版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
研究生实验技能培训
--分子生物学实验常用仪器介绍实验中心研究生实验技能培训
--分子生物学实验常用仪器介绍实验中心1Biometra梯度PCR仪Biometra梯度PCR仪2工作原理多次重复“变性解链—退火—合成延伸”的循环
工作原理多次重复“变性解链—退火—合成延伸”的循环3主要用途用于DNA的扩增梯度PCR仪特别适用于最适反应条件的摸索,在一次PCR反应中可检验多至12个反应温度,从而轻松得出最适反应温度。主要用途用于DNA的扩增4Mullis开车的时候,瞬间感觉两排路灯就是DNA的两条链,自己的车和对面开来的车象是DNA聚合酶,面对面地合成着DNA,……Mullis开车的时候,瞬间感觉两排路灯就是DNA的两条链5PCR仪的应用领域基因、DNA片段的克隆人工基因构建DNA序列测定基因定点突变基因型(突变)检测,SNP分析,遗传背景分析生物物种鉴定,系统进化研究基因表达量研究(real-timePCR)/基因表达谱研究(DNAchip,SAGE)PCR仪的应用领域基因、DNA片段的克隆6医学领域疾病基因检测/遗传病的产前诊断致病病原体的检测肿瘤治疗中癌基因的检测
会推广到大部分疾病治疗前的检测
DNA指纹、个体识别、亲子关系鉴别、法医物证其他:
动、植物检疫(转基因动植物检测)
医学领域疾病基因检测/遗传病的产前诊断7PCR具有极高的灵敏度样品正对照负对照标准分子量
污染是PCR实验的常见问题。只要实验室里曾经扩增过某个片段,就有可能以后的实验中发生污染。因此,做实验的时候绝对不要忘了负对照。用紫外灯破坏污染物也是一个办法PCR具有极高的灵敏度样品正对照负对照标准分子量污染是PC8PCR仪器的变迁三个水浴锅,用手移动(Mullis等人当时用的)电加热块+自来水冷却(PE,1988)电加热块+内置循环液冷却(PE,1989)三个加热块+机械手(Stratagene,1994)半导体制冷和加热(MJ,PE,BioMetra,Eppendrof)温度梯度,荧光检测(如Roche的Lightcycler)风加热Lab-on-chip式的PCR仪(所谓的芯片PCR)中国的状况1991年出现三个水浴锅+机械手的原始PCR仪(华美,复日等)现在以半导体(Peltier板)制冷式为主(杭州博日,上海天呈,厦门安普利等)PCR仪器的变迁三个水浴锅,用手移动(M9PCR仪的种类总体来说可以分为两大类:PCR扩增仪和实时荧光定量PCR仪普通的PCR扩增仪又衍生出带梯度PCR功能的梯度PCR仪、和带原位扩增功能的原位PCR仪等。2019年由ABI公司首先推出将扩增和检测融为一体的实时荧光定量PCR仪,此后很多公司如Eppendorf、ROCHE、Corbett、MJ等等都先后推出不同款式的定量PCR仪,PCR仪的种类总体来说可以分为两大类:10PCR仪的主要参数温度控制要精确度升降温的速度更快的升降温速度,可以缩短反应进行的时间,而且缩短了可能的非特异性结合、反应的时间,能提高PCR反应特异性。ABI早就有升降温速度高达5°Ceppendorf也推出了升降温速度可达到6℃/秒和4.5/秒PCR仪的主要参数温度控制要精确度11现在的PCR仪如ABI,Eppendorf的一般具有两种温控模式,即模块温控模式(Block-control)和反应管温控模式)(tube-control)。模块温控模式适用于长时间的静态孵育(如连接、酶切、去磷酸化等)。试管温控更为准确现在的PCR仪如ABI,Eppendorf的一般具有两种温控12梯度PCR仪
“摸条件”一度是让人很头疼的问题。梯度PCR的出现部分解决了一些问题——在反应过程中每个孔的温度控制条件可以在指定范围内按照梯度变化,根据结果,一步就可以摸索出最适合的反应条件。梯度PCR仪“摸条件”一度是让人很头疼的问题。13原位PCR扩增
在PCR仪上增加原位PCR模块就可以在玻片上进行原位PCR扩增,原位PCR扩增在PCR仪上增加原位PCR模块就可以在玻片上14多槽式高通量PCR仪
随着基因组高通量研究的需求的提高MJ有一种一拖四,就是1个主机带4个扩增槽,每个槽可以独立控温,一次可以作96x4个样品的PCR,不过一旦出现问题4个都不能用了。ABI则在原来的9700的基础上推出了双384孔的基座,一次完成384x2个样品,使得9700的功能又扩展到高通量领域而无需购买新的机器,可惜两个384槽不能独立控温。eppendorf则有一个控制面板,可以控制5个独立的PCR仪,每台机器可以联合,而且互不影响,但是比较浪费空间。
多槽式高通量PCR仪随着基因组高通量研究的需求的提高15仪器的功能性和人性化设计
