儿童肠菌移植临床应用管理专家共识重点2026

儿童肠菌移植临床应用管理专家共识重点2026肠道菌群在维持人体健康方面发挥重要作用，对重建肠道稳态和治疗相关疾病具有显著成效。鉴于儿童群体独特的生理与病理特点，肠菌移植在儿科临床应用中存在特殊性与挑战。为进一步规范和加强肠菌移植在儿童疾病中的应用，由中华医学会儿科学分会感染学组、中华医学会肠外肠内营养学分会肠道微生态协作组、中国妇幼保健协会精准医学专委会儿童肠道微生态和肠菌移植协作组共同组织相关专家，制订“儿童肠菌移植临床应用管理专家共识（2026）”，围绕适应证选择、供体筛选与管理、围移植期管理以及伦理规范4个关键方面，共形成22条推荐意见。1.适用人群：本共识适用于开展儿童肠菌移植的医疗机构，主要面向儿科医护人员及相关临床研究人员。2.共识制订工作组：2025年4月邀请儿童感染、儿童消化等专业领域的30位专家组建共识专家组。3.临床问题遴选、证据检索：基于临床研究设计时使用的研究对象、干预、比较、结局指标原则进行遴选，并通过系统检索国内外肠菌移植相关指南、共识与系统综述，结合专家访谈、会议讨论及我国儿科临床实际，最终确定了22条关键问题。证据检索采用中、英文关键词，覆盖中国知网、万方、中华医学期刊全文数据库、PubMed、Embase、CochraneLibrary等中、英文数据库，文献截止日期为2025年6月30日。4.文献筛选、质量评价与证据提取：采用证据推荐分级的评估、制订与评价方法对临床问题的证据质量和推荐强度进行分级（

表1

）。分级具体描述证据质量高（A）非常有把握观察值接近真实值中（B）对观察值有中等把握：观察值有可能接近真实值，但也有可能差别很大低（C）对观察值的把握有限：观察值可能与真实值有很大差别极低（D）对观察值几乎没有把握：观察值与真实值可能有极大差别推荐强度强（1）明确显示干预措施利大于弊或弊大于利弱（2）利弊不确定或无论质量高低的证据均显示利弊相当良好实践声明基于非直接证据或专家意见和（或）经验形成的推荐表1证据质量和推荐强度分级5.共识的传播、实施与更新：通过学术期刊、会议、新媒体等多种渠道进行传播与解读，以推动临床应用。未来将根据最新研究证据与临床需求每3年进行更新。推荐意见1：肠道菌群在儿童期呈动态变化，对儿童生长发育及儿科疾病的发生发展具有重要影响（B1）。肠道微生物群主要由细菌组成，也包含真菌、病毒和古菌等［1］。肠道菌群自出生起开始定植，其结构与多样性在儿童期持续演替，通常于5岁后接近成人水平，6~10岁功能丰度逐渐增强，11~14岁后趋于稳定［2,3］。该过程与儿童生理发育、免疫成熟及营养环境密切相关，受出生方式、喂养方式及饮食多样性等因素影响［4,5］。肠道菌群紊乱不仅增加儿童期罹患IBD与过敏性疾病的风险，也与成年后肥胖、糖尿病等长期健康结局相关［6］。以益生菌、益生元和肠菌移植为代表的菌群干预手段，为防治菌群紊乱相关疾病提供了新策略，对生命早期菌群建立及远期健康具有重要意义。（一）肠菌移植的适应证与禁忌证推荐意见2：复发性CDI或难治性CDI儿童推荐肠菌移植治疗（B1）。CDI是指急性新发腹泻（≥1项标准）：（1）粪便艰难梭菌毒素检测阳性；（2）粪便检出产毒艰难梭菌；（3）结肠镜或病理提示伪膜性结肠炎。复发性CDI指规范抗艰难梭菌治疗后8周内再次出现腹泻且实验室检测阳性。难治性CDI指规范治疗5d后临床无改善［7,8］。肠菌移植已被多个指南纳入复发性CDI的标准治疗方案［7,8,9］。我国2016年“关于儿童粪菌移植技术规范的共识”建议2次标准治疗未愈的复发性CDI患儿应用肠菌移植［10］。