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文档简介

DNA的复制和修复1本章内容DNA的复制1DNA的损伤和修复22DNA的生物合成DNA的半保留复制DNA复制的起始点和方向原核细胞DNA的复制真核细胞DNA的复制反转录作用DNA的损伤和修复细菌的限制修饰系统3一、DNA的半保留复制(一)概念

指以亲代DNA分子为模板,按照碱基配对的方式合成出子代DNA分子的过程。每个子代分子的一条链来自亲代DNA分子,另一条链是新合成的,这种复制方式称为~。复制:指以亲代DNA分子为模板合成出子代DNA分子的过程。转录:以DNA分子为模板合成出与其核苷酸顺序相对应的RNA的过程。逆转录:以RNA为模板将遗传信息传给DNA的过程。4(二)半保留复制假说的提出:

1953年,Watson&Crick在DNA双螺旋基础上(碱基配对原则)提出。1.DNA复制的假设:有3种可能:

1)全保留式;

2)半保留式;

3)混合式。52.实验依据

1958年Meselson和Stahl首次用实验证明了DNA的半保留复制。由此证实了DNA复制时,亲代分子分为两条链,分别构成子代分子的一半,且经过多代仍保持完整性。6他们先使大肠杆菌在以N15的NH4Cl为唯一氮源的培养基中生长,使其DNA全部变成N15的DNA。然后将细菌转入含N14的NH4Cl普通培养基,并将各代的细菌DNA抽提出来进行CsCL密度梯度离心。由于N15比N14DNA的密度大,离心时就形成位置不同的区带。他们发现在N15培养基上生长的细菌只形成一条N15的DNA区带,移至N14培养基上经过一代后,所以的DNA的嘧啶在N14和N15之间,说明形成了半N15和一半N14的杂交分子,第三代以后N14DNA成比例的增加。亲代分子分为二个亚单位(两条链),分别构成子代分子的一半,且经过多代仍保持完整性。73.意义:1)半保留复制保证了遗传的稳定性;2)DNA是处于不断变异和发展之中。DNA复制8二、DNA复制的起点和方向1、实验:用3H标记的dT,得到含3H的DNA;放射自显影或者电镜观察。2、推测:若放射性在两端——双向;若在一端——单向。

9DNA的复制开始于染色体上固定的起始点。起始点是含有100-200个碱基对的一段DNA。显示DNA的两条链在起始点形成叉子样的复制叉,随着复制叉的移动完成DNA的复制过程,说明DNA复制可以朝一个方向,也可以朝两个相反的方向进行。103实验证明:细菌染色体DNA复制大多是一个起点,双向复制。11(一)复制起点:原核生物:

1个起点;

真核生物:

多个起点。12大肠杆菌DNA是一个复制子基因组能独立进行复制的单位称~,含起点。13果蝇DNA复制具有多复制起点在真核生物染色体的不同位置上有多个起始点,如果蝇染色体为30000个碱基对,有2000-3000个复制起始位点。复制叉数目很大,复制总速度比原核生物快。果蝇胚胎DNA3min复制一代,而基因组总长只有果蝇1/40的大肠杆菌染色体复制一代却需要40min。14(二)方向:多为双向

15DNA链的合成方向是:5’→3’模板链的解读方向是:3’→5’16(三)复制叉(replicationfork):

DNA复制是边解链边复制,复制中的DNA在复制点呈分叉状,将分叉点称~。17(四)DNA复制的方式1、

直线双向复制单点双向,T7噬菌体多点双向,真核染色体DNA细菌为环状DNA复制起始于单个位点,每个复制泡包括2个复制叉。方向:5’→3’。182、θ型复制环状DNA的复制叉呈θ结构:环状双链DNA,对称复制,单向或双向(E.coli)19203、滚环复制环状单链DNA,Φx174214、D环复制(取代环复制)不对称复制:线粒体、叶绿体DNA。两条链的复制起点不在同一点上,一条链先复制,另一条链保持单链而被取代:当一条链复制到一定程度时才暴露出另一条链的复制起点,另一条链才开始复制。225、多复制叉复制第一轮复制尚未完成,复制起点就开始第二轮的复制。23DNA复制时复制叉前进的速率比较恒定,DNA复制的速率实际上取决于起始频率。E.coli复制叉移动的速率约50Kb/min,复制一代约需40分钟[4.2×106/(50Kb×2)=42]。富营养时,可采取多复制叉复制方式,20min复制一代。真核复制叉前进的速率约1000-3000bp/min,采用多复制子方式,真核染色体复制一代要6-8小时。

