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文档简介
Enzyme第三章
酶酶的概念酶(enzymes)酶是活细胞合成的、具有高度催化效率和高度特异性的一类蛋白质。核酸类(核酶、脱氧核酶)蛋白质(酶)生物催化剂几个相关概念:酶促反应酶的活性酶失活底物(Substrate,S)
产物(Product,P)第一节
酶的分子结构与功能
TheMolecularStructureandFunctionofEnzyme
一、酶的分子组成蛋白质部分:酶蛋白(apoenzyme)辅助因子(cofactor)
金属离子小分子有机化合物全酶(holoenzyme)结合酶(conjugatedenzyme)单纯酶(simpleenzyme)金属离子的作用稳定酶的构象;参与催化反应,传递电子;在酶与底物间起桥梁作用;中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。小分子有机化合物的作用在反应中起运载体的作用,传递电子、质子或其它基团。小分子有机化合物在催化中的作用
二、酶的活性中心必需基团(essentialgroup)酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的化学基团。目录或称活性部位(activesite),指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并催化底物为产物。酶的活性中心(activecenter)活性中心内的必需基团结合基团(bindinggroup)与底物相结合催化基团(catalyticgroup)催化底物转变成产物位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。活性中心外的必需基团底物活性中心以外的必需基团结合基团催化基团活性中心目录第二节
酶促反应的特点与机理
TheCharacteristicandMechanismofEnzyme-CatalyzedReaction
酶与一般催化剂的共同点在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点。酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应的活化能(activationenergy)。(一)酶促反应具有极高的效率一、酶促反应的特点酶的催化效率通常比非催化反应高108~1020倍,比一般催化剂高107~1013倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶比一般催化剂更有效地降低反应的活化能。
反应总能量改变非催化反应活化能酶促反应活化能一般催化剂催化反应的活化能能量反应过程底物产物酶促反应活化能的改变
活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量。一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物。酶的这种特性称为酶的特异性或专一性。*酶的特异性(specificity)(二)酶促反应具有高度的特异性根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,酶的特异性可大致分为以下3种类型:绝对特异性(absolutespecificity):只能作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物
。相对特异性(relativespecificity):作用于一类化合物或一种化学键。立体结构特异性(stereospecificity):作用于立体异构体中的一种。组HOCH3COOH组HOOCCH3OH
L(-)乳酸D(+)乳酸(与LDH契合)(不能在LDH中的三点结合)精精L-乳酸脱氢酶的催化作用特异性(三)酶促反应的可调节性对酶生成与降解量的调节酶催化效力的调节通过改变底物浓度对酶进行调节等酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。其中包括三方面的调节。(四)酶促反应的不稳定性二、酶促反应的机理(一)酶-底物复合物的形成与诱导契合假说酶底物复合物E+SE+PES
*诱导契合假说(induced-fithypothesis)酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶-底物结合的诱导契合假说。诱导契合假说第三节酶促反应动力学KineticsofEnzyme-CatalyzedReaction
概念研究各种因素对酶促反应速度的影响,并加以定量的阐述。影响因素包括有酶浓度、底物浓度、pH、温度、抑制剂、激活剂等。※研究一种因素的影响时,其余各因素均恒定。一、酶浓度对反应速度的影响当[S]>>[E],酶可被底物饱和的情况下,反应速度与酶浓度成正比。0V[E]当[S]>>[E]时,Vmax=k3[E]酶浓度对反应速度的影响
二、底物浓度对反应速度的影响在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应速度的影响呈矩形双曲线关系。当底物浓度较低时反应速度与底物浓度成正比;反应为一级反应。目录[S]初速度
v0VmaxKm1/2Vmax
底物浓度对酶促反应速度的影响bca随着底物浓度的增高反应速度不再成正比例加速;反应为混合级反应。目录[S]初速度
v0VmaxKm1/2Vmax_
底物浓度对酶促反应速度的影响bca当底物浓度高达一定程度反应速度不再增加,达最大速度;反应为零级反应目录[S]初速度
v0VmaxKm1/2Vmax_
底物浓度对酶促反应速度的影响bca(一)米-曼氏方程式中间产物
酶促反应模式——中间产物学说E+Sk1k2k3ESE+P※1913年Michaelis和Menten提出反应速度与底物浓度关系的数学方程式,即米-曼氏方程式,简称米氏方程式(Michaelisequation)。[S]:底物浓度V:不同[S]时的反应速度Vmax:最大反应速度(maximumvelocity)
Km:米氏常数(Michaelisconstant)
VVmax[S]Km+[S]=──当反应速度为最大反应速度一半时
Km值的推导Km=[S]∴Km值等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度,单位是mol/L。2=Km+[S]VmaxVmax[S]VmaxV[S]KmVmax/2(二)Km与Vmax的意义Km值①Km等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。②意义:a)
