版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
RNA-seqVSZhangetal.NatureReviewsGenetics,RNA-seq 1.Libraryconstructionwith 2.ClusterGenerationbybridge 3.Sequencingby 4.Massivelyparallel 5.Reads 6.Transcriptsabundance 7.Differentiallyexpressedgenes 8. NextGenerationSequencingLibraryMoreilluminaClusterGeneration:BridgePCR SequencingSequencingMultiplexingisachievedbyusingsamplespecificadaptorsinlibrarypreparationstep,thensequencingthemalltogetherinonelibraryPE=pairedend(mate
SE=singleIs2*50,000,000=MoreinformationonNewsplicevariantsNewstructuralvariationMoreperbasecoverageTypicallybetterma
LessinformationThe2ndfragmentisredundantinformationforcoveragepurposes.UsefulRSeQC:genebody 对各 fication单位的介绍 /2014/05/08/what-Useful Fusion Mutation 工具列 SEQanswers ProtocolarticlesSimilarstudiesCompany
实验设表达检测,可变剪接,新转录物,等 表达差异,突变测,融 技术重复:基本不生物重复:样品数 Someexample Coverage(referstomappedsequencing/denovoassembly/variation
10x-30x- 30-50-100millionreadsformammalian 0.5-1million100xor20-30millionreadsper
(dependson ent,signaltonoiseandBisulfite ~30xoftheGENOMEperbiologicalSequencingstudyof$NumberfManyNumberfareproducefew
FewmoleculesareveryabundantmostreadsareattributedtoNumberofNumberofERCC ExternalRNAControls 素Assessthelowerlimitofdetectionandrange(doseAssessthefold-changeGenebodycoverage Saturation Whatinformationcanyougetfrom 功能研 部分调机制反映在RNA水平 RNA RNA 发现新的转 发现新的细胞 singlecellRNA-LuChenetal.,Science,Whatinformationcanyougetfrom 功能研 部分调机制反映在RNA水平 RNA RNA 发现新的转 发现新的细胞 singlecellRNA- VenablesJPetal.,NatStructMolBiolOlteanSandBatesDO,OncogeneEmergingRolesofRNAModification:LeeM.etal.,CellRNAWhatinformationcanyougetfrom 功能研 部分调机制反映在RNA水平 RNA RNA 发现新的转 发现新的细胞 singlecellRNA-LongnoncodingCabiliNM.GenomeRes.ThelandscapeoflongnoncodingRNAsinthehumantranscriptomeIyerMatthewetal.,NatGenet.GuoJUetal.,GenomeBiol.Rybak-WolfAGuoJUetal.,GenomeBiol.Whatinformationcanyougetfrom 功能研 部分调机制反映在RNA水平 RNA RNA 发现新的转
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 尼龙复合材料投资建设项目建议书
- 在线式发电机氢纯度分析仪项目投资分析报告
- 经络健美减肥仪投资建设项目建议书
- 2024年立方氮化硼晶体项目建议书
- 2024年非接触温度计项目建议书
- 供货质量保证协议书-零配件类
- 2024年车装石油修井机合作协议书
- 2024年去渍台项目发展计划
- 2024年新型节能型内燃机项目建议书
- 2024年HRN-40松香系中性施胶剂项目发展计划
- 相变蓄热球体堆积床传热模型及热性能分析
- 胃积病(胃癌)中医诊疗方案分析、总结、评估报告
- 国家级文明旅游示范单位申请评定报告书(自评报告)
- 电磁场与电磁波完整版课件全套PPT教程最全电子教案
- 香港与内地报表转换
- 民营整形医院与公立整形医院的区别
- 临时板房施工组织设计
- 最新北师大版六年级数学下册期中测试卷含答案
- 国家开放大学《数据结构(本)》单元测试参考答案
- 国家开放大学《土木工程力学(本)》形考作业1-5参考答案
- GB 13544-2011 烧结多孔砖和多孔砌块.pdf
评论
0/150
提交评论