生物医学生物科技公司研发助理实习生实习报告

生物医学生物科技公司研发助理实习生实习报告一、摘要2023年6月5日至8月23日，我在一家生物医学生物科技公司担任研发助理实习生。核心工作成果包括协助完成3个细胞系的全基因组测序数据分析，处理约5GB原始测序数据，通过生物信息学工具进行变异筛选，最终提交2份包含150个显著变异位点的分析报告。期间应用了Python脚本自动化数据处理流程，将常规数据处理时间从5小时缩短至2小时；熟练掌握R语言进行统计分析，绘制了10张包含误差线的图表用于项目汇报。通过实践掌握了高通量数据质量控制标准，提炼出可复用的数据清洗模板，涵盖样本信息校验、缺失值处理及异常值检测等模块，有效提升了团队数据分析效率。二、实习内容及过程1实习目的希望通过实践了解生物医学生物科技公司的研发流程，将课堂上学到的分子生物学和生物信息学知识用到实际项目中，提升动手能力，看看自己是否真的喜欢这个方向。2实习单位简介我实习的公司主要做基因编辑技术相关的研发，产品集中在细胞治疗和疾病模型构建上。公司不大，研发部门就三四十个人，氛围挺开放的，老板也常在实验室转，大家交流比较多。3实习内容与过程第1周主要是熟悉环境，看了一些文献，然后跟着师兄做实验，学怎么培养细胞、做qpcr。我负责的细胞系是某种肿瘤细胞，每天要传代、做染料标记，数据记录特别繁琐，得确保每个样本的孔板号、重复次数都记对。第2周开始接触数据分析，主要是帮我导师处理一个抗肿瘤药物筛选项目的测序数据。原始数据是二代测序的，有几百个样本，一开始我对fastp工具挺陌生，师兄教了我怎么用脚本批量处理数据，我花了3天时间才把所有样本的质控做完，结果发现大概30%的样本需要重新测序，当时就觉得数据预处理真重要。第36周是核心项目，参与一个阿尔茨海默病相关基因的验证实验。我负责构建过表达载体，因为第一次做质粒转染，第一次转染失败率特别高，有些细胞根本没转染进去，有些又死光了。导师让我查了文献，发现是脂质体试剂选不对，换了个试剂才成功。最后我们做了3个实验重复，用wb检测蛋白表达量，三个孔的数据都在统计学显著区间内。第7周帮忙整理之前的实验数据，画图表，写报告。我用R语言画了基因表达热图，颜色深浅代表表达量高低，导师看了说挺直观。最后提交的报告里，我负责整理了测序结果中的snp位点，用vcf文件导出后筛选出频率超过5%的变异。4实习成果与收获整体完成了4个实验的辅助工作，独立处理了300多个测序样本，提交了2份完整报告。最大的收获是学会了怎么用自动化脚本处理大量数据，之前觉得编程很难，现在发现其实挺有意思的。实验过程中也意识到，做科研不能光靠热情，还得细心，比如有一次做实验没注意试剂放反了，结果一整板细胞都废了，花了两天时间才补上。5问题与建议第一个问题是我觉得公司培训机制有点弱，刚来的时候没人系统地讲实验原理，都是靠师兄师姐带着，有些实验为啥要用某个试剂，深层原因讲得不够透。建议可以搞个新人培训计划，比如每周安排一次组会，让师兄师姐讲讲实验设计思路。第二个是岗位匹配度问题，我实习前以为主要是做实验，结果实际工作里花在数据处理上的时间比实验操作还多，虽然学到了，但感觉跟我本科课程设置不太匹配。建议学校可以加一些生物信息学工具的实操课，比如R语言或者Python的生物应用模块，这样实习起来会顺手很多。三、总结与体会1实习价值闭环这8周像把书里的知识搬到了现实里。刚来的时候觉得细胞培养、测序分析都是概念，现在亲手做过才明白每个步骤的细节。比如处理测序数据，学校教的统计学理论，真用到几千个数据点筛选snp时，才懂数据清洗有多重要。之前做作业随便看看就行，现在知道一个格式错误可能导致整个分析链崩塌，这种责任感是以前没有的。实习结束回看，自己确实把分子生物学实验的基本功打扎实了，数据处理能力也跟上趟了，感觉像完成了一个学习闭环。2职业规划联结这次经历让我更清楚自己想干嘛了。之前对未来很模糊，现在觉得基因编辑方向挺有意思，尤其是看到师兄做crisprcas9实验时，能直观感受到技术改变生活的力量。我打算下学期补上生物信息学那门课，顺便考个pmp证书，感觉项目管理对做研究也挺重要。实习时看到老板常跟客户开会，怎么讲技术方案最清晰，我记下来以后会好好练练，以后自己创业或者进大厂都能用上。3行业趋势展望公司做的那个阿尔茨海默病项目，用到的单细胞测序技术，我后来查了下，现在临床应用还不多，但感觉很火。我实习最后整理的那份报告，导师说可以投稿，我就想，要是以后能参与这种前沿研究，把实验数据变成论文，那多酷啊。现在ai辅助分析挺流行，虽然我实习时没接触太多，但感觉未来得学学怎么用这些工具提高效率，不然单纯靠手动处理数据肯定不行。4心态转变以前觉得做实验就是按步骤操作就行，现在明白每个试剂、每个温度、每个离心力都要有依据。记得第5周做质粒提取时，师兄说缓冲液ph值调不对会失败，我当时觉得小题大做，结果试了才发现他真没错。这种被现实教育的感觉，挺磨人的，但也让人成长。现在抗压能力明显强了，以前实验出问题就慌，现在能冷静分析是哪一步出了错。这种心态转变，比学会什么技术更宝贵。5未来行动实习最后导师跟我说，以后想进他们公司得会熟练用linux，我回去就开始看相关教程，现在每天花1小时练习命令行操作。还有那个实验记录本，我发现把每次失败的原因都写透，比光记成功经验收获更大，打算以后继续这么干。下个学期打算找机会再实习1个月，这次争取能接触些更核心的实验，比如crispr敲除，把简历里项目经历写得更亮眼些。四、致谢1感谢公司提供这次实习机会，让我能接触到真实的研发环境。2特别感谢我的导师，实习期间耐