生物大数据-福建农林大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年

生物大数据_福建农林大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年翻译contig

参考答案:

跨叠克隆群##%_YZPRLFH_%##重叠克隆群##%_YZPRLFH_%##克隆重叠群##%_YZPRLFH_%##重叠群##%_YZPRLFH_%##克隆叠连群

导致氨基酸改变的核苷酸变异称为__________突变，它又可分为错义突变或无义突变

参考答案:

非同义

生物信息学主要是利用哪种工具实现对生命科学研究中生物信息的存储、检索和分析的？（）

参考答案:

计算机

Proteomics的含义是（）

参考答案:

蛋白质组学

被誉为“生物信息学之父”的科学家是（）

参考答案:

林华安

利用PubMed文献数据查找论文“TransgenicplantsofPetuniahybridaharboringtheCYP2E1geneefficientlyremovebenzeneandtoluenepollutantsandimproveresistancetoformaldehyde”的第一作者是

参考答案:

ZhangD

Bioinformatics的含义是（）

参考答案:

生物信息学

核酸序列一个位点的InDel会引起编码蛋白质的________突变

参考答案:

移码

全基因组中拷贝数变异CNV有5种形式,列举一种_________

参考答案:

缺失##%_YZPRLFH_%##串联复制##%_YZPRLFH_%##不连续的复制##%_YZPRLFH_%##高层次的复制##%_YZPRLFH_%##复杂的拷贝数变异##%_YZPRLFH_%##高层次的复制变异##%_YZPRLFH_%##不连续的复制变异##%_YZPRLFH_%##串联复制变异##%_YZPRLFH_%##缺失变异

Q值低于___时，相应的读段应该过滤掉

参考答案:

30

数据库提供了最全面和可靠的注释信息，被称为蛋白质序列数据的“黄金标准”。

参考答案:

SwissProt##%_YZPRLFH_%##Swiss-Prot##%_YZPRLFH_%##Swissprot##%_YZPRLFH_%##swissprot##%_YZPRLFH_%##Swiss-prot##%_YZPRLFH_%##swiss-prot

翻译proteome为中文

参考答案:

蛋白质组

与曼哈顿原子弹计划和阿波罗登月计划并称为三大科学计划。

参考答案:

人类基因组计划##%_YZPRLFH_%##HGP##%_YZPRLFH_%##hgp

常见的三大核酸数据库中，位于欧洲的是

参考答案:

EMBL##%_YZPRLFH_%##embl##%_YZPRLFH_%##Embl

三代测序技术的错误率__(高/低)于二代测序技术

参考答案:

高

二代测序数据文件的后缀是.fa或.fastq

参考答案:

正确

测序深度即测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小（Genome）的比值，它是评价测序量的指标之一

参考答案:

正确

读段文件除了文本格式之外，还可以用图象表示

参考答案:

错误

配对测序是一种特殊的双端测序方式

参考答案:

正确

配对测序方式可以用来解决重复序列长度超过read长度，无法拼接易形成断点的问题

参考答案:

正确

常见的三大核酸数据库是、、和，它们每天进行数据交换。3个答案请分别用一个空格隔开

参考答案:

DDBJEMBLGenBank##%_YZPRLFH_%##GenBankDDBJEMBL##%_YZPRLFH_%##EMBLDDBJGenBank##%_YZPRLFH_%##DDBJGenBankEMBL##%_YZPRLFH_%##GenBankEMBLDDBJ##%_YZPRLFH_%##EMBLGenBankDDBJ

一个氨基酸的性质主要由它的侧链决定（）

参考答案:

正确

数据库中收集了通过X射线衍射和核磁共振（NMR）试验测定的蛋白质结构的精确坐标数据。

参考答案:

PDB##%_YZPRLFH_%##蛋白质三维结构##%_YZPRLFH_%##pdb##%_YZPRLFH_%##Pdb

蛋白质的氨基酸序列就是其一维结构

参考答案:

正确

蛋白质发挥生物学功能依赖于其三维结构

参考答案:

正确

DNA具有超螺旋的三维结构

参考答案:

正确

利用X射线衍射进行三维结构测定时，需要得到生物分子的结晶体

参考答案:

正确

并非所有的蛋白质都有四级结构

参考答案:

正确

PubMed数据库中检索生物医学研究文献时可使用的检索词包括

参考答案:

