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DB11/T1804—DB11/T1804—Laboratoryanimal—Breedingandgenetic 北京市市场监督管理 发DB11/TDB11/T1804—DB11/TDB11/T1804— 前 附录A(规范性)实验动物微卫星DNA标记遗传检测方 附录B(规范性)实验斑马鱼SNP遗传标记的检测方 附录C(规范性)MHC单倍型实验鸡和实验鸭直接测序检测方 前本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起本文件代替DB11/T1804—2020A;7.2.21461.2—2017、DB11/T1461.3—2017、DB11/T1461.4—2018、DB11/T1461.5—2018;——2020年发布为DB11/T1804—DB11/TDB11/T1804—DB11/TDB11/T1804—GB14923实验动物NY/T14NY625标准化养殖场标准化养殖场实验动物laboratory实验种群experimental封闭群closed近交系inbred注:经典近交系经至少连续20代的全同胞兄妹交配培育而成。品系内所有个体都可追湖到起源于第20代或以后代数的一对共同祖先。经连续20代以上亲子交配与全同胞兄妹交配有等同效果。近交系的近交系数(inbreeding单倍型群体haplotype杂交群注:子一代简称F1PCR:聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction)SNP:(SingleNucleotidePolymorphism)STR:短串联重复序列(ShortTandemRepeat)表1实验猪按照NY625实验羊应按照GB14923和NY/T2665的规定进行。实验狨猴和雪貂应按GB14923的规定进行。封闭群实验小型猪、实验长爪沙鼠、实验鸽和实验树鼩繁殖方法按照GB14923的规定执行。实验鸡、实验鸭、实验鹅应按照NY/T1901的规定进行。近交系实验动物可分为基础群(foundationstock)、血缘扩大群(pedigreeexpansionstock)和生产群(productionstock),当近交系动物生产供应数量不是很大时,可不设血缘扩大群,仅设基础群和生产群。各基础群、血缘扩大群和生产群的繁育方式按照GB14923执行。表2群体大小(只/头/羽抽样数量(只/头/羽样数量按照表3规定执行。一般不超过30只。表3群体大小(只/头/羽/尾抽样数量(只/头/羽/尾≥群体数量表4GB/T22283GB/T22284GB/T22285GB/T3157GB/T19166GB/T19376GB/T22909GB/T2416ABC附录表A.1引物序列Mg2+A.1实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列Mg2+A.1实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列Mg2+表A.2引物序列退火温度A.2实验狨猴微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列退火温度表A.3引物序列退火温度A.3实验长爪沙鼠微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列退火温度表A.4引物序列TT(AG)A.4实验雪貂微卫星位点的引物序列、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列表A.5引物序列Mg2+浓度A.5实验猫微卫星位点的扩增条件和染色体分布(续引物序列Mg2+浓度A.5实验猫微卫星位点的扩增条件和染色体分布(续引物序列Mg2+浓度表A.6引物序列退火温度A.6实验鸡微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列退火温度表A.7引物序列退火温度A.7实验鸭微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列退火温度表A.8引物序列退火温度A.8实验鹅微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列退火温度BcaBcaG-G-G-G-表A.9引物序列退火温度UU-UU-UU-A.9实验鸽微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续引物序列退火温度UU-UU-表A.10引物序列品系片段长度A.10常用实验斑马鱼微卫星分子标记的遗传特征(续引物序列品系片段长度134134134,177190,134表A.11实验树鼩微卫星位点的名称、引物序列、PCR引物序列135-196-166-386-206-220-418-134-149-182-PCR总反应体积为15μL,其中含10×PCRbuffer:1.5μL,上下游引物(100pmol/μL)各1μL,4×dNTP100μmol/L:1μL,Taq1U:1μL,50ng~100ngDNA:1μL(ddH2O):8.5μL。PCR反应程序为:95℃预变性,4min;94℃变性,30s;退火温度(各位点序列、PCR反应条件见表A.1~A.10),30s;72℃延伸,30s;35个循环;72℃继续延伸7min;扩增产物4℃保存。据各位点的等位基因数计算封闭群的基因频率,进行卡方(chi-squaretest)检验。当群体达到平衡表A.12表A.13A.13近交系广西巴马小型猪和培育过程中遗传质量控制的微卫星座位及优势等位基因(续表A.14表A.15 附录取10μLPCR产物用25μL的水稀释,并用枪头吹打混匀。然后取1μL为模板,用表B.1程序软件分析B.1SNPSNP引物dbSNP表SNP引物dbSNP表SNP引物dbSNP附录C.1PCR片段384片段442C.2PCR984PCR总反应体积为15μL,其中含10×PCRbuffer:1.5μL,上下游引物(100pmol/μL)各1μL,4×dNTP100μmol/L:1μL,Taq酶1U:1μL,50ng~100ng基因组DNA:1μL(ddH2O8.5μL。PCR反应程序为:954min;94,30s;退火温度(各位点序片段片段AAGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGCAGGGT--------GGGGGGGGGGC片段片段片段片段片段片段AAGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGTGGGGT--------GGGGGGGGGGC片段片段片段片段参考文GB14925—2023[J]2010,5:张媛,李晓飞,李振宇,等.滇西亚种树鼩微卫星分子标记的筛选[J].中国比较医学杂志,2015,25:36-41.FanY,HuangZY,CaoCC,etal.2013.GenomeoftheChinesetreeshrew[J].Naturecommunications,4:1426.LiuXH,YaoYG.Characterizationof12polymorphicmicrosatellitemarkersintheChinesetreeshrew(Tupaiabelangerichinensis)[J],2013,34(E2):E62-8.XuL,ChenSY,NieWH,etal.EvaluatingthephylogeneticpositionofChinesetreeshrew(Tupaiabelangerichinensis)basedon
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