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文档简介
进阶临床试验Meta-analysis统合分析实务百年前的「临床试验」•
詹姆斯·林德(James
Lind,
1716年
-
1794年6月13日)–英国皇家海军外科医生(1739年
-
1748年),英格兰卫生学的创始人–发起利用柑桔类水果和新鲜蔬菜治疗和预防坏血病–
Atreatise
ofthe
scurvy
坏血病论2百年前的「临床试验」•
百年前的欧洲,长期在海上航行的水手经常遭受坏血病的折磨,患者常常牙龈出血,甚至皮肤淤血和渗血,最后痛苦地死去,人们一直查不出病因。奇怪的是,只要船只靠岸,这种疾病很快就不治而愈了。•问题:水手们为什么会得坏血病呢?•
书中提到他在1747年在船上做了一个临床试验:–出现坏血病的船员,大家都吃完全相同的食物–唯一不同的是有些病人每天吃两个橘子和一个柠檬,其他的人喝苹果
酒、稀硫酸、醋、海水。•
实验的结论:
吃柑橘水果的两人好转,其它人病情依然。3偏差?•
从现代的观点看,林德的临床试验不够严谨:–病人的分派Allocation–每一组的病人数
Sample
size–临床指标Clinical
indication/
Outcome–统计分析
Statistical
analysis4–Deviationofstudy
resultfrom
the
truth,
不能靠统计处理–测量时即发生错误
(内因):
Information
bias,
recall
bias,
report
bias–外因:Confounding
bias
~Confoundingfactors•Risk
of
Bias–
Infact,we
never
knowthetruth–The
resultsfromastudy
might
be
unbiaseddespite
methodologicalflaws
E.g.,
poor
randomizationor
losttofollow
up,
but
unbiased
results抽样所造成测量值与真
实值之间的差异,统计
可处理:通过多次测量或增加样“Bias”v.s.“Riskof
Bias”本数,获得的均值尽量
逼近•Error一
Systematicerrorv.s.•Bias一
SystematicerrorRandomerror5•
文献的证据等级与研究设计相关证据金字塔
→
随机对照试验
(RCT):
Level
1(GoldStandard)实证医学的证据等级6实证医学的证据等级•
文献的证据等级与研究设计相关•
证据的等级:良好研究设计可以减少偏差的程度
→
随机对照试验(RCT)7为什么要进行Meta-analysis?统合多个临床研究的样本数和结果,证据力高花费研究经费和人力相对低8Meta-analysisMeta-analysisStata
统计软件教育训练课程Meta-analysisQuickTutorialtoStataTo
Installandupdatethe
metanmodule
in
Stata
9.0
↑
(因为旧版每次都要更新)若
metan
不是最新版本,输入指令:which
metansscinstallmetaaggr’
all
replaceUnderSTB-44’clickon
sbe24UnderSTB-45’clickon
sbe24.1(按—more—或空白键,可以到下一页)若需要指令的协助:
help
(metan)search
(metan)--Twovariables:
metan
logesselogesmetan
logRRselogRR(log,effectsizes)(standarderror,
log,effectsizes)insheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\nodm.csv",clear--Threevariables:
metan
loges
logll
logulmetan
rr
ll
ul(log,effectsizes)(log,lower
and
upper
limits)metantcasestnoncasesccasescnoncases两组数字:logRR,selogRRgen
logRR=
ln(
(tcases/ttotal)
/
(ccases/ctotal)
)genselogRR=sqrt(
1/tcases+1/ccases
-1/ttotal
-1/ctotal
)三组数字:
RR,UL,
LL3组数字转2组数字gen
logrr=ln(rr)genselogrr=(ln(ul)-ln(ll))/3.92Introductiontothe“metan”Moduleinsheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)四组数字:
tcasestnoncasesccasescnoncasesIntroduction
to
the
“metan”ModuleForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)insheetusing"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearIntroduction
to
the
“metan”Moduleinsheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearmetantcasestnoncasesccasescnoncasesForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)Introduction
to
the
“metan”Moduleinsheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearmetantcasestnoncasesccasescnoncases若需要指令的协助:
help
(metan)Forbinary
(count)
data:4variables(2*2
data).0688114.5%Weight0.19
(0.08,0.46)0.39
(0.12,
1.26)0.25
(0.14,0.42)1.56
(0.37,6.55)0.71
(0.57,0.89)0.98
(0.58,
1.66)0.80
(0.51,
1.26)0.23
(0.18,0.31)0.62
(0.39,
1.00)0.20
(0.08,0.50)1.01
(0.89,
1.15)0.25
(0.07,0.91)0.38
(0.32,0.47)0.62
(0.57,0.68)insheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearmetantcasestnoncasesccasescnoncases,orrandomForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)RandomeffectIntroductiontothe“metan”Module1.880.664.290.2011.991.852.8616.672.991.0532.600.73Overall(I-squared
=
92.7%,
p
=0.000)22.24100.00StudyID101112OR
(95%
CI)34513268971insheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\nodm.csv",clearmetan
rr
ll
ulIntroductiontothe“metan”ModuleForbinary
(count)
data:3variablesinsheet
using"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\nodm.csv",clearmetan
logrrselogrrForbinary
(count)
data:3组数字转2组数字gen
logrr=ln(rr)genselogrr=(ln(ul)-ln(ll))/3.92Introductiontothe“metan”ModuleI2
≤50%:
Homogeneous(fixed
effect)I2
>50%:
Heterogeneity(randomeffect
mode)研究出现高异质性怎么办?20研究出现高异质性怎么办?l
不要先急著作统合分析
统合性回归分析(meta-regression)
次群组分析(subgroup-analysis):找出具有明显的
category差别的变项
总论文数小于10篇以下,尽量不要作统合性回归分析→Egger’s
test
敏感度分析(sensitivity
analysis):
将某些不合适的论文(例如板报或质量差的论文)删除
使用Random
effect
model21「出版性偏差」
