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文档简介
基于体液游离DNA的肿瘤常见驱动基因高通量测序专家共识总结CONTENTS010203共识背景与检测概述组织检测局限与cfDNA补充价值cfDNA检测的临床应用场景040506血浆cfDNA检测的循证证据胸腔积液的检测价值脑脊液cfDNA检测优势07腹腔积液与尿液检测08其他体液标本与推荐意见共识背景与检测概述随着高通量测序技术的不断发展,液体活检尤其是基于体液中游离DNA的分子检测在肿瘤诊疗中的应用日益广泛。液体活检因其无创或微创采样方式、可更好反映肿瘤原发灶及转移灶的异质性、可动态监测治疗疗效等优势,临床应用广泛。本共识重点聚焦基于体液cfDNA的肿瘤常见驱动基因NGS全流程质控环节的标准化及规范化。NGS技术推动液体活检液体活检的临床优势共识聚焦全流程质控共识背景与检测概述组织检测局限与cfDNA补充价值010302受限于患者的体能状态、肿瘤的解剖位置及特定临床情境,组织样本的获取常面临挑战。研究显示,10%~30%的实体瘤组织样本不符合NGS质控标准。组织与血液配对同步检测研究发现,血浆cfDNA检测可额外检出5%~15%的组织样本可能遗漏的驱动变异。组织样本获取困难组织样本质控不达标cfDNA额外检出驱动变异组织检测局限与cfDNA补充价值cfDNA检测的临床应用场景TITLEHEREcfDNA检测的临床应用场景初治患者驱动基因检测体液cfDNA检测可用于晚期实体瘤初治患者关键驱动基因变异的检测,为靶向治疗或其他特定治疗方案的选择提供分子依据。耐药机制识别在疾病进展或既往治疗失败后,体液cfDNA检测在获得性耐药机制的识别中具有重要价值。指导个体化治疗上述检测有助于明确耐药分子基础,指导后续治疗策略优化,实现精准、序贯的个体化治疗。血浆cfDNA检测的循证证据大规模研究证实可靠性联合检测提升检出率指南推荐同步检测一项纳入3209例Ⅳ期实体瘤患者的多中心研究显示,组织与血浆cfDNA基因检测的总体一致性为66.4%。联合检测将驱动基因的检出率从单一组织检测的47%提升至59%。NSCLC美国国家综合癌症网络指南建议,在适当的临床情境下可采用组织与血浆cfDNA同步检测,以实现更全面的基因分型。血浆cfDNA检测的循证证据胸腔积液的检测价值胸腔积液的检测价值与血浆相比,MPE上清液可能富集更多来源于肿瘤的DNA,具有更高的突变检测灵敏度及与肿瘤组织更高的基因变异一致性。MPE上清、细胞沉淀以及血浆样本的体细胞突变检出率分别为98.4%、90.5%和87.0%。即使在细胞学检查肿瘤细胞阴性的MPE中,上清液仍能有效检测到基因变异。MPE上清富集肿瘤DNA上清检出率优于血浆细胞学阴性仍可检出脑脊液cfDNA检测优势010203脑肿瘤患者脑脊液中的cfDNA浓度通常高于外周血,能更准确地反映颅内肿瘤的突变负荷和基因组特征。基线脑脊液上清cfDNA的突变检出率达99.2%,远高于血浆样本的57.6%。脑脊液上清cfDNA不仅与组织检测结果高度一致,其检出率也优于血浆和脑脊液细胞沉淀。脑脊液cfDNA浓度更高上清突变检出率高优先选择上清检测脑脊液cfDNA检测优势腹腔积液与尿液检测腹腔积液cfDNA的突变检出率远高于血浆,且中位突变等位基因频率也显著更高。腹腔积液cfDNA检测的灵敏度为97%,特异度为83%,与组织检出的一致性高达95%。尿液上清和沉淀的突变检出一致性分别为53%和48%,显著高于血浆样本的2%。腹腔积液突变检出率高腹腔积液一致性良好尿液检测性能优异腹腔积液与尿液检测其他体液标本与推荐意见BALFcfDNA的突变阳性率显著高于血浆,尤其对血浆易漏检的Ⅰ~Ⅱ期早期肺癌患者,其灵敏度优势更为突出。痰液样本的突变阳性率为65.1%,与组织检测结果相比,灵敏度为81.3%,特异度达100%。对于其他体液如BALF、痰液、胆汁等
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