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文档简介
ICS65.020.01CCS05ZJNJ团 体 标 准T/ZJNJ0020—2023基于无人机低空遥感的水稻育种表型检测技术规范Technicalspecificationforcropphenotypinginricebreedingwithunmannedaerialvehiclelow-altituderemotesensing2024–02–01发布 2024–02–15实施浙江省农业机械学会 发布T/ZJNJ0020-2023T/ZJNJ0020-2023II前 言本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件主要起草单位:浙江大学本文件参与起草单位:嘉兴市农业科学研究院,英国国立农业植物研究所、袁隆平农业高科技股份有限公司、南京农业大学T/ZJNJ0020-2023T/ZJNJ0020-2023PAGEPAGE8基于无人机低空遥感的水稻育种表型检测技术规范范围本文件规定了基于无人机低空遥感的水稻育种表型检测技术的术语、要求、方法等。本文件适用于基于无人机低空遥感的水稻育种表型检测。规范性引用文件(包括所有的修改单适用于本文件。GB/T14950摄影测量与遥感术语GB/T41450无人机低空遥感监测的多传感器一致性检测技术规范GB/T39612低空数字航摄与数据处理规范GB/T19557.7植物品种特异性(可区别性)、一致性和稳定性测试指南水稻NY/T3526农情监测遥感数据预处理技术规范NY/T4370农业遥感术语种植业术语GB/T14950GB/T41450GB/T39612和GB/T19557.7无人机低空遥感unmannedaerialvehiclelow-altituderemotesensing通常使用多旋翼无人机搭载传感器于120m以下收集目标的电磁波信息,经处理、分析后,识别目标物、揭示其几何、物理特征和相互关系及其变化规律的现代科学技术。航线规划routeplanning无人机多源图谱数据unmannedaerialvehicleimageandspectraldatanm~2500nm),可分为RGB图像、多光谱图像、高光谱图像,还包括通过主动发射特定波段的激光点云数据。分离群体segregatingpopulation植株间基因型和表现型存在差异的群体,通常是育种低世代群体。稳定群体uniformpopulation植株间基因型和表现型一致的群体,通常是育种高世代群体或品种或杂交组合。株系breedingline一个单株收获种子种植得到的群体,可以是分离群体或稳定群体。品系eliteline通常是对高世代群体在品种审定前的称谓,农艺性状已相对稳定。水稻育种材料种植要求分离群体F100株;Fcm~26cm,行距13cm~26cm。稳定群体123613.3m66.76×13m~6.×15m。品比试验13.3m无人机设备要求无人机应具备以下性能:有效载荷需大于所使用机载传感器设备的重量;续航时间≥15min;飞行姿态平稳,倾斜角平稳度、俯仰角平稳度、偏航角平稳度的误差≤3°;可抵御4级风力;具备自主避障功能;宜采用具备GNSS-RTK定位技术的无人机,水平定位精度≤3cm,垂直定位精度≤5cm;拥有可进行二次开发的云台接口,方便拓展可搭载的传感器设备;具有可用于挂载设备且具有横滚、俯仰、偏航三轴稳定效果的云台扩展模块。室外环境应满足无人机低空遥感平台对使用环境的要求。要求如下:a) 温度:10℃~50℃;b) 风速:0m/s~8.0m/s;c) 相对湿度:0%~95%;120m;太阳高度角(太阳光入射方向和地平面的夹角)30°~90°之间;400mols~2200moms。无人机遥感配套设备要求通则无人机遥感配套设备由机载传感器设备和辅助设备组成。机载传感器设备应包括RGB成像传感器、机载传感器说明RGBRGB成像传感器主要性能指标要求如下:相机镜头应为定焦镜头,且对焦无限远;1/220001/500s。多光谱成像传感器多光谱成像传感器主要性能指标要求如下:相机镜头应为定焦镜头,且对焦无限远;31110cm/pixel(于作业高度)。