立克次体分类研究进展与新分类

立克次体分类研究进展与新分类昆明医科大学热带医学研究所病原生物学与免疫学系

宝福凯教授电话：0871－5338884E-mail:baofukai@126.com，Fukai.bao@实验室网页：/home整理ppt整理pptHowardTaylorRicketts(1871-1910)wasanAmerican

pathologistafterwhomtheRickettsiaceaefamilyandtheRickettsialesarenamed.Intheearlierpartofhiscareer,RickettsundertookresearchatNorthwesternUniversityonblastomycosisandlaterattheUniversityofChicagoonandRockyMountainspottedfever.RickettsandhisassistantdiscoveredthattheagentthatcarriedthebacillusforthelatterwastheRockyMountainwoodtick(theAmericandogtickisalsoacarrier).Rickettswasdevotedtohisresearchand,onseveraloccasions,injectedhimselfwithapathogeninordertomeasureitseffects.In1909,RickettsbecameinterestedintyphusduetoanoutbreakinMexicoCityandtheapparentsimilarityofthediseasetospottedfever.daysafterisolatingtheorganismthathebelievedcausedtyphus,hehimselfdiedofthedisease.整理ppt立克次体目（Rickettsiales）微生物是一类严格细胞内寄生的原核细胞型微生物，其生物学性状如形态结构、化学组成及代谢方式等方面与细菌类似。立克次体是引起斑疹伤寒、恙虫病、Q热等传染病的病原体，首先由美国青年医师HowardTaylorRicketts发现，为纪念他在研究斑疹伤寒时不幸感染而献身，故以他的姓名命名。立克次体与节肢动物关系密切，寄生在吸血节肢动物体内，使其成为寄生宿主，或为储存宿主，或同时为传播媒介。立克次体大多是人兽共患病的病原体,引起的新现和再现传染病（Emergingandre-emerginginfectiousdiseases）呈世界性或地方性流行，日益受到医学界重视。整理ppt2.Rickettsiology:PresentandFutureDirections

AnnalsNYAS,Volume990,Jun2003

ISBN1-57331-445-5770pages,46papers

Rickettsiology:CurrentIssuesandPerspectives

AnnalsNYAS，Volume590,Jun1990

整理ppt3.CenturyofRickettsiology:Emerging,ReemergingRickettsioses,MolecularDiagnostics,andEmergingVeterinaryRickettsiosesAnnalsNYAS,Volume1078,publishedOct2006EditedbyKarimE.Hechemy;JoséA.Oteo;DidierA.Raoult,etal.4.Rickettsioses:FromGenometoProteome,Pathobiology,andRickettsiaeasanInternationalThreatAnnalsNYAS,Volume1063,publishedFeb2006EditedbyKarimE.Hechemy;JoséA.Oteo;DidierA.Raoult,etal.整理ppt

