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文档简介
关于动物肝脏提取和鉴定实验技术核酸的分类
DNA(脱氧核糖核酸)
主要存在于细胞核的染色体中。核外也有少量DNA,如线粒体DNA(mtDNA),叶绿体DNA(cpDNA),质粒DNA。
RNA(核糖核酸)
存在于细胞质中,如mRNA,rRNA,tRNA等。
除上述DNA,RNA外,还有非细胞形式存在的病毒和噬菌体,其或只含DNA,或只含有RNA。第2页,共22页,2024年2月25日,星期天核酸的理化性质在细胞内通常与蛋白质结合,以复合物形式存在微溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有机溶剂在酸性溶液中容易降解,在中性或弱碱性溶液中较稳定。DNA溶液粘度很大,RNA的粘度较小在强大离心力的作用下,可以从溶液中沉降下来第3页,共22页,2024年2月25日,星期天
浓盐法:利用RNA和DNA在不同盐浓度溶液中的溶解度不同将二者分离。离子去污剂法:利用SDS、CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)等去污剂使蛋白质变性,直接从生物材料中提取DNA。
苯酚抽提法:苯酚既是蛋白变性剂,又能抑制DNase的降解。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA连接键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。基因组DNA的提取方法第4页,共22页,2024年2月25日,星期天
核酸制备中常用的去垢剂
核酸本身带负电荷,结合带正电荷的蛋白质。用于核酸提取的去垢剂,一般都是阴离子去垢剂。
去垢剂的作用:
1.溶解膜蛋白及脂肪,使细胞膜破裂;
2.溶解核糖体上面的蛋白质,使其解聚,将核酸释放出来;
3.对RNase、DNase有一定的抑制作用。如:SDS、脱氧胆酸钠、4-氨基水杨酸钠、萘-1.5-二磺酸钠、三异丙基萘磺酸钠第5页,共22页,2024年2月25日,星期天
作用:
1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除去,以防造成蛋白污染。
2.某些蛋白质变性剂也有抑制RNase活性和破裂细胞的作用。
如:苯酚、氯仿、盐酸胍、DEPC核酸制备中常用的蛋白质变性剂第6页,共22页,2024年2月25日,星期天核酸制备中常用的酶
DNase:降解DNA
RNase:降解RNA
蛋白酶K:降解蛋白质溶菌酶:破碎细胞
第7页,共22页,2024年2月25日,星期天核酸提取的主要步骤沉淀核酸,去除盐类,有机溶剂等杂质除去与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂类等生物大分子:酚/氯仿抽提、蛋白变性剂(SDS、异硫氰酸胍等)、蛋白酶处理、高盐洗涤除去其它不需要的核酸分子破碎细胞:研磨、组织匀浆、超声、冻融;异硫氰酸胍、碱裂解;酶解(溶菌酶)第8页,共22页,2024年2月25日,星期天注意事项加入RNA降解酶除RNA加入DNA酶抑制剂:柠檬酸、氰化物、砷酸盐、EDTA、SDS、苯酚等蛋白变性剂反应不宜过于剧烈避免过酸、过碱及高温第9页,共22页,2024年2月25日,星期天一、实验目的:1、学习并掌握用浓盐法从动物组织中的提取DNA方法及其原理。2、学习和掌握二苯胺法测定DNA的原理和方法。第10页,共22页,2024年2月25日,星期天二、实验原理
核酸在真核细胞中都是以与蛋白质结合的状态存在,用DNP和RNP表示。
DNA-Pro(DNP)细胞核RNA-Pro(RNP)核仁及细胞质溶于高盐溶液(1mol/L),微溶于低盐溶液(0.14mol/L)溶于低盐溶液(0.14mol/L)微溶于高盐溶液(1mol/L)第11页,共22页,2024年2月25日,星期天
核酸含量的测定方法:紫外吸收法、定磷法和分别针对DNA和RNA的颜色反应方法。
脱氧核糖核酸中的脱氧核糖在酸性环境中变成ω-羟基-γ-酮基戊醛与二苯胺试剂一起加热产生蓝色化合物,在595nm处有最大的吸收。
DNA20~400微克范围内,光密度与DNA的浓度成正比,在反应液中加入少量乙醛,可以提高反应的灵敏度。
第12页,共22页,2024年2月25日,星期天三、实验试剂95%冷乙醇、NaCl固体二苯胺:称取纯二苯胺1g溶于100ml冰醋酸中,加入10ml过氯酸,混匀。临用时加1ml1.6%乙醛溶液,所配置试剂应为无色。0.14mol/LNaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液(PH=6.8)DNA标准液200ug/ml:DNA钠盐用5mmol/L的NaOH配制。氯仿/异戊醇=20:1(V/V)5%SDS第13页,共22页,2024年2月25日,星期天组织捣碎匀浆机
第14页,共22页,2024年2月25日,星期天猪肝8g匀浆16ml的0.14mol/LNaCl-0.05mol/L
柠檬酸钠缓冲液离心,4000r/min,10min上清(弃掉)沉淀沉淀25ml缓冲液洗涤离心,4000r/min,20min上清(弃掉)40ml的0.14mol/LNaCl-0.05mol/L
柠檬酸钠缓冲液沉淀21ml氯仿/异戊醇4ml5%SDS振荡30min(保鲜膜封口)加入3.6gNaCl固体,终浓度为1mol/L离心,3500r/min,20min吸取上清(量取体积)95%冷乙醇(缓慢加入)边加边朝一个方向缓慢搅动DNA粗制品第15页,共22页,2024年2月25日,星期天第16页,共22页,2024年2月25日,星期天除去蛋白质的方法
SDS(十二烷基硫酸钠)等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA防止DNA酶的降解,提取时可加入适量EDTA(乙二胺四乙酸)、柠檬酸,以降低DNA酶的活性氯仿一异成醇使蛋白质变性,离心除去变性蛋白质第17页,共22页,2024年2月25日,星期天DNA的定量测定第18页,共22页,2024年2月25日,星期天DNA粗品用5mmol/LNaOH溶解并定容至50ml,作为待测品。混匀,60℃水浴保温45min,冷却后,595nm处,比色。第19页,共22页,2024年2月25日,星期天以吸光度A595nm对DNA含量(ug)作图,绘制标准曲线。从标准曲线上查出样品的DNA含量。计算100g猪肝中DNA的含量:
待测样品中DNA的质量×25(稀释倍数)称取猪肝的质量=第20页,共22页,2024年2月25日,星期天匀浆(破碎细胞)要充分,需剪成小块。固体NaCl应磨碎,加入应分批缓慢加入,边加边摇,避免局部浓度过大或者未及溶解而沉入氯仿
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