下一代测序原理课件

下一代测序原理51、山气日夕佳，飞鸟相与还。52、木欣欣以向荣，泉涓涓而始流。53、富贵非吾愿，帝乡不可期。54、雄发指危冠，猛气冲长缨。55、土地平旷，屋舍俨然，有良田美池桑竹之属，阡陌交通，鸡犬相闻。下一代测序原理下一代测序原理51、山气日夕佳，飞鸟相与还。52、木欣欣以向荣，泉涓涓而始流。53、富贵非吾愿，帝乡不可期。54、雄发指危冠，猛气冲长缨。55、土地平旷，屋舍俨然，有良田美池桑竹之属，阡陌交通，鸡犬相闻。第二代测序技术原理及数据分析华大目SangerDideoxySequencingDNAWiEh5(TTaT3Labeledprimer+dATP,dcTPdTTP,anddGTP+ddCTPCITaTCGAAOTTGGAAGTcTTOTGGAAGTGA(3Electrophoresisof1Dr.FredSangerFrederickSangerwasawardedtheprizeinboth1958and1980.HeisPrizesandtheonlypersontobyreadingorderCTGSangeretal.,1977)DNA双脱氧链终止法测序rAdonwaneyLongman,,,,Ir创意法教育提出:“最差”的学生就是“最好”的学生,“最好”的学生在某一方面也可能是“最差”的学生,即学生无好差之分,要有效地提高小学生的语文素质,只有想方设法去激发学生的学习兴趣,尊重学生的个性,因材施教,平衡发展,培养学生的自主学习能力,才能全面提高小学语文教学水平。作为一名小学语文教师,我深知低年级识字数量的多少,质量的高低会对他们今后的继续学习产生直接影响。因为语文是一门基础学科,而识字教学又是基础中的基础。然而识字过程,又是一件十分枯燥的事。那么,怎样才能提高学生的识字质量呢?即:激发学生的学习兴趣,教给学生正确的识字方法,有效培养学生识字能力。我们常说,兴趣是最好的老师,如果学生认识到学习汉字的重要性,同时对识字产生了浓厚的兴趣,他们就能自觉主动地读书识字。怎样才能使学生对识字产生浓厚的兴趣呢?我在教学工作中采取了以下几种方法:一、激发兴趣,让学生乐意学兴趣是调动学生积极思维、探求知识的内在动力,有了兴趣爱好,学习就不再是一种负担,而是一种乐趣。在教学中语言、表情、动作要适合学生的年龄特征,使他们和老师的关系更亲近、更密切,其次根据学生天真活泼、合群、爱交朋友这一特点,可将生字形象地称为“娃娃”、“小客人”等好听的名字,让学生对生字有一种亲切感。比如用猜谜语的方式也极易让学生记住:(层)云头一具尸;(翠)士兵头上插羽毛;(爽)错错错大错;(琴)今日头上写二王;(困)一口咬根树;(牵)大牛腰戴帽;(灿)山边在起火;(握)屋边伸支手;(弹、胡)单弓射到古时月等。识字过程也随之变成交朋接友的过程,亲切自然的称呼自然唤起了学生的注意力,学习兴趣也就随之而生。二、变换形式,让学生在玩中学心理学家研究表明,小学儿童的有意注意力时间短,无意注意力占优势。根据这一特征,要想在40分钟的教学活动中保持学生的学习兴趣,就不能只采用单一的教学形式,要引导学生变换形式,不断满足学生的好奇心。游戏是学生乐意为之的活动,在教学过程中,要找准游戏与相关教学内容开展游戏,使学生真正“动”起来,做到在玩中学习,在玩中思考,在玩中创新。根据学生心理特点,教师讲授新课时,要精心设计,把理性的传授与声、色、形等融为一体,使机械、呆板的教学内容变得妙趣横生,赏心悦目,这样可以借教师的语言感染力,唤起学生的情感和想象,形成生动、活泼的课堂教学,天南地北,激发学生的学习兴趣。如:教学小学语文第一册《识字6》时,我设计了一个旅游的大情境,在愉快的游行中分成五个环节:①买票:自读生字。②浏览景点:认识景物名称(海鸥、沙滩、军舰、秧苗、稻田、鱼塘、果园、小溪、石桥、翠竹、飞鸟)。③扫除拦路虎:认识一只海鸥、一片沙滩、一艘军舰、一条帆船、一畦秧苗、一块稻田、一方鱼塘、一座果园、一道小溪、一孔石桥、一竿翠竹、一群飞鸟、一面队旗、一把铜号、一群“红领巾”,一片欢笑等数量词。④夺旗比赛:认读生字,再组词造句。