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文档简介
第三单元蛋白质化学及代谢氨基酸的性质一、氨基酸的物理性质1.溶解性无色晶体,水中溶解度各不同,取决于侧链。2.熔点熔点较高(200-300℃)。3.光吸收在紫外有特征吸收的仅三个芳香族的氨基酸Trp、Tyr、Phe,利用这一特点,可以通过测定280nm处的紫外吸收值的方法对蛋白溶液进行定量。Trp,Tyr和Phe的紫外吸收
4.旋光性除Gly外,其它的氨基酸都有旋光性。
如含两个手性碳原子,则有4种立体异构体,分别称为D-,L-,D别-和L别-氨基酸。L-苏氨酸(L-threonine)D-苏氨酸(D-threonine)L-别-苏氨酸(L-allo-threonine)D-别-苏氨酸(D-allo-threonine)
组成蛋白质的氨基酸除Gly以外,都有手性碳原子,所以都有旋光性,能使偏振光的偏振面的向左或向右旋转,向左旋转的称左旋,用“―”号表示,向右旋转的称右旋,用“+”号表示。
消旋外消旋内消旋L-胱氨酸D-胱氨酸内消旋胱氨酸二、氨基酸的酸碱性质1、氨基酸的两性离子形式
氨基酸在晶体或水溶液中通常以两性离子(dipolarion)形式存在。同一个氨基酸分子上可以即有正电荷又有负电荷,故称为两性电解质,可进行两性解离。熔点:高溶液介电常数:增加2、等电点BrÖnsted-Lowry的酸碱理论,即广义酸碱理论。HAA-+H+酸碱质子氨基酸在水中的两性离子形式既能像酸一样放出质子,也能像碱一样接受质子,氨基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质。Asanacid(protondonor):Asabase(protonacceptor):不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在:
正离子两性离子负离子在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(isoelectricpoint),以pI表示。在等电点时,氨基酸主要以两性离子形式存在,但也有少量的而且数量相等的正、负离子形式,还有极少量的中性分子。当溶液的pH=pI时,AA主要以两性离子形式存在。pH<pI时,AA主要以正离子形式存在。pH>pI时,AA主要以负离子形式存在。3.氨基酸的酸碱滴定曲线
Henderson-Hasselbalch方程pH=pKa+lg[质子受体][质子供体]酸碱滴定曲线pK1为-COOH(4-5)解离,pK2-NH3(10-11)解离﹢氨基酸的酸碱滴定4.等电点的计算
K1=[Gly±][H+][Gly+]K2=[Gly-][H+][Gly±]pI时,[Gly+]=[Gly-][Gly±][H+]K1=[Gly±]K2[H+][H+]2=K1K2pH=(pK1+pK2)/2pI=(pK1+pK2)/2pI=(2.34+9.60)/2=5.97Gly酸性氨基酸,以Asp为例:碱性氨基酸,以Lys为例:5.氨基酸的甲醛滴定法氨基酸不可直接用酸、碱滴定进行定量测定,因为滴定终点的pH过高(11-13)或过低(1-2),无适当的指示剂。加入过量的甲醛可降低氨基的碱性,相对增加-NH3酸性,使氢氧化钠滴定的终点下移至pH9附近,可用酚酞指示。三、氨基酸的化学性质1.α-氨基的化学反应:
(1)与亚硝酸的反应
VanSlyke定氮
(2)与甲醛的反应
氨基滴定
(3)与酰化基的反应
氨基保护基
(4)与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应
(5)与二甲基氨基萘磺酰氯(DNS-Cl)的反应
(6)与Edman试剂(苯异硫氰酸酯,PITC)反应
(7)与醛形成西佛碱
(8)酶氧化脱氨(1)与亚硝酸的反应(VanSlyke定氮)α-氨基3-4min,其他氨基也能反应,速度较慢。(2)与甲醛的反应:氨基酸的甲醛滴定法R—CH—COO-NH3+R—CH—COO-NH2+H+OH-中和滴定HCHOR—CH—COO-NHCH2OHHCHOR—CH—COO-N(CH2OH)2(3)酰基化反应酰氯:苄氧甲酰氯(Cbz-Cl):对甲苯磺酰氯(Tos-Cl):叔丁氧甲酰氯(Boc-Cl):酸酐:邻苯二甲酸酐:(R’=酰基)X=卤素(Cl、F)(4)与2,4-二硝基氟苯(DNFB,Sanger试剂)的反应弱碱性DNP-氨基酸取代DNFB测定蛋白质N端氨基酸,灵敏度高(5)与丹磺酰氯的反应(6)与异硫氰酸苯酯(PITC,Edman试剂)的反应无水HFPITCPTC-氨基酸PTH-氨基酸(7)与醛形成西佛碱