热盖——现在的PCR仪一般均配备热盖,热盖温度设为105℃,使样品管顶部的温度达到105℃左右,蒸发的反应液就不会产生凝集在管盖上而改变反应体积,这样用户就无需再向反应管内加石蜡油,直接减少后继反应的麻烦。过松过紧仪器的功能性和人性化设计
热盖——现在的PCR仪一般均配备热16样品基座——PCR反应多在0.2或者0.5的管子中进行,多数PCR仪也配备了不同的可更换样品槽适配不同的样品管。eppendorf有一个有趣的设计,一个槽内带有0.2和0.5两种不同样品孔,不需更换基座就可以分别使用两种不同的反应管ABI的9700就可以更换不同的样品槽样品基座——PCR反应多在0.2或者0.5的管子中进行,多数17软件——新的PCR仪都比较注重程序编写的简易性。大屏幕,显示实时信息,倒计时,记忆存储多个程序、自动断电保护等都有助于实验室中的复杂环境使用。软件——新的PCR仪都比较注重程序编写的简易性。大屏幕,显示18Biophotometer生物分光光度计Biophotometer生物分光光度计19技术参数
光学系统:吸收单光束分光光度计,配有基准光束
光源:氙灯
波长:氙230nm;260nm;280nm;320nm;562nm;595nm
光谱带宽:5nm:230nm-320nm,7nm:562nm-595nm
光度计测定范围:0.000到3.000A技术参数
光学系统:吸收单光束分光光度计,配有基准光束
20Biophotometer
生物分光光度计使用常见问答
Biophotometer
生物分光光度计使用常见问答
21答:DNA的在Biophotometer上能测定的最高浓度并没有一个绝对的值,这是因为这个浓度跟使用的比色皿光程和样品的稀释比例有关的。Biophotometer测定的最大吸光度是3.0。当测定的DNA样品吸光度大于2.5时,建议采用2mm的比色皿光程替代10mm。10mm光程下测定的A260=2.5时,相当于125µg/ml浓度的双链DNA,1.25µg/ml的1:10稀释。如果是在2mm光程6.25µg/ml的1:10稀释。答:DNA的在Biophotometer上能测定的最高浓22答:Biophotometer在260nm下能够测定的最小吸光度是0.05,这个吸光度值相当于浓度为2.5µg/ml的双链DNA的吸光度(约125ng双链DNA溶解在50µl溶液中),请确保核酸样品的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1。答:Biophotometer在260nm下能够测定的23答:Biophotometer在260nm下能够测定的最小吸光度是0.05,这个吸光度值相当于浓度为2µg/ml的RNA的吸光度(约100ng双链DNA溶解在50µl溶液中),请确保核酸样品的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1。答:Biophotometer在260nm下能够测定的24答:请检查以下操作中的细节是否有所注意:1-DNA样品的A260吸光度值是否>0.1。请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1)2-待测样品是否经过了充分的混匀,这样才能保证测定值的均一3-待测样品中有相当含量的杂质。A260/A280和260/A230是DNA纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5下其比值应该在2.0或2.5,A230是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A280是蛋白质的吸光度答:请检查以下操作中的细节是否有所注意:25答:产生四个加号的原因是因为测量的数值超过了测量上限>3.0A,请检查1-比色皿是否被完全压入比色皿槽内,出现加号有可能是比色皿的基座挡住了光线的通路。2-您使用的比色皿的中心高度是否在8.5mm?3-比色皿中是否加入了足够量的空白对照溶液?答:产生四个加号的原因是因为测量的数值超过了测量上限>3.026答:A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。同时需要注意的是A260的读数也必需大于0.1才能保证可靠的结果。答:A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的27答:Bradford方法中使用的试剂在和塑料长期接触后会使塑料发生损伤,这种试剂不可以在塑料比色皿中放置超过5分钟,测定值的波动是由于试剂与塑料表面发生反应后,导致吸光度发生变化而产生的,在使用这个方法时,建议使用玻璃比色皿。答:Bradford方法中使用的试剂在和塑料长期接触后会使28核酸与蛋白的电泳分析琼脂糖凝胶电泳
