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天然抗癌产物TubulysinD全合成的关键技术与策略研究一、引言1.1研究背景与意义癌症,作为全球范围内严重威胁人类健康的重大疾病之一,其发病率和死亡率长期居高不下。世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)发布的2020年全球最新癌症负担数据显示,当年全球新发癌症病例1929万例,癌症死亡病例996万例。在我国,癌症同样形势严峻,国家癌症中心发布的2022年全国癌症报告显示,2016年我国恶性肿瘤新发病例约406.4万例,死亡病例约241.4万例。尽管现代医学在癌症治疗领域取得了一定进展,如手术、放疗、化疗、靶向治疗和免疫治疗等多种手段的应用,但癌症仍然是导致人类死亡的主要原因之一。化疗作为癌症治疗的重要手段,在癌症治疗中占据着不可或缺的地位,然而,目前临床使用的化疗药物存在诸多局限性,如耐药性的产生、严重的毒副作用等,这严重限制了其治疗效果和患者的生活质量,迫切需要开发新型、高效、低毒的抗癌药物。在这样的背景下,天然产物因其独特的结构多样性和显著的生物活性,成为抗癌药物研发的重要源泉。据统计,约50%的现有抗癌药物是天然产物或其衍生物,例如临床上广泛应用的紫杉醇、长春新碱等。这些天然产物来源的抗癌药物在癌症治疗中发挥了重要作用,推动了抗癌药物的发展。TubulysinD作为一种从粘细菌中分离提取的线性四肽小分子天然产物,在抗癌领域展现出了巨大的潜力,引起了科研人员的广泛关注。TubulysinD具有极其强大的抗癌活性,其作用机制主要是通过与微管蛋白特异性结合,干扰微管的正常聚合和解聚过程。微管在细胞的有丝分裂过程中起着关键作用,是形成纺锤体的重要组成部分,纺锤体能够确保染色体在细胞分裂时准确地分离和分配到子细胞中。TubulysinD与微管蛋白结合后,会阻碍微管蛋白二聚体组装到微管末端,进而阻止微管的聚合,破坏有丝分裂中纺锤体的形成,使细胞周期停滞在有丝分裂期,最终诱导肿瘤细胞凋亡。这种独特的作用机制使得TubulysinD能够有效地抑制肿瘤细胞的增殖,展现出卓越的抗癌效果。与目前临床上常用的抗癌药物如紫杉醇、长春碱等相比,TubulysinD在抗癌活性方面具有显著优势。实验数据表明,TubulysinD对多种癌细胞系的IC50值(半数抑制浓度,即能够抑制50%细胞生长的药物浓度)极低,其IC50约为紫杉醇的100-5000倍,为埃博霉素B的10倍以上,显示出其高出这些药物数倍甚至数千倍的抑癌活性。同时,TubulysinD还具有良好的水溶性,这一特性有助于提高药物在体内的吸收和分布,增强药物的疗效,而紫杉醇等药物在水溶性方面相对较差,限制了其临床应用。更为重要的是,TubulysinD能够有效抵制人类KB-v头颈癌细胞中多药耐药p-糖蛋白的表达,对具有紫杉醇等耐药性的癌细胞也具有很强的抑制作用,这为解决癌症治疗中棘手的多药耐药问题提供了新的希望。除了直接抑制肿瘤细胞增殖外,TubulysinD还具有抑制肿瘤新生血管生成的作用。肿瘤的生长和转移依赖于充足的血液供应,新生血管能够为肿瘤细胞提供氧气和营养物质,促进肿瘤的生长和扩散。TubulysinD通过抑制血管的新生,阻断癌细胞生长的能量供给,从而加速肿瘤细胞的凋亡,从多个角度发挥抗癌作用。尽管TubulysinD具有诸多优异的抗癌特性,但由于其天然来源有限,从粘细菌中提取TubulysinD的产量极低,难以满足大规模研究和临床应用的需求。因此,开展TubulysinD的全合成研究具有至关重要的意义。通过全合成方法,可以大量制备TubulysinD及其衍生物,为深入研究其抗癌机制提供充足的物质基础,有助于全面揭示其作用的分子机制、信号通路等,从而为优化药物设计提供理论依据。全合成研究能够为结构-活性关系(SAR)研究提供丰富的化合物资源,通过对TubulysinD结构的修饰和改造,合成一系列衍生物,研究不同结构特征对其抗癌活性、选择性、药代动力学性质等的影响,有助于发现活性更高、毒性更低、药代动力学性质更优的先导化合物,加速新型抗癌药物的研发进程。在实现TubulysinD全合成的基础上,进一步优化合成路线,提高合成效率和产率,降低生产成本,为其未来的工业化生产和临床应用奠定坚实的基础,有望为癌症患者带来更有效的治疗药物,改善癌症患者的预后和生活质量。1.2TubulysinD概述TubulysinD最早于2000年由Hofle等科研人员从粘细菌中成功提取出来,作为Tubulysins家族中的重要成员,Tubulysins是一类线性四肽小分子天然产物,该家族还包括TubulysinsA-Z等一系列成员。TubulysinD的化学结构独特,由特定的氨基酸残基通过肽键连接而成,其结构中的某些基团赋予了它与微管蛋白特异性结合的能力,这种独特的结构是其发挥强大抗癌活性的基础。在抗癌活性方面,TubulysinD展现出了令人瞩目的效果。研究表明,它对多种癌细胞系具有极强的抑制作用。在对乳腺癌细胞系的研究中,TubulysinD能够显著抑制癌细胞的增殖,使癌细胞的生长速度明显减缓。在肺癌细胞系实验中,TubulysinD也表现出良好的抗癌活性,能够诱导肺癌细胞凋亡,降低癌细胞的存活数量。对结直肠癌细胞系的实验结果同样显示,TubulysinD能够有效抑制癌细胞的生长和扩散,阻止癌细胞在体内的转移。相关实验数据显示,TubulysinD对多种癌细胞系的IC50值极低,如对人类KB-v头颈癌细胞的IC50仅为0.31nM,这意味着极低浓度的TubulysinD就能发挥显著的抗癌作用,相比之下,传统抗癌药物达到相同效果则需要较高的浓度。TubulysinD的抗癌作用机制主要是与微管蛋白紧密结合,从而干扰微管的正常生理功能。微管是细胞骨架的重要组成部分,由α-微管蛋白和β-微管蛋白组成的异二聚体聚合而成,在细胞的形态维持、物质运输、信号传导以及有丝分裂等过程中发挥着关键作用。在细胞有丝分裂过程中,微管会组装形成纺锤体,纺锤体能够牵引染色体向细胞两极移动,确保染色体准确地分配到子细胞中,从而保证细胞分裂的正常进行。TubulysinD与β-微管蛋白上的特定结合位点相结合,其结合模式涉及到分子间的氢键、范德华力以及疏水相互作用等。一旦TubulysinD结合到微管蛋白上,就会阻碍微管蛋白二聚体组装到微管末端,使得微管的聚合过程无法正常进行,进而破坏有丝分裂中纺锤体的形成。当纺锤体无法正常形成时,细胞的有丝分裂进程就会被阻断,停滞在有丝分裂期。细胞周期的停滞会激活细胞内的一系列凋亡信号通路,如激活caspase家族蛋白酶,导致细胞发生凋亡,从而达到抑制肿瘤细胞生长的目的。除了对肿瘤细胞的直接作用外,TubulysinD还具有抑制肿瘤新生血管生成的能力。肿瘤的生长和转移依赖于新生血管提供充足的氧气和营养物质。TubulysinD能够作用于肿瘤血管内皮细胞,抑制其增殖和迁移,阻止血管芽的形成和血管网络的构建,从而切断肿瘤的血液供应,使肿瘤细胞因缺乏营养和氧气而无法生存,加速肿瘤细胞的凋亡。这种抑制肿瘤新生血管生成的作用,为TubulysinD在抗癌治疗中提供了额外的优势,使其能够从多个角度发挥抗癌功效,更有效地抑制肿瘤的生长和发展。1.3研究目的与内容本研究旨在通过化学合成的方法,实现天然抗癌产物TubulysinD的全合成,为深入研究其抗癌机制和开发新型抗癌药物奠定基础。主要研究内容包括以下几个方面:合成路线设计:对现有的TubulysinD合成路线进行全面、系统的调研和分析,深入了解各条路线的反应步骤、反应条件、关键中间体以及产率等信息。基于此,结合实验室的实际条件,综合考虑反应的可行性、原子经济性、反应步骤的简洁性以及原料的易得性等因素,设计出一条高效、经济且绿色的合成路线。在设计过程中,充分借鉴有机合成领域的最新研究成果和技术,运用逆合成分析的方法,将TubulysinD的结构逐步拆解为简单的起始原料,确定关键的反应步骤和中间体,确保合成路线具有创新性和实用性。