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代测序与二代测序的区别与联系Sanger法测序(一代测序)Sanger法测序利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。 直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成, 每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸 (ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-0H基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在 G、A、T或C处终止。终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。 它们具有共同的起始点, 但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用 X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。高通量测序(二代测序)高通量测序技术(High-throughputsequencing,HTS是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变,一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定 ,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(nextgenerationsequencing,NGS)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能 ,所以又被称为深度测序(Deepsequencing)。第一代和第二代测序技术第X代公司平台名称测序方法检测方法大约读长(碱基数)优点相对局限性ABI/3130桑格-荧光高读长,准确度一通量低;样品制备第 生命xL-3毛细管/光600-次性达标率咼,能成本咼,使之难以技术730x电泳测1000很好处理重复序做大量的平行测代公司L序法学列和多聚序列序第贝克GeXP桑格-荧光/600-高读长,准确度一通量低;单个样品-~一遗传毛细管次性达标率咼,能的制备成本相对曼光学1000代分析电泳测很好处理重复序较高
系统序法列和多聚序列;易小型化
第代罗氏/454基因组测序仪FLX系统焦磷酸测序法光学230400在第二代中最高读长;比第一代的测序通量大样品制备较难;难于处理重复和同种碱基多聚区域;试剂冲洗带来错误累积;仪器昂贵HiSe可逆链第以鲁q200终止物荧光/2x15仪器昂贵;用于数 很高测序通量据删节和分析的米那0/mi和合成光学0代Seq测序法费用很高很高测序通量;在测序运行时间长;5500广为接受的几种第ABI/xlSO连接测荧光/25-3第二代平台中,所读长短,造成成本-~二SOLiLiD序法光学5要拼接出人类基高,数据分析困难代D系统因组的试剂成本和基因组拼接困难;仪器昂贵最低读长短,推高了测第赫利Heli单分子荧光/25-3高通量;在第二代序成本,降低了基 scop合成测中属于单分子性克斯光学0因组拼接的质量;代e序法质的测序技术仪器非常昂贵 资料来源于文献
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