《生物信息学》课程教学大纲

ADDINCNKISM.UserStyle《生物信息学》课程教学大纲（理论课程）一、课程基本信息课程号1223S02016开课单位生命科学学院课程名称（中文）生物信息学（英文）Bioinformatics课程性质必修考核类型考试课程学分2课程学时34课程类别专业核心课先修课程《进化生物学》、《生物化学》、《遗传学》及《分子生物学》适用专业（类）生物技术二、课程描述及目标（一）课程简介《生物信息学》是本专业的一门选修课程。该课程旨在面向非生物信息学专业学生介绍生物信息学的基本概念，使学生了解研究中常用信息技术的原理及部分基本技术，将信息技术融入到分子生物学等领域，综合运用数学、信息技术和生物学工具，达到深刻理解生物数据的含义的目的，以为相关专业的进一步学习与科学研究奠定基础。（二）教学目标本课程拟达到的教学目标：通过本课程的学习，学生将掌握生物信息学的基本概念和基本原理，熟练应用生物信息相关数据库和相关软件。主要目标如下：课程目标1：掌握生物信息学的基本概念、基本原理；课程目标2：了解常用核酸、蛋白生物学数据库内容及其分析方法；课程目标3：了解组学的基本概念和方法；课程目标4：常用生物信息学工具软件的使用。三、课程目标对毕业要求的支撑关系毕业要求指标点课程目标权重1-3：掌握比较扎实的数学和物理、化学方面的基础理论知识，具有计算机及信息科学等方面的基础知识课程目标1202-1：具有主动获取知识的能力课程目标2、3302-2：具有综合运用所掌握的理论知识和技能，初步具备从事相关领域科学研究的能力课程目标1202-5：具备一定的计算机及信息技术应用能力课程目标430四、教学方式与方法生物信息学注意体现学生为主体、教师为主导的讨论式教学，多采用启发式、讨论式的教学方法，激发学生的学习积极性。主要使用多媒体，采取讲授和讨论相结合方式进行教学。充分利用现代教育技术多媒体手段进行教学，理论联系实际，让学生通过实验更好的理解书本的知识。五、教学重点与难点（一）教学重点有关生物信息学的基本概念、基本原理。（二）教学难点有关基本生物信息学的操作的基本原理。六、教学内容、基本要求与学时分配序号教学内容基本要求学时教学方式对应课程目标1第1章绪论了解生物信息学的定义，学科发展历程，主要研究领域，主要内容和方法。3讲授课程目标12第2章生物信息学的生物学及计算机基础掌握生物信息学所需的生物学知识，理解这些生物学知识在生物信息学中的重要性；理解数据库的基本知识、网络的域名、以及生物信息学常见的一些FTP服务；掌握利用数据库资源进行数据检索和查询。4讲授课程目标23第3章生物信息学数据库及其检索了解数据库的分类以及各级数据库的特征和优缺点；理解核酸及相关数据库的特点及其应用；理解蛋白质及相关数据库的特点及应用；熟练掌握NCBI/EMBL/DDBJ/SWISS-PROT等常见数据库的使用。4讲授课程目标34第4章序列比对了解序列比对的基本概念、常见算法；掌握全局对、局部比对的常用软件操作方法及结果的评估。4讲授、演示课程目标25第5章蛋白质结构分析学习从蛋白质结构的组织层次、结构测定及预测、蛋白质折叠等方面对蛋白质结构进行分析。4讲授与课堂讨论课程目标1、26第6章基因组的注释了解基因组注释内容以及常用方法3讲授课程目标3、47第7章蛋白质组学了解如何利用生物信息学方法与理论进行蛋白质的表达、翻译后修饰、定位及蛋白质的相互作用，蛋白组研究的主要方法。3讲授课程目标2、38第8章分子进化与系统发育了解系统发育分析的原理和应用以及常用软件和数据库的使用。3讲授与演示课程目标49第9章第二代测序技术及其应用学习第二代测序技术的主要平台及其基本原理，了解二代测序数据的分析流程。4讲授课程目标310第10章系统生物学了解系统生物学含义，理解系统生物学的工作框架，了解系统生物学的基2讲授课程目标1合计34七、实验内容、基本要求与学时分配序号实验项目名称实验内容与要求学时类型对应课程目标合计0注：实验要求包括必修、选修；实验类型包括“演示性”、“验证性”、“设计性”、“探究性”、“其它”等。八、学业评价和课程考核（一）考核类型：☑考试考查（二）考核方式：☑开卷考试闭卷考试课程论文课程报告其它：（三）成绩评定：考核依据建议分值（百分比）考核/评价细则对应课程目标平时考核30%出勤10%每次上课学生的考勤情况课程目标1作业10%每章课后思考题完成的进度，掌握的基本概念及正确性。课程目标1和2表现10%课堂与老师的互动及回答问题表现课程目标2和3期末考核70%基本概念、综合理解运用课程目标1课程目标2课程目标3九、课程目标达成评价课程目标的实际达成效果计算方式如下，达成值越高，教学效果越好。课程目标达成度毕业要求指标点达成度十、教材与教学参考书（一）教材《生物信息学》，陈铭，科学出版社，2022，第4版，ISBN：9787030719065（二）教学参考书1.《理解生物信息学》，李亦学等译，科学出版社，2018，ISBN：97870303283282.《Bioinformatics:ToolsandApplications》,Edwards,