医学信息检索1讲绪论课件

医学信息检索MedicalInformationRetrieval1整理课件文献检索课：一门获取知识的科学方法课社会信息化:信息和知识成为重要的生产力要素。知识信息的半衰期缩短。文献检索课是一门关于如何查找文献，独立获取知识信息的科学方法课。目标：培养学生的信息素养，继而提高学习和研究能力。2整理课件课程安排主要章节和内容教材与参考资料《医药信息素养》（胡家荣主编，人民军医出版社，2007年）各种电子数据库中的[指南][帮助]医学信息检索实习指导（教研室自编）3整理课件主要章节内容绪论图书馆利用基础（馆目检索、联目查询）中文生物医学文献数据库（书目型数据库）中文学术期刊全文数据库（全文型）PubMed检索系统（书目型）外文学术期刊全文数据库MedlinePlus（医学参考知识查询平台）网上特种文献检索（专利、会议、学位）4整理课件主要章节内容（续）网络检索工具网络虚拟参考咨询服务中外学术期刊全文的获取医学信息分析方法与综合利用总复习要求理论课不缺席。上机实习按要求完成课堂作业。平时多上网练习。5整理课件第一讲医学信息检索绪论广州医学院图书馆文检教研室6整理课件本讲主要内容标题第一节文献信息概述第二节文献信息检索第三节信息检索技术第四节信息检索语言第五节常用检索方法与检索策略7整理课件第一节文献信息概述8整理课件一、信息（information)定义：信息是物质存在的一种方式、形态或运动状态，是事物的一种普遍属性，一般指数据、消息中包含的意义，可以使消息中所描述事件的不定性减少。——（国家标准《情报与文献工作词汇基本术语》（GB4894-85）自然信息、社会信息基本属性客观性、可知性、传递性9整理课件二、知识（knowledge)Webster（韦氏词典）1997年版：知识是通过实践、研究、联系或调查获得的关于事物的事实和状态的认识，是对科学、艺术或技术的理解，是人类获得的关于真理和原理的认识的总和。理性化、优化、系统化的信息即为知识。10整理课件

知识的类型（世界经合组织）知识可以分为两大类基础理论知识（硬知识）社会实践知识（软知识）“有形知识”（可编码化、信息化，可通过各种传媒获得）。“隐形知识”（隐含经验类或无形知识）（需要通过社会实践获得）。

11整理课件三、文献（document,literature)文献：记录有知识的一切载体。其中包含四个要素：有信息和知识的内容；有记载信息知识的物质载体；有文字、图形、声频视频、激光等记录手段；有一定的表现形式（图书、期刊、电子出版物等）。12整理课件四、文献信息资源信息资源（Informationresources)是可供人类开发和利用的各类文献信息的集合。具有取之不尽，用之不竭，内容稳定，可以共享并且可以再生的特性。信息作为一种资源，在当前以知识为基础的经济社会中，地位明显上升，它与物质和能源共同构成了支撑现代社会经济发展的三大资源。各国政府都把对信息资源的开发作为国民经济发展事业的重中之重。近年来国内外开发的知识产品（数据库）和构建的一站式信息检索平台越来越多，越建越好。方便了信息用户。系统地了解这些知识产品和信息资源并加以有效地利用，可提高个人综合素质，加速知识的创新，促进科技发展。13整理课件五、文献的类型文献信息资源大致按以下三种形式划分：按文献载体形式划分按文献出版形式划分按对文献内容加工层次划分14整理课件按载体划分纸质型信息资源（印刷、手写）电子数字型信息资源（数据库、网络…）视听型信息资源——以磁性材料为载体缩微型信息资源——以感光材料为载体或者简单分为：印刷型：纸质及类似载体机读型：缩微、视听、电子数字化15整理课件按文献出版形式划分图书(book）（ISBN）包括传统的印刷本图书和现代的电子版图书。期刊(periodical，journal）（ISSN）学术性期刊科普性期刊娱乐性期刊16整理课件图书(books)国内外公开出版的图书都有ISBN码（InternationalStandardBookNumber)

