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文档简介
临床全自动核酸检测流水线应用专家共识总结2026全自动核酸检测流水线在我国的应用尚处于起步阶段,但相关技术规范和操作流程尚需进一步明确。鉴于此,中华医学会检验医学分会分子诊断学组和中国医师协会检验医师分会智能检验学组专家制定了《临床全自动核酸检测流水线应用专家共识》。本共识聚焦全自动核酸检测流水线的引入、运行操作和全流程管理,阐述了实验室改造要点、质量保证、生物安全防护和污染防控措施,描述了智能质控系统的应用场景和特性,梳理归纳了临床实验室相关建设与管理的核心技术要点及规范。核酸检测技术在感染性疾病、遗传病、肿瘤等疾病的诊断或治疗等方面具有广泛的应用。临床实验室目前采用的常规核酸检测方法操作步骤繁琐,批量检测周期较长,对人员专业素质要求高,且需要在具有严格分区的基因扩增实验室中进行。这种时间、空间和人员上的局限性制约了核酸检测技术的临床应用。伴随着精准医疗的快速发展,自动化的需求日益迫切
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1]
。核酸检测自动化主要有两种发展方向,其一是核酸即时检测(pointofcaretesting,POCT),可应用于发热门诊、急诊和某些特定病区实验室,仪器的体积和检测通量相对较小
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2-3]
,其二是全自动核酸检测流水线,主要安装在临床实验室用于大量样本检测,仪器的体积较大,可在无人值守情况下进行多个样本和不同检测项目的灵活组合检测
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]
。这两类系统能够简化实验室分区和复杂的人工操作,节省人力,缩短报告时间,同时提升质量控制水平,进一步降低生物安全风险
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4-5]
。核酸POCT临床应用相对较早,已有多个专家共识
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3,6-7]
,但全自动核酸检测流水线的应用在我国尚处于起步阶段,专业人员尚缺乏对此类系统的认识。尽管其检测模式类似于临床生化实验室的流水线,但根据检测原理,目前仍按照基因扩增实验室的相关要求进行管理。此外,由于原有实验室设计未考虑此类系统的特点,很多实验室在引进此类系统时还需进行相应要素的改造。日常工作中的质量管理、生物安全和防污染要求等方面也存在较多的疑惑。基于这些问题,中华医学会检验医学分会分子诊断学组和中国医师协会检验医师分会智能检验学组组织专家对全自动核酸检测流水线的临床应用中存在的问题进行了梳理和总结,希望通过共识规范和促进核酸检测流水线的应用和发展,推动临床核酸检验自动化的进程。共识编写工作组来自全国25个省区市62家医疗机构的临床检验诊断学、临床病理学和医院感染控制等多领域75位专家共同组成。在共识起草阶段,工作组进行了系统的文献检索,检索数据库主要包括WebofScience、PubMed、中国知网和万方数据知识服务平台,以“nucleicacidtesting”“moleculardiagnostics”“automation”“assemblyline”“laboratoryautomationsystem”和“laboratorybiosafety”等及对应中文检索词为关键词进行检索,并查询了国内外标准、指南和共识以及相关的法律法规等。检索截止日期为各数据库建库起至2024年12月31日。执笔专家基于检索结果,结合核酸检测流水线临床实际应用经验和问题,初拟了共识讨论稿。编写组长组织专家组召开3次线下会议,对讨论稿进行了深入讨论、审阅和修订,形成共识终稿。专家组参考李克特量表评分
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8]
制定了共识度调查问卷,通过函审形式调查。调查结果的统计评价采5分制,其中5分表示完全同意,4分表示基本同意,3分表示不确定,2分表示不太同意,1分表示完全不同意。共识度=评分≥4分的专家人数/总参评专家人数×100%。经集体讨论,鉴于核酸检测技术的特点和研究模式,本共识的证据等级与推荐强度等级参考评估、制定及评价分级系统进行评估
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9-10]