24三、原核生物DNA的复制(DNA指导的DNA合成)(一)大肠杆菌的DNA聚合酶(DNApolymerase,DNApol):催化dATP、dGTP、dCTP、dTTP聚合成新的3’,5’磷酸磷酸二酯键;有外切酶活性。25DNA复制过程最基本的酶促反应是四种脱氧核苷酸的聚合反应。1956年Kornberg等首次从大肠杆菌中分离出催化此反应的DNA聚合酶。他们将大肠杆菌提取液与P32标记的dNTP混合物一块温育,发现少量新合成的DNA的磷酸根上有p32标记,催化这个反应的酶是DNA聚合酶I,现已高度纯化。它是相对分子量为109KDa的一条肽链。261、E.COLiDNA聚合酶Ⅰ1)需要原料:4种dNTP作为底物;解开的DNA双链为模板;与模板互补的引物(DNAorRNA,要求有游离的3’-OH);Mg2+;酶活性部位含有紧密结合的Zn2+

;272)DNA聚合酶Ⅰ功能:催化dNTP加到DNA链的3’-OH末端(方向5’→3’)。3’端外切酶活性,可起校对作用;5’端外切酶活性,可切除引物、嘧啶二聚体;28脱氧核苷酸逐个加到引物的3‘端,是按照Waterson和Crick的碱基配对的原则,党模板上出现一个A时,新链就叫上一个脱氧的T。新的研究表明,DNA聚合酶不仅能催化DNA链的延长,还能从DNA的3’或者5‘末端按照3’-5‘或者5’-3‘的方向把DNA链逐步切断。29302、DNA聚合酶Ⅱ:反应需Mg2+

、NH4

+

;以带缺口(gap)的dsDNA为模板,反应同酶Ⅰ;具3’→5’外切酶活性;活力较低。3、DNA聚合酶Ⅲ:活力较强,主要负责DNA链的延伸;具3’→5’外切酶活性;311969年发行一个大肠杆菌的变异株DNA聚合酶I活力很低,但是仍能以正常的速度合成DNA,因此怀疑存在其他的DNA聚合酶,70年代分离出了DNA聚合酶II和III。DNA聚合酶Ⅲ活力是I的15倍,II的300倍。32DNA聚合酶III450KDa,主要成分是分子量为140KDa的a链,b亚基的功能是识别引物并使DNA母链与引物链结合。33450KDa,主要成分是分子量为140KDa的a链,b亚基的功能是识别引物并使DNA母链与引物链结合。一旦全酶结合在正确的起始位置上,DNA聚合酶III辅酶就以游离的形式释放,随后DNA聚合酶III复合物催化子代DNA链的延伸。34354、DNA聚合酶的校对作用:依赖于3个DNA聚合酶的3’末端外切酶活性,进行校对和纠错。多种蛋白质参与,从而保证了复制的准确性。36E.COLi的DNA聚合酶

ⅠⅡⅢ5’→3’聚合作用+++5’→3’外切酶作用+--3’→5’外切酶作用+++聚合核苷酸数/min600309000分子数/细胞40010010主要功能切除引物修复复制修复37下列有关DNA聚合酶Ⅱ的论述,哪一项是错误的?A是复制酶;B有5′—3′聚合活性;C有3′—5′外切酶活性;D有5′—3′外切酶活性。下列有关DNA聚合酶Ⅰ的论述,哪一项是错误的?A是复制酶又是修复酶;B有5′—3′聚合活性;C有3′—5′外切酶活性;D没有5′—3′外切酶活性。大多数染色体DNA的复制是A单向的;B单向的和双向的;C双向的;D单向或双向。38(二)大肠杆菌DNA连接酶(ligase):1、作用:

催化相邻的二个DNA片段间的连接;2、条件:

①两片段相邻;②两片段需与同一互补链结合;③反应耗能。39连接酶作用机理40(三)双链DNA的半不连续复制机制1、冈崎片段和半不连续复制①问题的提出:已知DNA两条链反向且都能作为模板;已知DNApol聚合方向只能是5’→3’;冈崎等提出DNA的不连续复制模型,认为:新合成3’→5’走向的DNA是由许多5’→3’方向合成的DNA片段连接而成的。41②实验:放射自显影;电子显微镜观察。冈崎片段:以

5’→3’走向DNA为模板合成小的DNA片段,约1000-2000核苷酸。1968年冈崎等用H3标记的dTTP掺入噬菌体去感染大肠杆菌,发现段时间内首先合成较短的DNA片段,接着出现较大的分子。42③结论:DNA是半不连续合成的。前导链(leadingstrand):

以3’→5’链为模板,新生链以5’→3’方向连续合成;后随链(laggingstrand):