OR_*_AND_NOT

Swiss-Prot数据库包括蛋白质的哪些信息

参考答案:

翻译后修饰_功能_细胞定位_组织特异性

蛋白质结构分类数据库包括

参考答案:

CATH_SCOP

相同长度序列，蛋白质组的复杂度低于基因的复杂度（）

参考答案:

错误

SWIS-PROT数据库中的关键词有

参考答案:

ID_OS_AC_DE

属于蛋白质二级结构的有

参考答案:

β折叠_α螺旋_γ转角

确定生物分子三维结构的实验方法有

参考答案:

核磁共振_电镜_X射线衍射

蛋白质高级结构预测（StructrePredicton）方法包括

参考答案:

折叠识别（Foldrecogniton）_CriticalAssessmentofproteinStructurePrediction(CASP)_从头预测（abintopredicton）_同源建模（Homlogymodeling）

优化算法（OptimzationAlgorithms）包括

参考答案:

Dynamicprogaming_CombinatorialExtension_Graphteory_MonteCarlo

PROSITEPattern中的序列模式表达符号[]含义是

参考答案:

[]内任意一个氨基酸残基

蛋白质氨基酸残基间的化学键不包括

参考答案:

范德华力

蛋白质数据库不包括

参考答案:

DDBJ

蛋白质三维结构数据库是

参考答案:

PDB

a螺旋与b折叠属于蛋白质的级结构

参考答案:

2

人类基因组计划是中国人主持的第一个国际项目（）

参考答案:

错误

多数遗传性状是由单个基因决定的（）

参考答案:

错误

大规模基因组测序主要有逐步克隆和鸟枪法2种策略（）

参考答案:

正确

DNA测序和蛋白质测序相关技术都获得过诺贝尔奖（）

参考答案:

正确

Sanger测序发现时间早于K.Mullis的PCR（）

参考答案:

正确

基于焦磷酸合成测序的方法是SOLiD/ABI（）

参考答案:

错误

二代测序数据文件的后缀是.fa或.fastq（）

参考答案:

正确

蛋白质亚基具有完整的级结构

参考答案:

3

翻译Arabidopsisthaliana

参考答案:

拟南芥##%_YZPRLFH_%##阿拉伯芥

翻译Caenorhabditiselegans

参考答案:

秀丽隐杆线虫##%_YZPRLFH_%##秀丽线虫##%_YZPRLFH_%##线虫##%_YZPRLFH_%##秀丽新小杆线虫

翻译Saccharomycescerevisiae

参考答案:

酵母##%_YZPRLFH_%##酿酒酵母##%_YZPRLFH_%##啤酒酵母##%_YZPRLFH_%##酵母菌

已知一个序列，要查找其相似序列，需要使用NCBI上哪个服务

参考答案:

blast##%_YZPRLFH_%##BLAST##%_YZPRLFH_%##Blast

常见序列文件格式的后缀名是

参考答案:

FASTA##%_YZPRLFH_%##Fasta##%_YZPRLFH_%##fasta##%_YZPRLFH_%##fa##%_YZPRLFH_%##FA##%_YZPRLFH_%##Fa##%_YZPRLFH_%##.fa##%_YZPRLFH_%##.fasta

读段长于重复序列的长度才可能填补空缺（）

参考答案:

正确

NCBI高级检索可以

参考答案:

限定作者_使用Boolean关系式_限定数据库_限制发表年份

Entrez数据库包括？

参考答案:

Protein_Nucleotide_dbSNP_PubMed

二代测序数据最常用的一种质控工具是。

参考答案:

fastqc##%_YZPRLFH_%##FastQC##%_YZPRLFH_%##Fastqc

列举二代测序数据分析中经常使用的1种短序列比对工具。

参考答案:

tophat##%_YZPRLFH_%##bowtie##%_YZPRLFH_%##MAQ##%_YZPRLFH_%##Maq##%_YZPRLFH_%##Star##%_YZPRLFH_%##Soap##%_YZPRLFH_%##bwa##%_YZPRLFH_%##Bowtie##%_YZPRLFH_%##bowtie##%_YZPRLFH_%##BWA##%_YZPRLFH_%##Tophat##%_YZPRLFH_%##SOAP##%_YZPRLFH_%##STAR##%_YZPRLFH_%##soap

序列格式中Fasta格式的特点是什么？

参考答案:

是一种文本格式_在新的一行中序列以“>”开始_以字母的格式提供序列

测序深度越高，测序数据量越大（）

参考答案:

正确

测序深度越高，从头组装的质量一定越好（）

参考答案:

错误

二代测序的核心技术是循环芯片测序法（）

参考答案:

正确

测序文库构建很大程度决定了测序数据的好坏（）

参考答案:

正确

对于复杂基因组，一般一种测序文库就足够了（）

参考答案:

错误

FPKM是单端RNA-seq基因表达量的表示方法（）

参考答案:

错误

进行有参考基因组的二代测序数据比对时，只需要基因组序列文件即可（）

参考答案:

错误

RNA-seq基因对应的读段数量和基因长度及测序深度有关（）

参考答案:

正确

N50可以作为评估基因组组装效果的一个指标（）

参考答案:

正确

Contig越长基因组拼接效果越好（）

参考答案:

正确

双端测序与单端测序的区别在于，前者需要在DNA片段的两端分别加上引物和连接子

参考答案:

正确

基因组从头组装的本质是寻找重叠区域（）

参考答案:

正确

fastaq文件中，Q值越小，测序质量越高（）

参考答案:

错误

基因组重测序技术可被用于哪些检测领域

参考答案:

皮草的真伪检测_中草药的产区检测_食品掺假检测_宠物疾病检测

关于C值悖论的描述正确的有哪些

参考答案:

亲缘关系相近的物种间C值差异很大_C值远远超过了遗传信息量的需要_进化程度低的生物C值反而更高

20世纪70年代，出现的2种DNA测序方法是

参考答案:

链终止测序法_化学降解测序法

二代测序数据分析中经常使用的2种比对工具是

参考答案:

Bowtie_BWA

常用的2个全基因组测序策略是

参考答案:

鸟枪法_逐步克隆法

下列属于最不易突变的氨基酸（）

参考答案:

半胱氨酸

在线的染色体可视化工具是（）

参考答案:

Genomebrowser

研究蛋白质与DNA相互作用的是（）

参考答案:

ChIP-seq

重复序列是在基因组中出现次数大于1的DNA片段，不包括（）

参考答案:

调控序列

组装基因组时，由重复序列导致的错误类型不包括（）

参考答案:

基因融合

影响基因组组装效果的因素不包括（）

参考答案:

测序时间

重测序数据分析的最后一步是（）

参考答案:

功能注释

RNA-Seq技术用途不包括（）

参考答案:

基因组测序

RNA-seq从头组装的常用工具是（）

参考答案:

Trinity

靶向测序使用的测序文库是（）

参考答案:

Amplicon

不采用荧光标记核苷酸的测序技术是（）

参考答案:

NanoPore

比较成熟的三代测序技术是（）

参考答案:

PacBio

大数据发展成熟的过程中会遇到的社会问题是

参考答案:

道德伦理

GenBank数据库里面的字段包括

参考答案:

ACCESSION_LOCUS_VERSION_ORIGIN

Fasta序列格式是以_______开头

参考答案:

>

哪个不是国际核酸数据库？

参考答案:

SwissProt

DNA3D数据库是

参考答案:

NDB

GenBank中具有唯一性的字段是（）

参考答案:

Accession

要找某个基因在样本中的表达量，需要使用NCBI的哪个服务

参考答案:

GEOProfiles

GenBank,DDBJ和EMBL三大数据间每进行数据交换

参考答案:

天

基于边合成边测序的测序方法是（）

参考答案:

Illumina/Solexa

下面哪个工具可以用来检验原始读段的质量？（）

参考答案:

Fastqc

哪个基因组序列还完全未被破解（）

参考答案:

恐龙

下列不属于分子生物学数据库的特点的是（）

参考答案:

版本不更新

“一旦空位，永远空位”描述的是（）

参考答案:

渐进比对算法

下列哪个方法最可能在基因组组装过程中留下空缺（）

参考答案:

鸟枪法建库

可以用来做数据库搜索的比对算法是（）

参考答案:

BLAST

大数据处理遇到的瓶颈不包括（）

参考答案:

数据量

提供了最全面和可靠的注释信息，被称为蛋白质序列数据的“黄金标准”。

参考答案:

SWISS-PROT##%_YZPRLFH_%##swiss-prot##%_YZPRLFH_%##Swissprot##%_YZP