国内外公开出版的期刊都有ISSN码（InternationalStandardSeriesNumber)一般阅读类书籍：注意选用经典教科书、浏览本专业或相关专业领域中的新书。参考工具书：注意利用字（词）典、手册、指南、年鉴、以及网络上的在线词典和大型参考数据库。17整理课件核心期刊（corejournals)是科技期刊中少数高质量的特定期刊，指各学科领域刊载本专业学术论文数量大、学术水平高，能反映本学科最新研究成果及前沿研究状况与发展趋势的期刊，其载文率、被引用率以及参考利用价值都很高。国内：中华医学杂志、~内科学…国外：柳叶刀、新英格兰医学杂志国内核心期刊可通过《中文核心期刊要目总揽》查找；国外医学核心期刊主要有NLM和WHO两个机构确定，可通过大型数据库查找。。18整理课件其它类型的文献报纸(newspaper)特种文献(specialpublications)（包括科技报告、会议文献、专利文献、标准文献、政府出版物、学位论文、技术档案、产品目录等）。19整理课件按对文献内容加工层次划分一次文献（primarydocument)二次文献(secondarydocument)三次文献(tertiarydocument)统称文献的级别20整理课件一次文献primarydocument又称原始文献。主要包括专著、期刊论文、科技报告、会议文献、学位论文、技术标准、档案资料以及专利文献等。具有创造性、新颖性、先进性和成熟性。是科研人员参考、学习、借鉴和利用的最基本、最主要的文献类型。但数量庞大、类型复杂、语种繁多、发表分散，需借助二、三次文献才能有效利用。21整理课件二次文献secondarydocument指各种目录、索引、文摘等检索工具或书目型数据库。其主要功能是揭示和报道一次文献，提供查找原始文献的线索。具有简明性、浓缩性、汇集性和系统性的特点，是文献信息检索的主体。二次文献仅仅是对收集到的一次文献进行加工整理，著录文献特征，标引查找线索，但不会改变一次文献原有的内容。22整理课件三次文献tertiarydocument指由各专家学者在利用二次文献的基础上，选用大量一次文献的内容，并对其进行分析、综合、提炼、重组而形成的再生文献，是在原始文献的基础上进行再创作的成果。包括综述、评论、进展、预测等，各类词典、手册、年鉴、百科全书、教科书等各类参考工具书也属三次文献的范畴。特点：具有海量信息，汇集知识系统性、针对性和综合性强，参考价值大等特点，也是科研人员获取文献信息的重要来源。23整理课件六、主要电子学术资源电子图书超星数字网书生之家方正阿帕比电子期刊（中文）中国学术期刊全文数据库（清华同方）万方数字资源中文科技期刊全文数据库（重庆维普）可购网上阅读卡单位团体订购或阅读卡24整理课件电子期刊（外文全文数据库）OVIDSpringerLinkProQuestMedLibElsevierScieneKluwerOnlineEBSCOhostWileyInterScienceEtal.广医图书馆订购中大图书馆订购25整理课件文献信息环境及特点信息量大，增长速度快，更新周期短；语种繁多，类型复杂，载体多样化；内容相互交叉，学科相互渗透；知识老化速度加快，信息有效率缩短；检索手段更新快，正向网络化方向发展；网络资源的开发、网络检索工具的研制、网络信息资源共享是未来的文献信息资源开发的趋势。26整理课件第二节文献信息检索27整理课件文献信息检索有效地选择和利用信息的科学方法与手段就是信息检索。广义：信息存储与信息检索（两个方面）狭义：仅指信息用户查找信息的过程。信息集合：即检索系统，包括手工检索工具、电子数据库、网络工具及其硬件设备和软件系统。28整理课件信息检索的基本原理信息存储时，将采集到的大量分散的源信息（一次文献），经过标引著录，加工整理，使之有序化后形成各类信息集合；信息检索时，将要查找的信息特征标识与信息集合中已存储的信息特征标识进行比较、匹配，双方特征标识完全一致或部分一致时，检索即为命中。29整理课件信息检索原理示意图

