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文档简介
二代测序技术检测地中海贫血多种突变的研究的开题报告一、选题背景地中海贫血(β-地中海贫血)是一种常见的遗传性血液病,主要发生在地中海沿岸地区、中东和印度等地。该病通过遗传方式传递,主要是由于HaemoglobinBeta基因的突变所导致的。当两个携带有突变基因的父母生育时,可能会产生携带双倍突变基因的孩子,表现为血红蛋白的合成障碍和贫血等症状,对患者身体健康造成较大危害。目前,早期诊断和治疗是控制地中海贫血的有效措施。诊断地中海贫血所用的方法以往主要是采用血涂片、红细胞计数和血红蛋白电泳等传统诊断方法,但这种诊断方法不够准确,而且有时病人可能携带多种突变基因,难以被及时发现。因此,二代测序技术成为一种新型的诊断方法,它可以实现对多个基因同时进行检测、分析和筛选,具有高通量、准确性高等优点。二、研究目的本研究旨在通过二代测序技术检测地中海贫血常见突变,筛查患者中是否存在同源和异源复合突变,为地中海贫血的早期诊断和治疗提供基础研究数据,同时为地中海沿岸地区和中东地区地中海贫血的遗传分析提供参考依据。三、研究内容和方法1.研究内容1)收集地中海贫血患者样本,提取总DNA;2)构建目标区域文库;3)进行高通量二代测序;4)对数据进行分析和比对;5)筛查和鉴定患者的地中海贫血常见突变以及同源和异源复合突变;6)绘制突变分布图。2.研究方法(1)样本收集和总DNA提取收集地中海贫血患者的外周血样本,并采用离体分离外周血白细胞的方法提取总DNA,作为二代测序的样本。(2)目标区域文库构建在已知地中海贫血常见突变的基础上,设计引物扩增出含这些突变位点的文库,进行二代测序。(3)高通量二代测序将文库进行高通量二代测序,获取原始序列数据。(4)数据分析和比对对原始数据进行质量控制,剔除低质量序列,使用各种软件进行数据分析、处理和比对,对数据进行基因型分析和基因变异分析,挖掘出地中海贫血的常见突变位点,并检测同源和异源复合突变。(5)筛查患者的常见突变和同源或异源复合突变对研究检测到的地中海贫血常见突变和同源或异源复合突变进行人工验证。(6)绘制突变分布图根据筛查和鉴定出的突变结果,绘制地中海贫血的突变分布图。四、预期成果1.完成对地中海贫血患者常见突变检测及地中海贫血的同源和异源复合突变检测。2.绘制地中海贫血突变分布图。3.
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