。证据等级分为3个等级,高:未来的研究不太可能对目前的评估结果有重要影响,从而不大可能改变当前推荐;中:未来的研究可能对目前的评估结果有重要影响,从而可能改变当前推荐;低:未来的研究很可能对目前的评估结果有重要影响,从而很可能改变当前推荐。根据调查问卷的共识度调查结果,将推荐强度等级分为强推荐和弱推荐,强推荐:专家共识度≥95%,且明确显示该干预/管理措施利大于弊或弊大于利;弱推荐:专家共识度<95%,或利弊不确定,亦或无论高或低质量的证据均显示利弊相当。一、定义和术语全自动核酸检测流水线定义:也称全自动核酸检测分析系统,指利用机械臂或轨道等自动化技术,将样本识别和加载、前处理、核酸提取和纯化、反应体系构建、封膜(加盖/密封)、扩增和检测分析等基因扩增检测流程的功能模块进行组合,在计算机系统控制下,将核酸检测过程从手工操作转换成机械操作,实现多样本和/或多项目“样本进结果出”,以下简称“核酸检测流水线”。其主要特点是实现了多样本/多项目同时检测和较大程度的无人值守,和核酸POCT(一般指将“提取扩增检测”整合在一个卡盒内进行核酸检测的系统)有明显区分。目前,各厂家在核酸检测流水线功能实现方面进行了多种模式的尝试和集成化系统开发[1,4,11]。二、环境和人员要求核酸检测流水线的场地不仅需要考虑设备本身的放置要求(如空间大小、电源等)等条件,还应考虑检测项目的生物安全风险(如病原体的传播风险)和污染风险(如样本交叉污染和核酸泄漏或残留污染)。具体而言,场地应具备良好的通风系统,同时合理规划工作流程,并配备必要的生物安全柜等安全设备,以确保检测过程的安全性和结果的准确性。在条件允许的情况下,应设计独立的流水线区,根据风险评估结果选择是否配置缓冲区(图1)。在空间有限的条件下,若只能放置在传统基因扩增实验室时,则建议放置在样本制备区。若在发热门诊或急诊等特殊场景应用时,应根据流水线的设计特点充分评估标本检测时对实验室环境可能产生的污染,以及周边环境如空气流动、其他仪器布局、人员走动等对系统检测可能产生的干扰。实验室应配备另一房间储存相关试剂和耗材。由于流水线设备体积较大,还应充分考虑实验室门、通道和工作区大小能否满足设备搬入、侧排风、检修和操作的空间需求。部分品牌流水线工作时需要大量纯水并产生大量废液,实验室改造时应设计中央纯水和废液管道。此外,应符合生产商使用说明书的其他环境要求,结合实验室其他设备的要求,综合考虑环境温湿度、大气压力、承重、震动或电磁干扰、电源的电压/频率/功率、照明、噪音、工作流程和双向通信系统等,还应使用匹配的不间断电源,保证设备用电的质量和安全。实验室应监测和记录上述环境指标,确保其符合常规检测要求。共识1核酸检测流水线宜放置于具有通风条件的独立区域或基因扩增实验室的标本制备区,并确保空间足够,方便工作。在通过生物安全风险和核酸污染风险评估后也可以放置在其他非独立的场所(证据等级:中,推荐强度:强推荐)。相对于传统核酸检测,全自动流水线实现从样本加载、核酸提取、聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)反应体系构建到结果分析的全流程自动化操作,大大减少了人工干预,但是由于核酸检测环节多,污染风险无处不在,质量控制措施要求高,工作人员必须能够熟练识别和处理检测过程中出现的常见问题,因此,操作人员均应具备临床检验资质,参加临床基因扩增检验实验室技术人员上岗培训,同时需完成仪器培训,掌握流水线操作和维护方法、常见故障处理流程、室内质控、不同类型标本的前理方式、异常结果分析处理、污染的预防和处理措施、生物安全管理和医疗废物处理等,考核合格后的员工方可授予使用权限。共识2核酸检测流水线操作人员需参加临床基因扩增检验实验室技术人员上岗培训,并经过严格的仪器操作培训和考核后方可上岗(证据等级:高,推荐强度:强推荐)。三、仪器设备临床实验室根据项目需求、产品注册情况、样本数量、报告速度和人员能力选择不同特点的流水线品牌、型号和模块组合。实验室依据仪器说明书和相关管理要求制订涵盖流水线不同模块的性能验证、预防性维护和周期性校准的标准操作规程(standardoperatingprocedure,SOP),并建立可追溯的记录单
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12]