聚丙烯酰胺凝胶电泳分离效果比琼脂糖好,条带比较集中可用于科研及检测分析核酸与蛋白的电泳分析琼脂糖凝胶电泳29电泳槽水平平板垂直平板电泳槽水平平板30垂直电泳系统垂直电泳系统31凝胶浓度选择琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围凝胶浓度选择琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)32电泳缓冲液
常用三种缓冲液Tris-硼酸(TBE)Tris-乙酸(TAE)Tris-磷酸(TPE)TBE与TPE:缓冲容量高,DNA分离效果好,但TPE在DNA片段回收时含磷酸盐浓度高,容易使DNA沉淀TAE:缓冲容量低,但价格较便宜,因而推荐选用TAE。缓冲液中的EDTA可螯合二价阳离子,从而抑制DNA酶的活性,防止PCR扩增产物降解电泳缓冲液常用三种缓冲液33核酸电泳的指示剂指示剂:溴酚兰二甲苯青溴酚兰:在碱性液体中呈紫兰色二甲苯青:水溶液呈兰色电泳时,其迁移速率与双链线性DNA大致相当核酸电泳的指示剂指示剂:34载样缓冲液指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液作用:①增加样品密度,使其比重增加,以确保DNA均匀沉入加样孔内②在电泳中形成肉眼可见的指
示带,可预测核酸电泳的速度和位置③使样品呈色,使加样操作更方便载样缓冲液指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液35核酸电泳的染色剂最常用的染色剂溴化乙锭银染色核酸电泳的染色剂最常用的染色剂36蛋白电泳的染色剂最常用的染色剂考马斯亮蓝G考马斯亮蓝R蛋白电泳的染色剂最常用的染色剂37溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光可在凝胶电泳液中加入终浓度为0.5ug/ml的EB,有时亦可在电泳后,将凝胶浸入该浓度的溶液中染色10~15min琼脂糖凝胶EB染色,肉眼可见核酸电泳带,其DNA量一般>5ng溴化乙锭太多,凝胶染色过深,核酸电泳带看不清时,可将凝胶放入蒸馏水浸泡30min后再观察溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)38银染色:银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物,然后用还原剂如甲醛使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳带染色黑褐色主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色,也用于琼脂糖凝胶染色灵敏度比EB高200倍,但银染色后,DNA不宜回收银染色:银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物39分子生物学常用仪器介绍-课件40BIO-PROFIL凝胶成像分析系统BIO-PROFIL凝胶成像分析系统41主要用途琼脂糖电泳,聚丙烯酰胺电泳,DNA、RNA和蛋白质1D\2D电泳凝胶,SouthernNorthern和Western印迹膜;点杂交膜;薄层层析板、TCL放射自显影胶片、菌落等样品的图像采集和分析,可对核酸、蛋白质的凝胶电泳条带进行分子量大小及含量分析。主要用途琼脂糖电泳,聚丙烯酰胺电泳,DNA、RNA和蛋白质142基本组成密闭型机箱:
一体化全封闭暗箱,设计精巧;最大程度上避免紫外线对人体的伤害。紫外透射台:
紫外光源波长254/306/365nm,紫外透射面积20x25cm。白光板(可选):
透射面积20x25cm
相机:
带积分功能高清晰黑白摄像头;高分辨率数码相机;高分辨率专业数字黑白CCD摄像头。
镜头:
电动/自动镜头。基本组成密闭型机箱:
一体化全封闭暗箱,设计精巧;最大程度上43主要用途(1)图像获取图像获取容易可以以多种格式存储获取粘贴板上的图像、与其它软件交换图像资源图像复制功能,对所获取的原始图像进行剪切、复制
