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文档简介
1、实验一CTAB法提取植物基因组DNA实验的目的:学习从植物组织中提取基因组DNA的基本原理和方法。实验原理:用机械研磨的方法粉碎植物的组织和细胞,植物细胞的匀浆中含有很多酶类(特别是氧化酶类),会对DNA的提取产生不良影响,所以在提取缓冲液中添加抗氧化剂和强还原剂(如巯基乙醇),使这些酶类的活性降低。 在液氮中研磨,材料容易损坏,研磨中各种酶类的作用减少。CTAB (hexadecyltrimethylamioniumbromide,十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子除污剂,能溶解细胞膜,与核酸形成复合体。该复合体在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl )可溶,用有机溶剂提取除去蛋白、多糖类
2、、酚类等杂质后,加入乙醇沉淀(CTAB可溶于乙醇)就能分离核酸。由于CTAB溶液在低于15度时会沉淀溶出,所以在加入冷植物材料之前必须进行预热(65度),离心温度不能低于15度。实验步骤:取年轻植物的叶子(3-5g )将液氮粉碎,放入离心管内1.5ml。 加入同体积的65预热的DNA提取缓冲液,在65的恒温水浴床上放置1-2h(1.5h )。加入2,等体积的氯仿:异丙醇(24:1 ),轻轻上下颠倒5分钟,静置5分钟,然后以12000rpm离心10分钟。3、吸取上层水相,重复步骤2一次。4、吸入上层水相,加入预冷的2/3体积的异丙醇,轻轻翻转2分钟,放入-20的冰箱10分钟,DNA沉淀后以120
3、00rpm离心收集,收集到的DNA用70%乙醇洗23次。 扔掉乙醇,在风干的DNA中加入适量的水使之溶解。5、DNA完全溶解后,加入不含RNAasea的12l(10mg/ml ),在37下保温1h,去除DNA中的RNA。6、在Eppendorf管中加入1mL氯仿:异丙醇(24:1 ),轻轻上下反转10分钟后,以10000rpm离心10分钟。7、吸入上层水相,加入1/10体积的3M乙酸钠和2倍体积的预冷无水乙醇,放入-20冰箱中,10分钟后以10000rpm离心10分钟,丢弃无水乙醇,加入70%乙醇洗涤23次,风干,最后8.DNA完全溶解后,进行1%琼脂糖凝胶电泳,检查DNA的质量,根据已知的D
4、NA分子量标准来估计其浓度。 调整过浓度的DNA在-20下预备使用。实验试剂:1,1米三级HCl (ph8.0)121.1g Tris溶解于800ml无菌水中,加入HCL将pH调节到8.0,定容调节到1L,进行高压灭菌。2,0.5m EDTA (ph 8.0 )186.1g EDTA-Na2H2O溶解于800ml无菌水中,用磁力搅拌器激烈搅拌,用NaOH将pH调节到8.0 (约20g ),定容至1L,进行高压灭菌。3,3.5m NaCl204.75g NaCL溶解于1L无菌水中,进行高压灭菌。4,10 % CTAB溶液10gCTAB溶解于80ml无菌水中,定容至100mL,进行高压灭菌。5、DNA提取液(500ml )3.5米NaCl200毫升TRISS-HCl50毫升PS50毫升10 % PS100毫升Water100毫升6、氯仿-异丙醇(24:1体积比)七、RNA东盟8、异丙醇9、无水乙醇10,3m乙酸钠11、1TE缓冲液实验器具:液氮罐,离心管1.5ml,离心架1.5ml,恒温水浴床,枪和枪口(1ml和200ul ),离心分离机(转速可调整为4000rpm和10000rpm ),剪刀注意事项(1)叶片越磨越好。(2)移液管的使用
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