。流水线投入使用后,要求每日检查并登记流水线运行状态,包括环境的温湿度、轨道的畅通性、试剂模块温度(需符合试剂说明书中的存储要求)及电力供应稳定性等。建议配置环境监控系统,实时记录关键参数,并在出现异常时自动触发报警。每日/批工作结束后,按说明书推荐的流程进行清洁和清洗,同时检查仪器内部有无液体滴溅。清洁时佩戴适当的防护用品,使用指定的清洁用品(如无尘布、超纯水、70%乙醇、核酸/核酸酶去除剂等)进行单向擦拭。应避免使用含氯消毒剂等具有腐蚀性的消毒用品,禁止喷雾消毒。为防止模块间的交叉污染,应及时清理扩增产物和废弃物,避免重复使用清洁用品,定期更换仪器紫外线灯及高效空气过滤器等。流水线的校准一般由制造商指定有资质的工程师完成,临床实验室检验人员对流水线的校准方法、校准频率、关键参数及其符合的标准全流程进行监督,需建立校准前确认制度,核查工程师资质证书、校准设备计量溯源性文件及校准方案合规性
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12]
。重点关注移液系统(吸液准确度、重复和定位精度)、温控系统(温度准确度和稳定性)、扩增和检测系统(升降温速度和均一性、荧光本底和荧光值精准度)和智能质控系统(如有配备)等
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13-14]
。校准完成后,采用留样再测等方式验证。实验室可根据仪器使用频率、发生异常情况频率等增加全系统或部分模块的校准次数,并做好记录。共识3针对核酸检测流水线不同模块的特征制定维护和校准SOP,使用指定的清洁用品进行擦拭清洁,模块内的清洁应避免交叉污染,流水线系统应定期校准(证据等级:高,推荐强度:强推荐)。流水线一般都具备故障自动诊断功能,但仪器操作人员仍需要掌握仪器设备相关知识,包括工作原理、模块化结构、关键性能参数及常见故障模式等。实验室应建立故障识别和处理SOP,并通过定期培训、案例研讨和模拟故障演练等活动,提高故障预防、识别、诊断与排除的能力。流水线常见的故障主要有条码信息读取异常、加样失败、机械臂运行异常、传感器失灵、扩增检测部件故障、软件操控系统或通信问题以及防污染系统故障等。一旦发现任何可能影响分析性能的仪器故障,应立即停止操作,迅速分析原因并排除故障。维修完成后,需对受影响的关键部位进行性能验证,确保仪器恢复正常运行。在实际工作中,实验室应实施精益化管理,通过优化流水线临床检验流程和调整人员岗位设置,提升临床检验效率。共识4流水线应具备故障自动诊断功能,其操作人员应在此基础上提高对流水线故障的预防、识别与排除能力,并在故障排除后进行必要的验证(证据等级:高,推荐强度:强推荐)。四、样本类型和前处理样本检验前质控及试剂耗材加载是流水线自动化检测的首要环节,包括样本前处理、上机、标签识别、混匀、容器开盖、一次性吸头装载、吸样、转移、加样与脱卸吸头等操作流程。临床实验室应使用流水线推荐的样本容器上机,包括原管上机和转管上机2种方式。原管上机适用于液体样本(如血液、尿液、无菌体液等),在采集样本时即选择适配流水线样本架的容器,并充分考虑容器的形状、尺寸、螺口规格、材质硬度与脆性,以保障样本上机过程中的稳定性和兼容性
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15]
,同时,流水线应该具备主动适配实验室样本采集容器的能力。转管上机则适用于非液体样本(如痰液、脓液、粪便等)及部分液体样本,此类样本需先完成均质化处理,再通过人工或自动方式完成转管操作。实验室应依据样本类型和检测要求,制定详细的样本前处理SOP,处理方法包括但不限于超声波粉碎、机械振荡、孵育、液化、酶解、剪碎、研磨、离心等,确保样本达到上机检测的最佳状态。处理过程中,需通过光学传感器或人工目视检查待测物的流动性和移液操作的顺畅性,及时发现并处理可能影响自动吸样的凝块或者黏稠物。特别需要注意的是,部分液体标本(如全血、腹水、肺泡灌洗液等)可能含有纤维蛋白凝块,淋球菌染者尿液中可存在透明丝状粘稠物,冷藏后的尿液中可能出现沉淀。这些物质不仅会影响移液操作的准确性,还可能干扰某些靶标(如细菌)的检出。因此,建议采取物理破碎、孵育、振荡混匀等方式处理样本
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16]
。此外,实验室也可以考虑配置独立的前处理模块,以实现不同类型样本的开盖、处理、分液和闭盖,提高工作效率并减少人为误差。共识5实验室应选择适配流水线检测的样本采集容器,流水线也应具备主动适配实验室样本采集容器的能力,依据样本类型和状态,指定相应的前处理流程。特别需要注意的是,非液体样本需进行充分的均质化处理,以符合流水线上机检测的要求(证据等级:中,推荐强度:强推荐)。五、性能验证实验室在引入核酸检测流水线时,必须依据设备和试剂说明书制定验证方案,以确保流水线系统能够符合既定的性能要求,满足临床诊断的需求。为了确保性能验证的科学性和标准化,实验室可参考相关行业标准和指南
[16-17]
