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文档简介
ICS11.220DB22B41吉林省地方标准DB22/T2972—2019羊泰勒虫病病原检测PCR法PCRassayfordetectionoftheileriaovis吉林省市场监督管理厅发布DB22/T2972—2019前言本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2015给出的规则起草。本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。本标准起草单位:延边大学、吉林农业科技学院、吉林省动物疫病预防控制中心。本标准主要起草人:贾立军、田万年、柴方红、梁晚枫、陈健、王海军、王欣睿、李国峰。IDB22/T2972—2019羊泰勒虫病病原检测PCR法12范围本标准规定了羊泰勒虫病病原PCR检测方法原理、试剂和仪器、样品采集、操作步骤和判定结果。本标准适用于绵羊泰勒虫病病原检测。规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法3原理双链DNA在高温加热的作用下变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则,通过人工合成的特异性寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链,再利用反应混合物中的四种脱氧核苷三磷酸(dNTPs)合成新生的DNA互补链,进而完成特定片段的体外扩增。4.1试剂除特别说明以外,本标准所用试剂均为分析纯,实验用水符合GB/T6682中一级水的要求。4.1.610mg/mL溴化乙锭见表A.2。4.1.9阴性对照为健康绵羊血液DNA提取物。4.1.10阳性对照为羊泰勒虫感染的绵羊血液DNA或含有目的片段DNA序列,DNA序列参见附录B。4.1.11空白对照为灭菌双蒸水。1DB22/T2972—20194.2.34.2.4Eppendorf管(1.5mL、0.5mL、0.2mL)。PCR反应管。4.2.5三角瓶。4.3引物引物序列与浓度见表1。表1引物序列与浓度引物引物序列长度/bp671基因序列浓度/μmol/L10P1(上游引物)P2(下游引物)5'-TGATGAGTTGATGTATTGTGGC-3'5'-TACCCGCATCCTATTTAGCAG-3'18SrRNA(AY262119)4.4仪器设备4.4.1微量加样器,单道2μL、10μL、20μL、100μL、200μL和1000μL。4.4.2低温高速离心机,12000r/min以上。4.4.3PCR扩增仪,温度范围为4℃~100℃。4.4.4分析天平,感量0.1mg。4.4.5高压灭菌器,120℃以上。4.4.6微波炉或恒温水浴锅,室温~100℃。4.4.7水平电泳槽。按照血液DNA提取试剂盒(4.1.1)操作说明书,提取待检绵羊血液样品基因组DNA、阴性对照(4.1.9)样品基因组DNA和阳性对照(4.1.10)样品基因组DNA。6.2PCR检测在PCR反应管(4.2.4)中依次加入反应试剂,PCR扩增体系为25µL,见表2。混匀后置PCR扩增仪(4.4.3)中,反应条件为96℃预变性5min,94℃变性1min,58℃退火1min,72℃延伸1min,进行35个循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。同时设定阴性对照、阳性对照和空白对照。2DB22/T2972—2019表2PCR检测反应体系试剂体积10×PCR缓冲液2.5mmol/LdNTP10µmol/L上游引物10µmol/L下游引物5U/µLTaq酶25mg/L样品DNA灭菌双蒸水2.5µL2.0µL1.0µL1.0µL0.25µL2.0µL16.25µL25µL总体积6.3PCR产物电泳将1%琼脂糖凝胶(4.1.7)板置于1×TAE缓冲液的电泳槽(4.4.7)中,取加样缓冲液(4.1.8)5µL分别与5µL的待检绵羊血液基因组DNA样品、阴性对照(4.1.9)、阳性对照(4.1.10)和空白对照(4.1.11)的PCR产物混匀后,按编号加入到1%琼脂糖凝胶板的加样孔中,凝胶的边孔中加入标准分子量DNAMarker(4.1.12)。在150V恒定电压下电泳仪(4.4.8)电泳30min后,凝胶成像系统(4.4.9)观察结果。标准阳性对照出现671bp的DNA扩增条带,标准阴性对照和空白对照无此扩增条带,反应结果成立。参见附录C。在阴性对照、阳性对照和空白对照成立条件下,若待检样品出现671bp的DNA扩增条带,判为阳性,报告绵羊泰勒虫感染。若无此DNA扩增条带,判为阴性,报告绵羊泰勒虫未感染。3DB22/T2972—2019AA附录A(规范性附录)聚合酶链式反应(PCR)试验常用试剂配制A.150×TAE缓冲液A.1.10.5mol/L乙二铵四乙酸(EDTA)(pH8.0)的配制见表A.1。表A.10.5mol/L乙二铵四乙酸(EDTA)(pH8.0)乙二铵四乙酸二钠灭菌双蒸水氢氧化钠18.6g80mL调pH至8.0定容至100mL灭菌双蒸水A.1.2TAE缓冲液(50×)的配制见表A.2。表A.2TAE缓冲液(50×)配制0.5mol/L乙二铵四乙酸(EDTA)(pH8.0)10mg/mL溴化乙锭的的配制见表A.3。表A.310mg/mL溴化乙锭A.3.11%琼脂糖凝胶的制备见表A.4。4DB22/T2972—2019表A.41%琼脂糖凝胶的制备琼脂糖1g1×TAE缓冲液定容至100mLA.3.2将三角瓶(4.2.5)放在沸水浴或微波炉(4.4.5)中加热至琼脂糖充分溶解(注意用微波炉加热时不要沸出),置室温冷却到50℃左右,加入10mg/mL溴化乙锭10μL,摇匀,倒入电泳板上,凝固后,4℃备用。A.4加样缓冲液加样缓冲液的配制见表A.5。表A.5加样缓冲液溴酚蓝甘油10mg2.5mL0.5mol/LpH6.8三羟甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)缓冲液定容至10mL5DB22/T2972—2019BB附录B(资料性附录)M羊泰勒虫18SrRNA基因片段671bp的DNA序列。TGATGAGTTGATGTATTGTGGCTTATTTCGGATGATACTTGTATTATCCGGATGATTACTTTGAGAAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTTTTGCCTTGAATAGTTTAGCATGGAATAATAAAGTAGGACTTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTAGGTACCAAAGTAATGGTTAATAGGAACAGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCCTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATTGGAGGTCGTCAGTTTTTACGACTCCTTCAGCACCTTGAGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACAAAGGAAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCTTTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGA
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