(8)酶氧化脱氨R′C=O+HR′H2NCHHR′COOHC=NCHHR-H2O+H2O2.α-羧基的化学反应
(1)成盐和成酯反应羧基保护
(2)酰氯化反应羧基活化
(3)叠氮反应合成肽
(4)与肼(hydrazine)的反应C端氨基酸分析(1)成盐反应R—CH—COOH+NaOHNH2R—CH—COONaNH2(2)成酯反应R—CH—COOH+C2H5OHNH2HCl气R—CH—COOC2H5NH2当羧基变成乙酯后,羧基的化学性质就被掩蔽了,而氨基的化学性质就突出地显示出来。(3)酰氯化反应
使氨基酸的羧基活化,易于另一氨基酸的氨基结合,在合成肽的工作上常用。(4)叠氮反应H2N-CHR-COOHYHN-CHR-COOH酰化氨基酸YHN-CHR-COOCH3酰化氨基酸甲酯NH2NH2(-CH3OH)YHN—CHR—CO—NH—NH2酰化氨基酸的肼衍生物HNO2YHN—CHR—CON3+2H2O酰化氨基酸叠氮3.α-氨基和α-羧基共同的反应
(1).与茚三酮(ninhydrin)的反应氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物(Pro为黄色),最大吸收峰在570nm(Pro440nm)处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法(μg)。
茚三酮还原茚三酮第二个茚三酮紫色化合物的两个共振形式(2).成肽反应4.侧链R基的化学反应(1)-S-S-和-SH的氧化还原反应R-SH:HS-CH2CH2OH巯基乙醇(mercaptoethanol)HS-CH2COOH巯基乙酸(mercaptoaceticacid)HS-CH2(CHOH)2-CH2SH二硫苏糖醇(DTT)
半胱氨酸的-SH很活泼,很容易在空气中重新氧化形成二硫键,一般可用卤代化物(碘乙酸,碘乙酰胺)对-SH进行保护。半胱氨酸的巯基可打开乙撑亚胺(氮丙啶)的环HHOOC-C-CH2-SH+NH2H2CNHH2C
HHOOC-C-CH2-S-CH2-CH2-
NH2NH2(AECys)半胱氨酸与二硫硝基苯甲酸(DTNB)或称Ellman试剂反应,硫硝基苯甲酸,412nm有光吸收。S—SCOOHO2NHOOCNO2半胱氨酸巯基能和多种金属离子形成络合物,如对氯汞苯甲酸。COOHHgHHOOC—C—CH2—SNH2(2)苯环的黄色反应Phe+少量浓H2SO4+浓HNO3
黄色TyrTrp+浓HNO3
黄色or(3)酚基的Millon反应(米伦氏反应)HgNO3
Tyr+Hg(NO3)2
红色HNO3
(4)pauly反应His+重氮苯磺酸红色(棕红色)Tyr+重氮苯磺酸橘黄色(5)Folin一酚反应+磷钼酸Tyr磷钨酸Trp蓝色(钼蓝与钨蓝混合物)(6)Arg的侧链反应可与环己二酮或丁二酮生成可逆的缩合物。四、氨基酸的分析分离氨基酸的分析分离工作是测定蛋白质结构的基础,分离和定量测定蛋白质水解液中的各种氨基酸是一项艰巨的任务。层析是利用混合物中各组分的理化性质的差别,使各组分以不同程度分配在两相(固定相和流动相)中,并使各组分以不同速度移动,从而达到分离。分配系数Kd=CACBCA:一种物质在A相(流动相)中的浓度CB:一种物质在B相(固定相)中的浓度分配层析原理(分配定律):当一种溶质在两种一定的互不相溶的溶剂中分配时,在一定温度下达到平衡后,它在这两种溶剂中的浓度比值与在这两种溶剂中的溶解度比值相等,这个比值是个常数,称分配系数K(1)逆流分溶(逆流分配)
(2)纸层析单向纸层析图Rf值
双向纸层析图
(3)薄层层析(4)离子交换层析法
原理:分离氨基酸时,用离子交换树脂作为支持物,利用离子交换树脂上的活性基团与溶液中的离子进行交换反应,由于各种离子交换能力不同,与树脂结合的牢固程度就不同,在洗脱过程中,各种离子以不同的速度移动,从而达到分离的目的。这种分离主要与各种离子所带电荷有关,在电荷相同时,与极性,非极性有关。离子交换树脂:
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