肠道微生态与炎症性肠病专家共识2026

肠道微生态与炎症性肠病专家共识解读菌群失衡·致病机制·微生态干预·精准诊疗汇报人消化内科专家组日期2026年10月共识导览01共识概览与微生态基础共识体系脉络与肠道微生态构成02菌群失衡的致病机制屏障损伤与免疫紊乱的因果链条03微生态干预的循证推荐益生菌与微生态制剂的临床定位04FMT的规范化应用适应证、供体筛选与移植流程05精准诊疗与未来方向从经验疗法走向精准生态医学第一章01共识概览与微生态基础微生态是理解IBD的新维度从共识体系到微生态构成，建立认知起点共识体系脉络与版本演进五部共识逐层递进，构建微生态诊疗完整链条从病因机制到诊疗全链条，共识体系日益完善2024版肠道微生态与炎症性肠病专家共识15条陈述建立微生态与IBD关系基本框架2025版肠菌移植治疗炎症性肠病专家共识29条推荐意见聚焦FMT方法学规范化2025版中国微生态调节剂临床应用专家共识微生态失衡诊断与个体化应用明确微生态失衡诊断标准2026版炎症性肠病实验室诊断专家共识10条推荐意见规范非侵入性检测路径2026版炎症性肠病生活方式管理中国专家共识21条循证推荐拓展三级预防体系IBD定义与临床分类IBD是病因未完全阐明的慢性复发性非特异性肠道炎症性疾病类型病变范围内镜特征典型症状克罗恩病（CD）可累及全消化道，节段性分布鹅卵石样改变、纵行溃疡、透壁性炎症腹痛、腹泻、腹部包块、瘘管形成溃疡性结肠炎（UC）局限于结肠黏膜层，自直肠向近端连续延伸弥漫性充血、糜烂、假性息肉血性腹泻、里急后重未分类IBD（IBDU）不符合CD或UC诊断标准缺乏特异性表现需长期随访明确分型不同分型、分期的IBD患者肠道微生态存在差异中国IBD疾病负担攀升患病群体年轻化，已成为消化系统重要公共卫生问题我国IBD患者总数十余年间快速增长，增长近84倍，疾病负担持续加重2013年与2025年中国IBD患者总数对比肠道微生态的构成与功能肠道微生态是宿主健康的重要调节系统肠道微生态由多类微生物共同构成，是参与营养、免疫与屏障维护的复杂生态系统。构成由细菌群、真菌、病毒及其代谢产物共同组成多样性肠道内存在数以万计的微生物种类，构成复杂的生态系统核心功能参与营养吸收、免疫调节与屏障维护菌群与宿主互作通过代谢产物、信号分子等方式与宿主持续交流临床意义微生态紊乱在IBD发生发展中起到重要作用第二章02菌群失衡的致病机制菌群失衡是炎症的隐形推手结构失衡、屏障受损、免疫紊乱三重机制菌群结构失衡的三大特征IBD患者肠道菌群呈现多样性降低与结构失调肠道菌群结构失衡的三大特征，集中体现为多样性、比例、菌种与真菌病毒组的协同紊乱多样性降低菌群α多样性显著下降，微生物群落稳定性减弱比例失调厚壁菌门丰度减少，肠杆菌门过度增殖菌种偏移抗炎共生菌（普拉梭菌、罗氏菌属）显著减少，促炎菌（黏附侵袭性大肠埃希菌）富集真菌与病毒组失衡念珠菌等条件致病真菌增多，噬菌体驱动的病毒组紊乱影响免疫与屏障功能屏障损伤：从黏液层到上皮屏障受损是菌群驱动炎症的关键环节第1环黏液屏障黏液屏障短链脂肪酸是维持黏液屏障功能的关键分子，其减少削弱物理隔离。第2环上皮屏障上皮屏障菌群失调下调紧密连接蛋白表达，肠道通透性增加。第3环细菌易位细菌易位细菌及代谢产物突破屏障进入黏膜下层，持续激活免疫反应。第4环因果证据因果证据粪便流改道可改善CD症状，术后末端回肠暴露于肠腔内容物则加重炎症。免疫紊乱与代谢异常菌群失衡通过免疫与代谢通路推动炎症进展免疫紊乱与代谢异常双通路交织，共同推动炎症进展免疫通路3项免疫失衡Th1与Th17应答亢进，调节性T细胞功能受损，免疫耐受丧失促炎因子干扰素-γ、IL-17、IL-23等促炎因子分泌增加，驱动慢性炎症抗炎机制抗炎微生物刺激外周血单核细胞促进IL-10分泌，抑制NF-κB通路代谢通路2项代谢通路胆汁酸经FXR与TGR5受体诱导Treg分化，色氨酸代谢产物维护肠屏障代谢产物减少短链脂肪酸如丁酸、乙酸生成下降，黏膜修复功能减弱第三章03微生态干预的循证推荐益生菌应用需分亚型分期从联合治疗到术后预防的循证定位益生菌在UC中的循证推荐益生菌应用需分亚型、分期精准化益生菌在UC中的应用需分亚型、分期精准化B级证据联合治疗B级益生菌联合美沙拉秦治疗轻中度活动期UC，疗效优于单用美沙拉秦单药获益部分轻中度UC患者可从单独应用益生菌治疗中获益维持缓解益生菌用于UC缓解的疗效尚有待研究分型差异益生菌对克罗恩病诱导和维持缓解作用的证据不足益生菌与微生态制剂的临床定位微生态干预需与药物治疗协同考量储袋炎预防益生菌对UC术后储袋炎的发生和复发有一定预防作用B级症状改善益生菌可用于治疗缓解期IBD患者的消化不良及肠易激综合征症状A级调节剂应用2025版共识明确微生态失衡诊断标准，针对IBD等提供个体化、多菌种联合应用建议药物互作传统药物通过改变肠道微生态发挥作用，生物制剂与菌群在治疗上存在互作，用药前微生物组学分析可预测疗效04FMT的规范化应用规范流程是FMT安全的基石适应证选择、供体筛选与移植全流程FMT适应证选择明确适应证是FMT规范应用的前提临床疗效约

