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文档简介
第三章
细胞生物学研究方法作出合理结论(the
research
method
in
the
cell
biology)进行初步观察形成可验证的假说设计对照试验查阅已有知识收集资料解释结果生物学研究模式生物不同物种享有共同分子机制如何学习细胞生物学?抽象思维与动态观点
结构与功能统一的观点同一性(unity)和多样性(diversity)的问题细胞生物学的主要内容:结构与功能(动态特征);细胞的生命活动;实验科学与实验技术——细胞真知源于实验室——What
we
know//How
we
know.第三章
细胞生物学研究方法(the
research
method
in
the
cell
biology)细胞形态结构的观察方法(study
method
for
cell
morphology
and
structure)细胞组分的分析方法(analysis
method
for
cell
composition)细胞培养、细胞工程与显微操作技术(cell
culture,cell
engineering
and
micro-oparatitechnique)第一节
细胞形态结构的观察方法光学显微镜技术(light
microscopy)电子显微镜技术
(Electron
microscopy)扫描遂道显微镜
(scanning
tunneling
microscope第二节
细胞组分的分析方法离心分离技术细胞内核酸、蛋白质、酶、糖与脂类等的显示方法
特异蛋白抗原的定位与定性细胞内特异核酸的定位与定性
放射自显影技术定量细胞化学分析技术第三节
细胞培养、细胞工程与显微操作技术细胞的培养细胞工程一、光学显微镜技术(light
microscopy)普通复式光学显微镜技术相差显微镜和微分干涉显微镜(phase-contrastmicroscope
and
differential
interference
contrasmicroscope,DIC)荧光显微镜技术(Fluorescence
Microscopy)激光共焦扫描显微镜技术(Laser
Confocal
MicroscoFRET
&
FRAP暗视野显微镜(dark
field
microscope)倒置显微镜(inverted
microscope)二、电子显微镜技术电子显微镜的基本知识电镜与光镜的比较电镜与光镜光路图比较
电子显微镜的基本构造主要电镜制样技术负染色技术
冰冻蚀刻技术超薄切片技术电镜三维重构技术扫描电镜(Scanning
electron
microscope,SEM三、扫描遂道显微镜扫描探针显微镜(
Scanning
Probe
Microscope,SPM)(80年代发展起来的检测样品微观结构的仪器)包括:STM、AFM、磁力显微镜、摩擦力显微镜等原理:扫描探针与样品接触或达到很近距离时,即产生彼此间相互作用力,如量子力学中的隧道效应(隧道电流)、原子间作用力、磁力、摩擦力等,并在计算机显示出来,从而反映出样品表面形貌信息、电特性或磁特性等。
装置:扫描的压电陶瓷,逼近装置,电子学反馈控制系统和数据采集、处理、显示系统。特点:(1)可对晶体或非晶体成像,无需复杂计算,且分辨本领高。(侧分辨率为0.1~0.2nm,纵分辨率可达0.001nm);可实时得到样品表面三维图象,可测量厚度信息;可在真空、大气、液体等多种条件下工作;非破坏性测量。可连续成像,进行动态观察用途:纳米生物学研究领域中的重要工具,在原子水平上揭示样本表面的结构。普通复式光学显微镜技术光镜样本制作分辨力(resolving
power):显微镜或人眼能将相邻两个质点区分开来的能力分辨率(resolution):指人眼或显微镜在25cm处,能清楚分辨的两个质点间的最小距离荧光显微镜技术(Fluorescence
Microscopy)原理与应用直接荧光标记技术间接免疫荧光标记技术在光镜水平用于特异蛋白质等生物大分子的定性定位:如绿色荧光蛋白(GFP)的应用激光共焦扫描显微镜技术(Laser
Scanning
Confocal
Microscopy)原理
应用:排除焦平面以外光的干扰,增强图像反差和提高分辨率(1.4—1.7),可重构样品的三维结构。相差显微镜(phase-contrast
microscope)将光程差或相位差转换成振幅差,可用于观察活细胞微分干涉显微镜(differential-interference
microscop偏振光经合成后,使样品中厚度上的微小区别转化成明暗区别,增加了样品反差且具有立体感。适于研究活细胞中较大的细胞器录像增差显微镜技术(video-enhance
microscopy)计算机辅助的DIC显微镜可在高分辨率下研究活细胞中的颗粒及细胞器的运动电镜与光镜的比较显微镜分辨本领光源透镜真空成像原理200nm可见光玻璃透镜不要求真空利用样品对光的吸收形LM(400-700)成明暗反差和颜色变化100nm紫外光玻璃透镜不要求真空(约200nm)电子束(0.01-0.9)利用样品对电子的散射TEM0.1nm电磁透镜要求真空和透射形成明暗反差1.33x10-5~1.33x10-3Pa电镜与光镜光路图比电子显微镜的基本构造主要电镜制样技术超薄切片技术用于电镜观察的样本制备示意图负染色技术(Negativestaining)与金属投影染色背景,衬托出样品的精细结构冰冻蚀刻技术(Freeze