(publication
bias):研究的质素相若,但报告较大效应值的大型研
究,相比于报告较小、或没有效应的小型研究更常被发表出版的情况。「出版性偏差」的风险:会令综合性的研究并不能准确地代表某主题的所有研究,而只偏
重于较极端的结果。图像化评估
Publication
Bias:Funnel
Plot漏斗图:
(A)有出版性偏差、(B)无出版性偏差22Funnel
plot
with
pseudo95%confidence
limits-2-1.5
-1
-.50logORFunnelplotwith
pseudo95%
confidence
limits-1
-.5
0.5logRRinsheetusing"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\afreg.csv“,clearmetafunnel
logrrselogrrmetafunnel
logorselogorIntroductiontothe“metafunnel”Module图像化评估PublicationBias:Funnel
Plotsearch(metafunnel)
search(metabias)5
4
3
2
.143.2.100Funnel
plot
with
pseudo95%
confidence
limits-1.5
-1
-.50
logORinsheetusing"D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\afreg.csv“,clearmetafunnel
logor
selogor,
egger
metabias
logor
selogor,
eggerIntroductiontothe“metafunnel”Module图像化评估PublicationBias:Funnel
Plot
→
Smallsizeeffect:
Egger’stestsearch(metafunnel)
search(metabias)5
432.1-20Stata
统计软件教育训练课程NetworkMeta-analysis*从以下开始安装*
MA/NMAnet
from
"http://www.homepages.ucl.ac.uk/~rmjwiww/stata/meta/"
net
install
network.pkg,
replacenet
install
mvmeta.pkg,
replace*Networkplotssc
install
netplotnet
from
"https://clinicalepidemio.fr/Stata"
net
install
network_graphs.pkg,
replacenet
install
metamiss2.pkg,
replace*SE
codenet
from
"/software/sj10-4/"
net
install
st0043_2.pkg,
replace安装Network
Meta-analysis相关套件help
network
graph2627PreparingforAnalysis:先设定长档案use“D:\助理研究员\中荣医研部-生统小组\全院教育课程规划-2022oct\112年d:
numberof
eventsn:total
sample
sizestudyvar→study:variable
of
study
titletrtvar→trt:variable
oftreatmentref:A
or
Placebo生统课程规划\护理部-Stata\Stata-Network
meta_new\long_data.dta
clearnetworksetupd
n,studyvarFor
binary
(count)data:(study)trtvar(trt)ref(A)“,_single
useIV_double
useTopical_useCombination_IV_and_topical先设定档案for
Network
Meta-analysis28network
setup
d
n,
studyvar
(study)
trtvar(trt)
ref(A)BCD
EAPlaceboIVStep1:Generating
Network
Geometry-Network
plot:
输入指令network
map●
所包含研究的数量—所使用相关数据的数量2930Step2:TestingforInconsistency-
Global
inconsistency
Test
输入指令network
meta
inconsistency无法拒绝虚无假说一致性
consistency的水平可接受Step2:TestingforInconsistency-
LocalinconsistencyTest输入指令networksidesplitall无法拒绝虚无假说一致性
consistency
的水平可Because
inconsistencywas
found
to
be
absent
in
both
global
and
local
tests,
the
consistency
assumptionwas
accepted31Step3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-先设定
network
meta
consistencyFornetworkforest32Step3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-
Networkforestplot(NFP)
输入:networkforest33\
Globaltestoninconsistency<diamond>uses
adiamondshape
to
show
summary
effect
sizes<eform>generatestransformed
indices
tomake
it
easy
to
interpret
the
forest
plotStep3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-
Networkforestplot(NFP)输入:eform
xlabel(0.1
1
10
100)network
forest,msize(*0.15)diamondcolors(blackblue
red)
list34ES:
effect
sizeStep3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-
Networkforestplot(NFP)
输入:intervalplot35Step3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-Networkforest
plot(NFP)
andinterval
plot
输入:intervalplot,eformES:
effect
size<eform>generatestransformed
indices
tomake
it
easy
to
interpret
the
forest
plot36intervalplot,eformnull(1)labels(Placebo
IV_singleIV_doubleTopicalCombination)
separatemargin(1085
10)textsize(2)xlabel
(0.01
0.1
1
10)<eform>generates
transformed
indices
to
make
it
easy
tointerpret
the
forest
plot<separate>and<margin>set
the
ranges
to
generate
easy-
to-read
plots,
the
values
ofwhich
should
be
appropriately
determined
by
the
userStep3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-Network
forest
plot(NFP)and
interval
plot
输入:intervalplot,eformnull(1)labels(Placebo
IV_singleIV_doubleTopical
Combination)margin
(108510)textsize(2)xlabel
(0.01
0.1
1
10)37Step4:DeterminingRelative
RankingsofTreatments-
Identify
superiority
输入:networkrankmin38networkrankmaxD:
最早达到最佳Step4:
Determining
Relative
RankingsofTreatments-
Identifysuperiority
输入:network
ran
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