⑤赠送纪念品:巩固数量词。整节课,学生在我精心设计的一个个生动有趣的场景中,将自己的心理调整到最佳状态,学得津津有味。三、教给方法,让学生在学中悟教学是以动态形式呈现的,而结果则是以静态形式存在于学生的主观世界中。为了让学生都想学、都愿学、都会学,在教学过程中,应根据不同的学习内容,指导学生掌握学习汉字的方法和规律。因为汉字是属表意文字,其中百分之七十的汉字是形声字。因此,正确掌握形声字是完成小学识字任务的关键之一。在形声字教学过程中,要引导学生注意分清形声字形旁的表意功能。如在“拉、打、挑、推”和“踢、跳、跃、跑”两组字的教学中,应引导学生区分“提手旁”和“足字旁”的表意功能,告诉学生“提手旁”表示与手有关的意义,“足”字旁表示与“足”和“脚”有关的意义。学生正确区分了这些部首以后,就能很好地掌握带有“提手旁”和“足字旁”的汉字了。童心纯真,童心无邪。学生们很多看似幼稚的想法却闪耀着智慧的光芒。在识字教学中,教师只要能满腔热情为学生铺路搭桥,帮助学生寻找隐含在汉字中的乐趣,那么识字将不再是他们的负担,而会成为他们的一种乐趣。总之,创意法教育就是创造新意。如何在课堂中创造新意,是我们第一线的教育者面临的一个重要的问题。我们要根据当前课改的经验和党的教育方针善于创造新意,全面提高语文课堂教学水平。一、分组1.班主任把本班学生根据学习成绩和学习能力划分成A、B、C三层，A层次是优秀生，B层次是中等生，C层次是学差生。优秀生有多少人就分成多少个组，每个组均包括A、B、C三个层次的学生，每个组的综合学习能力基本相同。2.明确任务，教师负责各组A层次学生的学习，A层次学生负责本组B层次学生，A、B层次的学生负责本组C层次学生的学习。3.教师要做好学生的思想工作，告诉学生分组的目的，是为了所有学生的进步，达到班级整体优化。更要做好优等生的工作，让他们知道“送人玫瑰，手留余香”的道理。同时还要告诉学生你现在所在层次是暂时的，A层次的学生如果不努力会降到B、C层次，B、C层次的学生经过努力随时可以升到A、B层次。二、备课首先根据上节课对学生的要求，教师给A、B、C三个层次的学生出测试题。下节课上课时发给学生进行测试。接着教师要认真研究教材和教学参考书，深入了解学生，制定出A、B、C三个层次学生的学习目的、学习内容。A层次学生掌握知识拓展性内容，满足其“吃得饱”，B层次学生掌握理解性内容，使其“吃得好”，C层次掌握形象记忆内容，保证其“吃得了”。例如：八年级数学因式分解一节，要求B、C层次学生掌握三种基本因式分解的方法即可，C层次学生只掌握三种基本方法中最简单的因式分解，而A层次的学生则可以补充分组分解法和十字相乘法；又如九年级求根公式一节，C层次学生只要记住求根公式，会应用就行，B层次还得理解求根公式的推导过程，会应用。A层次学生得达到会推导求根公式，熟练应用的程度。对A、B、C三个层次的学生的具体要求写成导学案，课前发给学生，便于学生预习。三、授课课堂大体分成四个阶段：1.测试（10分钟）。目的是检查对上节课知识的掌握情况，分层次出题，另外B层次学生答上A层次的题格外加分，同样C层次答上B或A的题更格外加分。2.学习（15分钟）。学生主动完成导学案中教师对自己的要求，不会的主动请教自己的责任人。3.练习（15分钟）。教师分层次留练习，学生完成课堂练习。不会的主动请教自己的责任人。4.课堂小结（5分钟）。学生汇报本节课的收获。教师留课后作业，作业内容也是分层次的。四、评价1.艺术评价对发言积极，回答正确的学生给予“你很会动脑筋，精彩极了”等表扬，对思维迟钝、不爱发言的学生则可采取“不要怕，大声些”“回答正确，掌声鼓励”等语句激励学生积极参与学习。在巩固练习时，对解答正确，书写工整规范的学生，教师可给予“你的作业真漂亮”等评语，对练习出错的学生则说：“再来一次，我相信你一定能成功！”2.量化评价包括：课堂测试、单元测试、期中考试、期末考试四种评价，其中课堂测试一周一评比。五、调层、调组根据学生的学习变化情况可随时调层、调组。