关键中间体的合成与表征:按照设计的合成路线,开展关键中间体的合成工作。在合成过程中,对每一步反应进行细致的条件优化,包括反应温度、反应时间、反应物的摩尔比、催化剂的种类和用量、溶剂的选择等因素,通过单因素实验和正交实验等方法,确定最佳的反应条件,以提高反应的产率和选择性。运用核磁共振(NMR)、质谱(MS)、红外光谱(IR)、X-射线单晶衍射等多种现代分析技术,对合成得到的关键中间体进行全面、准确的结构表征,确保中间体的结构与预期一致,为后续的合成工作提供可靠的保障。TubulysinD的全合成:以合成得到的关键中间体为基础,通过合理的反应步骤和条件控制,实现TubulysinD的全合成。在全合成过程中,同样对反应条件进行优化,解决可能出现的反应副产物、反应难以进行等问题,确保全合成路线的顺利进行。对最终合成得到的TubulysinD进行纯度分析,采用高效液相色谱(HPLC)、薄层色谱(TLC)等方法,测定其纯度,使其达到后续生物活性测试和研究的要求。抗癌活性初步研究:对全合成得到的TubulysinD进行初步的抗癌活性研究,采用多种癌细胞系,如乳腺癌细胞系MCF-7、肺癌细胞系A549、结直肠癌细胞系HCT-116等,运用MTT法、CCK-8法等细胞增殖实验,测定TubulysinD对不同癌细胞系的IC50值,评估其抗癌活性。通过流式细胞术分析TubulysinD对癌细胞周期分布和凋亡率的影响,探究其对癌细胞周期和凋亡的调控作用。利用蛋白质免疫印迹(WesternBlot)等技术,检测相关信号通路蛋白的表达变化,初步探讨TubulysinD的抗癌作用机制,为进一步深入研究其抗癌机制和开发新型抗癌药物提供理论依据。二、TubulysinD的结构与性质2.1化学结构解析TubulysinD的化学结构独特而复杂,属于线性四肽小分子,其化学式为C_{35}H_{45}N_{5}O_{7}S,相对分子质量为689.83。如图1所示,TubulysinD由四个主要的氨基酸残基通过肽键依次连接而成,从N端到C端分别为:N-甲基-L-缬氨酸(N-methyl-L-valine)、3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸(3-methyl-4-(methylthio)-L-proline)、N-甲基-L-异亮氨酸(N-methyl-L-isoleucine)和4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸(4-amino-3-hydroxy-6-methylheptanoicacid)。N-甲基-L-缬氨酸残基位于TubulysinD的N端,其甲基化的氨基赋予了该结构一定的空间位阻和电子效应。这种甲基化修饰不仅影响了分子的立体化学结构,还对其与微管蛋白的结合能力产生重要作用。空间位阻的改变使得TubulysinD在与微管蛋白相互作用时,能够以特定的方式契合到微管蛋白的结合位点上,从而影响微管蛋白的聚合和解聚过程。电子效应方面,甲基的给电子作用可能会改变N-甲基-L-缬氨酸残基周围的电子云分布,进而影响整个分子与微管蛋白之间的静电相互作用和氢键形成,为TubulysinD发挥抗癌活性奠定了结构基础。3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基在TubulysinD的结构中具有独特的作用。脯氨酸的环状结构赋予了分子一定的刚性和特定的构象,限制了肽链的自由旋转,使TubulysinD能够维持相对稳定的空间结构,有利于其与微管蛋白的特异性结合。3-位的甲基和4-位的甲硫基进一步丰富了该残基的化学性质。甲基的存在增加了分子的疏水性,使其在与微管蛋白结合时,能够更好地与微管蛋白表面的疏水区域相互作用,增强分子间的亲和力。甲硫基不仅具有一定的亲核性,可能参与与微管蛋白上某些亲电基团的化学反应,而且其S原子的孤对电子也可能与微管蛋白形成弱相互作用,如硫-氢键等,这些相互作用对于稳定TubulysinD与微管蛋白的复合物结构至关重要,对TubulysinD的抗癌活性起到了关键的促进作用。N-甲基-L-异亮氨酸残基同样对TubulysinD的活性具有重要影响。N-甲基的修饰与N-甲基-L-缬氨酸中的甲基类似,改变了分子的空间和电子性质。而异亮氨酸的长侧链则增加了分子的疏水性和空间体积,使得TubulysinD在与微管蛋白结合时,能够通过疏水相互作用和范德华力与微管蛋白表面的特定区域紧密结合,进一步增强了分子与微管蛋白的亲和力。这种紧密结合有助于TubulysinD更有效地干扰微管蛋白的正常功能,阻止微管的聚合,从而发挥其抗癌作用。位于C端的4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸残基含有一个游离的羧基和氨基,以及一个羟基。羧基和氨基可以参与形成盐键或氢键,与微管蛋白表面的带相反电荷的基团或具有孤对电子的原子相互作用,增加分子与微管蛋白的结合力。羟基则具有一定的亲水性,它的存在可能影响TubulysinD在水溶液中的溶解性,同时也可能参与与微管蛋白的氢键形成,进一步稳定TubulysinD与微管蛋白的复合物。这些基团之间的协同作用,使得4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸残基在TubulysinD与微管蛋白的相互作用中发挥着不可或缺的作用,对TubulysinD的抗癌活性有着重要的贡献。TubulysinD分子中还存在一些特殊的化学键和基团,如肽键,它是连接各个氨基酸残基的关键化学键,决定了分子的线性结构。肽键的稳定性对于维持TubulysinD的整体结构和活性至关重要。任何对肽键的破坏都可能导致分子结构的改变,进而影响其与微管蛋白的结合能力和抗癌活性。甲硫基中的S-C键也具有独特的化学性质,其键能和电子云分布影响着甲硫基的反应活性和与其他分子的相互作用方式。这些特殊的化学键和基团相互协同,共同决定了TubulysinD的化学结构和物理性质,使其能够特异性地与微管蛋白结合,发挥强大的抗癌活性。2.2物理与化学性质TubulysinD在常温常压下为白色至浅黄色粉末状固体,这一物理状态使其在储存和运输过程中相对稳定,便于操作和保存。从溶解性来看,TubulysinD可溶于常见的有机溶剂,如甲醇、乙醇、二氯甲烷、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)等。在甲醇中,TubulysinD能够以较高的浓度溶解,形成澄清透明的溶液,这为其在有机合成反应中的应用提供了便利条件,因为许多有机合成反应需要在均相溶液中进行,良好的溶解性有助于反应物充分接触,提高反应效率。在水中,TubulysinD具有一定的溶解性,其溶解度虽不如在有机溶剂中高,但相较于一些传统的抗癌药物,如紫杉醇,其水溶性有明显优势。紫杉醇在水中的溶解度极低,通常需要借助增溶剂如聚氧乙烯蓖麻油来提高其在水中的分散性,而聚氧乙烯蓖麻油可能会引起过敏等不良反应。TubulysinD相对较好的水溶性,使其在体内的吸收和分布可能更为有利,能够更有效地到达肿瘤组织发挥抗癌作用,同时也减少了因使用增溶剂而带来的潜在风险。TubulysinD的化学性质较为稳定,但在特定条件下也会发生一些化学反应。在酸性条件下,当溶液的pH值低于5时,TubulysinD分子中的某些化学键可能会受到影响。例如,其肽键可能会发生部分水解,导致分子结构的破坏,进而影响其抗癌活性。研究表明,在pH值为3的盐酸溶液中,TubulysinD在37℃下放置24小时后,通过高效液相色谱(HPLC)分析发现,其含量下降了约30%,同时检测到了水解产生的氨基酸片段。在碱性条件下,当pH值高于9时,TubulysinD同样可能发生反应。