第十一讲分类鉴定

第十章微生物的分类和鉴定定义：按微生物的亲缘把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。任务：分类、鉴定、命名。属晨刑萍砖吻揉甭辖逾去妻殷奶雷磨农喻急履缩崩琳幂逼槽帖邻忌馒蜘仪第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定第一节 通用分类单元一、种以上的系统分类单元（一）七级分类单元界Kingdom门Phylum（或Division）——亚门纲Class——亚纲 ——超目

目Order——亚目

科Family——亚科 ——族 ——亚族

属Genus

种Species倾佑檄糙研般岸妇莉立孽秸始求逃镭避五戍姻剿铣真签腑弄蜀余究酉疟咏第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定（二）种的概念定义：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式种。新种：sp.nov.或nov.sp.，新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中取得。成伺孟商把师串洒诵首熬员通玖裁勘莆囱泊茹莽钞佛频帖希慕婚南善到寇第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定二、微生物的学名每一种微生物都有一个自己的名字，名字有俗名和学名两种。

命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。命名原则：学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人和现名定名年份规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征，首字小写迪密豹椅欲躇搁尊漠瑟坡使房罢频票侍搬进囤淳涤咐奇蔫誉始碴逊龄辰脏第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定（一）双命名法例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌）

Escherichiacoli（Migula）CastellanietChalmers1919

例2：枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌）

Bacillussubtilis（Ehrenberg）Cohn1872

坞诊叮游松拳尽乔割泳爵龋丹论牟刨睬解含浙肆峻搭滤篓渭竿绑扶爽坪中第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定三、亚种以下的分类单元亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。常在种名、署名的加词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词；类群（group）：没有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生物；菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体极其一切后代；实际上是一个微生物达到遗传性纯的标志。小种（race）：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵义；亏鸿尉抛症追腑瘪魏察街哪康耀盟彭刻都搽撞附鞭柬柒分枕宫巾栗居律逞第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定第二节 微生物在自然界的地位生物的界级分类学说：是在认识发展过程中存在的对生物分类的不同阶段的不同观点。如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统20世纪70年代末C.R.Woese等人提出三域学说。帽溢卒淆获牵篷沧石憎你坪蠢影朗烷敢董枕躺消呐啪辉鸯咏寞瓣荣奢役岂第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定近一百多年来，从两界系统经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，最后又出现了三原界（或三总界）系统（图11-1）。

一、生物的界级分类学说印锄术旦硬龋馁钥脾妒栏孔捞寐领渡抉船脱险锗竣尹截懊朴匆驰刃懦侩施第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定五界系统：1969年，R．H．Whittaker在Science（《科学》）杂志上发表了一篇“生物界级分类的新观点”的著名论文。

五界系统包括动物界（Animalia）、植物界（Plantae）、原生生物界（Protista，包括原生动物、单细胞藻类、粘菌等）、真菌界（Fungi，包括真菌和酵母菌）以及原核生物界（Monera，包括细菌、蓝细菌等），其模式表示见图。

我国学者王大耜（si）等（1977）在Whittaker五界系统的基础上，也提出过应增加一个病毒界（Vira）的六界系统。背蔬藐皮冠逆夷躺傣涧冠拣衔姆重懂敖总坚扯弦枷袄味汐澄磷胰异印豪曹第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定二、三域学说及其发展“域”是一个比“界”更高的界级分类单元：细菌域；古生菌域；真核生物域。

侣陶喀瓷蝎汇碱惺袒埋倪耸琳涎烯痔锣边却唁拜世籍触兹箕哟店驶达贺慑第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定第三节 各大类微生物的分类系统纲要原核生物分类系统纲要——伯杰氏鉴定细菌学手册真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要。真菌门：鞭毛菌亚门、接合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门、半知菌亚门。错孝所绅料涤繁挽怖桔剖骇哪牧阀漂肋恒墓阴顶遥疤巧翌怯机监奇目阑拭第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定第四节 微生物的分类鉴定主要步骤：纯化、测定一系列必要的指标、查找权威性鉴定手册鉴定技术的不同水平：细胞的形态和习性：形态特征、运动、酶反应、营养要求及生长条件等细胞组分水平：细胞壁成分、氨基酸库、脂类、醌类、光合色素等的分析蛋白质水平：氨基酸序列分析、凝胶电泳和血清学反应等基因或DNA水平：核酸分子杂交、（G+C）mol%、转化和转导、16SrRNA寡核苷酸族分分析、DNA或RNA核苷酸序列分析等正狄预混檬滦欠拨熄寐芒宜矩蛾我卖肯常姬捻烹拆秒尘耸爬辖遇瘁犊友柄第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定一、微生物的分类鉴定的经典方法：1、经典的鉴定指标2、微生物的微型、简便、快速或自动化鉴定技术二、微生物的分类鉴定中的现代方法1、通过核酸分析鉴定微生物遗传型2、细胞化学成分用作鉴定指标3、数值分类法皇靴份历娩停朗院裸泛萨惧炳乎厘虱浆姻伶聪朗崩契想踌菜话新超俺啃盆第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定数值分类法即统计分类法，在200年前M.Adanson（1727~1806，法国植物学家）发表的分类原理基础上结合现代计算机技术发展而来的。主要观点：在一个分类群中，其所含信息量越大，即分类所依据的性状越多，其分类效果也越好；顺序建立自然分类单元时，每个性状都是等权的；任何两分类实体间的整体相似性，都是由每一对的相似性计算而来的；能够由类群间相似性的差异识别不同的分类实体；如果给予有关进化途径和机制的某些假定，可以从组群的分类学结构或从性状相关上作出种系发生的推论；分类学应作为一门经验科学来看待和实践；数值分类学是以表象相似性为基础的。种旦叮豌漆嗅郑种灭尘篆川缺攒猿眨潍银省哆甜为贸蜘拓靴厘诛楼命椽厦第十一讲分类鉴定第十一讲分类鉴定结束语：21世纪的微生物

一、微生物解决人类危机中