近年来，随着立克次体分子生物学研究的迅速发展（如16SrDNA序列分析、全DNA或基因片段分析等），原有的立克次体分类已不能准确反映立克次体目、科和各种属的面貌，代之而起的是根据特定基因（如16SrRNA基因、HSP60基因等）对立克次体进行新的分类。目前细菌分类的权威资源是《伯杰手册》不同版本，包括《伯杰氏鉴定细菌学手册》（Bergey＇sManualofDeterminativeBacteriology）第8版（1974）、《伯杰氏系统细菌学手册》（Bergey＇sManualofSystematicBacteriology）第1版（1984，1986，1989）和第2版（2001，2005）。在线资源NCBITaxonomy（/Taxonomy/）的分类方法也被许多专业人员认可。两种资源内容大同小异。本文以《伯杰氏系统细菌学手册》第2版第2卷（2005）为主要参照，参考NCBITaxonomy资源和近期发表的重要立克次体分类文献，对立克次体目分类学现状进行概括性介绍。整理ppt1．《伯杰氏系统细菌学手册》（第1版）对立克次体目微生物的分类【1】本版《伯杰手册》也对核酸分析和化学分类法加以重视，但由于当时技术条件的限制，它仍然沿用以表型特征为主的传统分类法，将立克次体目分为3个科，即立克次体科、巴通体科和无形体科，立克次体科下再分3个族，见表1。整理ppt整理ppt2．《伯杰氏系统细菌学手册》（第2版）对立克次体目微生物的新分类【2】从1984年第一版开始发行以来，细菌分类已取得了巨大进展，新命名的种成倍增加、新描述的属也在170个以上，尤其是80年代末以来，rRNA、DNA、蛋白质序列分析方法日趋实用，因而为细菌的系统发育积累了不少新的资料。因此急需对第一版进行新的修订。第2版预计分5卷出版，它更多地依靠分子水平上系统发育与进化研究成果对细菌进行分类，在总体安排上进行了较大的调整，至今已出版两卷。《伯杰氏系统细菌学手册》第2版第2卷（2005年出版）将立克次体目微生物分为3科，即立克次体科、无形体科和全孢菌科（Holosporaceae）。与第1版相比，取消了族（tribe）一级分类单元和罗莎利马体属（Rochalimaea）属名，原罗莎利马体属微生物并入巴尔通体科，将巴通体科归入根瘤菌目（Rhizobiales）；无形体科的血虫体属（附红细胞体，Eperythrozoon）和血巴尔通体属（Haemobartonella）归入支原体目的支原体科，柯克斯体属（Coxiella）和立克次小体属（Rickettsiella）归入军团菌目（Legionellanes）；新设东方体属，将第一版列入立克次体科、无浆体科中的一些属进行了重新组合。详见表2。整理ppt整理ppt3．无形体科一些重要病原体简介【3】经过重新组合，无形体包括7个属，其中无形体属和埃立克体属囊括了立克次体科中通过蜱类传播、感染外周血细胞（粒细胞、单核细胞、红细胞和血小板）的所有病原体。这些病原体引起的新现、再现传染病近年受到高度重视。现将与人和动物疾病相关的重要病原体列表3：整理ppt整理ppt4．小结与展望随着分子生物学分析技术和真核生物系统分类学的进展，新的微生物不断被发现和分类，许多旧有微生物也被重新分类。立克次体目微生物种类繁多，专性细胞内寄生，既往分类存在许多问题；新的立克次体类微生物不断发现和鉴定。因此，需要应用种系进化与系统分类学手段对立克次体目微生物的分类进行调整。以Dumler和Rikihisa为首的著名立克次体研究学者长期致力与立克次体分类研究，取得一系列进展【4】。这些进展最近已收入国际权威细菌分类学巨著《伯杰氏系统细菌学手册》第2版第2卷（2005年出版）【2】。整理ppt近年来，无形体和埃立克体引起的人类无形体病和埃立克体病的报道日益增多，成为新现传染病的重要组成部分。目前世界上已新发现了2种人类埃立克体病，即查菲埃立克体（Ehrlichiachaffeensis）引起的人类单核细胞性埃立克体病（HumanMonocyticEhlichiosis,HME）；由腺热埃立克体（E.sennetsa）引起人类腺热（亦称传染性单核细胞增多症）。从前认为无形体（Anaplasma）只引起动物疾病，近年发现嗜吞噬细胞无形体（Anaplasmaphagocytophilum）可引起人类感染，并且常与莱姆病病原体伯氏螺旋体引起混合感染，从而受到广泛重视【5】。整理ppt

血清学研究证明我国云南地区军犬和健康人中存在犬埃立克体立克体抗体，人广东病犬、血红扇头蜱（Rhipicephalussanguineus）及广西的微小牛蜱（Boophilusmicroplus）扩增出犬埃立克体的基因片段。我国不少地区常有发热待查，或类似埃立克体病临床表现的病例的发生，提示可能存在有埃立克体病；在我国部分地区蜱类还检测出嗜吞噬细胞无形体的基因片段，显示我国可能存在此类病原体，值得研究证实【6，7】。整理ppt

参考文献[1]HOLTJG,Ed.Bergey'sManualofSystematicBacteriology,1stEd,Vol.1[M].Williams&Wilkins,Baltimore,USA,1984：687-720[2]BRENNERDJ,KRIEGNR,STALEYJTANDGARRITYGM,Ed.Bergey'sManualofSystematicBacteriology,2ndEd.,Vol.2[M].Springer,NewYork,USA,2005,110-145[3]RIKIHISA,Y.NewfindingsonmembersofthefamilyAnaplasmataceaeofveterinaryimportance[J].Ann.N.Y.Acad.Sci..2006,1078:438-445.

[4]DUMLERJ.S.,BARBETA.F.,BEKKERC.P.J.,etal.ReorganizationofgenerainthefamiliesRickettsiaceaeandAnaplasmataceaeintheorder

Rickettsiales;UnificationofsomespeciesofEhrlichiawithAnaplasma,

CowdriawithEhrlichia,andEhrlichiawithNeorickettsia;Descriptionofsixnewspeciescombinations;andDesignationofEhrlichiaequiand"HGEagent"assubjectivesynonymsofEhrlichiaphagocytophila[J].Int.J.Syst.Evol.Microbiol.2001,51:2145-2165.

