那么瓶中毛重是1.25mg.ﻫ大量的多肽以毛重算。标出的重量含相关抗离子和水,例如,25mg样品中肽百分比为90%,那么,实际肽量为25mg×90%=22。5mgﻫ不要把肽含量和纯度搞混了。肽的纯度可能是100%,而肽含量相关带电基团(如Arg,Lys)的抗离子量和肽亲水性决定。这是合成肽的本身特性。冻干肽的保存ﻫ所有产品应存于冰箱,最好为-20℃肽溶液的保存ﻫ溶液肽远比冻干形式不稳定,溶液应为中性pH(pH5—7),—20℃保存的,为避免样品的反复冻融,最好分成小样存放.多肽的重建和操作ﻫ

多数肽溶于无菌蒸溜水。初次溶解时,要注意使初始浓度比要求浓度大,如果多肽仅有限溶解性,这便允许加入其它溶解剂或缓冲盐.

如果多肽在水中的溶解性有限,有几种选择可帮助溶解:ﻫ对碱性肽用稀乙酸(含Arg,Lys,His)ﻫ酸性肽用稀氨水(含Asp,Glu)

对极疏水的肽用10%有机修饰物(Acetonitnile,Methanol)ﻫ极不溶的肽用DMS0或DMF

guaniclinehydrochloride或脲的浓溶液也很有用,与上述方法合用,超声处理也是溶解多肽的有效手段.多肽的包装

目录中所有多肽除特别说明外,纯度为95~98%。包装为小瓶冻干粉。除特别注明外,多肽净重包装,例如,1mg瓶的β-amyloid1-40精确含1mg的多肽。多肽净重由氨基酸分析得到的肽含量计算。例如,一个多肽样品毛重5mg,氨基酸含量85%,多肽净重为5mg×0.85=4。25mg。请注意,多肽含量不是多肽纯度,与抗离子象乙酸盐和溶剂,特别是水结合量合成多肽的本身特性。多肽纯度可能达100%,但合成品中多肽含量由氨基酸组成,硫水性,和多肽对溶剂和离子的暴露决定,特别是在纯化过程中,无论多肽如何纯,冻干粉多肽含量一般为70-85%。剩余15—30%由其它基本非肽成份构成.多肽应用和保存ﻫ多肽具广泛的溶解性。多肽不溶的主要问题是形成二级结构。除了最太肽外,这点都会发生,在有多重疏水残基的肽中更显著。盐会促进二级结构形成.我们建议先在无菌蒸馏水或去离子中溶解多肽.如需要增加溶解率,可用声处理。溶解仍有问题,加少量稀乙酸(10%)或氨水,会便于溶解。ﻫ要长期保存多肽,最好冷冻干燥,冷干粉可在-20℃或更低存放几年而很少或无降解.溶液中的多肽远不稳定。多肽易受细菌降解,应用无菌纯化水溶解。