2019年欧洲儿科胃肠病学、肝病学和营养协会指南建议轻度CDI复发≥3次且药物治疗无效、重度CDI复发≥2次，重度或暴发性CDI经48h药物治疗无效的患儿进行肠菌移植［11］。2025年澳大利亚指南亦推荐肠菌移植用于儿童复发性、难治性及重度CDI［8］。研究表明，肠菌移植治疗儿童CDI的有效率为70%~90%［12,13,14,15］；治疗复发性CDI的有效率达96%~100%且多次移植效果更优［12，14］。肠菌移植在初发CDI中的应用仍限于研究探索。一项纳入467例成人CDI患者（含187例初发CDI）的队列研究显示肠菌移植对初发CDI具有显著疗效［16］。另一项研究发现肠菌移植与万古霉素治疗初发CDI的疗效相当［17］。这些研究为探索肠菌移植在初发CDI患儿中的应用提供了新视角。对于多次复发的CDI或复发性CDI高风险患儿（既往存在重度、暴发性或特别难治性CDI、有基础疾病），可考虑采用肠菌移植预防。推荐意见3：对于传统药物、免疫抑制剂、生物制剂治疗应答不佳或继发失应答的IBD患儿，可考虑肠菌移植辅助治疗改善应答（B2）。儿童IBD常用药物治疗存在约30%无应答或应答不佳的情况，导致高复发率与高医疗负担［18,19］。2023年共识指出肠菌移植可诱导缓解轻中度成人溃疡性结肠炎（ulcerativecolitis，UC），但不推荐作为常规疗法［20］。肠菌移植在儿童IBD治疗中的作用处于临床探索阶段。一项研究显示对常规治疗无效的轻中度IBD患儿，肠菌移植后1个月和6个月临床应答率分别为57%和28%［21］。另一项针对UC患儿的灌肠治疗报告1周内78%产生应答，1个月时67%保持应答［22］。系统综述汇总分析32例UC患儿肠菌移植治疗效果，总临床缓解率为28%，肠菌移植疗效与疾病严重程度有关［23］。Suskind等［24］对9例轻中度克罗恩病儿童行单次肠菌移植，2周后7例达临床缓解，12周后5例维持缓解。一项系统评价显示，16例患儿总体临床缓解率为56.3%，其中2例缓解达6个月［23］。成人研究中，对英夫利昔单抗治疗失败的克罗恩病患者行肠菌移植，1、3、6个月后临床缓解率分别为59.4%、62.5%和62.5%［25］。建议将肠菌移植作为儿童IBD的辅助治疗手段，其具体方案与疗效仍需大样本研究进一步验证。推荐意见4：常规治疗无效，以腹胀、腹泻、腹痛或便秘为主要表现的功能性胃肠病患儿，推荐肠菌移植治疗（B1）。功能性胃肠病（functionalgastrointestinaldisorder，FGID）又称肠-脑互动障碍，与胃肠动力紊乱、内脏高敏感性、肠道菌群及免疫功能变化等多种因素相关［26,27］。研究表明，FGID患儿与健康儿童的肠道菌群存在差异，且不同亚型具有不同菌群特征［28,29,30］。肠菌移植作为一种潜在疗法正被探索用于改善FGID症状及重塑肠道稳态。Wang等［31,32］研究发现肠菌移植有效缓解FGID患儿腹胀、腹痛及腹泻症状，并使其肠道菌群和肠道代谢组趋向健康儿童状态。一项荟萃分析纳入9项肠菌移植治疗成人IBS成人患者随机对照研究，发现单次肠菌移植显著降低治疗后1、3、6、24个月IBS症状严重程度评分（irritablebowelsyndromesymptomseverityscore，IBS-SSS），改善生活质量［33］。2021年一项研究分析了经内镜肠道置管术（colonictransendoscopicenteraltubing，TET）对45例功能性便秘（functionalconstipation，FC）儿童行肠菌移植的治疗效果，结果显示便秘明显改善［34］。