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文档简介
1、第十四章 基因重组与基因工程,第一节 自然界DNA重组和基因转移,第二节 重组DNA技术,克隆(clone),克隆即指同一副本或拷贝(copy)的集合;获取同一拷贝的过程叫克隆化。,自众多分子中分离获得相同分子,即为分子克隆,在分子生物学和遗传学领域所谈的分子克隆专指DNA克隆.,DNA克隆(DNA cloning):应用酶学的方法,在体外将目的基因与载体DNA结合成一具有自我复制能力的DNA分子复制子,继而通过转化或转染宿主细胞、筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增、提取获得大量同一DNA分子的过程。DNA克隆又称基因克隆(gene cloning), 基因工程,重组DNA技术(rec
2、ombinant DNA technology): 实现基因克隆所采用的方法及相关的工作。,克隆体系: 目的基因 载体DNA 工具酶 宿主细胞,1、目的基因(target gene):cDNA或基因组DNA,cDNA (complementary DNA):指体外经反转录合成的,与RNA (常指mRNA)互补的单链DNA,单链cDNA进而合成双链cDNA。,基因组DNA(genomic DNA):代表一个细胞或生物体整套遗传信息的所有DNA序列,称为基因组DNA。,2、载体(vector):质粒、噬菌体、柯斯质粒载体、病毒和人工染色体等,质粒(plasmid):存在于细菌染色体外的小型环状双链
3、DNA分子,在细胞中可以独立进行复制并在细胞分裂时恒定地传给子代细胞。,质粒载体,理想质粒载体的条件: 1、环状DNA,具有自主复制能力; 2、具有较多的拷贝数,易与宿主细胞的染色体DNA分开; 3、分子量相对较小(2kb数百kb),能够容纳目的基因; 4、具有较多单一限制性内切酶位点; 5、有一个或多个筛选标记; 6、具有较高的遗传稳定性。,The constructed plasmid pBR322,质粒载体,外源基因插入位点EcoR 含一个复制起始点(ori) 抗药基因terr和ampr,1977年由Boliver和Rodriguez等人自E.coli的天然质粒建成。,1、克隆载体,An
4、 example of an E. coli expression vector,质粒载体,2、表达载体,外源基因插入位点 复制起始点(ori) 标记基因 启动子 调控序列,3.1 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease): 存在于细菌体内,能够识别和切割双链DNA内部特定核苷酸序列的一类核酸酶。,3、工具酶:,许多限制性核酸内切酶II的识别序列属于回文结构 回文结构:DNA的两条链呈旋转对称,即中心轴两侧的碱基序列为互补序列。,【经典举例】Eco RI,限制性核酸内切酶,限制性内切酶切割产物:具有5磷酸基和3羟基基团 由于酶的作用不同可以产生三种切割末端。,(1)
5、5突出末端:如Eco RI,酶识别DNA序列的长短不同,一般为4-18bp,(3)平头钝性末端:如Hpa I,限制性核酸内切酶,(2)3突出末端:如Pst I,3.2 DNA聚合酶:大肠杆菌DNA聚合酶I、Klenow片段 (Klenow 酶)、T4 DNA聚合酶以及Taq酶等,3.3 DNA连接酶 T4 连接酶:可用于粘端与平端的连接,4、宿主细胞:大肠杆菌、酵母、动物细胞,分、切、接、转、筛、表达,第三节 DNA克隆的基本过程,一、“分”:目的基因及载体的制备,1、分离基因的方法:化学合成、基因组DNA、 cDNA 、 PCR、,基因组DNA文库(genomic DNA library):
6、利用限制性核酸内切酶将组织或细胞染色体DNA切割后,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有基因组DNA信息,总称基因组DNA文库,cDNA文库(cDNA library):以mRNA为模板,利用反转录酶合成与mRNA互补的DNA,再复制成双链cDNA片段,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有cDNA信息,总称cDNA文库 。常用于筛选编码蛋白质的结构基因。,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR):在反应体系中加入模板DNA、dNTP、特别设计的特异引物及耐热的DNA聚合酶(常用Taq酶),经多次变性、退火、延伸循环反应,使目的DNA呈指
7、数合成的过程,2、常用载体:质粒、噬菌体、病毒DNA,克隆载体(cloning vector):用于目的基因的克隆、扩增、序列分析和体外定点突变等,表达载体(expression vector):用于在宿主细胞中表达外源目的基因,获得大量表达产物,二、“切”:限制性内切酶切割目的基因和载体DNA,一、粘性末端连接,1、同一限制酶切割位点连接,碱基配对结合成重组分子。,2、不同限制酶切割位点连接,因有相同末端,经配伍后连接,三、“接”:重组体的构建,重组体构建,二、平端连接,平端在T4连接酶作用下可以连接。,三、同聚物加尾连接,利用同聚物序列,如多聚A与多聚T之间的互补作用完成连接,需末端转移酶
8、。,四、人工接头连接,用人工合成某酶切割序列的接头,与DNA平端相连后形成粘性末端再连接。,重组体构建,重组体构建,2、转染(transfection):将外源DNA导入真核细胞的过程,3、感染(infection):以l噬菌体、柯斯质粒和病毒为载体的重组DNA分子,在体外经过包装成具有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,才能感染适当的细胞,并在细胞内扩增。,四、“转”:重组DNA分子导入受体细胞,1、转化(transformation):将质粒或其它外源DNA导入宿主细胞(常用大肠杆菌),并使其获得新的表型的过程,五、“筛”:筛选出含重组DNA的受体细胞,抗药性标志选择,含抗药性基因的载体(ampr
9、 ,Tetr, Kanr)转入的细菌,可在含该药物的培养板上形成菌斑,进行初步筛选。,重组子的筛选,例如:,Screening for desired recombinant by antibiotic resistance genes (clones 2, 5, and 8),六、“表达”:使克隆基因在宿主细胞中复制、表达,1、外源基因在原核细胞的表达,大肠杆菌是最常用的原核表达体系,2、真核表达体系,酵母、昆虫及哺乳动物细胞等 表达产物更接近天然蛋白质,基因工程的基本步骤,1、分,2、切,3、接,5、筛,4、转,6、表达,疾病基因的发现、发展新药物、DNA诊断、基因治疗及遗传病的防治,一、
10、疾病相关基因分析,1、功能克隆(functional cloning):根据基因的功能(通常是根据其蛋白质)产物来寻找、克隆与疾病相关的基因,2、定位克隆(positional cloning):从一种致病基因的染色体定位出发逐步缩小范围,最后克隆该基因,二、制造生物活性蛋白,第四节 重组DNA技术与医学,基因工程产品,A tobacco plant in which the gene for firefly luciferase is expressed. Light was produced after the plant was watered with a solution conta
11、ining luciferin, the substrate for this lightproducing enzyme (see Box 13-3, Fig. 2). Dont expect glow-in-the-dark ornamental plants at your local nursery anytime soon; the light is actually quite weak and this photograph represents a 24 hour exposure. The real point-that this technology allows the introduction of new traits into plants-is nevertheless elegantly made.,转基因植物,基因工程的应用,转基因动物,三、基因诊断,基因诊断:利用分子生物学的基本原理和技术,在DNA或RNA水平上分析、鉴定与某些疾病有关基因的改变(基因结构及其表达水平的异常),遗传病的产前诊断、感染性疾病的快速诊断、某些
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