高光谱成像传感器高光谱成像传感器主要性能指标要求如下:相机镜头应为定焦镜头,且对焦无限远;波段范围一般在可见光、近红外、短波红外的波段范围;一般有推扫式和快照式两种成像方式。激光雷达传感器激光雷达传感器主要性能指标要求如下:16;3cm;5Hz。辅助设备要求光合有效辐射计光合有效辐射计主要功能和性能指标要求如下:400nm700nmμmoms,用于机载传感器曝光参数设定;180°;1ms;400μmoms~2200moms。辐射定标板辐射定标板主要功能和性能指标要求如下:(digitalnumber,DN)定标为地物的光谱反射率;表面遵循朗伯定律,即从任何角度看都具有相同的辐射度;1颜色校正板颜色校正板主要功能和性能指标要求如下:124RGB图1颜色校正板像控点像控点示例及田间布设图如图2所示,其主要功能和布设要求如下:RTK1~2图2像控点示例及田间布设图数据采集要求天气情况基本要求参见5.2室外环境应满足无人机低空遥感平台对使用环境的要求。航线规划基本要求航线规划基本要求如下:根据任务需求,设定合适的机载传感器参数,如传感器尺寸、像素尺寸、最小拍照间隔等;合理规划航线和飞行高度,确保能覆盖完整目标田块;设置航向/4070%;数据采集频率基本需求数据采集频率基本需求如下:于分蘖期、拔节期、灌浆期、成熟期时,每两周至少进行一次采集;于孕穗期、始穗期、齐穗期时,每周至少进行一次采集;1~2在连续多日阴雨天气后,应尽快进行数据采集,以补充天气不佳期间缺失的数据。无人机飞行检查要求每个飞行架次上电前后均应对无人机、传感器及其他设备进行相关检查,详见附录C。遥感数据预处理方法试验准备渐晕校正颜色校正24色标图像拼接辐射校正首先在图像采集区域内放置已知反射率信息的多块校正板,然后在图像中选取对应的感兴趣区域(regionofinterest,ROI),提取平均DN值,并基于线性校正法,建立图像之间的辐射校正因子,从而实现多光谱的辐射校正。示例校正公式参见附录D.1.2。几何校正D.1.3。田块分割表型解析方法株高提取基于无人机图像建立数字高程模型,可以提取水稻株高,具体提取流程参见图D.1A)。基于无人机机载雷达获取水稻点云,可以提取水稻株高,具体提取流程参见图D.1B)。有效穗识别基于无人机高清RGB图像建立稻穗识别的神经网络模型,可以计算出小区的有效穗数。产量预测基于无人机多源图谱数据计算植被指数等参数,可以预测水稻产量信息。表型解析评价指标概述依照不同的表型检测需求,使用多种不同的解析评价指标,一般使用回归分析与图像分类/目标检测/图像分割。回归分析图像分类/目标检测/图像分割F1PR表型数据的应用建议基于大量的水稻表型数据,使用者可以通过全基因组关联分析(genome-wideassociationstudy,GWAS)、数量性状基因座(quantitativetraitloci,QTL)等方法更准确地定位控制特定性状的基因株高
附录A(资料性)水稻表型指标说明叶色植株叶片色泽的深浅,叶色反映植株的代谢特征。绿色可分为深绿色、绿色、浅绿色等。特殊水稻叶色有紫色、红色、黄色、白色等。整株熟相叶面积指数单位土地面积上水稻叶片面积占土地面积的倍数叶倾角叶片腹面的法线与天顶轴的夹角分蘖数1~23叶或以上分蘖会成为穗。因此分蘖数远大于有效穗数。有效穗数5穗部形状籽粒结实率稻穗籽粒中实粒数除以总粒数乘以百分之百。总粒数是实粒数和空、秕粒之和。叶片叶绿素含量叶片含水量叶片中的水分含量,通常用百分比表示。叶片含水量(%)=(鲜重-干重)/鲜重×100%。叶片氮含量叶片中的总的氮元素含量,通常用百分比表示。叶片含氮量(%)=氮元素含量/干重×100%。籽粒氮含量籽粒中的总的氮元素含量,通常用百分比表示。籽粒含氮量(%)=氮元素总量/干重×100%。生物量产量植株成熟期收获的稻谷干燥至标准水分含量后的单位面积重量,通常以公斤/公顷或公斤/亩表示。倒伏率群体中倒伏的植株占全部植株的比例。是衡量群体抗倒伏特性的指标。病虫害程度((回归分析
附录B(资料性)表型解析评价指标说明(独立变量(依赖变量均方误差:MSE(meansquarederror)MSE是评估预测模型误差的常见指标。它是观测值与预测值之差的平方的平均值。计算公式为:式中:� ——样本数量;� ^�
��=1� � 1
−
