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文档简介
41
SZDB/Z
H5N6亚型禽流感病毒实时荧光RT-PCR
for
of
subtype
H5N6
avian
virus2018-07-
深圳市市场监督管理局
SZDB/Z
2018目次前言
................................................................................
II
范围
...............................................................................
规范性引用文件
.....................................................................
术语和定义
.........................................................................
原理
...............................................................................
仪器与试剂
.........................................................................
生物安全要求
.......................................................................
样品采集和前处理
...................................................................
核酸取
...........................................................................
核酸取
...........................................................................
10
......................................................................
11
结果判定
..........................................................................
附录
试常用剂配制....................................................
RT-PCR
反应体系配制
....................................
附录
H5N6
..............
SZDB/Z
2018前 言
IISZDB/Z
2018
亚型禽流感病毒实时荧光
检测方法
GB
19442
CT值CYCLE
荧光信号;而反应进行到延伸阶段时,Taq酶发挥5’→3’的外切核酸酶功能,将探针降解。这样探针上的荧光基团游离出来,所发出的荧光不再为淬灭基团所吸收而被检测仪所接收。随着PCR反应的循环
5.1
SZDB/Z
2018
r/min
1000
L,
1000
5.2
HA
ACA
GTG
GCG
AGT
TCC
CTA
GCA-BHQ1-3’HA
TAT
GAC
TAY
CCA
CAR
TAY
TCA
HA
CCA
GCT
AYC
ATG
ATT
GC3’NA
NA
NA
NA
探针
BHQ,或者可以选择标记其它荧光基团及其相应的淬
DNA
RNA
100
RNA
样品的采集、保存及运输应符合GB
19489、GB/T
SZDB/Z
2018
将两个灭菌的棉拭子于PBS溶液中浸湿,取一个棉拭子先插入活禽喉头口及上腭裂来回刮3~5次并旋转2~3次;将咽喉拭子和泄殖腔棉拭子一起放入盛有1mL灭菌的0.01moL/L
PBS(内含青霉素
可随机采集
1g
g。
将采集的样品于旋涡振荡器上振荡混匀约5s后,用高压灭菌镊子将拭子中的液体挤出,弃去拭子,
将所采组织病料置于洁净、灭菌并烘干的研磨器中,按质量体积比(1:1)加入样品保存液进行充分研磨,3000
L,再加入
200
氯仿,混匀器上振荡混匀
s,于
12000
r/min
离心
15
min。
400
移至相应的管中,避免吸出中间层,颠倒混匀于
4℃
12000
r/min
15
4℃
10
10
s,用微量加样器将其吸干,室温干燥
5~10min。
DEPC
r/min
离心
SZDB/Z
2018H5N6亚型禽流感病毒核酸取也可以采用等效RNA取试剂及方法:如采用自动化核酸抽仪和配
(附录B以AgPath-IDTM
试剂盒为例,列出反应体系配制表,仅参考)将配制的每
加样
a)
45℃
30min;b)热启动
95℃
10min(不同试剂的反应条件不一,应根据说明书进行);c) 95℃
45s,40
个循环,58℃时设置采集荧光。
Report
10.2质控
Ct
有明显的对数增长期(典型扩增曲线的图例见附录
在试验成立的条件,FAM及HEX通道结果均呈现Ct值≤35且呈现典型扩增曲线,判为荧光PCR阳性SZDB/Z
2018
检测经40个循环无Ct值且不出现扩增曲线,或者只出现单一通道有荧光信号,判为荧光PCR阴性反
SZDB/Z
2018
A.1
0.01mol/L
磷酸二氢钾(KH2PO4)
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