主要用途(1)图像获取44主要用途(2)图像处理彩色图像转换为黑白灰度图像图像的镜像和旋转图像反色、即负片效果图像的对比度/亮度调整图像的均匀化、平整区域、背景校正图像的锐化、柔化、羽化、强化物体边缘主要用途(2)图像处理45主要用途(3)图像分析条带定位:提取图象中的条带信息,确定泳道中是否有条带存在并定位分子量计算:在输入Mark泳道中各条带的已知分子量后,由计算机求出指定未知条带的分子量和bp值(碱基对数)。密度扫描:对指定泳道进行扫描,绘出扫描曲线,并计算出该泳道中各条带的密度积分和峰高背景去除:多种去背景的方法,并可对扫描曲线进行去背景后矫正主要用途(3)图像分析46分子生物学常用仪器介绍-课件47离心机离心机48AvantiJ-301高速冷冻离心机主要附件:8*50ml角转(Max30000rpm)10*100ml角转(Max18000rpm)6*38.5ml水平转头(Max24000rpm)AvantiJ-301高速冷冻离心机主要附件:49冷冻超速离心机主要附件:10*2ml角转(Max130000rpm)8*8ml角转(Max80000rpm)冷冻超速离心机主要附件:50工作原理离心机:利用惯性离心力分离液态非均相混合物的机械。根据分离方式可分为:过滤式分离式沉降式。若被处理的物料为悬浮液就称为离心沉降;若被处理的物料为乳浊液称为离心分离。
工作原理离心机:51主要用途主要用于各种生物大分子的分离、纯化、浓缩(如对病毒、生物大分子、高聚化合物沉降等)同时还可进行相对分子量的测定等。主要用途主要用于各种生物大分子的分离、纯化、浓缩(如对病毒、52转子固定角转子水平转子离心力公式:G(xg)=11.18(rpm/1000)2xRR:radiusrpm:roundperminute转子固定角转子53离心机的分类分离因数KC:离心力与重力之比(即U2T/Rg)根据KC分为常速KC<3000(6000rpm)高速KC=3000~50000(25000rpm)超速KC>50000(90000rpm)离心机的分类分离因数KC:54离心机使用注意事项挥发性或腐蚀性液体离心时,应使用带盖的离心管,并确保液体不外漏以免腐蚀机腔或造成事故要等到转速为零时才能打开离心机盖,取出样品。离心机使用注意事项挥发性或腐蚀性液体离心时,应使用带盖的离心55离心机的正确操作方法离心管的安放:平衡离心机的正确操作方法离心管的安放:平衡56离心速度的设定离心力与离心率离心速度必需根据离心样品的平均密度确定ForAngleRotorForSwingRotor离心速度的设定离心力与离心率57使用后的维护与保养注意腔底的周边清洁使用后的维护与保养注意腔底的周边清洁58O圈的作用密闭真空,防止样品飞溅生物安全防护,阻止有害生物样品外泄增加盖子与转子体的阻尼,防止盖子松脱O圈的作用密闭真空,防止样品飞溅59ThermoForma
高温灭菌二氧化碳培养箱
ThermoForma
高温灭菌二氧化碳培养箱
60工作原理通过在培养箱箱体内模拟形成一个类似细胞/组织在生物体内的生长环境如:恒定的酸碱度(pH值:7.2-7.4)稳定的温度(37°C)较高的相对湿度(95%)稳定的CO2水平(5%)来对细胞/组织进行体外培养的一种装置。
工作原理通过在培养箱箱体内模拟形成一个类似细胞/组织在生物体61二氧化碳培养箱的基本的要求一是能够对温度、二氧化碳浓度和湿度提供最精确稳定的控制二是能够对培养箱内的微生物污染进行有效的防范,并且能够定期消除污染二氧化碳培养箱的基本的要求一是能够对温度、二氧化碳浓度和湿度62温控系统温度控制
根据加热方式分为气套式和水套式具备相互独立三重温度控制功能的二氧化碳培养箱,即箱内温度控制、超温报警控制和环境温度监控。
温控系统温度控制
根据加热方式分为气套式和水套式63二氧化碳浓度控制红外传感器(IR)或热导传感器(TCD)
带有CO2测量系统自动校准功能
二氧化碳浓度控制64防污染设计和消毒灭菌系统紫外消毒HEPA过滤器高温消毒高温干热和高温湿热
防污染设计和消毒灭菌系统65高压消毒锅高压消毒锅66相关概念介绍灭菌(sterilization)是指杀灭一切活的微生物。消毒(disinfection)是指杀灭病原微生物和其他有害微生物,并不要求清除或杀灭所有微生物。相关概念介绍灭菌(sterilization)67方法灭菌方法可分为四种:物理、机械、化学和生物灭菌。一般多采用物理方法,如高温热力、滤过、超声波、紫外线和电离辐射等。消毒多应用化学药物。
方法灭菌方法可分为四种:物理、机械、化学和生物灭菌。68高温热力灭菌:干热灭菌适用于玻璃仪器,将物品放入烘箱,160~170oC,1~2小时。火焰灭菌适用于常用用具,如接种环、镊子等。灭菌方法是放在火焰上直接灼烧。湿热灭菌(1)高压蒸汽灭菌:适用于培养基、衣物等的灭菌。(2)间歇蒸汽灭菌:适用于不耐高温的培养基或无高压蒸汽灭菌锅时。(3)巴斯德灭菌:适用于牛乳类等不耐高温的物体。高温热力灭菌:干热灭菌69
湿热灭菌法与干热灭菌法效果比较结论:同样温度下,湿热比干热灭菌效果好原因:—蛋白含水量多时易凝固变性—湿热穿透力比干热大—湿热的蒸汽具有潜热湿热灭菌法与干热灭菌法效果比较70