(B.1)MSE值越小,表示模型的预测性能越好。均方根误差:RMSE(rootmeansquarderror)RMSE(MSE)MSEMSE�𝑀�=𝑀� (B.2)平均绝对误差:MAE(meanabsoluteerror)MAE是另一种衡量预测模型误差的指标。它是观测值与预测值之差的绝对值的平均值。计算公式为:� �=1� ��−^� (.3� 式中:� ——样本数量;� ^� MAE对异常值不敏感,它表示平均预测误差的大小。(r-quae)决定系数(r-squared)是用于衡量回归模型拟合优度的统计指标。在给定的回归模型中,决定系011具体而言,决定系数通过比较模型拟合的数据与简单平均值的拟合情况来计算。其计算方式为:�2=1−��𝑟� (B.4)��𝑡�式中:��𝑟� ——残差平方和,是模型预测值与实际观测值之间的差异的平方和;��𝑡� ——总平方和,是观测值与观测值平均值之间差异的平方和。解释决定系数的时候,可以这样理解:当�2接近1时,说明模型可以很好地解释因变量的变异,即模型拟合效果较好。当�2接近0时,表示模型无法解释因变量的变异,拟合效果较差。图像分类/目标检测/图像分割一般对于常见的二分类问题,可以根据样例和其对应的模型输出的组合,划分为真正例(truepositive)、假正例(falsepositive)、真反例(truenegative)、假反例(falsenegative)四类,如表格B.1所示。表B.1二分类输出情况预测实际真(true)假(false)真(true)真正例(truepositive)假正例(falsepositive)假(false)真反例(truenegative)假反例(falsenegative)正确率:accuracy正确率是指模型正确预测的样本数占总样本数的比例。计算方式为:���= ������������������������������+���������+����
···················(B.5)精准率:precision精准率是指模型在预测为真正例的样本中,实际为真正例的比例。计算方式为:�𝑟���𝑡�= ��𝑟𝑡���𝑖�� (B.6)���������+����������召回率:recall召回率是指模型在所有实际为真正例的样本中,成功预测为真正例的比例。计算方式为:𝑟�𝑎�= ��𝑟𝑡���𝑖�� (B.7)����������+������������F1F1scoreF1值是精准率和召回率的调和平均数,用于综合评估模型性能。计算方式为:1=�������∗����� (.8)������������P-RprecisionrecallcurveP-RP-R平均精度:AP(averageprecision)P-R交并比:IoU(IntersectionoverUnion)计算预测分割和实际分割之间的交集与并集的比率来评估性能。计算方式为:𝑡�=�∩�×100% (B.9)�∪�式中:�,� ——分别为预测值集合和真实值集合。附录C(资料性)C.1
T/ZJNJ0020-2023无人机作业设备检查单 日期: 检查人:上电前检查无人机作业设备检查单 日期: 检查人:上电前检查架次1架次2……设备检查事项无人机起落架安装牢固机臂展开且安装牢固云台安装稳定电池电量充足传感器云台调平传感器安装正确到位传感器镜头盖打开存储卡安装正确且空间充足其他辐射校正板放置到位颜色校正板放置到位上电后检查架次1架次2……设备检查事项无人机遥控器正常连接飞机遥控器联网且RTK信号正常避障信号正常传感器数据线连接正常实时光合有效辐射值测量对焦位置合适光圈、ISO及快门时间合适存储路径设置正常传感器触发信号正常其他执行的飞行任务正确T/ZJNJ0020-2023T/ZJNJ0020-2023PAGEPAGE11遥感数据预处理方法畸变校正
附录D(资料性)遥感数据预处理及表型解析方法说明径向畸变描述如式(D.1)所示,切向畸变描述如式(D.2)所示:�0=�(1+�1�2+�2�4+�3�6)···································�=�(1+��2+�
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