药物设计与设计人生

药物设计与设计人生第1页，课件共35页，创作于2023年2月第2页，课件共35页，创作于2023年2月药物研发的进程*courtesyMerck-FrosstDrugDesignProcessBIOTECHTRIPOSDiscoveryPhase第3页，课件共35页，创作于2023年2月计算机辅助的药物设计第4页，课件共35页，创作于2023年2月锁钥模型第5页，课件共35页，创作于2023年2月第一个SBDD方法设计的新药碳酸酐酶抑制剂Dorzolamide

(治疗青光眼疾病)于1994年上市Wellcome公司用CADD方法设计的5－HT1D受体激动剂

311C90(治疗偏头痛)，进入三期临床研究美国Eli

Lilly公司开发的第一个高效、高选择性人体非胰腺分泌型磷脂酶抑制剂LY311727,进入临床研究4个已上市的HIV-1蛋白酶抑制剂类药物的研制过程中，计算机辅助药物设计起了重要作用2个凝血酶抑制剂已进入临床研究Glaxo开发的唾液酸酶抑制剂4-胍基Nen5Ac2en(抗感冒药物)进入临床研究治疗糖尿病药物(醛糖还原酶抑制剂)上市计算机辅助药物设计成功的例子第6页，课件共35页，创作于2023年2月药物设计流程建模和显示基于配体的设计(定量构效关系和药效团分析)化学信息学组合化学库设计与分子多样性

结构生物学和生物信息学从头药物设计虚拟筛选核磁数据辅助解析SoftwareIntroduction第7页，课件共35页，创作于2023年2月

TotalSolutions第8页，课件共35页，创作于2023年2月MolecularModelling&Visualisation

分子建模与可视化

Modelling&VisualisationSYBYL/Base（基础平台）AMPAC（半经验量化）MOPAC（半经验量化）MM3_2000（分子力学）MOLCAD（图形显示）AdvancedComputation（构像分析）第9页，课件共35页，创作于2023年2月SYBYLGraphicswindowTextportSoftwareIntroduction第10页，课件共35页，创作于2023年2月MOLCADModelling&Visualisation第11页，课件共35页，创作于2023年2月AdvancedComputationAdvancedComputation内置了多种构像分析的工具。包括系统构像搜索法，格点构象搜索法，随机搜索法，基于遗传算法的构像分析。帮助用户确定分子的优势低能量构象，为QSAR，药效团分析等等模块提供素材。Systematicsearchexample10conformations95conformationsTorsionangleModelling&Visualisation第12页，课件共35页，创作于2023年2月QSAR&ADME

定量构效关系与药动学性质预测QSARwithCoMFA（比较场分析）AdvancedCoMFAHQSAR（全息法定量构效关系）ClogP/CMR（疏水参数与分子折射率）Distill（公共子结构分析）MolConnZ（拓扑指数）QSAR第13页，课件共35页，创作于2023年2月QSAR&ADMEModulesQSARwithCoMFA,AdvancedCoMFA,HQSAR,clogP/CMR,Distill,VolSurf研究的内容计算与化合物活性性质相关的结构特征构建预测化合物活性的模型生物活性,ADME性质根据模型预测活性和ADME性质在药物发现中所起的作用为筛选和合成新化合物提供信息为药物设计提供新思路QSAR&ADME第14页，课件共35页，创作于2023年2月CoMFA-

Interpretation与活性高度相关的网格被用某些特定的颜色标记出来，指示用户修饰分子的思路。LessstericbulkMorenegativechargeQSAR&ADME第15页，课件共35页，创作于2023年2月PharmacophorePerception

药效团分析

PharmacophoreperceptionDISCOtechGASP第16页，课件共35页，创作于2023年2月WhatisaPharmacophore?例子-TagametandZantac在体内具有相同的生物学效应结合到相同的受体whatdotheyhaveincommonin2D?SulphurRingNitrogenrichsectionwhatdotheyhaveincommonin3D?H-bondDonorH-bondAcceptorHydrophobePharmacophoreperception第17页，课件共35页，创作于2023年2月ChemicalInformatics

化学信息学

ChemicalInformaticsUNITY（数据库管理与搜索）CONCORD/SteroPlex（2D-3D）SARNavigator（高通量筛选数据分析）第18页，课件共35页，创作于2023年2月BiomolecularSoftwareBiomolecularSoftwareBiopolymer（生物大分子）Composer（同源模建）MatchMaker（穿线法）GeneFold（复合穿线法）FUGUE（远程同源模建）ProTable（蛋白质结构分析）SiteID（结合位点分析）LeapFrog（从头设计）Rachel第19页，课件共35页，创作于2023年2月ProTable（合理性分析）ComputestructurequalitydatainMSSAndvisualiseitontheactualstructureBiomolecularSoftware第20页，课件共35页，创作于2023年2月VirtualScreening

虚拟筛选VirtualScreeningFlexXFlexX-PharmCscoreCombiFlexXFlexS第21页，课件共35页，创作于2023年2月CScore多种评价函数共同进行打分。G_scoreD_scorePMF_scoreChemScore

GOLD程序 DOCK程序 * GLIDE程序多种评价函数的一致性评价就是更具有参考意义的CScoreVirtualScreening第22页，课件共35页，创作于2023年2月DatabaseScreenwithDOCKTop1%~10%ScreenwithFlexXLeadCompounds>2MillionCompsVirtualScreening虚拟筛选方法第23页，课件共35页，创作于2023年2月FlexX–唾液酸酶第24页，课件共35页，创作于2023年2月设计人生第25页，课件共35页，创作于2023年2月WhatdoweneedtolearnHowtostudyHowtousetimeHowtosolveproblems第26页，课件共35页，创作于2023年2月Thismomentwillnap,youwillhaveadream;Butthismomentstudy,youwillinte－rpretadream第27页，课件共35页，创作于2023年2月Thoughtisalreadyislate,exactlyistheearliesttime第28页，课件共35页，创作于2023年2月Timethestudypainistemporary,hasnotlearnedthepainislife-long第29页，课件共35页，创作于2023年2月Thestudycertainlyisnotthelifecomplete.But,sincecontinuallylifepartof-studiesalsoisunabletoconquer,whatbutalsocanmake?第30页，课件共35页，创作于2023年2月Pleaseenjoythepainwhichisunable