第二代测序技术原理及数据分析华大目SangerDideoxySequencingDNAWiEh5(TTaT3Labeledprimer+dATP,dcTPdTTP,anddGTP+ddCTPCITaTCGAAOTTGGAAGTcTTOTGGAAGTGA(3Electrophoresisof1Dr.FredSangerFrederickSangerwasawardedtheprizeinboth1958and1980.HeisPrizesandtheonlypersontobyreadingorderCTGSangeretal.,1977)DNA双脱氧链终止法测序rAdonwaneyLongman,,,,IrTheautomaticDNAsequencingmachine自动荧光垂直板凝胶电泳测序仪代表:ABI公司377型垂直板自动测序仪96个泳道读长高达700800bp日分析能力达300个样品d◎decodNTP3-hwith光检测探头CACCGCATCGAAATTAACTTCCAAAGTTAAGCTTG自动荧光毛细管凝胶电泳测序仪代表:安玛西亚公司MegaBAcEl000华大基因GrowthofncblGrowthofGenBank60,00050,00040,00030,000N20,00010,000LL年份化长其上进利花会SequencingTechnologyDevelopment195019197019801990200012010AppliedBiosystemsSolidSystemInventionofOfDNaCapillarystructureSequencingInventionof(1953)(1977)(1996)luminaenomInventionOlInventionofAnalyzerAutomated454GS20F|u。rescent(2006)Sequencer(2005)2#gNextGenerationSequencingTechnologyIllumina/HiSeg2000AppliedBiosystems/SOLIDSequencing-By-SynthesisSequencing-ByLigationRoche/454GenomeSequencerFLXSequencing-By-SynthesisRoche/454GenomeSequencerFLX速度快,一个测序反应耗时10个小时,获得4-6亿个碱基对读长长,单个序列的读长更长平均可达到450个碱基左右通量高,每个反应可以得到超过100万个序列读长,成本大大降低鞋Roche/454TitaniumPicoTiterplate2Samples/Run4Samples/Run16Samples/RunRoche/454GsflXWorkflowDNALibraryPreparationemPCRSequencing4.5hand108h4.5hEmulsionPCRDNALibraryPreparationAmplificationSequencingBySynthesisGenomefragmentedby.AnnealsstDNAtoannebulizationexcessofDNAcaptureLoadbeadsintoPicoTiterTM.AdaptorligationbeadsPlateesstDNAlibrarycreatedEmulsifybeadsandPCRSequencingbysynthesisreagentsinwater-in-oil-PhotonsGeneratedare.ABfragmentsselectedmicroreactorsCapturedbyCamerausingavidin-biotinClonalamplificationoccursSequencingImageCreatedpurificationinsidemicroreactorsGSequencingoverviewGSF|X(454)NTP→PPiPPiAPSATPATP+Luciferin-luciferaseOxyluciferinLightSignal