含有Met,Cys或Ty固相多肽合成Fmoc方法ﻫﻫ任何多肽链的关键连接为肽键,由一个氨基酸的氨基与另氨基酸的缩合形成。通常一个氨基酸由一个中心碳原子组成,它由四个基它基团包围:氨基、羰基、基和侧链.侧链,称为R,区别不同氨基酸的结构.某些侧链含有干扰肽键形成的功能团。因此侧链功能团的封闭很重要。ﻫ图工显示了Fmoc合成的一般流程,首先第一个Fmoc氨基酸通过一个酸性接头接到不溶载体树脂上,Fmoc去保护通过用碱处理树脂来完成,一般是Poperidine.用预先激活或原位激活连接第二个Fmoc氨基酸.要求总多肽合成后,通过TFA分离来除去树脂和去保护。Fmoc分离固相多肽合成中多肽分离主要用酸解Fmoc法用弱酸,比如TFA或TMSBr.各种添加剂,一般为thiolcompound,水和酚,用来保护多肽的免分离中Carbocation的破坏。下列保护基与TFA和TMSBr分离相合:(略)基于保护基团的类别,必须使用去保护剂的组合。例如,当Boc和tButyl存在时,它们的Carbocation对应物能与Trp,Tyr和Met反应形成tbutyl产物.EDT是极有效的t—butyltrifluoroacetate清除剂,但它不保护Trp。因此,必须加水以控制烷基化。Trp的吲哚环和Tyr的OH极易与Pmc反应.水再次表现出对此反应的抑制。Trt和Mtr基团也有相似情形。较此适当组合清除剂将极大降低副反应。tBoc和CBZ多肽合成tBoc合成法见图3tBoc法的分离法Boc使用强酸,比如HF,TFMSA或TFMoTf。分离加入各种添加剂,一般为thiol化合物以保护多肽免受carbocation破坏。HF分离法(如下)略TFMSOTf分离TMSOTf分离SPPS的一般连接方法适于固相多肽合成的连接反应要求酰化反应,对同源多肽最有效。FmocSPPS连接方法FmocSPPS最常用的连接法是活性酯,要么原位,要预先激活.起初P-nitrophenyl和N-hydnxysuccinimide激活酰是常用形式。甚至,有HOBt时,连接反应也很慢,此外,Fmoc氨基酸ONSu、酯与succinimido-carbonyl—β-alanine-N-Hydroxysuccinidide酯副产物的形成相关。今天最常用的激活酯是Opfp和Odhbt。有HoBt时反应速度极快,副产物少。另一方面,使用象DCC,HBTU,BOP,BOP-Ce,或TBTU活化剂时,能原位进行许多连接反应.Carbondiimide的直接添加是最佳选择.然而,TBTU和HBTU第二个出现,接着BoP,最后是BoP-CE。再者,酯连接发现BoP/HoBt〉Carbodiimido/HoBt>Carbodiimido/ODHbT>Carbodiimide/Opfp.最近以来,HOAt和其对应Uronium盐同类物HATU的发展,发现此HoBt和HBTU具更强催化活性,结果是增加连接产出,缩短连接时间,消旋降低。故此,更适合阻位氨基酸的连接,使得难合成肽的合成更成功。tBocSPPS的普通连接法Carbodiimides,主要是DCC是使用多年的连接试剂,主要的问题是激活和酰化过程中dicyclohexylurea的沉淀。并且伴有许多副反应,已有几种产生可溶脲的Carbodiimide,例如DIC,t-butylmethyl—和t—tatyllethyl-carbodiimide,但是这些试剂未解决副反应的问题。结果生产出了新的激活剂。首先是BOP,随后是PyBrop,PyBOP,HBTU,TBTU和HATU。所有前述试剂都要活性碱基。所有前面讨论的DCC及其衍生物都通过对称酐的形成起作.通常,对称酐反应性极强已广泛用于SPSS,特别t-Boc合成中,对称酐整合入Fmoc氨基酸有一些困难,例如,从N-(3—dimethylaminopropyl)—N?/FONT〉—ethyl-carbodiimides—HG制备的对称酐,由于Z—alkory—5(4H)—oxayolne中间体的形成,在Carbodiimidie和tertianyamines存在时重排,还有,不是所有的Fmoc对称酐都溶于DCM,或者无论所有试剂如何都不溶。对称酐的另一种改变是混合酐,Carboxglic—Carbonate或Carboxglic-phosphinic混合酐,典型的情况且是,由活性isobutyl—或isopropyl—choroformate制备这些,用Nox被阻氨基酸代替phosphinicchloride.通常反应迅速及少或无有副反应.混合酐,N-carboxy酐(NCAS),也叫,Leuch酐,已广泛用于多聚氨基酸制备,这类化合物联合Nox保护和活化炭基,一旦和另一个氨基酸或肽残基反应,释放CO2做为副产物。用光气处理α氨基酸很容易得到NCA衍生物,在严格调控条件下,NCA衍生物常结晶析出,便可使用。这些条件要求严格控制合成中的PH,在PH值低于10时,NCA和肽或氨基酸残基反应产物,肽—Carbamate易失去CO2形成自由α-氨基端,发生聚合。pH10.5时,NCA便水解隆解。所以反应在PH10.2条件下进行。别的条件要求是反应在0℃液相合成ﻫ基于将单个N—α保护氨基酸反复加到生长的氨基成份上,合成一步步地进行,通常从合成链的C端氨基酸开始,接着的单个氨基酸的连接通过用DCC,混合炭酐,或N—carboxy酐方法实现。Carbodiimide方法包括用DCC做连接剂连接N-和C—保护氨基酸。重要的是,这种连接试剂促接N保护氨基酸自己炭基和C保护氨基酸自由氨基间的缩水,形成肽链,同时产出N,N?/FONT>—dyaylcohercylurea副产物。然而,此方法因其导致消旋的副反应,或在强碱存在时形成5(4H)-oxaylones和N—acylurea而受到影响.庆幸地是,这些副反应能最小化,如果还不能完全消除。方法是加入象HoSu或HoBT这样的连接催化剂,此外,此方法也可用于合成N保护氨基酸的活性酯衍生物。依次产生的活性酯将自发与任何别的C保护氨基酸或肽反应形成新的肽。ﻫ当从副产品,diaydohexylurea分离活性酯有困难时,可用混合Carbonic酐方法,此方法由两步组成,第一步是在有tertiary碱的有机溶剂中用适当的酰基氯激活Nx保护氨基酸的炭基,第二步是让肽或氨基酸的自由氨基与Carbonic酐反应.Carbonic酐通常加到自由氨基的14倍.