文献信息检索标识数据库标引存储检索表达式检索提问规范检索语言检索匹配运算输出检索结果采集30整理课件信息检索在科研中的意义和作用可以使文献资源充分地得以传递、交流和利用，减少科研活动中的重复劳动和物质资源的浪费。用最少量的时间，获取最大量的信息，从而加速科研进程，促进科技进步。扩大学术视野，启迪研究思路，改善智能结构，实现知识自我更新，做到有所发现、有所创新，有所发展。31整理课件信息检索的分类按检索对象划分数据检索(dataretrieval)事实检索(factretrieval)文献检索(literatureretrieval)按检索技术手段划分手工检索计算机检索网络查询与交流确定性检索，可直接获得解答。32整理课件数据（型）信息检索又称数值检索，检索对象为特定的数值数据，主要回答“是多少”一类的问题，属于确定性检索的范围。如：物质的各种参数、电话号码、银行帐号、各类统计数字、化学药物的理化常数，常用计量等。数据检索需借助相关的参考工具书或通过数值型（事实型）数据库。33整理课件事实（型）信息检索又称事项检索，检索对象为特定的事实，主要回答“是谁”或“是什么”一类的问题，也属于确定性检索。如：名词、概念、标准、法律法规等。纳米技术生物芯片细胞凋亡事实检索主要借助参考工具书或事实型数据库。34整理课件文献（型）检索以某些特定的文献为检索对象，检索结果是关于某一课题的切题文献或相关文献。如：查国内外近五年关于“早老素与老年痴呆的关系”方面的研究文献。文献检索属于相关性检索，系统仅提供相关的文献线索、文献摘要或全文以供检索者参考阅读和分析研究。文献检索借助手工检索工具或大型期刊文献数据库（书目型或全文型数据库）。35整理课件信息检索方式手工检索（1879-）（印刷型检索工具）《美国医学索引》《中文科技资料目录》计算机检索

（1960-）（包括计算机，操作系统，数据库，检索软件）如：

《CBM》《MEDLINE》网络查询与交流（1990-）（利用各种搜索引擎，访问各类信息资源站点、查询网络数据库、通过电子邮件、讨论组等）36整理课件数据库数据库：是由一个或多个文档构成，以计算机磁盘或光盘等高新科技材料为载体，并有专门的软件进行管理的系统化、有序化的数据集合体，是计算机信息检索系统的重要组成部分。数据库根据收录内容不同，可分为数值型、事实型以及文献型等三种类型。37整理课件数值数据库(NumericDatabase)存储各种统计、实验、测量等方面的数据。事实数据库(FactDatabase)存储描述事物等信息的情况过程和现象的事实。（如各类电子版字辞典）文献数据库（Literaturedatabase)数据库类型38整理课件

文献型数据库书目数据库(BibliographicDatabase)存储文献的外部特征，主要包括文献的题名、著者、著者单位、所载期刊刊名，出版年、卷、期和起止页码，可以包括摘要，但不包括文献的全文。全文数据库(FullTextDatabase)与书目数据库相对而言。主要存储原始文献的全文，如期刊论文、报纸新闻、法律法规、政府出版物等。39整理课件文献型数据库的一般结构数据库（databank）

文档（file，通常按年限划分）记录（record，单元论文）字段（field）字段用来记录和描述每篇文献的外表特征和内容特征。（如：题名、作者、摘要）40整理课件数据库常见字段题名（Title,TI）★著者（

Author,AU）★著者单位地址（Address,

AD）出处（Source,

SO）★摘要（

Abstracts,AB）文献类型（Publicationtype,PT）文献题录三要素（线索）：题名著者出处题录41整理课件第三节计算机文献检索技术42整理课件计算机基本检索技术计算机检索不论是最早的单机或联机检索，或是现代流行的网络查询，一般使用的检索技术主要包括：布尔逻辑检索截词检索邻近检索（位置检索）字段限定检索网络信息检索规则43整理课件1.布尔逻辑检索技术布尔逻辑检索是建立最早、应用最为广泛的检索理论和检索技术，也是最简单、最基本的计算机检索的匹配模式。逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户的检索要求，并通过逻辑运算符连接两个以上的检索词，从而实现两个以上概念的逻辑组配检索。44整理课件布尔逻辑示意图运算符：AND，*起缩小检索范围，提高查准率的作用。运算符：OR，+起扩大检索范围，提高查全率的作用。运算符：NOT，-起缩小检索范围，用于去除检出文献中不需要的部分。逻辑与逻辑或逻辑非45整理课件布尔逻辑表达式childandasthma小儿哮喘lungcancerandsmoking吸烟与肺癌traceelementsnotzinc