高压蒸汽灭菌操作注意事项(1)查看排水桶加水至Low水平线上。当水线超过High时,将水排出至Low线上。查看仓内水水不足时加蒸馏水使水面与三角搁架相平为宜。待灭菌物品注意不要装得太挤,以免防碍蒸汽流通而影响灭菌效果。三角烧瓶与试管口端均不要与桶壁接触,以免冷凝水淋湿包口的纸而透入棉塞。高压蒸汽灭菌操作注意事项(1)查看排水桶71高压蒸汽灭菌操作注意事项(2)121.3℃(15磅/时2),15-20min灭菌如果压力未降到0时,打开排气阀,就会因锅内压力突然下降,使容器内的培养基由于内外压力不平衡而冲出瓶口,造成棉塞沾染培养基而发生污染。取物品时戴手套,防烫伤。高压蒸汽灭菌操作注意事项(2)121.3℃(15磅/时272THANKYOU!THANKYOU!73研究生实验技能培训
--分子生物学实验常用仪器介绍实验中心研究生实验技能培训
--分子生物学实验常用仪器介绍实验中心74Biometra梯度PCR仪Biometra梯度PCR仪75工作原理多次重复“变性解链—退火—合成延伸”的循环
工作原理多次重复“变性解链—退火—合成延伸”的循环76主要用途用于DNA的扩增梯度PCR仪特别适用于最适反应条件的摸索,在一次PCR反应中可检验多至12个反应温度,从而轻松得出最适反应温度。主要用途用于DNA的扩增77Mullis开车的时候,瞬间感觉两排路灯就是DNA的两条链,自己的车和对面开来的车象是DNA聚合酶,面对面地合成着DNA,……Mullis开车的时候,瞬间感觉两排路灯就是DNA的两条链78PCR仪的应用领域基因、DNA片段的克隆人工基因构建DNA序列测定基因定点突变基因型(突变)检测,SNP分析,遗传背景分析生物物种鉴定,系统进化研究基因表达量研究(real-timePCR)/基因表达谱研究(DNAchip,SAGE)PCR仪的应用领域基因、DNA片段的克隆79医学领域疾病基因检测/遗传病的产前诊断致病病原体的检测肿瘤治疗中癌基因的检测
会推广到大部分疾病治疗前的检测
DNA指纹、个体识别、亲子关系鉴别、法医物证其他:
动、植物检疫(转基因动植物检测)
医学领域疾病基因检测/遗传病的产前诊断80PCR具有极高的灵敏度样品正对照负对照标准分子量
污染是PCR实验的常见问题。只要实验室里曾经扩增过某个片段,就有可能以后的实验中发生污染。因此,做实验的时候绝对不要忘了负对照。用紫外灯破坏污染物也是一个办法PCR具有极高的灵敏度样品正对照负对照标准分子量污染是PC81PCR仪器的变迁三个水浴锅,用手移动(Mullis等人当时用的)电加热块+自来水冷却(PE,1988)电加热块+内置循环液冷却(PE,1989)三个加热块+机械手(Stratagene,1994)半导体制冷和加热(MJ,PE,BioMetra,Eppendrof)温度梯度,荧光检测(如Roche的Lightcycler)风加热Lab-on-chip式的PCR仪(所谓的芯片PCR)中国的状况1991年出现三个水浴锅+机械手的原始PCR仪(华美,复日等)现在以半导体(Peltier板)制冷式为主(杭州博日,上海天呈,厦门安普利等)PCR仪器的变迁三个水浴锅,用手移动(M82PCR仪的种类总体来说可以分为两大类:PCR扩增仪和实时荧光定量PCR仪普通的PCR扩增仪又衍生出带梯度PCR功能的梯度PCR仪、和带原位扩增功能的原位PCR仪等。2019年由ABI公司首先推出将扩增和检测融为一体的实时荧光定量PCR仪,此后很多公司如Eppendorf、ROCHE、Corbett、MJ等等都先后推出不同款式的定量PCR仪,PCR仪的种类总体来说可以分为两大类:83PCR仪的主要参数温度控制要精确度升降温的速度更快的升降温速度,可以缩短反应进行的时间,而且缩短了可能的非特异性结合、反应的时间,能提高PCR反应特异性。ABI早就有升降温速度高达5°Ceppendorf也推出了升降温速度可达到6℃/秒和4.5/秒PCR仪的主要参数温度控制要精确度84现在的PCR仪如ABI,Eppendorf的一般具有两种温控模式,即模块温控模式(Block-control)和反应管温控模式)(tube-control)。模块温控模式适用于长时间的静态孵育(如连接、酶切、去磷酸化等)。试管温控更为准确现在的PCR仪如ABI,Eppendorf的一般具有两种温控85梯度PCR仪
“摸条件”一度是让人很头疼的问题。梯度PCR的出现部分解决了一些问题——在反应过程中每个孔的温度控制条件可以在指定范围内按照梯度变化,根据结果,一步就可以摸索出最适合的反应条件。梯度PCR仪“摸条件”一度是让人很头疼的问题。86原位PCR扩增