以5’→3’链为模板,新生链以5’→3’方向合成若干短片段(冈崎片段),再通过连接酶连接成DNA链,为后随链。4344下列有关DNA复制的论述,哪一项是正确的?ADNA复制是全保留复制;B新链合成的方向与复制叉前进方向相反者,称前导链C新链合成的方向与复制叉前进方向相同者,称前导链;D前导链是不连续合成;E滞后链是连续合成。452、RNA引物①问题提出:已知DNApol只能在3’-OH上延伸,由谁提供了3’-OH?②实验证明:新合成的DNA链中有RNA,证明DNA聚合酶合成新DNA时需要引物(一小段RNA)。在多瘤病毒体外系统中合成冈崎片段5‘端是一个约10个核苷酸长的RNA。46③RNA引物酶(RNAprimase):引物酶与多种起始蛋白结合形成引物体;功能:催化引物合成:

在DNA一定部位合成,并与其互补,合成方向5’→3’;参与解链。引物RNA3’-OH末端作为DNA合成的起始点。RNA引物合成的过程称作引发。实验证据证明DNA复制的引发需要一种称作引物体的RNA合成系统。47④RNA引物(RNAprimer)引物酶合成的引物为十几个核苷酸的RNA。冈崎片段引物的合成不需要特异的起始部位。33引物酶沿模板链向分叉的方向前进,并断断续续的催化合成后随链的引物RNA短链。48⑤后随链合成过程:引物酶以DNA为模板,合成后随链引物。DNApolⅢ在引物上延伸(前导链和后随链)。完成DNA合成后,DNApolⅠ用其5’→3’外切酶活性除去引物。DNA连接酶将两个冈崎片段连接起来。493、滞后链生成包括:起始:RNA引物的合成;延长:从引物3’端添加dNTP,合成DNA;终止:切除RNA引物,连接各片段。504、与母本DNA双链分离相关的酶:1)DNA解链酶(DNAhelicase):

使复制叉前方DNA双链解开,每解1个bp需耗2个ATP。2)单链结合蛋白

(SingleStrandBindingprotein,SSB):几分子的SSB与已分开的DNA链紧密结合,以防两链重新结合。

此时,复制酶系统结合在模板链上,进行半不连续复制。513)DNA旋转酶

(拓扑异构酶Ⅱ,topoisomerase):复制前:松弛DNA超螺旋,解除拓扑张力复制后:重新引入超螺旋(需ATP供能)

52(四)总结——原核细胞DNA的复制过程:1、合成所需材料:①模板DNA②原料:合成引物所需的NTP,合成DNA所需的dNTP;③酶和pr。2、合成方向:5’→3’;模板链解读方向:3’→5’533、合成步骤:识别起点:由DNA指导的引物酶等多种pr完成;解旋:由拓扑异构酶Ⅱ解除超螺旋;解链:由DNA解链酶催化解开一短链,SSB与单链DNA结合,防止双链间氢键再形成;RNA引物合成:以DNA为模板,在引物酶催化下由DNA转录生成5-10个核苷酸链;54DNA链延长:在引物3’-OH基上,按碱基互补原则经DNA聚合酶(主要是酶Ⅲ)催化DNA链从5’→3’延伸。

前导链为连续的;后滞链为不连续的冈崎片段。

切除引物,补齐缺口:由DNA聚合酶Ⅰ催化,切去RNA引物;按碱基互补原则,沿5’→3’方向,补齐缺口。55连接切口(nick):由DNA连接酶催化,将补齐缺口的3’-OH基与下一个冈崎片段的5’-P以磷酸二酯键连接起来(消耗NAD+),最终形成完整的、与模板互补的DNA新链。校正并修复DNA:由DNA聚合酶校正并切除错配,再按5’→3’方向加上正确核苷酸。终止:相当于两个复制叉的中点处。至此,原核细胞DNA合成完毕。56模板DNA前导链模板解旋酶引物后滞链模板DNpolymerase连接酶冈崎片段已连接的冈崎片段单链结合蛋白新合成的前导链DNA聚合酶57原核生物复制时,主要起聚合作用的酶是A、DNA聚合酶ⅠB、DNA聚合酶аC、DNA聚合酶ⅡD、DNA聚合酶ⅢDNA连接酶的作用是A、合成RNA引物B、将双螺旋解链C、去除引物,天补空隙D、使双连DNA缺口的两个末端连接起来58DNA拓扑异构酶的作用是A、辨认复制的起始点B、稳定复制叉

