ITS菌种鉴定方-法_第1页
ITS菌种鉴定方-法_第2页
ITS菌种鉴定方-法_第3页
全文预览已结束

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

1、利 用 ITS 进 行 菌 种 鉴 定 是 目 前 较 多 采 用 的 方 法 。 ITS 是 内 源 转 录 间 隔 区 ( Internally Transcribed Spacer)的英文缩写, 位于rRNA 编码基因18S,5. 8S和28S之间的小基因片段。其优 点有: 具有高拷贝数,整个序列的长度在600800 bp,利用rDNA通用引物能够很容易被扩增出来; 同时包含保守与变异序列, 能根据保守序列中的变异位点设计特殊引物进行特异性扩增比较, rRNA基因(rDNA)在微生物的鉴定应用中,具有检测微生物种水平的多态性特征。这些rDNA高度保守地分布在染色体的不同位置,在每个单倍染

2、色体基因组中的拷贝数超过200个,这使得保守区域 能够很容易被扩增出来。每个重复的rDNA 序列的存在方式为由一前一后的18S rDNA 小亚基单元 (SSU) , 5.8S rDNA, 28S rDNA大亚基单元(LSU)组成,已设计出通用引物来扩增ITS序列分析相关 真菌种水平之间的差异。 本研究通过丝状真菌ITS保守序列的扩增, 同源序列的对比分析 ,结合传统鉴定方法,对从土壤中分离筛选的一株丝状真菌进行了分析鉴定,并对鉴定结果和方法进行了比 较分析。 种内变异还显示在rDNA基因间内转录间隔区和(分别为ITS和ITS)的片段大小上。 ITS区在核糖DNA中进化较快,可在同一属间甚至群体

3、间发生变化。其中ITS区在种间变异性较高(22),种内变异性较低(3) 。选择的两对引物均以ITS区的序列为靶目标,其中引物(ITS1和ITS4)扩增的是ITS区、5.8SrDNA和ITS区的基因序列,可以鉴别出念珠菌属的3个菌种; 引物(ITS4和ITS86)扩增的是5.8S rDNA和28S rDNA之间的ITS区的保守顺序,可以鉴别出念珠菌属的7个菌种。因而笔者更推荐采用引物,它不仅有很强的通用性,能识别更多菌种,而且具有更高的属种特异性。1、通用引物: ITS1 5-TCCG TAGG TGAA CCTG CGG一3ITS4 5-TCCT CCGC TTAT TGAT ATGC一3通用引物 ITS4 5-TCCT CCGC TTAT

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论