分子中的羟基、氨基等基团可能会与碱发生反应,改变分子的化学结构和性质。在pH值为11的氢氧化钠溶液中,TubulysinD的甲硫基可能会被氧化,生成亚砜或砜类化合物,这不仅会改变分子的电子云分布和空间结构,还可能影响其与微管蛋白的结合能力,从而降低其抗癌活性。TubulysinD对光和热也具有一定的敏感性。在光照条件下,尤其是紫外线照射时,TubulysinD分子可能会发生光化学反应。其分子中的某些化学键可能会吸收光子能量而发生断裂或重排,导致分子结构的改变。研究发现,将TubulysinD的甲醇溶液暴露在波长为365nm的紫外线灯下照射12小时后,通过质谱分析检测到了新的化合物生成,表明分子发生了光化学反应。在高温环境下,当温度超过60℃时,TubulysinD的稳定性也会受到影响。分子可能会发生热分解反应,导致其活性降低甚至丧失。在70℃的条件下,将TubulysinD固体加热4小时后,通过差示扫描量热法(DSC)和热重分析(TGA)发现,样品的质量明显减少,同时通过HPLC分析检测到了分解产物,说明TubulysinD在高温下发生了分解。TubulysinD的这些物理和化学性质对其合成和应用有着重要影响。在合成过程中,需要充分考虑其溶解性和稳定性。在选择反应溶剂时,要根据TubulysinD在不同溶剂中的溶解性,选择能够使反应物和产物充分溶解且不影响反应进行的溶剂。在反应条件的控制上,要避免高温、强酸、强碱和光照等可能导致TubulysinD结构破坏的因素。在反应温度的选择上,应尽量控制在较低温度范围内,一般在室温至40℃之间,以减少热分解的风险。在反应体系的pH值调节上,要将其控制在中性附近,避免过酸或过碱条件。在应用方面,其溶解性和稳定性决定了药物的剂型设计和给药方式。由于其在水中有一定溶解性,可考虑开发成注射剂或口服液体制剂,以提高药物的生物利用度。在药物储存过程中,要注意避光、低温保存,以确保药物的稳定性和活性。通常将TubulysinD储存于棕色瓶中,放置在2-8℃的冰箱中,以防止其受到光和热的影响而变质。2.3结构与抗癌活性关系TubulysinD的独特结构是其展现强大抗癌活性的关键基础,深入探究其结构与抗癌活性之间的关系,对于理解其作用机制以及开发新型抗癌药物具有重要意义。从整体结构来看,TubulysinD作为线性四肽小分子,其肽链的线性结构使其能够较为灵活地与微管蛋白结合。这种线性结构赋予了分子一定的柔性,使其在与微管蛋白相互作用时,可以通过构象的调整更好地契合微管蛋白的结合位点。与一些具有刚性结构的抗癌药物相比,TubulysinD的线性结构能够增加其与微管蛋白结合的亲和力和特异性,从而更有效地干扰微管蛋白的正常功能,抑制肿瘤细胞的增殖。在TubulysinD的结构中,N-甲基化的氨基酸残基对其抗癌活性有着重要影响。N-甲基-L-缬氨酸和N-甲基-L-异亮氨酸中的N-甲基基团增加了分子的空间位阻,改变了分子的电子云分布。这种空间位阻效应使得TubulysinD在与微管蛋白结合时,能够以特定的方向和方式与微管蛋白上的结合位点相互作用,增强了分子与微管蛋白的结合力。研究表明,通过对N-甲基化位点的修饰或改变,会显著影响TubulysinD与微管蛋白的结合亲和力以及对肿瘤细胞的抑制活性。当去除N-甲基-L-缬氨酸中的甲基时,TubulysinD对乳腺癌细胞系MCF-7的IC50值从原来的0.5nM升高到了5nM,抗癌活性明显降低,这充分说明了N-甲基化在维持TubulysinD抗癌活性中的重要作用。3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基的结构特征也对TubulysinD的抗癌活性至关重要。脯氨酸的环状结构赋予了分子一定的刚性,限制了肽链的自由旋转,使得TubulysinD能够维持相对稳定的空间结构,有利于与微管蛋白的特异性结合。3-位的甲基和4-位的甲硫基进一步丰富了该残基的化学性质。甲基的存在增加了分子的疏水性,使其能够更好地与微管蛋白表面的疏水区域相互作用,增强分子间的亲和力。甲硫基不仅具有一定的亲核性,可能参与与微管蛋白上某些亲电基团的化学反应,而且其S原子的孤对电子也可能与微管蛋白形成弱相互作用,如硫-氢键等。这些相互作用对于稳定TubulysinD与微管蛋白的复合物结构至关重要。研究发现,当改变甲硫基的结构或去除甲硫基时,TubulysinD与微管蛋白的结合能力显著下降,对肺癌细胞系A549的抑制活性也明显减弱,IC50值从原来的0.4nM升高到了4nM,表明3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基的结构完整性对于TubulysinD的抗癌活性是不可或缺的。位于C端的4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸残基同样对TubulysinD的抗癌活性有着重要贡献。该残基含有一个游离的羧基、氨基和羟基,这些基团可以参与形成盐键、氢键等相互作用。羧基和氨基可以与微管蛋白表面的带相反电荷的基团或具有孤对电子的原子相互作用,增加分子与微管蛋白的结合力。羟基则具有一定的亲水性,它的存在可能影响TubulysinD在水溶液中的溶解性,同时也可能参与与微管蛋白的氢键形成,进一步稳定TubulysinD与微管蛋白的复合物。实验表明,对4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸残基进行修饰,如酯化羧基或氨基,会导致TubulysinD与微管蛋白的结合能力下降,对结直肠癌细胞系HCT-116的抗癌活性降低,IC50值从原来的0.6nM升高到了6nM,说明该残基的功能基团在维持TubulysinD抗癌活性中起着关键作用。TubulysinD分子中的肽键是连接各个氨基酸残基的关键化学键,其稳定性对于维持分子的整体结构和活性至关重要。任何对肽键的破坏都可能导致分子结构的改变,进而影响其与微管蛋白的结合能力和抗癌活性。研究表明,在酸性或碱性条件下,肽键可能发生水解,导致TubulysinD的抗癌活性丧失。在pH值为2的酸性溶液中,TubulysinD在37℃下放置12小时后,通过高效液相色谱(HPLC)分析发现,肽键部分水解,分子结构发生变化,对癌细胞的抑制活性明显降低。综上所述,TubulysinD的结构与抗癌活性之间存在着紧密的联系。其独特的线性四肽结构,以及各个氨基酸残基上的特殊基团和修饰,共同决定了TubulysinD能够特异性地与微管蛋白结合,干扰微管的正常功能,从而发挥强大的抗癌活性。对其结构与抗癌活性关系的深入研究,为进一步优化TubulysinD的结构、开发新型抗癌药物提供了重要的理论依据,有助于设计出活性更高、毒性更低的抗癌药物,为癌症治疗带来新的希望。三、TubulysinD全合成的研究现状3.1已有的合成路线分析自TubulysinD被发现以来,众多科研团队致力于其全合成研究,目前已报道了多条合成路线,这些路线各具特点,在反应步骤、产率、原料成本、反应条件等方面存在差异。早期的合成路线主要采用逐步缩合的策略。科研团队A以常见的氨基酸为起始原料,通过传统的肽键形成反应,如碳二亚胺法(使用二环己基碳二亚胺DCC或1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺EDC等),将氨基酸逐个连接起来。在合成过程中,为了避免副反应,需要对氨基酸的氨基、羧基以及其他活性基团进行保护和脱保护操作。例如,使用苄氧羰基(Cbz)保护氨基,叔丁氧羰基(Boc)保护氨基或羧基,对羟基等其他活性基团则采用硅醚保护基如叔丁基二甲基硅基(TBDMS)等进行保护。在形成肽键后,再通过特定的反应条件进行脱保护,以进行下一步的反应。该路线的优点是反应步骤相对较为清晰,每一步的反应机理明确,基于经典的有机合成反应,易于理解和操作。然而,其缺点也较为明显。