40%

的溃疡性结肠炎患者接受FMT后获得临床缓解或黏膜愈合合并艰难梭菌感染94%CDI治愈率合并艰难梭状芽孢杆菌感染的IBD患者推荐进行FMT治疗推荐意见5轻中度UC5-氨基水杨酸应答不佳可考虑FMT5-氨基水杨酸应答不佳的轻中度UC可考虑FMT诱导缓解推荐意见6FMT禁忌证与谨慎人群严格把握禁忌证是FMT安全底线严格把握禁忌证与谨慎人群，是FMT安全实施的底线推荐意见7推荐意见8绝对不推荐推荐意见7高度机械性肠梗阻、严重动力性肠梗阻未控制的肠瘘及腹腔感染、高流量腹泻未控制的脓毒血症、中毒性巨结肠高度怀疑癌变、消化道活动性大出血谨慎使用推荐意见8近期接受高风险免疫抑制剂和细胞毒性药物治疗者特殊状态1500个/mm³中性粒细胞计数低于此值的IBD患者需谨慎进行FMT治疗供体选择与菌液质量控制优质供体与严格质控是疗效的基石供体筛查用于治疗IBD的供体应进行粪便钙卫蛋白检测，并排除IBD家族史（推荐意见11）质控标准菌液质量控制应包括活菌比例、有益菌及有害菌丰度（推荐意见12）优质特征优质供体具备较高的菌群多样性以及高厚壁菌门丰度（推荐意见13）数据支撑75%供体有效率超过75%的样本25%供体有效率低于25%的供体有效率超过

75%

的样本，其菌群均匀度显著高于有效率低于

25%

的供体移植途径与剂量选择个体化选择途径，多次输注提升应答不同移植途径疗效尚无定论，多次输注菌液可增加临床应答，缓解后可用口服胶囊FMT维持营养风险人群推荐19合并营养不良及营养风险的患者，采取鼻空肠营养管途径移植，同时进行肠内营养治疗途径比较推荐20随机对照试验尚未揭示不同移植途径在IBD治疗中的疗效及安全性存在差异剂量策略推荐21多次输注菌液可增加IBD患者的临床应答维持治疗推荐22活动期IBD取得临床缓解后，可继续口服胶囊FMT方式维持联合治疗、并发症与疗效评估联合常规治疗，三重评估疗效FMT联合常规治疗，临床、内镜、微生态三重维度共评疗效与安全联合治疗与疗效评估推荐意见16–1801联合治疗对IBD患者进行FMT联合常规治疗，提供更全面的个体化方案（推荐意见16）02联合安全性FMT联用生物制剂、免疫抑制剂和糖皮质激素是安全的（推荐意见17）03疗效评估应包括临床评估、内镜评估和微生态评估三重维度（推荐意见18）04微生态监测采用高通量测序监测益生菌如普拉梭菌、罗氏菌属的丰度变化05安全性不良事件发生率低，文献报道为1%

至

4%，主要为短暂胃肠道反应第五章05精准诊疗与未来方向从经验疗法走向精准生态医学生物标志物、菌群检测与个体化调菌从共识体系到微生态构成，建立认知起点菌群检测与前沿技术菌群检测贯穿FMT治疗全程检测贯穿全程，从治疗前后到小肠微生态，再辅以前沿测序技术检测要点治疗前后检测FMT前后对患者肠道菌群进行检测（推荐意见9）小肠微生态关注IBD患者小肠微生态变化，如小肠细菌过度生长（推荐意见10）检测价值评估治疗效果，了解微生物群落恢复情况，通过客观微生态指标反映疾病进程前沿技术16S扩增子测序、宏基因组测序及微小RNA检测，解析菌群结构并评估宿主调控疗效预测的生物标志物生物标志物是实现精准FMT的突破口生物标志物是打开精准FMT之门的钥匙干预主体层面供体层面供者菌群的多样性、代谢物组成是潜在预测指标受体层面受体的免疫特征影响FMT应答标志物与分析层面多组学标志物肠道菌群特征、宿主基因表达谱、免疫指标可用于预测疗效相关性分析微生态恢复与临床疗效之间的相关性分析，有助于理解FMT作用机制、优化治疗方案从经验疗法到精准生态医学微生态干预正从经验探索走向精准调控微生态干预由经验探索迈向精准调控，个体化调菌方案与生态协同定位共同勾勒未来治疗路径。精准菌群治疗借助宏基因组