第八章-钼酶及含钼蛋白(固氮酶)_第1页
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文档简介

1、第8章含钼酶和蛋白质(固氮酶),第1节总结了第2节固氮酶,第3节二氮的配位化学,第4节固氮酶的模拟,第5节钼氧酶及其模拟,第1节总结了钼是生物体中唯一的第二过渡元素。钼酶相对分子量大,难以纯化。钼容易变价。钼具有多种价态和复杂的存在状态,因此钼酶的许多问题仍不清楚。钼是人类生长所必需的微量元素。它广泛分布于体内,可在所有器官、组织和体液中检测到。钼是许多酶的辅因子。钼参与酶和蛋白质的合成、维生素B12的组成和代谢,促进红细胞的发育和成熟,预防贫血,并促进核酸和蛋白质的合成。钼缺乏:钼缺乏会导致心肌病或其他心血管疾病。钼的缺乏也会导致食道癌、骨癌、肝癌和龋齿。孕妇缺乏钼会导致胎儿发育障碍。钼过量

2、:钼过量会引发痛风和癌症。对于一些含钼的食物,由于食物来源不同,钼的含量也有很大的不同。一般来说,豆类及其产品是最丰富的蔬菜食品。动物性食品的含量最高的是海鲜,其次是动物肝和肾。钼主要通过食物链中的迁移进入人体。钼主要分布在人体内。钼广泛存在于水、土壤和各种动植物中。钼主要分布在人体的肝和肾中。人体血液中钼的含量能更好地反映人体对钼的摄入量。根据中国营养学会2000年制定的中国居民膳食营养参考摄入量,成人钼的推荐摄入量为60g/天,最大耐受摄入量为350g/天。一些钼酶的主要成分,所有与钼有关的金属蛋白和金属酶都与氧化还原有关,并参与生物体中的电子转移。钼酶的组成很复杂。一些钼酶如固氮酶、黄嘌

3、呤氧化酶和黄嘌呤脱氢酶除了钼辅酶外还含有铁硫蛋白或黄素腺嘌呤二核苷酸。其它钼酶如硝酸还原酶和亚硫酸盐氧化酶也含有细胞色素。钼酶中的铁蛋白或细胞色素通常作为电子传递介质,而钼活性中心则发挥生物催化作用,如通过底物结合氧化和还原底物。钼酶根据其结构和功能的不同可分为固氮酶和转氨酶。代表性的钼、氮酶含有一个femo-cluster辅基,所有其他酶都含有钼、钼辅基:蝶呤辅酶钼双加氧酶分为氧化酶和还原酶。氧化酶是一个氧化过程;还原酶是一个缺氧过程:黄嘌呤o尿酸NO3-NO2-(moivmovi)so32-so42-(movimoiv)co2o cocho rcooh钼双加氧酶的催化反应与电子转移和钼价有

4、关。在第二部分,固氮酶可以有效地将N2转化为NH3在常温常压下;20世纪80年代,Hellriegel和Wilfarth首先发现并证实了自然界中生物固氮的存在,然后人们发现生物固氮广泛存在于微生物和原核生物中。已经发现至少200种微生物具有生物固氮功能。目前,世界农业每年消耗近1亿吨尿素,生物固氮提供了世界所需氮肥的75% (3亿吨尿素)。尿素的工业化生产需要高温高压来消耗大量的能源,同时污染大气,对环境造成第一次污染;与此同时,只有30%的化肥被农作物使用,大部分进入地下水,对环境造成二次污染。固氮微生物利用可再生能源在常温常压下固定空气中的氮,氮被植物直接吸收利用,不会对环境造成任何污染。

5、早日实现人工生物固氮是生物无机化学及相关学科发展的重要目标!人类对biolog的理解这极大地刺激了固氮酶的生化研究和开发。然后从生物体中分离纯化出活性酶,人们用各种物理方法对固氮酶进行了更深入的研究。与此同时,科学家们在过渡金属配合物的存在下进行了氮在溶液中的化学反应,合成了第一个过渡金属重氮配合物,并且出乎意料地稳定;此后,许多分子氮配合物相继合成,并研究了它们在溶液中的还原反应(质子化后可形成肼和氨)。固氮酶的分离纯化、溶液中氮分子的还原和过渡金属重氮配合物的制备是相互联系、相互促进的。长期以来,固氮酶的结构和生物固氮的机制一直是科学家们努力探索的目标。20世纪70年代,成功分离出固氮酶活