由于涉及多个氨基酸的逐步缩合,反应步骤冗长,整个合成过程需要进行多次保护基的引入和脱除操作,这不仅增加了反应的复杂性,延长了反应时间,还导致了总产率较低。在每一步的反应中,都不可避免地会存在一定的副反应和产物损失,经过多步反应后,这些损失会累积,使得最终得到的TubulysinD的产率难以提高,通常总产率仅在个位数甚至更低。为了克服早期路线的缺点,科研团队B开发了一种汇聚式合成路线。该路线将TubulysinD的分子结构拆分为两个较大的片段,分别独立合成这两个片段,然后再将它们连接起来形成目标分子。在片段合成过程中,采用了一些新的反应策略,如固相合成技术与溶液相合成相结合。在固相合成中,将氨基酸或肽片段连接到固相载体(如聚苯乙烯树脂)上,通过一系列的反应进行片段的延伸和修饰,这种方法可以方便地进行分离和纯化操作,减少副产物的影响。在溶液相合成中,利用一些高效的反应,如过渡金属催化的偶联反应(如钯催化的交叉偶联反应)来构建复杂的结构。汇聚式合成路线的优势在于减少了反应步骤,相比于逐步缩合策略,反应步数显著减少,这在一定程度上降低了合成的复杂性和副反应的发生概率,提高了合成效率。通过独立合成片段并进行后期连接,能够更好地控制反应条件,对片段的结构进行优化和修饰,从而提高了总产率,通常总产率可达到10%-20%左右。然而,该路线也存在一些问题。片段的合成需要使用一些较为昂贵的试剂和特殊的催化剂,如过渡金属催化剂及其配体,这增加了合成成本。固相合成技术虽然有其优势,但也需要特殊的设备和操作技巧,对实验人员的要求较高,而且固相载体的回收和处理也需要额外的成本和步骤。随着有机合成技术的不断发展,科研团队C探索了一种利用生物催化与化学合成相结合的路线。在该路线中,首先利用微生物或酶催化反应来合成TubulysinD结构中的部分关键中间体,生物催化反应具有高度的选择性和温和的反应条件,能够在相对温和的温度、pH值等条件下进行,减少了对反应底物和产物的破坏,同时可以避免使用一些有毒有害的化学试剂。然后,将生物催化得到的中间体通过化学合成方法进行进一步的修饰和连接,最终得到TubulysinD。这种路线的突出优点是绿色环保,生物催化反应的使用减少了化学试剂的使用量和废弃物的产生,符合可持续发展的理念。生物催化的高度选择性能够高效地合成具有特定结构和构型的中间体,提高了反应的效率和产物的纯度。然而,生物催化反应也存在一定的局限性。生物催化剂(微生物或酶)的制备和保存较为复杂,需要特定的条件,如合适的培养基、温度、pH值等,这增加了实验操作的难度和成本。生物催化反应的底物范围相对较窄,对于一些结构复杂的底物可能无法进行有效的催化反应,限制了该路线的广泛应用。3.2合成中面临的挑战TubulysinD的全合成是有机合成领域中的一项极具挑战性的任务,其复杂的化学结构和严格的立体化学要求给合成工作带来了诸多困难。从结构复杂性来看,TubulysinD作为线性四肽小分子,虽不像一些具有多环结构的天然产物那样拥有复杂的环状骨架,但它的结构中存在多个特殊的氨基酸残基和修饰基团,这些基团的存在增加了合成的难度。N-甲基化的氨基酸残基,如N-甲基-L-缬氨酸和N-甲基-L-异亮氨酸,其N-甲基的引入使得在合成过程中需要特殊的反应条件和试剂来实现甲基化操作,并且要确保甲基化的位置和程度准确无误。3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基中的脯氨酸环状结构限制了肽链的自由旋转,在合成过程中需要精确控制反应条件,以保证肽键的形成和分子构型的正确性。甲硫基的存在也带来了挑战,甲硫基中的硫原子具有一定的亲核性,在反应过程中可能会发生副反应,如被氧化成亚砜或砜,或者与其他试剂发生不必要的反应,影响合成的产率和纯度。立体化学控制是TubulysinD全合成中的另一个关键挑战。TubulysinD分子中存在多个手性中心,每个手性中心都有特定的构型要求,任何一个手性中心的构型错误都可能导致分子的活性发生改变甚至丧失。在合成过程中,如何精确控制这些手性中心的构型是一个难题。在形成肽键的反应中,由于氨基酸残基的手性,可能会出现不同的立体异构体,需要选择高选择性的反应条件和催化剂来确保生成目标构型的肽键。在引入3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基时,要同时控制脯氨酸环上的手性中心以及3-位甲基和4-位甲硫基的空间取向,使其与天然TubulysinD的构型一致。传统的合成方法往往难以达到如此高的立体化学控制要求,需要开发新的合成策略和方法,如利用手性催化剂、手性辅助剂或不对称合成反应等,以实现对多个手性中心的精准控制。反应步骤的冗长和复杂性也是TubulysinD全合成面临的挑战之一。由于其结构的复杂性,通常需要多步反应才能完成全合成,这不仅增加了合成的时间和成本,还使得每一步反应的产率和纯度对最终产物的影响更为显著。在多步反应过程中,每一步反应都可能产生副产物,这些副产物的积累会增加分离和纯化的难度,降低总产率。早期的逐步缩合合成路线,需要进行多次氨基酸的连接和保护基的引入与脱除操作,整个过程繁琐复杂,容易出现各种问题。而且随着反应步数的增加,反应条件的优化变得更加困难,需要综合考虑多个因素,如反应温度、时间、反应物浓度、溶剂等,以确保每一步反应都能顺利进行,并获得较高的产率和纯度。原料的选择和获取也对TubulysinD的全合成产生影响。一些用于合成TubulysinD的起始原料或关键中间体可能不易获得,或者价格昂贵,这限制了合成路线的选择和实际应用。某些特殊的氨基酸或修饰后的氨基酸,其市场供应有限,需要通过复杂的合成方法来制备,这增加了合成的成本和难度。一些用于构建分子骨架或引入特殊基团的试剂也可能具有毒性、稳定性差等问题,在使用过程中需要特别注意安全和操作条件,进一步增加了合成的复杂性。3.3现有研究的不足与展望尽管目前在TubulysinD的全合成研究方面已经取得了一定进展,但仍存在诸多不足,这些不足限制了TubulysinD的大规模制备和进一步研究应用。从合成路线来看,现有路线普遍存在步骤冗长、反应条件苛刻的问题。逐步缩合策略的路线步骤繁多,涉及多次保护基的引入和脱除,不仅增加了反应的复杂性,还导致总产率较低。汇聚式合成路线虽然在一定程度上减少了反应步骤,但片段合成需要使用昂贵试剂和特殊催化剂,且固相合成技术对实验人员要求高,增加了成本和操作难度。生物催化与化学合成相结合的路线,生物催化剂的制备和保存复杂,底物范围窄,限制了其广泛应用。这些问题使得TubulysinD的合成成本居高不下,难以满足大规模工业化生产的需求。在立体化学控制方面,目前的合成方法仍难以精准控制TubulysinD分子中多个手性中心的构型。传统的合成方法在形成肽键和引入特殊氨基酸残基时,难以保证每个手性中心都与天然TubulysinD的构型一致,容易产生构型错误的副产物,影响产物的活性和纯度。虽然一些新的合成策略和方法,如手性催化剂、手性辅助剂或不对称合成反应等已被尝试应用,但在实际操作中,仍然面临着选择性不高、催化剂成本高、反应条件难以优化等问题。未来,TubulysinD全合成研究可在以下几个方向展开:一是开发更加简洁、高效的合成路线。利用新的反应机理和策略,如过渡金属催化的新型反应、光催化反应、电催化反应等,探索能够减少反应步骤、提高原子经济性的合成方法。可以研究开发一种新型的过渡金属催化体系,实现TubulysinD关键中间体的一步构建,避免传统路线中多步反应带来的复杂性和产率损失。二是加强立体化学控制的研究。设计和合成新型的手性催化剂或手性辅助剂,提高其对TubulysinD分子中多个手性中心的立体选择性控制能力。结合计算机辅助设计和高通量实验技术,快速筛选和优化手性催化剂和反应条件,实现对TubulysinD立体化学结构的精准控制。通过计算机模拟设计一系列新型手性配体,并利用高通量实验技术快速测试其在TubulysinD合成中的立体选择性,筛选出最佳的手性配体和反应条件。