除锌以外的微量元素肝癌或肝细胞瘤的诊断(肝癌

or肝细胞瘤)and诊断优先级：（）>NOT>AND>OR46整理课件2.截词检索技术截词检索(Truncation)是将检索词截断，取其中的一部分片段，再加上截词符号一起输入计算机，系统自动将词片段与数据库中的索引词匹配，凡含有该词片段的文献均被检出。截词方式主要有：右截词符“*”

（*=0-n个字符）中间截词符“？”

(？=0-1个字符)输入Pain*，即可检出：Pain,painful,painless,painness，painkiller

47整理课件3.邻近检索技术（Proximity)邻近检索是用邻近算符（或叫位置算符）连接两个检索词，要求检出文献中的两个检索词必须同时出现在同一个句子或同一个字段当中。常用于自由词检索，起提高查准率的作用。near

要求两词出现在同一个句子中。with

要求两词出现在同一个字段中，如篇名、摘要、主题词等。48整理课件4.字段限定检索技术多数文献数据库检索系统中都设置了字段限定检索功能[Limit]，以满足检索用户指定检索某一个特定字段或几个字段信息的要求。运算符：IN，=

[AU]限查作者[AD]限查作者机构[MH]限查医学主题词[PT]限查文献类型[TA]限查特定刊名徐军INAU，AU=徐军；综述INPT提示:多数文献数据库检索系统中都设置了字段限定检索功能，以满足检索用户检索某一个特定字段或几个字段信息的要求。过去常用命令式,近两年多数改为表单勾选式。49整理课件5.加权检索（含义）基本含义：加权检索是某些检索系统中设置的一种定量检索技术。基本方法：在每个提问词后面给定一个数值表示其重要程度，这个数值称为权。在检索时，先查找这些检索词在数据库记录中是否存在，然后再计算存在的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值，该记录即为命中记录。50整理课件加权检索（作用）加权检索可以命中核心概念文献，因此是一种缩小检索范围提高检准率的有效方法.如:中国生物医学文献数据库（CBM）就采用了这种技术,可以将主要论述某一主题概念的医学论文检出来，减少命中文献数量，提高文献主题专指度。51整理课件6.聚类检索聚类检索是在对文献进行自动标引的基础上，构造文献的形式化表示——文献向量,然后通过一定的聚类方法，计算出文献与文献之间的相似度，并把相似度较高的文献集中在一起，形成一个个的文献类的检索技术。在这样的类目体系中，主题相近、内容相关的文献便聚在一起，而相异的则被区分开来。52整理课件7、网络信息检索规则包含或排除检索（加减检索）：+，-词组检索（强制检索）：“

”自然语言检索：任意词或句子模糊检索：可以自动修正提问错误，给出正确信息概念检索：系统自动对某一概念词及其同义词或近义词加以识别并自动匹配检索多语种检索：系统自动翻译转换不同语种53整理课件检索技术的发展趋势目前信息检索技术正逐步从书目检索向全文检索和多媒体检索方向发展，智能化检索将成为未来计算机网络信息检索的发展趋势。在学习应用传统检索技术的同时，也要不断地注意学习更先进的检索技术。54整理课件文献检索语言概述文献检索语言是根据文献信息检索的需要而创制的一种人工语言，又叫做文献存储或检索语言。（标引、索引、检索语言）文献信息检索语言既是汇集、组织、存储文献的手段和工具，又是沟通文献管理者、文献用户、以及文献作者三方的桥梁。系统学习了解有关检索语言的基本知识是提高检索效率的重要环节。55整理课件检索语言的种类（一）描述文献外表特征的检索语言文献题名索引系统（书名、刊名目录）著者索引系统（著者索引）文献序号索引系统（专利号索引、科技报告号索引、技术标准号索引）引文索引系统（以科技论文末尾的参考文献外表特征（题录）编制的著者引文索引系统，如：美国《科学引文索引》56整理课件检索语言的种类（二）描述文