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文档简介

ICS07.080

B20/39

中华人民共和国国家标准

GB/TXXXXX—2017

核酸适体活性评价标准操作规范

Generaltechniquerulesforactivityevaluationofaptamer

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(工作组讨论稿)

-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施

GB/TXXXXX—2017

核酸适体活性评价标准操作规范

1范围

本标准规定了核酸适配体与靶标结合的亲和力和特异性的评价,确立核酸适配体与靶标结合的专一

性和选择性的方法验证,建立性能评价的技术通则。

本标准适用于针对细胞,大分子,小分子,复杂靶标等不同层次靶标体系的核酸适配体。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文

件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法

SN/T1193基因检验实验室技术要求

3术语和定义

3.1核酸适配体(Aptamer)

能够与多种目标物(蛋白、药物、金属离子、无机或有机分子、细胞、组织)发生高亲和性和特异

性结合的一类单链核苷酸(DNA或RNA)分子。

3.2平衡解离常数(disocciationconstant,Kd)

是靶标物质被核酸配体结合一半时靶标物质的浓度常数。

4操作步骤

4.1核酸适配体与靶标的结合能力分析方法

测定筛选获得核酸适配体与靶标结合的平衡解离常数(Kd),Kd值越小表明两者相互作用越强。

Kd常用测定方法:

4.1.1荧光光谱法:适用于细胞,大分子,小分子,复杂靶标等。对核酸适配体进行荧光标记,稀释

到不同浓度,与相同浓度的靶标共混并在合适的条件下孵育,将结合后的靶标与未结合的核酸适配体分

离,使用荧光光谱仪测定核酸-靶标复合物的荧光强度,绘制荧光强度与核酸适配体浓度的关系图,拟

合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer]),获得Kd值。

4.1.2流式细胞术:适用于细胞、大分子、小分子等。对核酸适配体进行荧光标记,释到不同浓度;

与相同浓度的靶标共混并在合适的条件下孵育,将核酸-靶标复合物通过流式细胞仪,测定带有荧光标

记的核酸-靶标复合物的数量,绘制其与核酸适配体浓度的关系图,拟合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer]),

获得Kd值。

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GB/TXXXXX—2017

4.1.3表面等离子共振法:适用于细胞、大分子、小分子等。将核酸适配体固定于芯片上,稀释靶标

到不同浓度,加入不同浓度梯度的靶标在合适的条件下孵育后清洗,通过表面等离子共振法设备测定核

酸适配体结合的靶标的数量,绘制其与靶标浓度的关系图,拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target]),获得Kd

值。

4.1.4等温滴定微量热法:适用于大分子、小分子等,将核酸适配体和靶标进行透析处理,选择适宜

的样品浓度,脱气处理后,进行核酸适配体-靶标滴定试验,同时进行对照实验(滴水试验,样品滴定

缓冲溶液试验),所得数据经过软件分析即可得到Kd值。

4.1.5酶联适配体分析法:适用于细胞等,将核酸适配体固定于基板上,洗脱后加入不同浓度梯度的

靶标,孵育后冲洗,再加入带有荧光标记的核酸适配体孵育后洗脱,通过荧光分析仪获得荧光强度,绘

制荧光强度与靶标浓度的关系图,拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target]),获得Kd值。

4.1.6DNA捕获元件法:适用于细胞、大分子、小分子等。将标记荧光集团和淬灭集团的核酸适配体

与不同的浓度靶标混合,孵育后,检测荧光强度。绘制荧光强度与靶标浓度的关系图。拟合η

=Bmax/(1+Kd/[Target]),获得Kd值。

4.1.7生物膜干涉法:适用于:细胞、大分子、小分子等。将核酸适配体固定于芯片上与不同的浓度

靶标混合,孵育后清洗,利用生物膜干涉设备测定与核酸适配体结合的靶标数量,绘制其与靶标浓度的

关系图,拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target]),获得Kd值。

4.1.8超滤法:适用于细胞、大分子等。对核酸适配体进行荧光标记,释到不同浓度;与相同浓度的

靶标共混并在合适的条件下孵育,使用超滤膜过滤,使用荧光光谱仪测定核酸-靶标复合物的荧光强度,

绘制荧光强度与核酸适配体浓度的关系图,拟合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer]),获得Kd值。

4.2核酸适配体与靶标结合特异性验证

基于4.1的结果选择亲和力最高(即Kd值最低)的核酸适配体进行特异性验证。选择靶标和几种靶

标的结构类似物进行测试,使用4.1中介绍的方法分别测量核酸适配体与靶标以及几种结构类似物的亲

和力(即Kd值)并进行比较,获得特异性结果。

5防污染措施

检测过程中防止交叉污染的措施按照GB/T27403中的规定执行。

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