在PCR仪上增加原位PCR模块就可以在玻片上进行原位PCR扩增,原位PCR扩增在PCR仪上增加原位PCR模块就可以在玻片上87多槽式高通量PCR仪
随着基因组高通量研究的需求的提高MJ有一种一拖四,就是1个主机带4个扩增槽,每个槽可以独立控温,一次可以作96x4个样品的PCR,不过一旦出现问题4个都不能用了。ABI则在原来的9700的基础上推出了双384孔的基座,一次完成384x2个样品,使得9700的功能又扩展到高通量领域而无需购买新的机器,可惜两个384槽不能独立控温。eppendorf则有一个控制面板,可以控制5个独立的PCR仪,每台机器可以联合,而且互不影响,但是比较浪费空间。
多槽式高通量PCR仪随着基因组高通量研究的需求的提高88仪器的功能性和人性化设计
热盖——现在的PCR仪一般均配备热盖,热盖温度设为105℃,使样品管顶部的温度达到105℃左右,蒸发的反应液就不会产生凝集在管盖上而改变反应体积,这样用户就无需再向反应管内加石蜡油,直接减少后继反应的麻烦。过松过紧仪器的功能性和人性化设计
热盖——现在的PCR仪一般均配备热89样品基座——PCR反应多在0.2或者0.5的管子中进行,多数PCR仪也配备了不同的可更换样品槽适配不同的样品管。eppendorf有一个有趣的设计,一个槽内带有0.2和0.5两种不同样品孔,不需更换基座就可以分别使用两种不同的反应管ABI的9700就可以更换不同的样品槽样品基座——PCR反应多在0.2或者0.5的管子中进行,多数90软件——新的PCR仪都比较注重程序编写的简易性。大屏幕,显示实时信息,倒计时,记忆存储多个程序、自动断电保护等都有助于实验室中的复杂环境使用。软件——新的PCR仪都比较注重程序编写的简易性。大屏幕,显示91Biophotometer生物分光光度计Biophotometer生物分光光度计92技术参数
光学系统:吸收单光束分光光度计,配有基准光束
光源:氙灯
波长:氙230nm;260nm;280nm;320nm;562nm;595nm
光谱带宽:5nm:230nm-320nm,7nm:562nm-595nm
光度计测定范围:0.000到3.000A技术参数
光学系统:吸收单光束分光光度计,配有基准光束
93Biophotometer
生物分光光度计使用常见问答
Biophotometer
生物分光光度计使用常见问答
94答:DNA的在Biophotometer上能测定的最高浓度并没有一个绝对的值,这是因为这个浓度跟使用的比色皿光程和样品的稀释比例有关的。Biophotometer测定的最大吸光度是3.0。当测定的DNA样品吸光度大于2.5时,建议采用2mm的比色皿光程替代10mm。10mm光程下测定的A260=2.5时,相当于125µg/ml浓度的双链DNA,1.25µg/ml的1:10稀释。如果是在2mm光程6.25µg/ml的1:10稀释。答:DNA的在Biophotometer上能测定的最高浓95答:Biophotometer在260nm下能够测定的最小吸光度是0.05,这个吸光度值相当于浓度为2.5µg/ml的双链DNA的吸光度(约125ng双链DNA溶解在50µl溶液中),请确保核酸样品的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1。答:Biophotometer在260nm下能够测定的96答:Biophotometer在260nm下能够测定的最小吸光度是0.05,这个吸光度值相当于浓度为2µg/ml的RNA的吸光度(约100ng双链DNA溶解在50µl溶液中),请确保核酸样品的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1。答:Biophotometer在260nm下能够测定的97答:请检查以下操作中的细节是否有所注意:1-DNA样品的A260吸光度值是否>0.1。请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1)2-待测样品是否经过了充分的混匀,这样才能保证测定值的均一3-待测样品中有相当含量的杂质。A260/A280和260/A230是DNA纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5下其比值应该在2.0或2.5,A230是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A280是蛋白质的吸光度答:请检查以下操作中的细节是否有所注意:98答:产生四个加号的原因是因为测量的数值超过了测量上限>3.0A,请检查1-比色皿是否被完全压入比色皿槽内,出现加号有可能是比色皿的基座挡住了光线的通路。