。验证方案应涵盖实验室所使用的核酸检测系统的各个要素,包括样本容器、前处理方式、试剂、耗材、流水线各模块、分析软件及结果传输等。前处理方式的验证应覆盖说明书指定的样本类型,尽可能选择真实的临床样本。尤其对于非液体样本,除验证其能否被充分液化外,还应验证前处理方式对靶标核酸的影响。若暂无阳性临床样本,可将阳性质控品添加到多个真实临床阴性样本中,进行模拟实验以验证检测效果。实验室应根据具体项目的特点选择不同的验证指标,区分定性项目和定量项目的侧重点。定性项目的验证指标应主要关注符合率、检出限、交叉反应、抗干扰能力等;定量项目的验证指标包括测量正确度、测量精密度、测量不确定度、分析特异性(含抗干扰能力)、分析灵敏度、检出限与定量、线性区间及可报告区间等
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11,18-20]
。特别是对于多靶标核酸检测,实验室必须覆盖所有靶标分析物的验证,确保每一个靶标的检测都达到预期的性能水平。在检出限和精密度的验证过程中,“不同批内20次重复测定”中“不同批”的定义至关重要。在传统手工检测中,通常是分批进行样本测,而流水线系统中,样本检测可以连续上样,因此,实验室需要根据实际工作流程中的“上机批次”来定义“不同批”。每次上机前,实验室需确保上一批验证样本结果已完成,方可进行下一批样本的验证。为了提升验证的可靠性,实验室还应使用多个批号试剂盒检测进行验证。性能验证的判断标准应以试剂说明书声明的性能指标为准。若验证未达标,实验室应采取措施加以调整和改进。除首次装机外,当检测系统发生可能严重影响性能的情况(如设备搬迁、主要部件故障、系统升级等),或现有检测系统的任一要素发生变更时,需重新启用前对受影响的性能进行针对性验证。除了常规性能指标外,实验室还应对流水线系统的一些特色指标进行验证
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11,21]
,包括但不限于检测通量、周转时间、无人值守时长、各种模式的识别度、移液准确性、漏液现象、样本交叉污染及扩增产物污染等。通过综合评估这些验证指标,实验室可撰写更完善的SOP,优化质控措施,也为持续改进提供科学依据
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22]
。六、质量保证临床实验室应建立适合核酸检测流水线检验的质量保证体系,覆盖分析前、分析中和分析后各个环节,在关键点应用恰当的质量控制措施,建立相应的持续改进方案。同时实验室应常态化参加相应项目的室间质量评价。核酸检测流水线的检测过程与传统核酸检测过程相比并无差别,要求也基本一致,具体可参照相关行业标准和指南
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12,16,23]
。同时重点关注设备日常维护和校准、预防污染措施以及质控品的选择与使用管理。实验室根据检测预期用途选择合适的质控品,兼顾其稳定性,基质尽可能接近真实患者样本,定性测定中使用接近检出限的弱阳性水平,定量测定中使用接近报告范围上限和下限的水平。对于多重检测,建议循环使用不同靶标种类或型别的质控品,并在一个周期内覆盖全部靶标
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24]
。操作过程中,阴性和阳性质控品应参与样本的前处理、提取和扩增全过程。质控品的检测频率应结合流水线系统的检测模式、设备稳定性、质控品批间差异、样本量、运行频率和患者风险等情况确定,可按批次、工作日时长或样本数量间隔检测。例如,对于批处理模式的流水线,每批次检测48或96份样本,则要求每批次均进行质控品的同步处理和检测;而对于单管处理模式或者较小批处理模式的流水线(可以连续上样检测),则可以参照即时检测系统的要求
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3,6]
,每日首批样本检测时进行质控品检测。对于已配备智能质控系统的流水线,可将人工质控判断升级为主动识别和自动示警。在条件允许的情况下,实验应进一步挖掘智能质控系统的潜力。例如,设置质控品的自动执行频率,根据样本量或样本中强阳性比例等动态因素,实时调整质控品的数量和执行频率,同时确保质控品循环覆盖所有靶标、所有提取孔位和扩增孔位。此外,建议引入统计学方法实时分析质控数据趋势,构建质控基线。综合分析设备状态、试剂批号、环境参数及样本信号强度等多维数据,结合样本结果智能判断系统是否“在控”。一旦检测到“失控”,系统应能够辅助分析原因,评估对之前样本结果的影响,并自动确定需要重新检测的样本范围。