C、解开DNA双连作模板D、断开DNA,使复制旋转时不致缠绕打结。关于引物酶的描述,下列正确的是A、不需要DNA为模板B、以dNTP为底物C、合成方向是3′-5′D、其产物是带-OH的RNA片段复制中的RNA引物A、解开DNA双连B、使DNA聚合酶Ⅲ活化C、提供5′-P合成DNA链D、提供3′-OH合成DNA链59DNA复制时需要①DNA聚合酶Ⅲ,②解链酶,③DNA聚合酶Ⅰ,④引物酶,⑤连接酶,其作用顺序是

A、④③①②⑤B、②③④①⑤C、②④①③⑤D、①②③④⑤60三、真核细胞DNA的复制真核生物与原核类似,但更复杂,不同之处:(一)DNA模板上有多个起点,即真核细胞DNA复制由多个复制子共同完成的。61(二)有5种DNA聚合酶,各具功能;引物合成、核苷酸链聚合:α;核DNA的复制、校正:δ;线粒体DNA的复制:

γ修复DNA:

β、ε;真核生物中至少有5种DNA聚合酶,分别命名为α、β、γ、δ和ε。δ具有3‘-5’核酸外切酶的活性。62(三)端粒(telomere)的复制:1、端粒:真核生物线形染色体末端具有的特殊结构,由成串的重复序列组成,富含G的核苷酸序列。

端粒的功能:稳定染色体末端结构;防止染色体间末端连接;补偿5’末端切除引物形成的空缺。632、端粒酶(telomerase):一种含RNA链的逆转录酶,以所含RNA链(约150b)为模板来合成DNA端粒。功能:1)起模板作用(与端粒互补);

2)有逆转录酶的作用。端粒酶是一种核糖核蛋白,它是由RNA和蛋白质两种成分组成。643、端粒复制模型:1)借RNA与3’末端ssDNA互补;2)以酶上RNA为模板,使DNA链延伸,合成多个重复单位;3)端粒酶RNA反折作为引物,由DNA聚合酶α合成互补链。由此染色体保持大致相同的长度。654、端粒、端粒酶意义与细胞衰老、凋亡有关;

正常:生殖细胞由于有端粒酶而保持端粒的一定长度;

体细胞端粒酶活性丧失,端粒短到一定程度引起细胞凋亡。

异常:肿瘤细胞端粒酶活性恢复,端粒复制,细胞恶性增殖。意义:抑制端粒酶活性可防治肿瘤。66四、反转录作用:RNA指导的DNA合成1、反转录(逆转录reverstranscription):

以RNA为模板,4种dNTP为底物,合成与模板互补的DNA的过程。这与通常转录过程中遗传信息从DNA到RNA的方向相反,故称~。发生部位:宿主细胞质672、反转录酶:RNA指导的DNA聚合酶,催化逆转录反应的酶。功能:1)以RNA为模板合成DNA;2)RNase活性,水解杂合链中的RNA;3)以DNA为模板合成DNA。病毒反转录酶作用时需要引物,生成的DNA链的方向是5’-3‘,含Zn2+。68HIV的复制693、反转录作用的生物学意义:1)发展了中心法则;702)有助于对RNA病毒致癌机理的了解;3)有助于研究疾病的起因、寻找防治途径;4)反转录病毒可改建成理想的信息载体,用于肿瘤和遗传病的基因治疗;5)用于分子生物学的研究:合成基因、测序。71五、DNA的损伤与修复一、DNA的损伤:

一些生物因素、理化因素:UV(紫外线)、电离辐射和化学诱变剂可使细胞DNA受到损伤而引起生物突变或致死。一定条件下,生物机体能使这种损伤得到修复。UV造成的基因改变嘧啶二聚体的形成72

引起DNA损伤的化学及物理因素5573化学诱变因素:烷化剂:是亲电试剂,能与亲核中心反应,特别是与鸟嘌呤N7原子作用。烷化剂有二甲基硫酸,甲基甲烷磺酸,N-甲基-N’-硝基-N-亚硝基胍等。亚硝酸:腺嘌呤、胞嘧啶经亚硝酸氧化脱氨形成次黄嘌呤和尿嘧啶(这些碱基也能自发脱氨)。嵌入剂:吖啶类染料,如原黄素、溴乙锭。它们是一类平面分子,能插DNA双螺旋堆积的碱基之间。物理诱变因素:电离辐射(x射线、αβ

射线):打断嘌呤咪唑环产生甲酰胺基咪唑环;造成碱基缺失或修饰。UV辐射:DNA经紫外照射,同一条链上相邻两个嘧啶碱基之间交联形成嘧啶二聚体。诱变剂和致癌剂的检测:BruceAmes设计了简易检测方法——Amestest。采用鼠伤寒沙门氏杆菌的His营养缺陷型,菌与待测物置于不含His的培养基中培养。若待测物具有诱变作用,可使缺陷型发生突变恢复His合成能力而产生菌落。74二、

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