2-您使用的比色皿的中心高度是否在8.5mm?3-比色皿中是否加入了足够量的空白对照溶液?答:产生四个加号的原因是因为测量的数值超过了测量上限>3.099答:A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。同时需要注意的是A260的读数也必需大于0.1才能保证可靠的结果。答:A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的100答:Bradford方法中使用的试剂在和塑料长期接触后会使塑料发生损伤,这种试剂不可以在塑料比色皿中放置超过5分钟,测定值的波动是由于试剂与塑料表面发生反应后,导致吸光度发生变化而产生的,在使用这个方法时,建议使用玻璃比色皿。答:Bradford方法中使用的试剂在和塑料长期接触后会使101核酸与蛋白的电泳分析琼脂糖凝胶电泳
聚丙烯酰胺凝胶电泳分离效果比琼脂糖好,条带比较集中可用于科研及检测分析核酸与蛋白的电泳分析琼脂糖凝胶电泳102电泳槽水平平板垂直平板电泳槽水平平板103垂直电泳系统垂直电泳系统104凝胶浓度选择琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围凝胶浓度选择琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)105电泳缓冲液
常用三种缓冲液Tris-硼酸(TBE)Tris-乙酸(TAE)Tris-磷酸(TPE)TBE与TPE:缓冲容量高,DNA分离效果好,但TPE在DNA片段回收时含磷酸盐浓度高,容易使DNA沉淀TAE:缓冲容量低,但价格较便宜,因而推荐选用TAE。缓冲液中的EDTA可螯合二价阳离子,从而抑制DNA酶的活性,防止PCR扩增产物降解电泳缓冲液常用三种缓冲液106核酸电泳的指示剂指示剂:溴酚兰二甲苯青溴酚兰:在碱性液体中呈紫兰色二甲苯青:水溶液呈兰色电泳时,其迁移速率与双链线性DNA大致相当核酸电泳的指示剂指示剂:107载样缓冲液指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液作用:①增加样品密度,使其比重增加,以确保DNA均匀沉入加样孔内②在电泳中形成肉眼可见的指
示带,可预测核酸电泳的速度和位置③使样品呈色,使加样操作更方便载样缓冲液指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液108核酸电泳的染色剂最常用的染色剂溴化乙锭银染色核酸电泳的染色剂最常用的染色剂109蛋白电泳的染色剂最常用的染色剂考马斯亮蓝G考马斯亮蓝R蛋白电泳的染色剂最常用的染色剂110溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光可在凝胶电泳液中加入终浓度为0.5ug/ml的EB,有时亦可在电泳后,将凝胶浸入该浓度的溶液中染色10~15min琼脂糖凝胶EB染色,肉眼可见核酸电泳带,其DNA量一般>5ng溴化乙锭太多,凝胶染色过深,核酸电泳带看不清时,可将凝胶放入蒸馏水浸泡30min后再观察溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)111银染色:银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物,然后用还原剂如甲醛使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳带染色黑褐色主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色,也用于琼脂糖凝胶染色灵敏度比EB高200倍,但银染色后,DNA不宜回收银染色:银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物112分子生物学常用仪器介绍-课件113BIO-PROFIL凝胶成像分析系统BIO-PROFIL凝胶成像分析系统114主要用途琼脂糖电泳,聚丙烯酰胺电泳,DNA、RNA和蛋白质1D\2D电泳凝胶,SouthernNorthern和Western印迹膜;点杂交膜;薄层层析板、TCL放射自显影胶片、菌落等样品的图像采集和分析,可对核酸、蛋白质的凝胶电泳条带进行分子量大小及含量分析。主要用途琼脂糖电泳,聚丙烯酰胺电泳,DNA、RNA和蛋白质1115基本组成密闭型机箱:
一体化全封闭暗箱,设计精巧;最大程度上避免紫外线对人体的伤害。紫外透射台:
紫外光源波长254/306/365nm,紫外透射面积20x25cm。白光板(可选):