另一项随机双盲对照研究也证实，结肠灌肠联合肠菌移植在12周内有效增加FC患儿自发性排便次数［35］。推荐意见5：多重耐药菌感染或定植，经筛查已排除肠源性感染风险的儿童，推荐肠菌移植帮助清除多重耐药菌（C1）。抗菌药物耐药已成为全球公共卫生重大威胁，多重耐药感染导致治疗失败风险增加、住院时间延长及临床结局恶化［36,37］。对于抗菌药物治疗效果欠佳的多重耐药菌感染儿童，可考虑采用肠菌移植辅助清除耐药菌。一篇纳入21项研究共涉及192例成人患者的系统综述发现肠菌移植对多重耐药菌的清除率达37.5%~87.5%；在感染治疗与定植清除中的疗效相当［38］。肠菌移植可成功清除产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌、产碳青霉烯酶肠杆菌、耐万古霉素肠球菌及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的肠道定植［39］。儿童治疗有2例病例报道，1例14岁噬血细胞性淋巴组织细胞增生症患儿经鼻十二指肠肠菌移植成功清除产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌定植，8个月微生物学随访阴性，肠菌移植后1.5年无再次感染［40］；1例16岁急性髓系白血病移植后患儿在造血干细胞移植术后98d接受2次肠菌移植，实现VRE清除，但产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌定植持续［41］。推荐意见6：对于激素难治性或激素依赖的肠道移植物抗宿主病（graftversushostdisease，GVHD）患儿，建议二、三线药物治疗的同时行肠菌移植治疗（C1）。GVHD是儿童造血干细胞移植后非复发死亡的首要原因，传统激素治疗对难治性或依赖性患儿效果有限［42,43］，1年生存率不足30%。肠菌移植通过重建肠道菌群稳态、调节免疫平衡及修复肠道屏障，为这类患儿提供了新的治疗方向。2016年，日本团队首次将肠菌移植应用于肠道急性GVHD的治疗，研究纳入4例患者（3例激素抵抗、1例激素依赖），结果显示接受肠菌移植后，3例达到完全缓解，1例达到部分缓解［44］。2021年苏州大学附属第一医院的I期和Ⅱ期研究显示，肠菌移植组21d临床缓解率高于非肠菌移植组，总体病死率下降，未增加不良反应［45］。同年另一项前瞻性研究报道，肠菌移植对急性GVHD的总应答率为57%（完全应答42%），可改善慢性GVHD的器官受累［46］。其他研究也报道了7例患有肠道GVHD和抗生素耐药性结肠炎的儿童接受肠菌移植治疗，缓解率达86%，同时也显示肠菌移植在儿童GVHD中具有较高的安全性和有效性［47］。基于现有证据，本共识推荐对于激素难治性肠道急性GVHD患儿，建议在二、三线药物治疗的同时，尽早开始肠菌移植治疗；对于肠道慢性GVHD患儿，肠菌移植亦可作为辅助治疗手段。未来需通过多中心随机对照研究进一步优化方案，推动肠菌移植在儿童GVHD中的规范化应用。推荐意见7：常规治疗无效的儿童难治性过敏性疾病（特应性皮炎、多重食物过敏合并生长发育迟缓等）可考虑肠菌移植治疗（C2）。肠道菌群失调在儿童过敏性疾病的发生发展中起关键作用。过敏患儿与健康儿童肠道菌群组成存在显著差异，这种紊乱可通过免疫调节、破坏肠屏障及影响营养吸收加重病情。肠菌移植通过重塑健康微生态，有望恢复免疫平衡、改善屏障功能并促进营养吸收［48,49］。特应性皮炎（atopicdermatitis，AD）是一种反复发作的慢性湿疹性瘙痒病，肠道菌群可能通过免疫系统调节影响AD［50］。