6、性中心的铁钼辅助基团,确定了构成固氮酶的铁蛋白和钼铁蛋白的单晶结构。到目前为止(1993年),已测定了1.16高分辨率的钼铁固氮酶的晶体结构。人工固氮酶的研究取得了很大进展。固氮酶催化以下反应,生物固氮系统可分为两种类型:自生固氮和共生固氮;一些固氮微生物只能在好氧环境中具有固氮功能;另一种固氮微生物可以在缺氧条件下固氮;此外,一些固氮微生物可以在有氧和无氧条件下自由固氮;根据固氮酶所含金属的种类,固氮酶可分为三类:钼固氮酶、钒固氮酶和铁固氮酶。每种固氮酶由两种金属蛋白组成,除铁蛋白外,它还含有另一种钼铁蛋白(MoFe)、钒铁蛋白(VFe)或铁铁铁蛋白(FeFe)。1993年,Rees等人获得

7、了固氮菌和多杀性巴氏杆菌固氮酶钼铁蛋白的X射线结构数据,分辨率为0.22nm,基本确定了固氮酶的结构。它由两种相对独立且分离的纯蛋白质组成,即铁蛋白和钼铁。铁蛋白是一种依赖于所提供能量的电子转运蛋白,具有将电子转移到钼铁蛋白的功能。钼铁蛋白是结合底物分子和催化底物还原的位点。固氮酶的组成,钼固氮酶的结构,铁蛋白是一个二聚体,它含有一个Fe4S42 /1原子簇来桥接两个亚单位。每对钼-铁蛋白,22个四聚体)包含一对Fe4S4(即磷簇)和一个FeMo辅因子(M簇)。钼铁蛋白的晶体结构、氮化钼酶的结构和电子转移、氮化钼酶中钼铁蛋白的结构以及不同类型微生物固氮菌的铁蛋白已被分离纯化并得到深入研究。它们

8、的大小和功能相似。它们是由两个分子量约为60000道尔顿的相同亚基形成的二聚体,并且Fe4S4簇结构通过四个半胱氨酸上的硫原子桥接在两个亚基之间。Fe4S4簇单元位于蛋白质球表面,易于接近溶剂分子,因此铁蛋白对氧化极其敏感。主要功能:1。电子传播媒体的作用;Fe4S4 2,Fe4S42。它的存在对于FeMo辅酶的生物合成是必要的。3.它的存在是FeMo辅酶插入修饰的FeMo辅酶缺陷型铁钼蛋白所必需的。P-簇:电子从铁蛋白金属簇中心转移到铁锰辅酶中心的桥效应。m团簇是固氮酶固氮的活性中心,其研究已经引起了许多化学家的关注。相比之下,自1973年以来,国内外学者根据结构化学、化学键理论、复合催化原

9、理和化学探针提出的十几个团簇模型,如固氮酶网袋模型和快连双立方烷烃模型,都是以钼为结合底物的核心原子。这种在自然界进化的独特的活性中心结构能有效地将氮固定成氮,这比人们的智慧更有思想。根据这一新信息,固氮酶活性中心的结构和功能研究将有新的突破。M-簇、FeMo-辅酶和蛋白质的重要性在于结合位点少且相对松散,因此易于提取;M团簇中相邻铁-铁之间的距离为2.58-2.67;钼-铁距离为2.67-2.73,这意味着铁-铁和钼-铁之间存在一定程度的金属-金属结合。MoFe-Co (M团簇),电子转移机制?铁蛋白循环?钼铁蛋白的催化循环?氢化酶如何表现自己?在催化过程中,氮与铁或钼结合?哪里有可承诺量?

10、有特异性吗?小方程式,大学问!1.电子转移机制,铁蛋白和FeMo辅酶之间的距离是32,所以不可能在它们之间直接转移电子。2。固氮酶铁蛋白循环图,3。固氮酶铁蛋白循环图,4。固氮酶与底物之间可能的结合位点,底物与铁蛋白附件之间的结合位置和方式仍是有待进一步研究的问题。钒固氮酶可与铁结合,在厌氧条件下具有催化活性。在还原N2的过程中,钒固氮酶使用其自身还原当量的50%来生产H2,而钼固氮酶仅使用25%。因此,钒固氮酶的催化活性不如钼固氮酶,只有在土壤缺钼的情况下,生物才会采用钒固氮体系。但是,钒固氮酶具有不如钼固氮酶的优点。 (1)钒固氮酶在低温(如5点钟)和酸性环境下的还原效率高于钼固氮酶;(2