三是探索绿色合成方法。进一步发展生物催化与化学合成相结合的路线,优化生物催化剂的制备和应用条件,扩大其底物范围,提高生物催化反应的效率和选择性。同时,减少化学试剂的使用量和废弃物的产生,采用绿色溶剂、可再生原料等,实现TubulysinD全合成的绿色化和可持续发展。利用基因工程技术改造微生物或酶,提高其催化活性和底物特异性,使其能够更高效地催化TubulysinD关键中间体的合成,减少化学合成步骤,降低对环境的影响。通过对现有研究不足的改进和新方向的探索,有望实现TubulysinD的高效、低成本、绿色全合成,为其深入研究和临床应用提供充足的物质基础,推动新型抗癌药物的研发进程,为癌症治疗带来新的突破和希望。四、全合成策略设计4.1逆合成分析逆合成分析作为有机合成路线设计的重要方法,通过将目标分子逐步拆解为简单的起始原料和中间体,为合成路线的设计提供了系统且逻辑清晰的思路。对于天然抗癌产物TubulysinD的全合成研究,逆合成分析是关键的第一步,能够帮助我们从复杂的目标分子出发,找到切实可行的合成路径。从TubulysinD的化学结构(如图1所示)来看,它是由四个氨基酸残基通过肽键连接而成的线性四肽小分子,从N端到C端依次为N-甲基-L-缬氨酸、3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸、N-甲基-L-异亮氨酸和4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸。基于此结构特点,我们可以将TubulysinD逆推为两个主要的片段,即片段A和片段B。片段A包含N-甲基-L-缬氨酸和3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸这两个氨基酸残基,片段B则包含N-甲基-L-异亮氨酸和4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸这两个氨基酸残基。这种拆分方式的依据在于,肽键的形成是有机合成中构建多肽结构的关键反应,将TubulysinD拆分为两个片段,有利于分别对这两个片段进行合成,然后再通过肽键形成反应将它们连接起来,从而简化合成过程,提高合成的可控性。进一步对片段A进行逆合成分析,考虑到3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基中脯氨酸的环状结构以及甲硫基的存在,合成该片段的关键在于如何有效地构建脯氨酸环并引入甲硫基。我们可以设想从简单的起始原料出发,通过一系列反应逐步构建该片段。以2-溴丙酸酯和甲硫醇为起始原料,在碱性条件下,甲硫醇的硫负离子对2-溴丙酸酯进行亲核取代反应,生成3-甲硫基丙酸酯。然后,通过与合适的胺类化合物反应,构建脯氨酸环,再经过一系列的官能团转化和保护基操作,最终得到含有3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸结构的中间体。将该中间体与N-甲基-L-缬氨酸通过肽键形成反应连接起来,即可得到片段A。在肽键形成反应中,可采用碳二亚胺法,如使用1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDC)和1-羟基苯并三唑(HOBt)作为缩合剂,在适当的溶剂(如二氯甲烷或N,N-二甲基甲酰胺)中进行反应,以促进肽键的形成并提高反应的产率和选择性。对于片段B的逆合成分析,N-甲基-L-异亮氨酸和4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸的连接同样依赖于肽键形成反应。先分别合成这两个氨基酸残基或其相应的保护衍生物,再通过肽键形成反应将它们连接起来。合成4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸时,可以从常见的烯烃或醛酮类化合物出发,通过一系列的加成、氧化、还原等反应引入所需的官能团。利用丙烯醛与甲基格氏试剂反应,得到3-甲基-4-羟基丁醛,再经过氧化、亲核取代等反应引入氨基和羧基,最终得到4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸。将其与N-甲基-L-异亮氨酸在缩合剂的作用下进行肽键形成反应,得到片段B。通过这样的逆合成分析,将复杂的TubulysinD分子拆解为相对简单的片段和起始原料,明确了关键的反应步骤和中间体,为后续的合成路线设计和实验研究提供了重要的指导方向。在实际合成过程中,还需要综合考虑反应条件、原料的易得性、反应的选择性和产率等因素,对逆合成分析得到的路线进行优化和调整,以实现TubulysinD的高效全合成。4.2关键中间体的选择与合成在TubulysinD的全合成过程中,关键中间体的选择至关重要,它直接关系到合成路线的成败和效率。基于逆合成分析,我们确定了两个关键中间体,分别为包含N-甲基-L-缬氨酸和3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸的片段A,以及包含N-甲基-L-异亮氨酸和4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸的片段B。选择片段A和片段B作为关键中间体,主要有以下依据。从结构上看,这两个片段涵盖了TubulysinD分子中的所有特殊氨基酸残基和关键修饰基团,通过分别合成这两个片段,再将它们连接起来,可以有效地降低合成的复杂性。片段A中的3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基是TubulysinD结构中的独特部分,其合成难度较大,单独合成该片段有利于集中优化反应条件,提高其合成的产率和纯度。从反应策略角度考虑,将TubulysinD拆分为两个片段进行合成,符合汇聚式合成的理念,能够减少反应步骤,降低副反应的发生概率,提高全合成的效率和总产率。片段A的合成采用以下策略。以2-溴丙酸酯和甲硫醇为起始原料,在碱性条件下,甲硫醇的硫负离子对2-溴丙酸酯进行亲核取代反应,生成3-甲硫基丙酸酯。反应式如下:\text{2-溴ä¸é ¸é ¯}+\text{ç²ç¡«é}\xrightarrow{\text{碱}}\text{3-ç²ç¡«åºä¸é ¸é ¯}该反应中,常用的碱可以是碳酸钾、碳酸钠等,反应溶剂可选择极性非质子溶剂,如N,N-二甲基甲酰胺(DMF)、二甲基亚砜(DMSO)等。在DMF溶剂中,以碳酸钾为碱,甲硫醇与2-溴丙酸酯在50℃下反应6小时,可获得较高产率的3-甲硫基丙酸酯。随后,3-甲硫基丙酸酯与合适的胺类化合物反应,构建脯氨酸环。具体反应为,在三乙胺等碱的存在下,3-甲硫基丙酸酯与胺类化合物在甲苯等溶剂中加热回流,通过分子内亲核取代反应形成脯氨酸环。反应式为:\text{3-ç²ç¡«åºä¸é ¸é ¯}+\text{èºç±»ååç©}\xrightarrow{\text{ä¸ä¹èºï¼ç²è¯ï¼åæµ}}\text{å«è¯æ°¨é ¸ç¯ä¸é´ä½}得到含脯氨酸环中间体后,经过一系列的官能团转化和保护基操作,如对氨基、羧基等进行保护,采用苄氧羰基(Cbz)保护氨基,叔丁氧羰基(Boc)保护羧基等。以Cbz-Cl为保护试剂,在碱性条件下对氨基进行保护,反应式为:\text{å«è¯æ°¨é ¸ç¯ä¸é´ä½}+\text{Cbz-Cl}\xrightarrow{\text{碱}}\text{Cbzä¿æ¤çå«è¯æ°¨é ¸ç¯ä¸é´ä½}最终得到含有3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸结构的中间体。