一项多中心随机对照研究评估了肠菌移植在中重度AD患者中的安全性、疗效及免疫学影响，结果显示接受肠菌移植治疗的患者在湿疹面积和严重程度指数（eczemaareaandseverityindex，EASI）评分上的改善程度，达到EASI评分50（EASI评分降低50%）的比例均高于安慰剂组的患者［51］。Mashiah等［52］报道9例AD患者接受肠菌移植治疗，4~12周AD评分指数显著下降。在过敏性肠炎患儿中，经肠菌移植治疗后89.5%的患儿症状在2d内缓解，多数肠道菌群多样性显著提升［53］。肠菌移植也被视为干预食物过敏的潜在策略。个案报道显示，常规治疗无效的严重食物过敏患儿经肠菌移植后症状减轻［54］。肠菌移植在嗜酸粒细胞性胃肠疾病的应用尚处于初步探索阶段［55］。总体而言，肠菌移植有望成为难治性过敏性疾病的治疗选择，但其确切疗效与长期安全性尚需更大规模临床研究证实。推荐意见8：对于原发或获得性免疫缺陷病、肠梗阻、消化道穿孔、活动性消化道出血、中毒性巨结肠的儿童不推荐肠菌移植治疗（GPS）。免疫缺陷儿童，包括原发性免疫缺陷病、接受实体瘤和血液系统恶性肿瘤积极细胞毒性治疗、接受过嵌合抗原受体T细胞治疗或造血干细胞移植［中度及以上中性粒细胞减少时（中性粒细胞1000/mm3）］、中性粒细胞缺乏、患有晚期或未治疗的人类免疫缺陷病毒感染（CD4计数200/mm³）的患儿。严重免疫缺陷状态下，患儿免疫系统无法有效遏制移植微生物的定植与侵袭，肠菌移植可能增加肠源性血流感染的风险。肠梗阻、消化道穿孔等疾病时常伴发严重肠道屏障破坏，肠道黏膜出现广泛糜烂、溃疡，细菌可直接进入门静脉系统和体循环，增加了细菌和其代谢产物易位的风险。（二）供体筛选与管理推荐意见9：儿童肠菌移植治疗的供体，优先选择18~35岁健康成人；若需选用儿童供体，建议以亲属间捐赠为主（GPS）。儿童肠菌移植供体年龄尚无统一定论，优先选择18~35岁的健康成人供体。该年龄段供体肠道菌群结构稳定、多样性高、代谢功能活跃，慢性病风险低，临床应用中已显示出良好的疗效与可控的安全性［56,57］。但成人供体应用于儿童时，需关注其对受体神经、免疫和胃肠道发育的潜在影响，可能存在促使发育异常的风险［58］。临床应用过程中如出现相关异常，应及时停用并追溯原因。与成人相比，年龄匹配的儿童供体在肠道菌群发育阶段与受体更具同步性，理论上更符合患儿的生理需求［58,59］，但儿童供体较稀缺，难以建立稳定供者库；其肠道菌群仍处于发育阶段，稳定性和多样性可能不足，质控难度大；涉及未成年捐赠，伦理审查严苛，遗传性疾病筛查复杂，从而增加筛选难度。亲属供体（如父母或兄弟姐妹）因遗传背景、饮食习惯和生活环境高度相似，其肠道菌群组成与患儿更具亲和性，可增加菌群定植率，并可能降低过敏原暴露风险［60］。若选用儿童作为供体，需法定监护人和（或）儿童本人同意，避免可能引发的家庭压力或利益冲突等伦理顾虑。推荐意见10：合格供体筛选需包括个人信息，内外科体格检查，血液学检查，粪便常规及病原学检查，尿常规，心理评估，饮食及生活习惯评估等（GPS）。合格供体筛选项目需包括个人基本信息、自身疾病史、用药史、疫苗接种史、流行病学史、高危行为史、家族疾病史、心理评估正常、合理的膳食营养与良好生活习惯、内外科体格检查、血液学检查、尿液检查、粪便常规及病原学检查正常，具体条目可参考供体筛查标准化表格（附件1，请扫描文章首页二维码查看）［61］。推荐意见11：建议通过粪便16S核糖体RNA测序或宏基因组分析，评估供体的肠道菌群（GPS）。供体“健康菌群”尚无统一的量化标准，理想的供体菌群应具有高多样性、关键功能菌丰度高、组成稳定及代谢活跃的特点。