病原微生物测序平台需求说明

病原微生物测序平台需求说明一、货物需求明细序号货物名称数量单位备注1.1基因测序仪主机1台1.2测序仪内置操作分析软件1套1.3独立的病原微生物数据分析软件及服务器一台（提供≥5年使用权）1台1.4全自动样本体系制备系统（含定量模块）1套1.5磁力架1套1.6涡旋振荡器1台1.7掌上离心机1台1.8恒温电子冰盒1个1.9报告打印终端1台1.10文库构建试剂盒4套1.11测序试剂盒及芯片4套二、技术要求序号货物名称招标技术要求1病原微生物测序平台1.1功能要求：1.1.1该系统将用于未知物种基因组测序、已知物种再测序、全基因组小RNA分析、微生物宏基因组分析、病毒基因组变异研究、甲基化研究、转录组分析等；1.1.2可用于不明原因感染、高热等疫情的快速应对；1.1.3可用于对病原微生物（如冠状病毒）的进化变异研究、毒力基因研究、耐药基因研究；1.2质量标准：符合国家相关质量标准，要求仪器具有良好的准确度与精确度；并且技术成熟；1.3招标技术要求：1.3.1.高数据通量：每次反应可生成≥75亿(7.5G)碱基数据；1.3.2.每次运行至少可生成可读2500万个片段标签序列；1.3.3.数据读长：单端读取序列，读长不低于150个碱基；双端读取序列：读长不低于2x150个碱基；1.3.4.提供≥3种不同Reads数的测序试剂盒，适合不同通量需求的应用；1.3.5.测序文库直接用于测序仪上机，文库克隆扩增在测序仪上自动化完成，整个测序过程只需操作一台设备，有效降低操作复杂性，减少实验误差；1.3.6.读长2x150bp时，整个测序运行完成时间：≤24小时；1.3.7.在快速测序模式读长为100bp时，整个测序运行完成时间：≤5小时；1.3.8.设备需支持读长包括:75bp、100bp、150bp、300bp多种模式的读长检测；1.3.9.测序原理：采用光学原理的基于可逆终止子边合成边测序技术，使用荧光信号确认碱基种类，每次只读取一个碱基，不接受多个碱基同时测定，保证最终的核酸序列读取准确性；1.3.10.数据准确率：2x150bp读长时，Q30>80%；1.3.11.测序系统主机内置服务器，主机同时具备样本文库克隆扩增、测序和数据分析功能，无需再额外配置样本文库克隆扩增设备；1.3.12.全封闭检测室，集成式测序卡盒，卡盒内预装所有测序需要的生物酶和试剂，无论单端和双端测序，都无需手工配制，减少生物污染；1.3.13.测序试剂盒带有无线射频识别（RFID）条码，自动追踪试剂，确保所有测序试剂的兼容性；1.3.14.测序仪主机机载的生物信息学支持软件，可完成16S宏基因组测序、新物种拼接、小RNA分析、扩增子分析、靶向DNA测序等分析流程；1.3.15.基因测序仪主机具有医疗器械注册证；1.3.16.检测灵敏度需为单个碱基序列；检测准确度及重复性可精确读取≥12个的连续单个重复碱基（如AAAAAAAAAAAAAAA）；1.3.17.测序仪下机数据为压缩好的FastQ文件格式，无须经过文件格式转化，即可直接用于主流生信分析软件进行数据分析；2文库2库构建部分2.1通量：内置高精度独立机械臂，单次运行样本最高通量≥24；2.2舱室：封闭式舱室设计，可容纳≥24个多功能标准板位；2.3功能板块：≥6个功能模块，分别为移液系统、制冷模块、加热模块、磁力模块和PCR扩增模块、定量模块，无需机外配套设备，即可完成核酸提取、文库制备、文库扩增、均一化及稀释混合、定量等全流程自动化，无需人工干预，制备好的文库可直接上机测序；2.4浓度测定：内部配置1-96样本通量浓度测定系统，定量范围：0.2-100ng/μL，通过光吸收法和荧光法的技术原理检测核酸浓度，自动记录结果并可追溯，无需额外配置或外挂浓度测定工具；2.5洁净度：内置紫外消毒系统和高效空气过滤系统，可杀灭细菌芽胞、病毒和细菌繁殖体等；对于0.3µm颗粒系，过滤效率高于≥99.95%；2.6应用流程：内置≥30项项目程序，可用于病原宏基因组、新冠全基因组、单菌全基因组、扩增子和自主开发的建库流程；系统兼容市面上主流的商品化试剂盒，支持用户自定义流程；2.7仪器配置冷藏模块，加热振荡模块；2.8内置紫外消毒系统和高效空气过滤系统；2.9具有图形化中文操作界面，运行后实时显示台面布局；2.10具有运行状态监测、实时告警、用户权限设置、实验记录和溯源功能；2.11仪器配有安全门，具备开机自检、紧急停机按钮，确保仪器运行安全；3分析系统3.分析系统3.1基于本地电脑安装，支持windows、Mac和linux操作系统；3.2可视化操作窗口，无需命令行编程经验，不需要编写linux命令；3.3支持不同测序平台的数据的导入和分析，包括一代测序数据Sanger平台；几乎所有二代测序平台数据，如SOLID、LifeIonTorrent、CompleteGenomics、Roche454、IlluminaGenomeAnalyzer；三代测序数据，如PacBio平台；3.4提供下载Hg19或Hg38及其他生物的参考序列及注释信息的接口；3.5支持创建和修改workflow，实现拓展或自定义分析流程；3.6可以进行DNA-seq、RNA-seq、Chip-Seq、Bisulfite、miRNA、Microarray、16S/宏基因组序列拼接组装、SNP检测、多样本分析、数字基因表达、小RNA分析、标签表达谱、表观基因组学分析、EST文库构建、系统发育分析、聚类分析等数据分析以及服务器整合和定制化服务；3.7可以创建GenomeBrowserTrack，可视化查看分析结果；3.8可以监控、暂停和终止分析过程、记录分析日志；3.9可兼容微生物MicrobialGenomicsModule插件，实现宏基因组、微生物组靶标序列和全基因组的多样性、功能及分型研究；3.10可进行MLST，无参最接近匹配分析，K-mertree和SNPtree制作及可视化，耐药性分析；可进行样本的中央管理及比较分析；3.11可支持系统发育树所有分支的基因组组装，可进行CDS分析及注释；3.12可进行PCR引物和TaqMan探针设计，克隆载体设计，sanger序列分析；3.13可支持DNA