etching)
(技术示意图)冰冻断裂与蚀刻复型:主要用来观察膜断裂面的蛋白质颗粒和膜表面结构。快速冷冻深度蚀刻技术(quick
freeze
deep
etching)电镜三维重构技术电子显微术、电子衍射与计算机图象处理相结合而形成的具有重要应用前景的一门新技术。电镜三维重构技术与X-射线晶体衍射技术及核磁共振分析技术相结合,是当前结构生物学(Structural
Biology)——主要研究生物大分子空间结构及其相互关系的主要实验手段。扫描电镜原理与应用:电子“探针”扫描,激发样品表面放出二次电子,探测器收集二次电子成象。CO
2临界点干燥法防止引起样品变形的表面张力问题一、离心分离技术用途:用于分离细胞器与生物大分子及其复合物差速离心:分离密度不同的细胞组分密度梯度离心:精细组分或生物大分子的分离二、细胞内核酸、蛋白质、酶、糖与脂类等的显示方法原理:利用一些显色剂与所检测物质中一些特殊基团特异性结合的特征,通过显色剂在细胞中的定位及颜色的深浅来
判断某种物质在细胞中的分布和含量。Feulgen
Staining三、特异蛋白抗原的定位与定性免疫荧光技术:快速、灵敏、有特异性,但其分辨率有限(图)蛋白电泳(SDS-PAGE)与免疫印迹反应(Western-Blot)免疫电镜技术:免疫铁蛋白技术免疫酶标技术
免疫胶体金技术应用:通过对分泌蛋白的定位,可以确定某种蛋白的分泌动态;胞内酶的研究;膜蛋白的定位与骨架蛋白的定位等四、细胞内特异核酸的定位与定性光镜水平的原位杂交技术(同位素标记或荧光素标记的探针)电镜水平的原位杂交技术(生物素标记的探针与抗生物素抗体相连的胶体金标记结合)五、放射自显影技术原理及应用:利用同位素的放射自显影,对细胞内生物大分子进行定性、定位与半定量研究;实现对细胞内生物大分子进行动态和追踪研究。步骤:前体物掺入细胞(标记:持续标记和脉冲标记)———放射自显影六.定量细胞化学分析技术细胞显微分光光度术(Microspectrophotometry)利用细胞内某些物质对特异光谱的吸收,测定这些物质(如核酸与蛋白质等)在细胞内的含量。包括:紫外光显微分光光度测定法可见光显微分光光度测定法流式细胞仪(Flow
Cytometry)主要应用:用于定量测定细胞中的DNA、RNA或某一特异蛋白的含量;测定细胞群体中不同时相细胞的数量;
从细胞群体中分离某些特异染色的细胞;分离DNA含量不同的中期染色体。一、细胞的培养动物细胞培养(群体培养和克隆培养)类型:原代培养细胞(primaryculturecell)继代培养细胞(sub-culture
cell)细胞株(cell
strain)
正常二倍体,接触抑制细胞系(cell
line)
亚二倍体,接触抑制丧失植物细胞培养类型:原生质体培养(体细胞培养)单倍体细胞培养(花药培养)非细胞体系(cell-free
system)二、细胞工程细胞融合(cell
fusion)与细胞杂交(cell
hybridization单克隆抗体(monoclone
antibody)技术
图细胞拆合与显微操作技术物理法结合显微操作技术(图1、图2)化学法结合离心技术制备核体(karyoplast)和胞质体(cytoplast)。其它技术遗传分析(mutant,knock
out,knock
in)对细胞生命活动的研究成为当今生命科学发展的瓶颈细胞松弛素B对细胞生命活动的研究成为当今生命科学发展的瓶颈细胞生命活动突变体分析蛋白修饰分析基因表达多肽定性分析生物信息学序列测定双向电泳分析DNA分离与克隆机器人技术(robotics)功能基因组学蛋白质分离与制备蛋白质组学落射式照明原理荧光显微镜照片(微管呈绿色、微丝红色、核蓝色)LCSM照片,蓝色为细胞核,绿色为微管DIC显微镜下的硅藻(伪彩色)A
comparison
of
yeast
cells
thwere
growing
on
the
vaginalepithelium
seen
with
differentypes
of
LM.under
bright-field;phase-contrast;c)DICExamples
of
negtively
stainedmetal-shadowed
specimens.Electron
micrographs
of
a
tobacrattle
virus
after
negtive
staiwith
potassium
phosphotungstat磷钨酸钾or
shadow
casting
withchromium(b).速度逐渐提高,样品按大小先后沉淀A等速度沉降,B等密度沉降Caenorhabditis
elegansDrosophila
melanogaster早在20世纪最初的20年中,人们就发现,如果把关注的焦点集中在相对简单的生物上则发育的现象难题可以得到部分解答。因为这些生物的细胞数量更少,分布相对单一,变化也
较好观察。由于进化的原因,细胞生命在发育的基本模
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