筛选时需结合疾病特异性考量。例如，UC治疗成功与供体中毛螺菌科、瘤胃球菌属等丰度较高相关［62,63］。而IBS的“超级供体”则表现出多雷菌属、乳杆菌属和瘤胃球菌科的高丰度［64］。建议通过16S核糖体RNA或宏基因组测序主估菌群结构、功能与耐药基因，可选结合代谢组学检测短链脂肪酸、胆汁酸等代谢物水平，以综合验证菌群的代谢活性与适应性［61，65］。肠道菌群作为“第二基因组”主要通过表观遗传和代谢途径影响宿主，因此在筛选中可借助多组学技术，确保菌群功能与宿主背景的适配性。推荐意见12：过敏性疾病需进行肠菌移植治疗的儿童，建议供体进行回避过敏原饮食至少1周（GPS）。既往明确食物过敏史的受者儿童，供体需要在捐赠前至少1周（即洗脱期）严格限制此类过敏食物摄入。其他过敏性疾病需行肠菌移植者，相应供体也应严格限制常见过敏食物（如牛奶、鸡蛋、坚果、麸质等）的摄入，以确保捐赠粪便中不含过敏食物成分。如供体无法遵守饮食限制，则不适合作为此次移植捐赠者［49］。推荐意见13：持续肠菌移植捐赠供体需进行跟踪评估。推荐持续捐赠的成人供体每2个月进行1次全面评估；儿童供体每半年进行1次全面评估，每2个月进行1次粪便检查（包括16S核糖体RNA或宏基因组、粪便常规及病原学检测）（GPS）。供体应依据筛选条目定期复查，确保各项检查正常［66］。若出现异常，需立即停止捐赠，1周后复查相关指标，恢复正常后方可重新启用。每次菌液制备前应留取粪便样本备查。对于儿童供体，考虑到其生活环境与饮食习惯相对稳定、病原暴露风险较低，建议全面评估每半年进行1次，粪便检查每2个月进行1次。（三）围移植期管理推荐意见14：肠菌移植治疗前应对受体进行全面评估，包括其营养状况、饮食情况、免疫功能，以及基础疾病控制情况（GPS）。需行肠菌移植的患儿如合并肠功能障碍，术前应进行营养风险筛查（采用儿科营养不良评估筛查工具或营养状态和生长发育风险筛查工具），必要时营养干预［67］。患儿术后饮食一般无特殊限制，鼓励摄入富含膳食纤维的食物或制剂，以促进菌群定植［68］；针对特定疾病，可采用相应饮食提升疗效，如克罗恩病患儿给予克罗恩病剔除饮食［69］，IBS患儿推荐低发酵性寡糖、二糖、单糖及多元醇饮食或地中海饮食［70］，FC患儿宜增加膳食纤维及水分摄入、避免辛辣刺激食物，食物过敏患儿需进行饮食回避或替代［71］。此外，可通过体液免疫、细胞免疫及细胞因子检测评估免疫功能，该指标联合基础疾病状况可作为疗效评价与随访的依据。推荐意见15：肠菌移植前3d受体根据疾病类型酌情采用抗生素预处理；推荐肠菌移植前24h采用灌肠或复方聚乙二醇3350电解质散进行肠道清洁（B2）。受体原有肠道菌群是影响供体菌群定植与肠菌移植疗效的关键因素。适当的抗生素预处理可清除致病菌、释放定植生态位，提升供体菌群植入率与临床有效率［72］。对于复发性CDI患者，抗生素预处理已被临床指南推荐［61］。多项荟萃分析也显示，在复发性CDI、IBD及多重耐药菌感染等疾病中，肠菌移植前使用抗生素与更高的供体菌株定植水平和临床有效率相关［73,74］。具体抗生素选择需基于疾病类型个体化决定，如IBS可考虑利福昔明，真菌感染用抗真菌药，复杂肠道感染则依据粪培养结果选用敏感抗生素［75］。肠道清洁能净化结肠内容物、减少艰难梭菌毒素与孢子，并为供体菌群创造更有利的定植环境，有助于提高移植菌群的存活与定植效率［76,77］。推荐在肠菌移植前24h通过灌肠或口服复方聚乙二醇3350电解质散进行肠道清洁。推荐意见16：儿童肠菌移植治疗途径包括上中消化道（鼻-空肠管、胃镜）、下消化道（结肠镜、TET置管、保留灌肠）及口服肠菌胶囊（B1）。