实验室可定期对历史数据进行建模分析,评估开盖后质控品和试剂的稳定性,监测关键性能指标的变化趋势,通过持续的数据积累与模型迭代,逐步提高智能质控系统的自动判断能力。共识6核酸检测流水线需符合临床分子诊断实验室质量控制体系要求,实验室可依据流水线的不同检测模式建立不同的质控规则。流水线宜配备智能质控系统,提高质量保证措施的效率(证据等级:高,推荐强度:强推荐)。七、结果分析和报告临床实验室应依据核酸检测流水线试剂说明书制定结果报告SOP和不确定结果复检SOP,以确保所有结果在发布前均经过授权人员的审核和确认。尽管部分流水线系统具备质控系统和结果自动分析功能,可以直接提供定性、定量或无效结果,但实验室使用该功能时需谨慎,尤其是早期阶段,需要依据仪器运行状态、后台数据(如原始曲线、基线等)和质控结果进行人工判断。若出现质控未通过、结果无效、后台数据与报告结果不相符、报告结果与其他关联结果不符、临床医生认为有必要重新检测等检测结果不确定的情况,实验室应启动复检程序,例如对同一样品采用相同或不同方法进行重复检测和/或重新采样复检。此外,自动化系统与人工判读结果可能存差异,这种差异需要在系统中规范记录,这些数据将作为智能质控系统的修正或升级基础,通过积累这些差异数据,实验室可以不断优化质控规则,提高系统的自动判读准确率。同时,实验室可充分利用智能质控系统,根据预设的通用规则,结合人工干预条件下的结果重分析或重检测的历史据,及时预警异常结果并实施自动重测或者重分析,从而缩短报告时间,保证结果的准确性。流水线检测项目的报告内容与传统手工法检测项目的要求一致,在报告单需要注明“全自动流水线及检测方法”字样,并注明所用的设备和试剂名称。共识7实验室应制定核酸检测流水线结果报告SOP和不确定结果复检SOP,对于系统自动分析的结果应谨慎使用。实验室可充分利用流水线智能化技术优势,通过及时预警异常结果和自动重测等手段缩短报告周转时间(证据等级:中,推荐强度:强推荐)。八、预防污染和生物安全管理核酸检测流水线改变了传统的实验室分区检测布局,独立的自动化系统降低了潜在污染风险(包括核酸污染和病原体污染)
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25-26]
。但是由于检测原理和检测步骤并未发生根本改变,因此预防污染仍然至关重要。临床实验室应根据流水线自身特点制定污染预防、监测和处理SOP并持续改进。流水线设备需要具备预防污染的设计,包括各模块内部气流控制和过滤、规划移液路径、防止滴落装置、耗材丢弃时固液分离和密封、紫外线消毒装置等。实验室应选择说明书指定的带滤芯配套吸头等耗材,并制订关键耗材的性能验证方案。在开展性能验证时,可使用强阳性样本和阴性样本间隔上机检测,验证系统防污染能力,同时通过擦拭试验监测高风险污染部位。在日常检测过程中定期开展擦拭试验。若频繁检出强阳性样本或者检出高致病性病原阳性后,应适当增加对应项目的阴性质控品的数量和检测频率,并增加空白对照、擦拭试验监测点位数量和开展频率。每日及时清理扩增产物和废弃物,在清洁设备时使用一次性清洁用具,各模块间不混用,尤其是高污染风险部位。非一次性用品必须严格限定使用范围,用后依据规范处理并单独存放。此外,对于不具备自动开/闭盖功能的流水线,上机前需要人工开盖,为防止盖子混用,盖子不宜重复使用。共识8预防污染对于核酸检测流水线至关重要,设备内需配备必要的防污染装置,实验室应制定污染预防、监测和处理SOP并进行持续改进(证据等级:高,推荐强度:强推荐)。当前,核酸检测流水线主要用于病原微生物的检测,临床实验室在引进流水线前,应结合病原微生物的危险等级,对场地和工作模式开展生物安全风险评估,重点关注样本前处理和废弃物处理流程。操作人员应参加生物安全培训并取得合格证书。对于经呼吸道传播病原体的样本,由于不同流水线前处理能力在差异,若需要人工开盖、前处理或分装,应在生物安全柜内操作。为提高生物安全性,病原体灭活宜尽早进行,可选择具有灭活功能的采样管,或者在实验室内使用恰当的方法对样本进行灭活处理
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27-28]
。对于经验证充分灭活的样本,非气溶胶传播的病原检测项目样本(一般指血液标本),以及非病原微生物项目样本,经风险评估后,可以参照生化免疫流水线对其进行安全管理。部分流水线模块配备生物安全负压装置和高效空气过滤器,实验室应定期对这些装置进行检定。接触过非灭活原始样本的耗材均应视为具有传染性,应使用专用的医疗垃圾袋密封,移出后按《医疗废物管理条例》相关要求进行处理。流水线废液应根据其成分进行相应处理后再排放至医废管道。
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