下一代测序技术简介ppt课件

1、Next Generation Sequencing(NGS)技术简介，1，PPT学习交流，Sanger排序，Sanger排序仍是基因排序行业的黄金标准，但总排序是技术瓶颈。(昂贵的价钱、繁琐的程序、效率低下)、2、PPT学习通信、ngs=next generation sequencing、ngs高吞吐量排序(HTS)非编码RNA或PCR产品不需要牙齿步骤。1，试样处理，7，PPT学习交流，Roche 454排序阶段，2，库准备，库准备包括连接器连接和磁珠精炼2阶段，454库连接器a，2个b，分别为44bp，20bp的PCR引物，20bp，9，PPT学习交流，Roche 454测序阶段，4，

2、emRCR，PCR牙齿扩增，形成了每个珠子中密集的DNA簇，牙齿DNA序列完全相同，可以用于后续阶段。10，PPT学习交流，乳液PCR(emRCR)，11，PPT学习交流，Roche 454排序阶段，5，准备反应板，机器排序，454排序反应板称为PTP，12，PPT，14，PPT学习交流，454测序器中，A，T，G，C的4茄子碱基分别存储在单独的试剂瓶中，每个阶段反应4个碱基依次放入反应池中，碱基对结合后释放超磷酸(PPi)，牙齿超磷酸在酶的作用下释放。15，PPT学习交流，Illumina排序原理，Illumina合成排序原理，16，PPT学习交流，Illumina排序流程，17，PPT学习

3、交流，桥梁PCR，18，PPT学习交流abbs在连接反应中，这些探针根据碱基互补性规则与单链DNA模型链成对。这样，在5轮排序反应后，所有核酸序列SOLID的双碱编码矩阵，22，PPT学习交流，ABI SOLiD连接排序原理，探针的5端标有一种茄子颜色的荧光染料。探针3段15位是任意碱基。其中，1，2位组成的碱基对表示探针染料类型，35位的“N”是任意碱基，68位的“Z”是可与所有碱基配对的特殊碱基。SOLiD排序反应的每一轮排序将连接第15个碱基，删除第68个碱基，同时记录第12个碱基决定的荧光颜色。23，PPT学习交流，ABI SOLiD连接排序原理，24，PPT学习交流，ABI SOLi

4、D连接排序原理，两个碱基一起确定颜色，将大大提高排序的准确度。25，PPT学习交流，ABI SOLiD连接排序原理，5轮排序反应后第0位，第1位，第1位，第2位.按顺序连接对应于模板序列的颜色信息，将牙齿出现“0，1，2，3”，26，PPT学习交流，454平台的突出优点是阅读场。目前454系统的串行读取长度已超过400 BP。454平台的排序成本比其他平台高得多，但对于从头开始连接或需要长时间阅读的应用程序(如环境微生物学)，仍然是理想的选择。每个排序平台的特征摘要，Roche 454，Illumina，1。可扩展的超高速Genome Analyzer系统当前每次运行后可获得20 GB以上的高

5、质量过滤数据。最优化后通量也预计增加到95 GB，相当于人类基因组的30倍。2.样品量少的Genome Analyzer系统所需的样品量低到100ng，可应用于许多样品限制实验，如免疫沉淀、糙米切割等。3.简单、快速、自动化的Genome Analyzer系统提供了最简单、最简洁的工作流。样品库的准备可以在几个小时内完成，一周内就能获得高精度的数据。自动化的过程不减少手动错误或污染的可能性，不需要机器人操作或洁净室。27、PPT学习交流，1 .无与伦比的通量目前，SOLiD 3系统一次可以产生50 GB的人类基因组序列资料。这相当于基因组的17倍复盖范围，是任何其他下一代排序系统都无法实现的2

6、。准确性很明显。新的ECC模块提供高达99.99%的准确度。可定位碱基的最大98%高于45%。更多的标签以提高灵敏度和动态范围；高精度远视读取顺序，支持无参考序列的数据分析。各个排序平台的特征摘要，ABI SOLiD，28，PPT学习交流，第三代排序平台的比较差异，29，PPT学习交流，太平洋生物科学史(PacBios)实时单分子排序节目图表。a .单零开始模式波纳米结构的侧面，底部的玻璃面上固定着每个纳米结构包含DNA聚合酶分子。海浪纳米结构和共聚焦成像系统仅在底部保证荧光检测。b .显示了标记为荧光的核苷酸基质混合在碱基序列中的过程。该瞬间荧光检测分为5个阶段。太平洋生物科学公司，30，PPT学习交流，Life Technology，IonTorrent半导体排序筹码技术图解。a .筹码结构设计的分层显示器上层是单个DNA聚合反应的微池，下层2层构成场效应电晶体离子传感器。每个微池都有相应的场效应电晶体探针，用于识别每个pH值的变化。b .剖面：在微池中，DNA聚合酶将两个重复的TTP核苷酸混合在测序片段中。反应过程中释放的氢离子由下面的场效应晶体管检测。31、PPT学习交流、Complete Genomics、Complete Genomics的DNB阵列生产和cPAL技术的方案图。A.