肠菌移植途径的选择需综合考虑患儿年龄、疾病类型、住院需求、感染风险、抗生素预处理与肠道清洁需求、重复给药可行性、治疗依从性、舒适度及家庭经济状况等因素。对于存在口服摄入不足、胃排空延迟、营养不良或高营养风险的患儿，推荐采用鼻-空肠管途径，可在移植同时实现肠内营养支持。若病变累及结肠且需结肠镜评估，推荐结肠镜途径；病变局限于直肠和乙状结肠，则推荐保留灌肠途径。如鼻-空肠管置管困难或不耐受口服胶囊，可考虑鼻-胃管途径，但多数肠道菌群易被胃酸、胆汁破坏，实际到达肠道的活菌数量和多样性可能显著降低，影响疗效。口服肠菌胶囊便捷安全，能降低侵入性操作风险，适合不耐受置管、依从性较差或需长期维持治疗的儿童。3~6岁儿童建议先进行空胶囊训练以减少误吸风险。一项成人研究显示，口服肠菌胶囊与结肠镜下肠菌移植治疗复发性CDI的治愈率差异无统计学意义［78］。2025年Xiao等［79］研究发现口服肠菌胶囊后的不良事件发生率仅为其他移植途径的1/10。一篇对24项肠菌移植研究的肠道菌群宏基因组荟萃分析，联合途径实施肠菌移植后肠道菌群定植更高［73］。肠菌移植最优移植途径尚无统一共识，联合途径在未来可能成为更优选择。推荐意见17：儿童单次肠菌移植推荐用量为每公斤体重1~2g粪便制备成的菌液或胶囊。3岁患儿应酌情减量或分次进行；体重≥40kg儿童按成人剂量，一般不超过50g粪便制备的菌液或胶囊（GPS）。移植菌群的剂量影响肠菌移植临床疗效。成人研究多采用50g粪便/次制备成菌液或胶囊［80］。一项系统综述与荟萃分析发现，单次移植量≤50g与临床低应答相关［81］。另一项随机对照研究显示，将单次剂量从30g提高至60g可使IBS患者的临床应答率从76.9%提升至89.1%［64］。儿童单次肠菌移植推荐按体重计算，用量为1~2g粪便/kg体重。3岁患儿应酌情减量或分次进行；体重≥40kg的儿童可按成人剂量，一般不超过50g粪便/次。菌液制备建议按1ml含0.5g粪便的比例，即菌液剂量为2ml/kg。推荐意见18：多次肠菌移植治疗临床获益优于单次肠菌移植（GPS）。肠菌移植多次治疗可通过增加受体微生物多样性与定植提高临床应答。干预宿主-微生物组相互作用复杂的疾病时，通常需长时间、多次治疗［82］。一篇系统综述与荟萃分析显示，较单次肠菌移植，多次肠菌移植将复发性CDI临床治愈率由76%提升至93%［81］。对复发性CDI或难治性CDI患者，若首次肠菌移植后48h内临床应答不佳，可考虑多次治疗或更换供体后再次治疗。对于多因素疾病且初次肠菌移植已获得良好临床获益的患儿，可考虑以4~8周为间隔实施多次治疗，具体方案需基于个体化疗效评估制订。推荐意见19：采取下消化道途径治疗者，需抬高臀部，保持头低脚高侧卧位至少2h（GPS）。采取下消化道途径行肠菌移植时，尽可能延长菌液在肠道的保留时间，增加定植。术前指导患儿进行收缩肛门锻炼；术后采用头低脚高位，并抬高臀部，分散患儿注意力，必要时患儿家属捏住患儿臀部约5min，防止过早排出菌液；术后至少2h内保持不排便为宜。推荐意见20：肠菌移植治疗后的疗效评估应根据疾病种类进行，包括临床评估和微生态评估，必要时进行内镜评估（GPS）。儿童肠菌移植疗效评价标准尚未统一，可参考“肠道菌群移植临床应用管理中国专家共识（2022版）”［68］。复发性CDI以治疗后8周症状持续缓解、粪便毒素转阴及菌群多样性恢复至供体50%以上为准［83］；克罗恩病与UC均以治疗后12周临床症状缓解、菌群多样性恢复至70%以上，并分别依据儿童克罗恩病活动指数/克罗恩病内镜下严重程度指数及儿童溃疡性结肠炎活动指数梅奥评分评估缓解与有效［20，