Km是酶的特征性常数之一;b)
Km可近似表示酶对底物的亲和力;c)
同一酶对于不同底物有不同的Km值。
Vmax定义:Vm是酶完全被底物饱和时的反应速度,与酶浓度成正比。(三)Km值与Vmax值的测定1.双倒数作图法(doublereciprocalplot),又称为林-贝氏(Lineweaver-Burk)作图法-1/Km1/Vmax1/[S]1/VVmax[S]Km+[S]V=(林-贝氏方程)+1/V=KmVmax1/Vmax1/[S]两边同取倒数2.Hanes作图法[S][S]/V-KmKm/Vm在林-贝氏方程基础上,两边同乘[S][S]/V=Km/Vmax+[S]/Vmax双重影响温度升高,酶促反应速度升高;由于酶的本质是蛋白质,温度升高,可引起酶的变性,从而反应速度降低。三、温度对反应速度的影响最适温度(optimumtemperature):酶促反应速度最快时的环境温度。*低温的应用酶活性0.51.02.01.50102030405060温度ºC温度对淀粉酶活性的影响
四、pH对反应速度的影响最适pH(optimumpH):酶催化活性最大时的环境pH。0酶活性pH
pH对某些酶活性的影响
胃蛋白酶淀粉酶胆碱酯酶246810五、抑制剂对反应速度的影响酶的抑制剂(inhibitor)凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白变性的物质称为酶的抑制剂。区别于酶的变性抑制剂对酶有一定选择性引起变性的因素对酶没有选择性
抑制作用的类型不可逆性抑制(irreversibleinhibition)可逆性抑制(reversibleinhibition):竞争性抑制(competitiveinhibition)非竞争性抑制(non-competitiveinhibition)反竞争性抑制(uncompetitiveinhibition)(一)不可逆性抑制作用*概念抑制剂通常以共价键与酶活性中心的必需基团相结合,使酶失活。
*举例有机磷化合物
羟基酶解毒------解磷定(PAM)重金属离子及砷化合物
巯基酶解毒------二巯基丙醇(BAL)
(二)可逆性抑制作用*概念抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;抑制剂可用透析、超滤等方法除去。竞争性抑制非竞争性抑制反竞争性抑制*类型1.竞争性抑制作用+IEIE+SE+PES反应模式定义抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物的形成,使酶的活性降低。+++EESIESEIEP*特点抑制程度取决于抑制剂浓度与底物浓度之比;I与S结构类似,竞争酶的活性中心;动力学特点:Vmax不变,表观Km增大。抑制剂↑
无抑制剂1/V1/[S]
磺胺类药物的抑菌机制与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶二氢蝶呤啶+对氨基苯甲酸+谷氨酸二氢叶酸合成酶二氢叶酸2.非竞争性抑制*反应模式E+SESE+P+
S-S+
S-S+ESIEIEESEP+IEI+SEIS+I*特点抑制剂与酶活性中心外的必需基团结合,底物与抑制剂之间无竞争关系;抑制程度取决于抑制剂的浓度;动力学特点:Vmax降低,表观Km不变。抑制剂↑1/V1/[S]无抑制剂3.反竞争性抑制*反应模式E+SE+PES+IESI++ESESESIEP*特点:抑制剂只与酶-底物复合物结合;抑制程度取决与抑制剂的浓度及底物的浓度;动力学特点:Vmax降低,表观Km降低。抑制剂↑1/V1/[S]无抑制剂•各种可逆性抑制作用的比较
六、激活剂对反应速度的影响激活剂(activator)使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质。•必需激活剂(essentialactivator)•非必需激活剂(non-essentialactivator)第四节
酶的调节
TheRegulationofEnzyme
酶活性的调节(快速调节)酶含量的调节(缓慢调节)调节方式调节对象关键酶一、酶活性的调节(一)酶原与酶原的激活酶原(zymogen)有些酶在细胞内合成或初分泌时只是酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。酶原的激活在一定条件下,酶原向有活性酶转化的过程。酶原激活的机理酶原分子构象发生改变形成或暴露出酶的活性中心
一个或几个特定的肽键断裂,水解掉一个或几个短肽在特定条件下胰蛋白酶原的激活过程赖缬天天天天甘异赖缬天天天天缬组丝SSSS46183甘异缬组丝SSSS肠激酶胰蛋白酶活性中心胰蛋白酶原的激活过程酶原激活的生理意义①避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化,并②使酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证体内代谢正常进行。有的③酶原可以视为酶的储存形式。在需要时,酶原适时地转变成有活性的酶,发挥其催化作用。(二)变构酶变构效应剂(allosteric
effector)变构激活剂变构抑制剂变构调节(allostericregulation)变构酶(allostericenzyme)变构部位(allostericsite)一些代谢物可与某些酶分子活性中心外的某部分非共价可逆地结合,使酶构象改变,从而改变酶的催化活性。变构酶常为多个亚基构成的寡聚体,具有协同效应变构激活变构抑制变构酶的S形曲线[S]V无变构效应剂(三)酶的共价修饰调节共价修饰(covalentmodification)在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,此过程称为共价修饰。常见类型磷酸化与脱磷酸化(最常见)乙酰化和脱乙酰化甲基化和脱甲基化腺苷化和脱腺苷化-SH与-S-S互变
酶的磷酸化与脱磷酸化
-OHThrSerTyr酶蛋白H2OPi磷蛋白磷酸酶ATPADP蛋白激酶ThrSerTyr-O-PO32-酶蛋白腺苷酸环化酶(无活性)腺苷酸环化酶(有活性)
ATPcAMP↑
激素(胰高血糖素、肾上腺素等)+
受体
PKA(无活性)
PKA(有活性)
糖原合酶
糖
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