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文档简介
生化实验技术与方法第1页,共23页,2023年,2月20日,星期六实验操作硅胶薄板的制备:注意胶要均匀。1.2g硅胶H加4.0ml0.5%CMC溶液,研磨数分钟后,倒在预先准备好的玻璃板上,铺开,使浆液分部均匀,放在水平台上,自然晾干。第2页,共23页,2023年,2月20日,星期六2.板的处理:薄板的活化:105℃,0.5h
薄板的刮分:径向层析的优点是:样品展层后图谱呈弧形带状,使Rf值相近的化合物也能清楚地分开。3.点样:样品为鼠李糖、木糖和葡萄糖。点样量8-10μl。注意:点样点的直径小于5mm,点样要少量多次,吹风机风力不能过大。4.展层:展层溶剂为:乙酸乙酯:甲醇:乙酸:水=12:3:3:2(体积比),新鲜配制。5.显色:显色剂:苯胺-二苯胺-磷酸试剂。第3页,共23页,2023年,2月20日,星期六20mm10mm30mm8mm第4页,共23页,2023年,2月20日,星期六第5页,共23页,2023年,2月20日,星期六苯丙氨酸解氨酶的提取纯化
实验原理苯丙氨酸解氨酶(L-phenylalanine:ammonialyase,简称PAL;EC4.3.1.5)是植物体内苯丙烷类代谢的关键酶,与一些重要的次生物质如木质素、异黄酮类植保素、黄酮类色素等合成密切有关,在植物正常生长发育和抵御病菌侵害过程中起重要作用。本次实验是以银杏叶为原料采用分步盐析、透析脱盐、离子交换等方法得到苯丙氨酸解氨酶。第6页,共23页,2023年,2月20日,星期六仪器高速冷冻离心机;恒温水浴;电子天平;柱层析系统试剂酶提取液:0.1mol/L硼酸-硼砂缓冲液(含1mmol/LEDTA、20mmol/Lβ-巯基乙醇)固体硫酸铵0.02mol/L磷酸盐缓冲液(pH8.0,含0.5mmol/LEDTA,2.5%甘油,20mmol/Lβ-巯基乙醇);DEAE纤维素52第7页,共23页,2023年,2月20日,星期六操作步骤酶液提取(1)植物材料2g,剪成小段,加入5倍体积的酶提取液,于冰浴上用研钵研磨。(2)将已匀浆的酶液转入离心管,4000r冷冻离心30min。(3)取离心后的上清液(酶粗提液),量出其体积,留样0.5ml
。硫酸铵分级沉淀酶蛋白(1)根据实际体积、温度和硫酸铵饱和度用量表,算出达到38%饱和度应加入酶粗提液中的硫酸铵量,并称硫酸铵。(240g/L)(2)将酶液倒入烧杯内,边缓慢搅拌边缓慢加入称好的固体硫酸铵,待全部加完后,再缓慢搅拌10min;然后于9000r离心15min,保留上清液于烧杯内。(3)根据硫酸铵饱和度用量表,算出从38%到75%饱和度所需硫酸铵用量。(222g/L)(4)按上述(2)步同法处理,离心后,弃去上清液,保留沉淀。(5)将沉淀溶于2ml酶抽提液中,留样0.5ml
。透析脱盐酶液装入透析袋,放入低盐溶液中透析过夜,留样0.5ml。第8页,共23页,2023年,2月20日,星期六银杏叶2g+10ml酶提取液研磨4000rpm、30min取上清液加硫酸铵至饱和度38%
9000rpm、15min取上清液加硫酸铵至饱和度75%
9000rpm、15min取沉淀溶于2ml酶抽提液透析第9页,共23页,2023年,2月20日,星期六纯化离子交换层析DEAE纤维素(1)称取DEAE纤维素52干粉1~1.5g,加20ml的0.02mol/L磷酸盐缓冲液(pH8.0)浸泡4h以上(或浸泡过夜)。(2)装柱:把预处理的DEAE纤维素52装柱。装柱完成后,用2~3个床体积的0.02mol/L磷酸盐缓冲液(pH8.0)洗脱平衡该柱。(3)上样:把所得的酶洗脱液小心地注入柱床面中央,上样结束后,在床面以上小心地加入0.02mol/L磷酸盐缓冲液2~3cm厚液层。注意上样开始就收集流出液。(4)洗柱:约用2倍床体积的A液(0.02mol/L磷酸盐缓冲液)及B液(含1mol/LNaCl的0.02mol/L磷酸盐缓冲液)洗柱,按洗脱管编号,取A280值高的管中洗脱液测其PAL的活力;合并主要含有PAL活力的各管洗脱液,并量出其体积(ml)。第10页,共23页,2023年,2月20日,星期六苯丙氨酸解氨酶的活力测定
PAL催化L-苯丙氨酸裂解为反式肉桂酸,反式肉桂酸在290nm处有最大吸收值。若酶的加入量适当,A290升高的速率可在几小时内保持不变,因此通过测定A290升高的速率以测定PAL活力。规定1h内A290增加0.01为PAL的一个活力单位。第11页,共23页,2023年,2月20日,星期六取试管2支,按表中所述(0号为调零管,1号为测定管。注意按表格从上到下的顺序加入试剂)。(单位:ml)
试剂类型调零管(0号)待测管(1号)pH8.7的0.1mol/L硼酸缓冲液320.1mol/LL-苯丙氨酸溶液0
