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文档简介
1、Polymerase Chain Reaction,PCR,多聚酶链式反应技术,以拟扩增的DNA分子为模板,以一对分别与模板互补的寡核苷酸片段为引物,在DNA聚合酶的作用下,按照半保留复制的机理沿着模板链延伸直至完成新的DNA合成,核酸模板,引物,反应缓冲系统,Taq DNA聚合酶,4种dNTP,Mg2+,包括Tris-HCl(维持PH值),KCl(利于引物的退火),Taq聚合酶保护剂,PCR的特异性(3端和5端;18-25bp;0.1-0.5M;Tm值;4种碱基随机分布;自身避免反向重复序列;引物之间不存在互补序列;3端选择保守的氨基酸序列;与非特异性序列的同源性),PCR的合成原料,四种d
2、NTP浓度应相等,耐高温,在热变性时不会被钝化,使DNA聚合酶具有催化活性,DNA/RNA,线性,小片段模板,核酸样品应除去存在对DNA聚合酶有抑制作用的有机溶剂和金属离子,实验参数设置,变性的温度与时间 退火的温度与时间 延伸的温度与时间 循环数,PCR产物检测,琼脂糖凝胶电泳,EB,它能和碱基间的氢键结合,在波长为254nm365nm的紫外光照射下呈橘红色(530nm)的荧光,琼脂糖凝胶板的制备(1.5%),加样电泳(电压80V、时间2hr),紫外,PCR技术,巢式PCR,原位PCR,多重PCR,定量PCR,逆转录PCR,逆转录 PCR,相对于基本PCR,在开始阶段增加步骤:RNA cDN
3、A合成,是单链到双链的过程。,引物,逆转录酶,RNA水解酶,Real Time qPCR,荧光嵌合法(TB Green) 荧光探针法,实时荧光定量PCR技术 (Real-Time Quantitative PCR) 是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。,基线(Baseline) 是指在PCR扩增反应的最初数个循环里,荧光信号变化不大,接近一条直线,这样的直线即基线。 光阈值(threshold) 一般将PCR反应前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号,荧光域值是PCR 3-15个循环荧光信号标准差的10倍,荧
4、光域值设定在PCR扩增的指数期 Ct (Cycle threshold)值 表示每个PCR反应管内荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数,Real Time qPCR,。,固定循环数后,荧光信号与模板数成正比。 初始DNA量越多, 荧光达到阈值时所需要的循环数(Ct 值)越少。 起始模板的对数浓度与Ct呈线性关系,根据样品的Ct值就可计算出样品中所含的模板量。,Real Time qPCR,熔解曲线,确认PCR反应的特异性。,Ct值无数值(undetected)阴性 Ct值30.0 阳性 Ct值30.0 表达量极少,Real Time qPCR,相对定量法分析结果,内参/管家基因,GAPDH、-actin
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