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文档简介
冰冻切片的(DIG-labeledRNAprobe)原位杂交操作程序一、
切片制备用新鲜组织制作6μm厚冰冻切片,37℃干燥1~4小时,进行下一步操作。二、
预杂交前处理预固定:4%PFA(inDEPC-PBSPh7.4)RT30~60min4%PFA:多聚甲醛20g1×PBS450ml
加热(60℃、20min)溶解冷却后调pH至7.41×PBS→500mlPBSRT5min×210×PBS:500mlNaCl40gKCl1gKH2PO41gNa2HPO47.7gDEPC水450ml
调Ph至7.5DEPC水加至500mlPBS(含0.3%v/vTritonX-100)RT15min临用前配制
10%TritonX-10015ml1×PBS→500mlPBSRT5min×2第1页/共24页第一页,共25页。消化:2μg/mlProteinaseKinTEbuffer37℃10minTE:
pH8.0Tris-HCl1M5mlpH8.0EDTA0.5M1mlDEPC水→500ml0.2%GlycininPBSRT5min×2
(50xDenhart’s;
Ficoll400聚蔗糖1g后固定:4%PFAinPBSRT15minPVP聚乙烯基吡咯烷酮1g
BSA牛血清白蛋白1g
DEPC水100ml)
PBSRT3min×2
0.1
M三乙醇胺(TEA)/0.25%乙酸酐RT5min×2
0.1M三乙醇胺:三乙醇胺2.64mlDEPC水200ml
用前加入乙酸酐500μlPBSRT5min×2第2页/共24页第二页,共25页。三、
预杂交预杂交
50℃2h预杂交液:50%去离子甲酰胺
5×SSC5×Denhardt’s0.02%SDS0.1mg/mltRNA四、
杂交杂交
50℃12h以上第3页/共24页第三页,共25页。
五、
杂交后处理2×SSC脱去盖膜(片)50℃2×SSC清洗37℃10min×220μg/mlRNaseAinRnsaebuffer37℃30minRnsaebuffer;2MTris5ml0.25MEDTA4ml3MnaCl167mlpH8.0DW→1000mlRnasebuffer37℃30min
2×SSC50℃15min×2
1×SSC(含0.02%SDS)37℃15min×25%SDS2ml
1×SSC500ml0.1×SSC37℃15min×2
第4页/共24页第四页,共25页。BufferⅠ37℃10min×2BufferⅠ:2MTris-HClPh7.625ml3MNaCl25mlD.W.→500ml封闭;0.5%抗体阻断液inBufferⅠ(含0.2%Tween20)
37℃20min抗体阻断液:
(1:500抗地高辛抗体in阻断液37℃2h)阻断剂1gTween-200.4ml
BufferⅠ37℃10min×2BufferⅠ200ml
BufferⅡ37℃10min×2第5页/共24页第五页,共25页。
显色;BufferⅡ:2MTris10ml(1:50NBT/BCIPStockSolutioninBufferⅡ2~24h)3MNaCl6.67ml
MgCl22.033g(湿合、避光)
D.W.180ml
浓HCl调pH至9.5D.W.→200ml终止反应:
BufferⅢRT5min×2
流水冲洗
5-10min
1%甲基绿复染3-10min,
水洗,晾干,封固第6页/共24页第六页,共25页。DNA探针检测石蜡
切片中DNA第7页/共24页第七页,共25页。组织标本肝穿刺组织,常规石蜡包埋,4m连续石蜡切片,贴在涂有切片粘合剂的干净载玻片上,58℃烤18h。第8页/共24页第八页,共25页。试剂1.20×SSC2.HBVcDNA-Dig探针5g3.4%多聚甲醛4.0.1mol/LPBS,pH7.45.0.2mmol/LHCl和0.1mol/L甘氨酸PBSpH7.46.0.4%TritorX-100PBSpH7.47.蛋白酶
20g/ml8.0.25%乙酸酐,用0.1mol/L三乙醇胺配制9.预杂交缓冲液和杂交缓冲液10.AKP标记抗DigFab段二抗,可1:500稀释11.TSM、TSM2(配制参阅附录4)12.NBT和BCIP显色液或用AKP显色Kit
第9页/共24页第九页,共25页。操作流程杂交前处理预杂交杂交杂交后漂洗杂交后检测结果判断第10页/共24页第十页,共25页。杂交前处理1.石蜡切片常规脱蜡至水2.0.02MpH7.4PBS洗3×3min3.0.2MHCI20min室温(除去蛋白)4.2×SSC(内含5MEDTA)50℃洗30min5.蛋白酶
2g/ml37℃20min6.0.1M甘氨酸PBS洗10min室温,中止酶反应7.4%多聚甲醛,20min室温8.PBS洗3×3min9.75%,85%,95%和无水乙醇各2min第11页/共24页第十一页,共25页。预杂交和杂交
加预杂交液20l/每片,42℃2h。
加杂交液10~20ul/每片(内含HBV-cDNADig标记探针4g/ml),加盖硅化玻片,将切片置于95℃10min,使探针和靶病毒DNA双链打开(变性),然后迅速置于冰上5min,再将切片置于盛有2×SSC湿合内,42℃杂交过夜(12~16h)。第12页/共24页第十二页,共25页。杂交后漂洗1.将切片置于2×SSC液内振动移去盖片2.2×SSC洗2×10min,55℃3.0.5×SSC2×5min,50℃4.PBS洗3×3min5.10%醋酸20min室温,阻断内源性碱性磷酸酶6.PBS洗3×3min第13页/共24页第十三页,共25页。信号放大和显示1.1:500稀释AKP标记抗Dig二抗,37℃4h,或4℃过夜2.PBS洗3×3min3.TSM1洗2×5min4.TSM2洗2×5min5.显色液在1mlTSM2中加入4.5lNBT,3.5l,BCIP
混合后,显色30min~12h,中间不断观察6.TSM2洗,PBS洗3×3min,核固红或甲基绿衬染7.蒸镏水洗,系列乙醇脱水,二甲苯透明,树脂封片第14页/共24页第十四页,共25页。结果判断
第15页/共24页第十五页,共25页。ISH流程探针合成组织细胞标本的准备ISH试剂的配制操作流程第16页/共24页第十六页,共25页。探针1、根据文献报道合成PCR引物一对。
2、PCR扩增:用高保真DNA聚合酶进行PCR扩增。第17页/共24页第十七页,共25页。3、将PCR扩增产物亚克隆入pGEM2Z质粒(EcoRI和ACCI酶切位点),在大肠杆菌中扩增,纯化。原理:PGEM3质粒购于promega公司,含有位于pUc19MCS侧面的SP6和T7RNA聚合酶启动子,在将所需序列插入MCS后,一个简单的基于lacZα-肽灭活的颜色选择方案将促进重组体的筛选。在体外,将SP6或T7RNA聚合酶加入到含有标记物的三磷酸核苷前体的转录系统中,可允许从任何一方向产生多拷贝DNA插入序列的标记RNA探针。第18页/共24页第十八页,共25页。4、
利用Roche生产的体外转录标记RNAkit(Cat.No999644)操作流程参阅《原位检测技术》p132-133。第19页/共24页第十九页,共25页。
组织细胞标本的准备
ISH试剂的配制(所有试剂和用具均用DEPC水处理)第20页/共24页第二十页,共25页。操作流程11、活细胞经4%多聚甲醛固定20min,室温,PBS
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