虽然此方法在低温时高效高产,产品纯,但也有其缺点,例如,由羰基的强激活酐衍生物有消旋倾向。然而此问题在使用Nx-α—Urethane保护基(Cb2,或tBoc)时便不会发生。进一步:由于高反应性,混合Carbonic酐倾向5(4H)-oxagolomes,Urerbanesdiacyimide,酯的形成,并易失调.ﻫ促进这些副反应的条件是高温,延长激活时间(即,混合酐形成后,加到alkylchlorocarbonate和amine成份的时间,amine组成的空间占位,平共处和混合酐的不完整形成。幸运的是,大多这些副反应,除形成哑唑酮和脲烷外,可通过低温进行反应(~-15℃),大为减少,并且缩短活化时间(~1-2分钟)。为了使哑唑酮和尿烷形成最少,要实行如下措施:1)必要性须用无水有机溶剂,乙酸,四氢喃,t-butand,或acetonitrile;2)应使用tertiary碱和N—methglmorpholine;3)必须用Cb2或tBocN-α保护氨基酸。ﻫ虽然用isobutyl-和ethylchlorocarbonate常用来形成羰酐,但确有别的连接试剂,例如,EEQD和IIQD用来与CarboxaP成份反应形成erhyl-或isobutylcarbonate衍生物.不同于传统酐程序,EEQD和IIQD不要求碱,也不要求低温,通常要求一种有机溶剂(有许多也用)中0。1-0.4MHPLC分析和纯化

分析HPLC使用柱子和泵系统,可以经受传递高压,这样可以用极细的微粒(3-10μm)做填料.由此多肽要在几分钟内高度被分析。ﻫHPLC分两类:离子交换和反相。离子交换HPLC依靠多肽和固相间的直接电荷相互作用.柱子在一定PH范围带有特定电荷衍变成一种离子体,而多肽或多肽混合物,由其氨基酸组成表现出相反电荷。分离是一种电荷相互作用,通过可变PH,离子强度,或两者洗脱出多肽,通常,先用低离子强度的溶液,以后逐渐加强或一步一步加强,直到多肽火柱中洗脱出。离子交换分离的一个例子使用强阳离子交换柱.如sulfoethylaspartimide通过酸性PH中带正电来分离。ﻫ反相HPLC条件与正常层析正相反。多肽通过疏水作用连到柱上,用降低离子强度洗脱,如增加洗脱剂的疏水性。通常柱子由共价吸附到硅上的碳氢烷链构成,这种链长度为G4—G8碳原子.由于洗脱是一种疏水作用。长链柱比短链对小的,高带电肽好。另一方面大的疏水肽用短链柱洗脱好.然而,总体实践中,这两类柱互变无多少显著差别,别类载体由碳水化合物构成,比如苯基。

典型的操作常由两绶冲剂组成,0。1%TFA—H2o和80%acetonitrile0.1%TFA--H2o稀acetonitrile。用线型梯变以每分钟0。5%到1.0%改变的速度混合。常见分析和纯化用柱为

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