透射面积20x25cm
相机:
带积分功能高清晰黑白摄像头;高分辨率数码相机;高分辨率专业数字黑白CCD摄像头。
镜头:
电动/自动镜头。基本组成密闭型机箱:
一体化全封闭暗箱,设计精巧;最大程度上116主要用途(1)图像获取图像获取容易可以以多种格式存储获取粘贴板上的图像、与其它软件交换图像资源图像复制功能,对所获取的原始图像进行剪切、复制
主要用途(1)图像获取117主要用途(2)图像处理彩色图像转换为黑白灰度图像图像的镜像和旋转图像反色、即负片效果图像的对比度/亮度调整图像的均匀化、平整区域、背景校正图像的锐化、柔化、羽化、强化物体边缘主要用途(2)图像处理118主要用途(3)图像分析条带定位:提取图象中的条带信息,确定泳道中是否有条带存在并定位分子量计算:在输入Mark泳道中各条带的已知分子量后,由计算机求出指定未知条带的分子量和bp值(碱基对数)。密度扫描:对指定泳道进行扫描,绘出扫描曲线,并计算出该泳道中各条带的密度积分和峰高背景去除:多种去背景的方法,并可对扫描曲线进行去背景后矫正主要用途(3)图像分析119分子生物学常用仪器介绍-课件120离心机离心机121AvantiJ-301高速冷冻离心机主要附件:8*50ml角转(Max30000rpm)10*100ml角转(Max18000rpm)6*38.5ml水平转头(Max24000rpm)AvantiJ-301高速冷冻离心机主要附件:122冷冻超速离心机主要附件:10*2ml角转(Max130000rpm)8*8ml角转(Max80000rpm)冷冻超速离心机主要附件:123工作原理离心机:利用惯性离心力分离液态非均相混合物的机械。根据分离方式可分为:过滤式分离式沉降式。若被处理的物料为悬浮液就称为离心沉降;若被处理的物料为乳浊液称为离心分离。
工作原理离心机:124主要用途主要用于各种生物大分子的分离、纯化、浓缩(如对病毒、生物大分子、高聚化合物沉降等)同时还可进行相对分子量的测定等。主要用途主要用于各种生物大分子的分离、纯化、浓缩(如对病毒、125转子固定角转子水平转子离心力公式:G(xg)=11.18(rpm/1000)2xRR:radiusrpm:roundperminute转子固定角转子126离心机的分类分离因数KC:离心力与重力之比(即U2T/Rg)根据KC分为常速KC<3000(6000rpm)高速KC=3000~50000(25000rpm)超速KC>50000(90000rpm)离心机的分类分离因数KC:127离心机使用注意事项挥发性或腐蚀性液体离心时,应使用带盖的离心管,并确保液体不外漏以免腐蚀机腔或造成事故要等到转速为零时才能打开离心机盖,取出样品。离心机使用注意事项挥发性或腐蚀性液体离心时,
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 2025年美国妇产科医师协会《安全降低初次剖宫产的质量改进策略》指南解读课件
- 2026年香料植物行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年劳动力分析软件行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年家务清洁用具行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年消防泵行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年变速器齿轮行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年燃气锅炉行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年巨磁阻(GMR)传感器行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年速度传感器行业分析报告及未来发展趋势报告
- 2026年血液净化培训题及答案
- (正式版)JBT 10437-2024 电线电缆用可交联聚乙烯绝缘料
- 文旅融合和文化旅游
- 智慧停车场经济效益分析
- 第五章体育活动与心理健康
- 高中英语新人教版选修四全册单词默写练习(分单元编排附相关知识和部分参考答案)
- 电网公司基建项目安全施工作业B票
- 云南省农村留守儿童现状调研报告
- GB/T 4798.5-2007电工电子产品应用环境条件第5部分:地面车辆使用
- 《道德与法治》六年级下《科技发展造福人类》课件
- (完整版)中铁合同样板
- 艰难梭菌课件
评论
0/150
提交评论