11、)钒固氮酶将乙炔还原成乙烯,部分还原成乙烷;(3)钒固氮酶具有明显的氢化酶活性;(4)钒固氮酶在N2还原过程中会产生少量中间体肼。化学通报,2007,4,270,第3节,二氮的过渡金属配合物。1965年,艾伦在常温常压下合成了第一个过渡金属配合物二氮钌(NH3)5(N2)Cl2,改变了氮分子无活性的概念,提供了一种活化分子氮的方法。通过研究重氮化合物获得生物固氮信息的希望鼓励科学家深入探索更多的例子。目前,已合成了数百种重氮配合物。这项研究开辟了一个新的研究领域,促进了人们探索生物固氮的秘密。1.最高非活性氮分子在轨道3g中占据较低的能量-15.6 eV,而最低空轨道3g具有较高的能量-7.0

12、 eV.也就是说,很难将电子完全从N2转移到受体,或者从电子给体转移到N2。因此,N2既不容易氧化,也不容易还原。N2分子如何被激活是生物固氮化学模拟研究中的一个重要问题。氮的分子轨道能级和电子云的分布,双氮配合物的成键模式:端基配位和侧基配位,CoH(N2)(PPh3)3结构,(NH3)5Ru2(N2)4结构,c6h5l i6n2n2 (et2o) 22结构(省略苯基和醚),3。氮分子的配位激活了端基配位的bis。由侧基配位的键的形成降低了两个氮原子之间的电子云密度,并且反馈键削弱了两个氮原子的键强度。这两种效应都促进了N2的激活,反馈键是主要的一种。在端基和侧基配位的重氮过渡金属配合物的成

13、键模式中,中心金属原子具有低氧化态,电子构型大多为d5-d10。共配体的路易斯碱越强,越有利于形成反馈键,N2活性越大。与端基配位相比,侧基配位重氮配合物的双键更长,N2活性更大。4-配位氮原子的反应性只是研究的第一步。如何还原和质子化最初活化的二氮生成氨是一个困难的课题,至今进展缓慢!近几十年来,生物固氮的化学模拟研究一直是一个热点。中国科学家在这一领域做了大量出色的研究工作。例如,早在20世纪70年代,陆嘉熙和蔡就参与了女性组织结构的研究,并分别提出了福州模式和厦门模式,引起了国际上的关注。20世纪90年代初,美国学者里斯等人阐明了固氮酶活性中心簇及其周围多肽分子的三维结构,从而导致了生物

14、固氮化学模拟研究的新高潮。近年来,国内外的理论化学家根据里斯的FeMoco中心复合模型,提出了不同的N2成键模型。尽管国内外对化学模式生物固氮的研究取得了显著进展,但仍处于理论研究阶段。20世纪70年代,固氮酶的结构仍未确定。化学家基于EXAFS和其他光谱和化学分析研究,提出了铁-钼修复模型化合物的结构类型。根据EXAFS的数据,Hodgson提出了两种结构模型:(a)、(b)双网状口袋的福州模型,双座双立方烷烃的厦门模型,到目前为止,世界各地的科学家围绕固氮酶化学模拟的总体目标,合成了数百个具有立方烷烃或类似立方烷烃的铁硫簇和钼铁硫簇。FeMo-辅酶金属簇的结构模拟,holm教授的结构模拟,

15、p-簇,Kazuyuki辰巳教授的结构模拟,第5节钼转氨酶及其模拟,除了固氮酶以外,另一种非常重要的钼酶是转氨酶,而已知的转氨酶包括黄嘌呤氧化酶和脱氢酶、硝酸还原酶、亚硫酸盐氧化酶、醛氧化酶和二甲基亚砜还原黄嘌呤氧化酶,这不同于同一种酶中的黄嘌呤脱氢酶。核酸在各种动物和植物中分解,降解产物腺嘌呤和鸟嘌呤被一些酶转化成黄嘌呤。生成的黄嘌呤被黄嘌呤氧化酶催化氧化成尿酸,生成的H2O2被过氧化氢酶分解成O2和H2O。该反应的意义在于,由核酸分解形成的氮碱基随血液到达肝脏,并被特定的酶去氨基,以获得嘌呤和其它物质,在该酶的作用下,嘌呤和其它物质被氧化成尿酸。别嘌呤醇,黄嘌呤氧化酶活性位点,硝酸盐还原酶:广泛分布于植物和微生物中,是将NO3-还原为NO2-的催化剂。这种酶的生理功能取决于有机体。通常,亚硝酸盐还原酶催化NO2-还原成NH3。因此,硝酸盐酶迈出了将NO3-转化为NH3的第一步。硝酸盐还原为亚硝酸盐是一个能量

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