感染性疾病多重病原体检测共识2026

感染性疾病多重病原体检测共识01CONTENTS020304呼吸系统感染中枢神经系统感染消化系统感染血流及其他感染呼吸系统感染根据感染部位与病情严重程度，从低靶标（2~6）逐步升级至高靶标（10~20）乃至tNGS/mNGS，避免盲目使用广谱技术，实现资源合理分配。分层检测策略检测选择需结合患者年龄、免疫状态、流行病学史及治疗反应，如婴幼儿、免疫抑制宿主、重症患者优先启动更高阶多重核酸检测，缩短诊断时间。临床指征导向无明确临床指征时，不推荐常规进行广谱病原体筛查，防止过度诊断与资源浪费，仅对经验性治疗无效或病情快速进展者升级为tNGS/mNGS。避免无指征广谱检测阶梯化个体化原则上呼吸道快速分流临床特征与流行病学史指导的分流原则特定病原体流行期的快速检测策略婴幼儿及老年人群体的检测方案优化根据患者症状、体征及流行病学史快速判断感染风险，避免无指征广谱检测，实现精准分流，提高检测效率，减少医疗资源浪费。在流感、新冠等特定病原体流行期或聚集性发病时，首选快速抗原或2~6靶标多重核酸检测，以快速明确病原体，指导早期隔离与治疗。对于婴幼儿或老年人，以及经验性治疗无效的患者，建议采用2~10靶标多重核酸检测，覆盖更广病原体，提高检出率，避免漏诊。需住院治疗的社区获得性肺炎、医院获得性肺炎或免疫抑制宿主肺炎，应及时采集下呼吸道标本进行细菌培养及药敏试验，并联合10~20靶标多重核酸检测，覆盖常见病原体。住院肺炎的标本采集与基础检测对于重症、病情快速进展、常规检测阴性或经验性治疗无效的住院肺炎患者，可应用靶向二代测序或宏基因组学第二代测序，以快速识别罕见或疑难病原体，指导精准治疗。重症及进展性肺炎进阶检测选择免疫抑制宿主肺炎患者应同步进行基础培养、多重核酸检测，并优先采用超多重核酸检测或tNGS/mNGS，以缩短诊断时间，避免漏诊机会性感染如真菌、病毒等。免疫抑制宿主肺炎联合检测策略住院肺炎联合检测中枢神经系统感染上呼吸道及轻症社区获得性肺炎首诊时，根据临床特征和流行病学快速分流，特定病原体流行期首选快速抗原或2-6靶标多重核酸检测，避免无指征广谱检测。疑似中枢神经系统感染首诊时，应同步启动脑脊液常规、生化、涂片及培养等基础检查，并联合6-20靶标多重核酸检测，覆盖常见细菌及病毒，缩短诊断时间。血流感染诊断首诊应遵循血培养与快速分子检测联合原则，社区获得性感染首选多重PCR，医院获得性或免疫低下患者可加用tNGS或mNGS，并覆盖常见耐药基因。呼吸道感染首诊分流与阶梯检测中枢神经系统感染首诊同步联合检测血流感染首诊血培养联合快速分子检测首诊基础联合检测010203当脑脊液常规检查、涂片培养及6-20靶标多重核酸检测阴性，但临床高度怀疑感染或经验性抗感染治疗72小时无效时，应优先采用tNGS或mNGS进行二线检测以明确病原体。中枢神经系统感染一线阴性后升级测序策略对于重症、病情快速进展的社区获得性肺炎或医院获得性肺炎，若常规细菌培养及10-20靶标多重核酸检测阴性或经验性治疗无效，可应用靶向二代测序（tNGS）或宏基因组学二代测序（mNGS）以缩短诊断时间。重症呼吸系统感染一线阴性后升级测序策略医院获得性血流感染或免疫低下患者，在血培养及多重PCR检测阴性后，可加用tNGS或mNGS；多重耐药菌高发地区还应覆盖常见耐药基因检测，以提高诊断效能并指导抗感染治疗。血流感染及免疫低下患者一线阴性后升级测序策略一线阴性升级测序免疫抑制缩短诊断对于免疫抑制宿主，如器官移植、放疗化疗及长期使用免疫抑制剂者，建议在基础检测的同时，直接选用覆盖机会性病原体的超多重核酸检测或tNGS/mNGS，以缩短诊断时间，避免延误治疗。疑似中枢神经系统感染的免疫抑制宿主，应在首诊时同步进行脑脊液常规检查、隐球菌抗原检测及超多重核酸检测，或直接采用tNGS/mNGS，以快速识别隐球菌、CMV等机会性病原体。