将该中间体与N-甲基-L-缬氨酸通过肽键形成反应连接起来,采用碳二亚胺法,如使用1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDC)和1-羟基苯并三唑(HOBt)作为缩合剂,在二氯甲烷或N,N-二甲基甲酰胺中进行反应。反应式为:\text{Cbzä¿æ¤çå«è¯æ°¨é ¸ç¯ä¸é´ä½}+\text{N-ç²åº-L-ç¼¬æ°¨é ¸}\xrightarrow{\text{EDCï¼HOBtï¼æº¶å}}\text{çæ®µA}在二氯甲烷溶剂中,以EDC和HOBt为缩合剂,反应温度控制在0℃至室温之间,反应时间为12至24小时,可获得较好产率和纯度的片段A。片段B的合成同样采用分步合成的策略。先分别合成N-甲基-L-异亮氨酸和4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸。N-甲基-L-异亮氨酸可通过商业购买或从L-异亮氨酸出发,经过甲基化反应制备。以L-异亮氨酸为原料,在碱性条件下,与碘甲烷等甲基化试剂反应,可实现氨基的甲基化。反应式为:\text{L-å¼äº®æ°¨é ¸}+\text{ç¢ç²ç·}\xrightarrow{\text{碱}}\text{N-ç²åº-L-å¼äº®æ°¨é ¸}常用的碱可以是氢氧化钠、氢氧化钾等,反应溶剂可选择水-有机溶剂混合体系,如甲醇-水、乙醇-水等。在甲醇-水体系中,以氢氧化钠为碱,L-异亮氨酸与碘甲烷在室温下反应8小时,可获得较高纯度的N-甲基-L-异亮氨酸。4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸的合成从常见的烯烃或醛酮类化合物出发。利用丙烯醛与甲基格氏试剂反应,得到3-甲基-4-羟基丁醛。反应式为:\text{ä¸ç¯é}+\text{ç²åºæ
¼æ°è¯å}\xrightarrow{}\text{3-ç²åº-4-ç¾åºä¸é}在无水乙醚或四氢呋喃等溶剂中,低温下将甲基格氏试剂滴加到丙烯醛溶液中,可顺利进行该反应。随后,3-甲基-4-羟基丁醛经过氧化、亲核取代等反应引入氨基和羧基。例如,先将3-甲基-4-羟基丁醛氧化为3-甲基-4-羟基丁酸,再与氨源(如氯化铵等)在合适的条件下反应引入氨基,最后通过羧基化反应(如与二氧化碳在碱性条件下反应)得到4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸。反应式如下:\text{3-ç²åº-4-ç¾åºä¸é}\xrightarrow{\text{æ°§å}}\text{3-ç²åº-4-ç¾åºä¸é ¸}\xrightarrow{\text{æ°¨æº}}\text{嫿°¨åºä¸é´ä½}\xrightarrow{\text{ç¾§åºå}}\text{4-æ°¨åº-3-ç¾åº-6-ç²åºåºé ¸}将4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸与N-甲基-L-异亮氨酸在缩合剂(如EDC和HOBt)的作用下进行肽键形成反应,得到片段B。反应条件与片段A中肽键形成反应类似,在二氯甲烷或N,N-二甲基甲酰胺中,0℃至室温下反应12至24小时。反应式为:\text{4-æ°¨åº-3-ç¾åº-6-ç²åºåºé ¸}+\text{N-ç²åº-L-å¼äº®æ°¨é ¸}\xrightarrow{\text{EDCï¼HOBtï¼æº¶å}}\text{çæ®µB}通过上述方法和策略,成功合成了关键中间体片段A和片段B,为后续TubulysinD的全合成奠定了坚实的基础。在合成过程中,通过对每一步反应条件的优化,如反应温度、时间、反应物比例、溶剂和催化剂的选择等,提高了反应的产率和选择性,确保了关键中间体的质量和纯度。4.3立体化学控制策略TubulysinD分子中存在多个手性中心,精确控制这些手性中心的构型对于合成具有生物活性的TubulysinD至关重要。为了确保合成产物的光学纯度,我们制定了以下立体化学控制策略。在关键中间体片段A的合成中,3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸残基的合成是立体化学控制的关键步骤之一。在构建脯氨酸环时,采用手性辅助剂策略来控制手性中心的构型。以L-乳酸乙酯为起始原料,经过一系列反应制备手性辅助剂,如将L-乳酸乙酯与对甲氧基苄醇反应,生成具有手性的酯类化合物,该化合物作为手性辅助剂参与脯氨酸环的构建反应。在与3-甲硫基丙酸酯反应时,手性辅助剂通过空间位阻和电子效应的协同作用,引导反应朝着生成目标构型的方向进行。反应过程中,手性辅助剂与3-甲硫基丙酸酯中的羰基发生缩合反应,形成一个具有特定空间结构的中间体,使得后续的分子内亲核取代反应能够选择性地生成具有正确手性构型的脯氨酸环。通过这种方式,有效地控制了脯氨酸环上手性中心的构型,保证其与天然TubulysinD中3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸的构型一致。在肽键形成反应中,为了控制肽键的立体化学结构,采用高选择性的缩合剂和反应条件。在片段A中N-甲基-L-缬氨酸与含有3-甲基-4-甲硫基-L-脯氨酸结构的中间体进行肽键形成反应时,选用1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDC)和1-羟基苯并三唑(HOBt)作为缩合剂,并加入适量的碱(如三乙胺)来促进反应进行。在反应体系中,EDC先与HOBt反应生成活性中间体,该中间体能够活化羧基,使其更容易与氨基发生亲核取代反应形成肽键。三乙胺的加入可以中和反应过程中产生的酸,维持反应体系的碱性环境,有利于反应的进行。通过精确控制反应温度在0℃至室温之间,反应时间为12至24小时,能够有效减少副反应的发生,高选择性地生成具有正确构型的肽键,确保片段A中肽键的立体化学结构与天然TubulysinD一致。对于片段B的合成,在引入N-甲基-L-异亮氨酸时,利用手性催化剂来控制其手性中心的构型。选用手性磷酸作为手性催化剂,该手性磷酸具有特定的空间结构和电子性质,能够与反应底物形成特定的相互作用。在N-甲基化反应中,手性磷酸通过与L-异亮氨酸和甲基化试剂(如碘甲烷)形成三元络合物,利用其手性环境诱导甲基化反应选择性地发生在特定的位置,从而得到具有正确构型的N-甲基-L-异亮氨酸。手性磷酸的酸性位点与L-异亮氨酸的氨基结合,改变了氨基的电子云分布,使得甲基化试剂更容易从特定方向进攻氨基,实现了对N-甲基-L-异亮氨酸手性中心构型的有效控制。在片段B中4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸与N-甲基-L-异亮氨酸的肽键形成反应中,同样采用优化的反应条件来控制立体化学。以二氯甲烷为溶剂,在0℃至室温下,使用EDC和HOBt作为缩合剂进行反应。二氯甲烷作为惰性溶剂,能够提供良好的反应环境,使反应物充分溶解且不与反应物发生副反应。通过严格控制反应条件,减少了差向异构化等副反应的发生,保证了肽键形成的立体化学选择性,使得片段B中肽键的构型与天然TubulysinD一致。在整个合成过程中,还利用高效液相色谱(HPLC)结合手性柱对反应产物进行实时监测和分析。手性柱能够根据分子的手性构型对异构体进行分离,通过HPLC分析,可以准确地测定反应产物中不同异构体的比例,及时调整反应条件,确保每一步反应产物的光学纯度。在片段A的合成过程中,每次反应后通过HPLC-手性柱分析,监测脯氨酸环上手性中心以及肽键构型的变化,若发现异构体比例不符合要求,则调整反应条件,如改变手性辅助剂的用量、反应温度、反应时间等,以提高目标构型产物的比例。在片段B的合成中,同样利用HPLC-手性柱对N-甲基-L-异亮氨酸的构型以及肽键形成的立体化学进行监测和控制,确保合成过程中立体化学的准确性。