1样品(酶)溶液0.1
0.1将各管混匀,放入40℃恒温水浴保温1h(准确计时),到时各加0.2ml2mol/LHCl终止反应。紫外分光光度于波长290nm处测定1号管的A290。第12页,共23页,2023年,2月20日,星期六蛋白质测定(考马斯亮蓝染色法)取酶液0.1ml,用蒸馏水稀释至5ml取试管8支,按下表加入各溶液:将上述各试管混匀,静置2min,测定各管的A595。
试管编号01234567标准蛋白质溶液(ml)50ug/ml00.20.40.60.81.0//稀释酶液(ml)//////1.01.0蒸馏水(ml)2.01.81.61.41.21.01.01.0考马斯亮蓝(ml)2.02.02.02.02.02.02.02.0第13页,共23页,2023年,2月20日,星期六PAL总活力、比活力、蛋白质含量的计算步骤体积(ml)蛋白质含量(mg)总活力(m)比活力(m/mgprotein)粗提硫酸铵沉淀透析离子交换层析第14页,共23页,2023年,2月20日,星期六SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
(SDS-PAGE)测定蛋白质分子量
原理:SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方法,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量。电泳迁移率与颗粒的电荷、形状、大小(分子量)有关,如电荷、形状都一样,则电泳迁移率只与分子量有关。第15页,共23页,2023年,2月20日,星期六SDS是在PAG系统中引进SDS(十二烷基磺酸钠)。
SDS的作用:1.能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的二级和三级结构,强还原剂(巯基乙醇)能使二硫键断裂,使蛋白质完全变性。2.能与变性的蛋白质按比例结合,形成SDS-蛋白质复合物。SDS-蛋白质复合物的特点:1.由于结合大量的SDS,使蛋白质丧失了原有的电荷状态,从而降低或消除了各种蛋白质分子之间天然的电荷差异。2.复合物都是椭圆棒状,从而降低或消除了各种蛋白质分子之间天然的形状差异。因此在进行电泳时,蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。第16页,共23页,2023年,2月20日,星期六测定各条带的相对迁移率,根据已知蛋白质分子量和它们的相对迁移率,以相对迁移率为横坐标,lgMr为纵坐标作标准曲线。根据未知蛋白质的相对迁移率从标准曲线上查出它们的lgMr,再换算成蛋白质分子量.第17页,共23页,2023年,2月20日,星期六
在一定范围内,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数。若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。第18页,共23页,2023年,2月20日,星期六操作如同PAGE。样品:蛋白质要完全变性。蛋白质+SDS+巯基乙醇100℃2-5分钟标准蛋白市场有售,被测蛋白质的分子量应在标准蛋白分子量以内。染色:考马氏亮蓝、银染色该法测定蛋白质分子量的局限性:1.蛋白质是由亚基(如血红蛋白)或两条以上肽链(如胰凝乳蛋白酶)组成的,测定时只是它们的亚基或单条肽链的MW。2.电荷异常的蛋白质(如组蛋白,带大量正电荷)3.结构异常,不于分子量呈线性关系(如胶原蛋白)4.带有较大辅基的蛋白质(如糖蛋白)第19页,共23页,2023年,2月20日,星期六实验操作编号溶液名称12%分离胶4%浓缩胶130%Acr–0.8%Bis2.0ml0.2ml2pH8.8Tris-HCI1.25ml-3pH6.8Tris-HCI-0.375ml410%SDS50ul15ul5TEMED5ul5ul610%AP50ul15ul7H2O1.65mlo.9ml总体积约5mL约1.5mL
胶的制备第20页,共23页,2023年,2月20日,星期六标准蛋白质分子量兔磷酸化酶B97400牛血清白蛋白66200兔肌动蛋白43000牛碳酸酐酶31000胰蛋白酶抑制剂20100鸡蛋清溶菌酶14400第21页,共23页,2023年,2月20日,星期六样品的处理:按0.5mg蛋白质/1mL溶液的比例向标准蛋白质或待测样品中加入样品溶解液(小试管),充分溶解后,置沸水浴3min,取出冷至室温。加样量:20μl,标准蛋白(M)全加。电泳:点样端负极,恒压:开始80V,待样品进入分离胶后120V。电极缓
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