免疫抑制宿主出现腹泻时，需警惕CMV、寄生虫及真菌等机会性感染。应采用“常规+扩展”阶梯策略，先进行6~20靶标多重核酸检测，必要时行内镜活检，以缩短诊断周期。免疫抑制宿主应优先采用超多重核酸检测中枢神经系统感染中免疫抑制患者的快速诊断路径消化系统感染中免疫抑制患者的阶梯式扩展策略消化系统感染门诊急性腹泻分层临床指征导向分层原则检测范围分层扩展标准免疫抑制宿主特殊策略门诊急性腹泻检测应严格遵循“临床指征导向+分层管理”，避免无指征广谱检测。伴发热、血便、重度脱水、免疫功能低下或有特定流行病学史者，需针对性开展粪便细菌培养和2~6靶标多重核酸检测。住院及重症腹泻患者需扩大检测范围，推荐抗微生物药物使用前进行血培养和6~20靶标多重核酸检测。有旅行史、疫水接触史或来自寄生虫高发地区者，应行寄生虫检测，以覆盖潜在病原体。免疫抑制宿主需警惕机会性感染（如CMV、寄生虫、真菌等），采用“常规+扩展”阶梯策略，必要时行内镜活体组织检查。此分层管理可缩短诊断时间，避免漏诊罕见病原体。010203扩大检测范围与时机流行病学史导向的病原体筛查免疫抑制宿主的阶梯式检测策略针对住院及重症腹泻患者，应在抗微生物药物使用前进行血培养，并联合6~20靶标多重核酸检测，以全面覆盖常见病原体，避免漏诊。有旅行史、疫水接触史或来自寄生虫高发地区的患者，需主动进行寄生虫检测，针对特殊暴露史制定检测路径，从而有效提高诊断精准性。免疫抑制宿主需警惕机会性感染如CMV、寄生虫、真菌等，采用“常规+扩展”阶梯策略，必要时行内镜活体组织检查，以缩短诊断时间。住院重症腹泻扩大010302免疫抑制宿主、重症或病情快速进展者，应在基础检测同时进行隐球菌特殊染色和抗原检测、超多重核酸检测或tNGS/mNGS，以缩短诊断时间。免疫抑制宿主需警惕CMV、寄生虫、真菌等机会感染，采用“常规+扩展”阶梯策略，必要时行内镜活体组织检查，以明确病原体。重度免疫抑制宿主应取深部组织或血液样本，同时送需氧厌氧培养和tNGS或mNGS，并结合免疫学及影像学检查进行综合评估。中枢神经系统免疫抑制机会感染检测策略消化系统免疫抑制宿主机会感染阶梯检测皮肤软组织免疫抑制重症感染综合评估免疫抑制机会感染血流及其他感染血流感染诊断应遵循“血培养+快速分子检测”联合原则，社区获得性感染首选多重PCR，医院获得性感染或免疫低下患者可加用tNGS或mNGS，以提高检出率与时效性。在多重耐药菌感染高发地区，检测应覆盖常见耐药基因如mecA、blaKPC、blaNDM等，以指导精准抗感染治疗，避免经验性用药失败，优化抗菌药物管理。对于实体器官移植、造血干细胞移植、透析等高风险患者，HBV、HCV、HIV筛查可优先选择多重核酸检测，梅毒仍以免疫学检测为主，实现早期诊断与防控。血培养与快速分子检测联合原则多重耐药菌基因检测覆盖血源性传染病高风险患者筛查血流感染联合检测血源性传染病高风险患者人群界定多重核酸检测在HBV、HCV、HIV筛查中的优先地位梅毒螺旋体筛查仍以免疫学检测为主接受实体器官移植、造血干细胞移植、大型手术、输血治疗、血液透析、肿瘤放化疗、免疫抑制剂长期治疗及内镜腔镜等介入性操作者，需综合评估临床特征与流行病学情况，进行针对性筛查。针对HBV、HCV、HIV（1+2型）病原体，高风险患者可优先选择多重核酸检测，或与免疫学检测联合使用，以提高早期检出率，缩短窗口期，降低漏诊风险。梅毒螺旋体筛查不推荐优先使用多重核酸检测，仍以快速血浆反应素试验（RPR）或甲苯胺红不加热血清试验（TRUST）联合梅毒螺旋体颗粒凝集试验（TPPA）作为标准方案。血源性传染病筛查010203泌尿皮肤感染检测单纯性泌尿系统感染通常无需病原学检查，必要时清洁中段尿培养或2~6靶标多重核酸检测；儿童患者需警惕支原体、衣原体合并感染，避免无指征广谱检测。单纯性泌尿系统感染检测策略重症或复杂性泌尿系统感染优先选