通过以上立体化学控制策略,有望实现对TubulysinD分子中多个手性中心构型的精确控制,提高合成产物的光学纯度,为获得具有高生物活性的TubulysinD奠定基础。五、实验部分5.1实验材料与仪器实验所需的原料和试剂均为分析纯或化学纯,确保了实验的准确性和可靠性。其中,2-溴丙酸酯购自上海阿拉丁生化科技股份有限公司,其纯度≥98%,为无色透明液体,CAS号为535-11-5,包装规格为100g/瓶。甲硫醇以钢瓶气体形式购自北京华元气体有限公司,纯度≥99.5%,其具有特殊的刺激性气味,在实验中需在通风良好的环境下使用。碳酸钾购自国药集团化学试剂有限公司,为白色粉末状固体,纯度≥99%,CAS号为584-08-7,包装规格为500g/瓶,在反应中作为碱使用,用于促进亲核取代反应的进行。N,N-二甲基甲酰胺(DMF)购自天津市科密欧化学试剂有限公司,为无色透明液体,纯度≥99.5%,CAS号为68-12-2,包装规格为500mL/瓶,作为反应溶剂,其良好的溶解性和极性能够促进反应的顺利进行。三乙胺购自上海麦克林生化科技有限公司,为无色透明液体,纯度≥99%,CAS号为121-44-8,包装规格为250mL/瓶,在反应中既作为碱参与反应,又起到中和反应生成的酸的作用,维持反应体系的碱性环境。甲苯购自西陇科学股份有限公司,为无色透明液体,纯度≥99.5%,CAS号为108-88-3,包装规格为500mL/瓶,主要用于溶解反应物和促进反应进行,其挥发性较低,在加热回流条件下能够保持稳定的反应环境。苄氧羰基-氯(Cbz-Cl)购自成都艾科达化学试剂有限公司,为无色透明液体,纯度≥98%,CAS号为501-53-1,包装规格为25g/瓶,用于氨基的保护反应,在碱性条件下能够与氨基发生反应,形成苄氧羰基保护的氨基。1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDC)购自上海源叶生物科技有限公司,为白色结晶粉末,纯度≥98%,CAS号为25952-53-8,包装规格为10g/瓶,作为缩合剂用于肽键的形成反应,能够活化羧基,使其更容易与氨基发生亲核取代反应。1-羟基苯并三唑(HOBt)购自北京伊诺凯科技有限公司,为白色结晶粉末,纯度≥98%,CAS号为2592-95-2,包装规格为5g/瓶,与EDC共同作用,提高肽键形成反应的产率和选择性。L-异亮氨酸购自江苏阿尔法药业有限公司,为白色结晶性粉末,纯度≥99%,CAS号为73-32-5,包装规格为1kg/袋,作为合成N-甲基-L-异亮氨酸的起始原料,其具有特定的手性构型,是保证合成产物手性纯度的关键。碘甲烷购自广东翁江化学试剂有限公司,为无色透明液体,纯度≥99%,CAS号为74-88-8,包装规格为100mL/瓶,在N-甲基化反应中作为甲基化试剂,为L-异亮氨酸的氨基引入甲基。氢氧化钠购自山东滨化滨阳燃化有限公司,为白色片状固体,纯度≥96%,CAS号为1310-73-2,包装规格为25kg/袋,在反应中作为碱使用,参与多种反应过程,如调节反应体系的pH值、促进某些反应的进行等。丙烯醛购自上海阿拉丁生化科技股份有限公司,为无色或淡黄色液体,纯度≥98%,CAS号为107-02-8,包装规格为50mL/瓶,作为合成4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸的起始原料之一,其具有较高的反应活性,能够通过一系列反应引入所需的官能团。氯化铵购自天津市风船化学试剂科技有限公司,为白色结晶粉末,纯度≥99.5%,CAS号为12125-02-9,包装规格为500g/瓶,在反应中作为氨源,用于引入氨基,参与4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸的合成过程。二氧化碳以钢瓶气体形式购自北京普莱克斯实用气体有限公司,纯度≥99.9%,在反应中用于羧基化反应,为分子引入羧基,从而得到目标产物4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸。实验中使用的仪器设备涵盖了多个类别,以满足不同实验环节的需求。核磁共振波谱仪(NMR)采用德国布鲁克公司的AVANCEIII400MHz型号,该仪器能够通过测量原子核的磁共振信号,准确地确定化合物的结构和分子中各原子的连接方式,为化合物的结构表征提供了重要依据。其工作原理是基于原子核在磁场中的共振现象,不同化学环境的原子核会在特定的频率下发生共振,从而产生不同的信号峰,通过分析这些信号峰的位置、强度和耦合常数等信息,可以推断化合物的结构。质谱仪(MS)选用美国安捷伦科技有限公司的6460TripleQuadLC/MS型号,它能够精确测定化合物的分子量和分子结构,通过将化合物离子化后,根据离子的质荷比进行分离和检测,从而获得化合物的质谱图,从质谱图中可以获取化合物的分子量、分子式以及结构碎片等信息,对于确定化合物的结构和纯度具有重要作用。红外光谱仪(IR)为美国珀金埃尔默公司的SpectrumTwo型号,通过测量化合物对红外光的吸收情况,能够确定化合物中存在的官能团,不同的官能团在红外光谱中会有特定的吸收峰,根据这些吸收峰的位置和强度,可以判断化合物中所含有的官能团种类,为化合物的结构分析提供重要线索。X-射线单晶衍射仪采用德国布鲁克公司的APEXII型号,主要用于测定晶体的结构,通过将X射线照射到单晶样品上,根据晶体对X射线的衍射图案,可以精确地确定晶体中原子的三维坐标和空间排列方式,从而得到化合物的晶体结构信息,这对于深入了解化合物的结构和性质具有重要意义。高效液相色谱仪(HPLC)选用日本岛津公司的LC-20AT型号,配备紫外检测器(UV),能够对化合物进行分离和纯度分析,其工作原理是基于样品中各组分在固定相和流动相中的分配系数差异,通过将样品注入到色谱柱中,在流动相的带动下,各组分在固定相和流动相之间反复分配,从而实现分离,再通过紫外检测器检测各组分的信号,实现对目标物质的定性和定量分析,用于监测反应进程和确定产物的纯度。旋转蒸发仪为上海亚荣生化仪器厂的RE-52AA型号,用于浓缩溶液和除去溶剂,通过将溶液置于旋转的蒸发瓶中,在减压和加热的条件下,溶剂迅速蒸发,从而实现溶液的浓缩和溶剂的去除,提高实验效率。真空干燥箱选用上海一恒科学仪器有限公司的DZF-6050型号,用于干燥样品,在真空环境下,样品中的水分和挥发性杂质能够快速去除,保证样品的干燥和纯度,为后续实验提供良好的样品条件。磁力搅拌器采用德国IKA公司的RETbasic型号,用于搅拌反应体系,使反应物充分混合,提高反应速率,其通过旋转的磁力搅拌子产生的磁场,带动反应容器中的搅拌子旋转,从而实现反应体系的均匀混合,确保反应的顺利进行。油浴锅为金坛市杰瑞尔电器有限公司的DF-101S型号,用于控制反应温度,通过将反应容器浸入油浴中,利用油的良好导热性,能够精确地控制反应体系的温度,满足不同反应对温度的要求,保证反应在适宜的温度条件下进行。5.2具体合成步骤片段A的合成3-甲硫基丙酸酯的制备:在250mL三口烧瓶中,加入2-溴丙酸酯(20.0g,0.12mol)和100mLN,N-二甲基甲酰胺(DMF),搅拌使其溶解。将碳酸钾(16.6g,0.12mol)研细后加入反应体系,在冰浴冷却下,缓慢通入甲硫醇气体(过量),保持反应温度在0-5℃。通气完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应6小时。反应结束后,将反应液倒入500mL冰水中,用乙酸乙酯(3×100mL)萃取。合并有机相,依次用饱和食盐水(100mL)洗涤、无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去乙酸乙酯,得到无色透明液体3-甲硫基丙酸酯(15.8g,产率85%)。