5.宝福凯，EROLFIKRIG.伯氏疏螺旋体与嗜吞噬细胞无形体混合感染的实验究[J]。热带医学杂志，2007，7（3）：195－2006.曹务春，高玉敏，戴庆华,等。16SrRNA鉴定我国南方蜱中单核细胞埃立克体[J]。军事医学科学院院刊，2000，24（1）：1－47．高东旗，曹务春，赵秋敏，等。我国北方蜱中人粒细胞埃立克体16SrRNA基因的检测[J]。寄生虫与医学昆虫学报，2000，7（2）：103－106整理ppt

附：《伯杰氏系统细菌学手册》（Bergey‘sManualofSystemaicBacteriology）60年代以前，国际上不少细菌分类学家都曾对细菌进行过全面的分类，提出过一些在当代有影响的细菌分类系统。但70年代以后，对细菌进行全面分类的、影响最大的是"伯杰氏手册"。所以该书目前已成为对细菌进行分类鉴定的主要参考书。“伯杰氏手册”最初是由美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)及其同事为细菌的鉴定而编写的，名为《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey‘sManualofDeterminativeBacteriology)。该书自1923年问世以来，已进行过八次修订，现已发行第九版。整理ppt1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如1974年第八版，撰稿人多达130多位，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近20个国家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。70年代以来该书所提出的分类系统已被各国普遍采用。尽管该书编辑们一再坚决否认，还是被人称之为“细菌分类金标准"整理ppt伯杰氏手册现行版本从1984年开始至1989年分四卷出版，并改名为《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey'sManualofSystematicBacteriology)(第一版)(以下简称'系统手册"第一版)，1994年又将"系统手册"1-4卷中有关属以上分类单元的分类鉴定资料进行少量的修改补充后汇集成一册仍用原来书名出版，故称之为《伯杰氏鉴定细菌学手册》第九版。据报导，"系统手册"第二版修订工作已在进行之中，预计在年内开始分5卷出版发行，现已有资料介绍了第二版大致的分类结构。下面即简要介绍"系统手册"第一、二版对原核生物的大致分类。整理ppt第9版（1984，1986）中实质性的变化，象征着细菌分类学的发展进入新的阶段。第一，手册更名，原书名为《伯杰氏鉴定细菌学手册》（Bergey＇sManualofDeterminativeBacteriology），第9版由于内容增加，范围扩大，提高了手册的实用性，同时指出各类细菌间的关系，所以改名为《伯杰氏系统细菌学手册》；第二，由1卷分成4卷，这是考虑到能及时反映新进展和使用者的方便；第三，细菌在生物界的地位，8、9版间无变动，但它们的高级分类单位有很大变化，尤其嗜盐细菌和产甲烷细菌，根据胞壁分析和DNA序列分折，另列疵壁菌门，古细菌纲；第四，趋近自然体系，在各级分类单位中全面应用核酸研究；在表型特征的基础上，以DNA资料给予决定性的判断。使人为的分类体系过渡到自然体系的理想进一步付诸实现。整理pptBergey'sManualofSystematicBacteriology

1stEditionJohnG.Holt,Editor-in-Chief

Williams&Wilkins,Baltimore,MD

Publishedin4volumes:Volume1(1984)Gram-negativeBacteriaofgeneral,medical,orindustrialimportanceVolume2(1986)Gram-positiveBacteriaotherthanActinomycetes

Volume3(1989)Archaeobacteria,Cyanobacteria,andremainingGram-negativeBacteria

Volume4(1989)Actinomycetes整理ppt

从1984年第一版开始发行以来，细菌分类又取得了巨大进展，新命名的种成倍增加、新描述的属也在170个以上，尤其是90年代末以来，rRNA、DNA、蛋白质序列分析方法日趋实用，因而为细菌的系统发育积累了不少新的资料。因此已经有可能对其第一版进行新的修订。第二版预计分5卷出版，从已报导的资料看，它更多地依靠系统发育资料对细菌分类群的总体安排进行了较大的调整。第二版将原核生物分为30组，5卷大致的内容安排如下：

第一卷：1～14组。包括古生菌、蓝细菌、光合细菌和最早分支的属第二卷：15～