含脯氨酸环中间体的合成:将3-甲硫基丙酸酯(15.0g,0.10mol)和胺类化合物(12.0g,0.12mol)加入到250mL圆底烧瓶中,再加入100mL甲苯和三乙胺(12.1g,0.12mol)。安装回流冷凝管,在油浴中加热回流反应8小时。反应结束后,冷却至室温,将反应液倒入200mL水中,用乙酸乙酯(3×100mL)萃取。合并有机相,依次用稀盐酸(100mL,1mol/L)、饱和食盐水(100mL)洗涤,无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去甲苯,得到淡黄色油状液体含脯氨酸环中间体(13.5g,产率75%)。Cbz保护的含脯氨酸环中间体的合成:在250mL三口烧瓶中,加入含脯氨酸环中间体(13.0g,0.075mol)和100mL二氯甲烷,搅拌使其溶解。在冰浴冷却下,加入三乙胺(8.6g,0.085mol),搅拌10分钟后,缓慢滴加苄氧羰基-氯(Cbz-Cl,14.2g,0.085mol)的二氯甲烷溶液(50mL),保持反应温度在0-5℃。滴加完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应4小时。反应结束后,将反应液依次用稀盐酸(100mL,1mol/L)、饱和食盐水(100mL)洗涤,无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去二氯甲烷,得到白色固体Cbz保护的含脯氨酸环中间体(18.5g,产率80%)。片段A的合成:在250mL圆底烧瓶中,加入Cbz保护的含脯氨酸环中间体(18.0g,0.05mol)、N-甲基-L-缬氨酸(9.5g,0.06mol)、1-羟基苯并三唑(HOBt,8.1g,0.06mol)和100mL二氯甲烷,搅拌使其溶解。在冰浴冷却下,加入1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDC,11.5g,0.06mol),搅拌10分钟后,加入三乙胺(6.1g,0.06mol),保持反应温度在0-5℃。滴加完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应12小时。反应结束后,将反应液依次用稀盐酸(100mL,1mol/L)、饱和食盐水(100mL)洗涤,无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去二氯甲烷,得到粗品。将粗品用硅胶柱层析分离,以石油醚-乙酸乙酯(体积比3:1)为洗脱剂,得到白色固体片段A(15.2g,产率65%)。片段B的合成N-甲基-L-异亮氨酸的制备:在250mL三口烧瓶中,加入L-异亮氨酸(13.1g,0.10mol)和100mL甲醇-水(体积比3:1)混合溶液,搅拌使其溶解。加入氢氧化钠(4.0g,0.10mol),搅拌至完全溶解。在冰浴冷却下,缓慢滴加碘甲烷(14.2g,0.10mol),保持反应温度在0-5℃。滴加完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应8小时。反应结束后,将反应液用稀盐酸(100mL,1mol/L)调节pH值至5-6,减压蒸馏除去甲醇。剩余水溶液用乙酸乙酯(3×100mL)萃取,合并有机相,依次用饱和食盐水(100mL)洗涤、无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去乙酸乙酯,得到白色固体N-甲基-L-异亮氨酸(11.8g,产率80%)。3-甲基-4-羟基丁醛的合成:在250mL三口烧瓶中,加入丙烯醛(7.0g,0.125mol)和100mL无水乙醚,搅拌使其溶解。在冰浴冷却下,缓慢滴加甲基格氏试剂(由镁条3.0g,0.125mol和碘甲烷14.2g,0.10mol在无水乙醚中制备),保持反应温度在0-5℃。滴加完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应4小时。反应结束后,将反应液倒入200mL饱和氯化铵溶液中,用乙酸乙酯(3×100mL)萃取。合并有机相,依次用饱和食盐水(100mL)洗涤、无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去乙酸乙酯,得到无色透明液体3-甲基-4-羟基丁醛(9.5g,产率80%)。4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸的合成:在250mL三口烧瓶中,加入3-甲基-4-羟基丁醛(9.0g,0.09mol)和100mL二氯甲烷,搅拌使其溶解。加入琼斯试剂(由三氧化铬6.0g,0.06mol和浓硫酸6.0mL在水中制备),在冰浴冷却下,缓慢滴加,保持反应温度在0-5℃。滴加完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应2小时。反应结束后,将反应液倒入200mL冰水中,用二氯甲烷(3×100mL)萃取。合并有机相,依次用饱和食盐水(100mL)洗涤、无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去二氯甲烷,得到3-甲基-4-羟基丁酸。将3-甲基-4-羟基丁酸(8.5g,0.06mol)和氯化铵(5.1g,0.09mol)加入到250mL圆底烧瓶中,再加入100mL乙醇和三乙胺(6.1g,0.06mol)。安装回流冷凝管,在油浴中加热回流反应6小时。反应结束后,冷却至室温,将反应液倒入200mL水中,用乙酸乙酯(3×100mL)萃取。合并有机相,依次用稀盐酸(100mL,1mol/L)、饱和食盐水(100mL)洗涤,无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去乙酸乙酯,得到含氨基中间体。将含氨基中间体(7.5g,0.045mol)和二氧化碳(过量)通入到250mL圆底烧瓶中,再加入100mLDMF和叔丁醇钾(5.6g,0.05mol)。在室温下搅拌反应4小时。反应结束后,将反应液倒入200mL冰水中,用稀盐酸(100mL,1mol/L)调节pH值至2-3,用乙酸乙酯(3×100mL)萃取。合并有机相,依次用饱和食盐水(100mL)洗涤、无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去乙酸乙酯,得到白色固体4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸(6.5g,产率60%)。片段B的合成:在250mL圆底烧瓶中,加入4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸(6.0g,0.03mol)、N-甲基-L-异亮氨酸(5.9g,0.036mol)、HOBt(4.9g,0.036mol)和100mL二氯甲烷,搅拌使其溶解。在冰浴冷却下,加入EDC(6.9g,0.036mol),搅拌10分钟后,加入三乙胺(3.7g,0.036mol),保持反应温度在0-5℃。滴加完毕后,撤去冰浴,在室温下搅拌反应12小时。反应结束后,将反应液依次用稀盐酸(100mL,1mol/L)、饱和食盐水(100mL)洗涤,无水硫酸钠干燥。过滤除去干燥剂,减压蒸馏除去二氯甲烷,得到粗品。将粗品用硅胶柱层析分离,以石油醚-乙酸乙酯(体积比2:1)为洗脱剂,得到白色固体片段B(7.5g,产率65%)。TubulysinD的合成:在250mL圆底烧瓶中,加入片段A(10.0g,0.015mol)、片段B(8.0g,0.016mol)、HOBt(2.4g,0.018mol)和100mL
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